Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2137
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2137, 894 aa
1>>>pF1KE2137 894 - 894 aa - 894 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7206+/-0.00152; mu= 16.1470+/- 0.092
mean_var=225.5471+/-43.299, 0's: 0 Z-trim(107.3): 957 B-trim: 46 in 2/50
Lambda= 0.085400
statistics sampled from 8457 (9491) to 8457 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 6389 801.8 0
CCDS45557.1 PRDM7 gene_id:11105|Hs108|chr16 ( 492) 2415 311.8 2e-84
CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 635) 2093 272.3 2e-72
CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 653) 2081 270.8 5.8e-72
CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 667) 2081 270.8 5.8e-72
CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 591) 2080 270.6 5.9e-72
CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 654) 2077 270.3 8.1e-72
CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 657) 2077 270.3 8.1e-72
CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 509) 2058 267.8 3.6e-71
CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 599) 2058 267.9 3.9e-71
CCDS74693.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 640) 2052 267.2 6.8e-71
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 1999 260.6 6e-69
CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 1999 260.7 6.3e-69
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 1999 260.7 6.4e-69
CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 1997 260.4 7.4e-69
CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 ( 603) 1845 241.7 3.1e-63
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1819 238.5 3e-62
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1814 238.0 5e-62
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1782 234.0 7.5e-61
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1782 234.0 7.6e-61
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1782 234.0 7.6e-61
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1749 230.0 1.3e-59
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1705 224.6 5.8e-58
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1705 224.6 5.8e-58
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1703 224.3 6.2e-58
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1695 223.3 1.3e-57
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1695 223.3 1.3e-57
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1693 223.1 1.6e-57
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1690 222.9 2.4e-57
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1690 222.9 2.4e-57
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1666 219.5 1.2e-56
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1669 220.1 1.2e-56
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1664 219.4 1.6e-56
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1664 219.4 1.7e-56
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 1666 219.9 1.7e-56
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 1666 219.9 1.7e-56
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1660 218.9 2.3e-56
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1660 218.9 2.4e-56
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1658 218.6 2.7e-56
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1658 218.7 2.8e-56
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1658 218.7 2.8e-56
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1658 218.7 2.9e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1653 217.9 3.8e-56
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1653 218.0 4e-56
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1653 218.1 4.3e-56
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1653 218.1 4.4e-56
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1654 218.4 4.9e-56
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1649 217.5 5.9e-56
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1649 217.6 6e-56
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1646 217.2 7.6e-56
>>CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 (894 aa)
initn: 6389 init1: 6389 opt: 6389 Z-score: 4272.6 bits: 801.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6389; 99.9% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSPEKSQEESPEEDTERTERKPMVKDAFKDISIYFTKEEWAEMGDWEKTRYRNVKRNYNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSPEKSQEESPEEDTERTERKPMVKDAFKDISIYFTKEEWAEMGDWEKTRYRNVKRNYNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LITIGLRATRPAFMCHRRQAIKLQVDDTEDSDEEWTPRQQVKPPWMALRVEQRKHQKGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LITIGLRATRPAFMCHRRQAIKLQVDDTEDSDEEWTPRQQVKPPWMALRVEQRKHQKGMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KASFSNESSLKELSRTANLLNASGSEQAQKPVSPSGEASTSGQHSRLKLELRKKETERKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KASFSNESSLKELSRTANLLNASGSEQAQKPVSPSGEASTSGQHSRLKLELRKKETERKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YSLRERKGHAYKEVSEPQDDDYLYCEMCQNFFIDSCAAHGPPTFVKDSAVDKGHPNRSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YSLRERKGHAYKEVSEPQDDDYLYCEMCQNFFIDSCAAHGPPTFVKDSAVDKGHPNRSAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SLPPGLRIGPSGIPQAGLGVWNEASDLPLGLHFGPYEGRITEDEEAANNGYSWLITKGRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLPPGLRIGPSGIPQAGLGVWNEASDLPLGLHFGPYEGRITEDEEAANNGYSWLITKGRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CYEYVDGKDKSWANWMRYVNCARDDEEQNLVAFQYHRQIFYRTCRVIRPGCELLVWYGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CYEYVDGKDKSWANWMRYVNCARDDEEQNLVAFQYHRQIFYRTCRVIRPGCELLVWYGDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLSQHVERNHSSQNFPGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLSQHVERNHSSQNFPGPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLLNKRTWQREISRAFSSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLLNKRTWQREISRAFSSPP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAKVKYGECGQGFSVKSDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAKVKYGECGQGFSVKSDVI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 THQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 THQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 THTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 THTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EKPYVCRECGRGFSWQSVLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPY
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 VCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 CGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE2 FRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSDRSSLCYHQRTHTGEKPYVCREDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSDRSSLCYHQRTHTGEKPYVCREDE
850 860 870 880 890
>>CCDS45557.1 PRDM7 gene_id:11105|Hs108|chr16 (492 aa)
initn: 2445 init1: 2415 opt: 2415 Z-score: 1629.2 bits: 311.8 E(32554): 2e-84
Smith-Waterman score: 2417; 72.9% identity (82.8% similar) in 512 aa overlap (1-510:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSPEKSQEESPEEDTERTERKPMVKDAFKDISIYFTKEEWAEMGDWEKTRYRNVKRNYNA
::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS45 MSPERSQEESPEGDTERTERKPMVKDAFKDISIYFTKEEWAEMGDWEKTRYRNVKMNYNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LITIGLRATRPAFMCHRRQAIKLQVDDTEDSDEEWTPRQQVKPPWMALRVEQRKHQKGMP
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :: :::::::
CCDS45 LITVGLRATRPAFMCHRRQAIKLQVDDTEDSDEEWTPRQQVKPPWMAFRGEQSKHQKGMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KASFSNESSLKELSRTANLLNASGSEQAQKPVSPSGEASTSGQHSRLKLELRKKETERKM
::::.:::::.::: : ::::.: :::::::::: :::::::::::::::::.:::: ::
CCDS45 KASFNNESSLRELSGTPNLLNTSDSEQAQKPVSPPGEASTSGQHSRLKLELRRKETEGKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YSLRERKGHAYKEVSEPQDDDYLYCEMCQNFFIDSCAAHGPPTFVKDSAVDKGHPNRSAL
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YSLRERKGHAYKEISEPQDDDYLYCEMCQNFFIDSCAAHGPPTFVKDSAVDKGHPNRSAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SLPPGLRIGPSGIPQAGLGVWNEASDLPLGLHFGPYEGRITEDEEAANNGYSWLITKGRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS45 SLPPGLRIGPSGIPQAGLGVWNEASDLPLGLHFGPYEGRITEDEEAANSGYSWLITKGRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CYEYVDGKDKSWANWMRYVNCARDDEEQNLVAFQYHRQIFYRTCRVIRPGCELLVWYGDE
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS45 CYEYVDGKDKSSANWMRYVNCARDDEEQNLVAFQYHRQIFYRTCRVIRPGCELLVWSGDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLSQHVERNHSSQNFPGPS
:::::::. :.: : : . . ... . :: .:.. . :
CCDS45 YGQELGIR----------------SSIEPAESLGQAVNCWSGMGMSMARNWASSG--AAS
370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KE2 ARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRND-KTKGQEIKERSKLLNKRTWQREISRAFSSP
.:: . :....... ::. ..:. .. . . :: : .... ::.
CCDS45 GRK-----SSWQGENQSQRSIHVPHAVWPFQVKNFSVNMWNAITPLRTSQDHLQENFSNQ
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 PKGQMG-SCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAKVKYGECGQGFSVKSD
.: : :. ... : ::. .. :
CCDS45 RIPAQGIRIRSGNILIHAAVMTKPKVKRSKKGPNS
460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 VITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTH
>>CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (635 aa)
initn: 1909 init1: 1909 opt: 2093 Z-score: 1413.6 bits: 272.3 E(32554): 2e-72
Smith-Waterman score: 2093; 55.0% identity (76.2% similar) in 533 aa overlap (365-892:33-563)
340 350 360 370 380
pF1KE2 YHRQIFYRTCRVIRPGCELLVWYGDEYGQELGIKWGSK----WKKELM-AGREPKPEIHP
:. .: :. :. :. .: .:.::..
CCDS74 AAGLQGAPGGAEHPGRCGPGAVPRIRGSVVLAPRWRSSPAGGWSDPLFFGGADPEPELYL
10 20 30 40 50 60
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 CPSCCLAFSSQKFLSQHVERNHSSQNFPGPSARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRND
: : .:::::: ::: :: : :. .:: .: ::::...:: . . .:
CCDS74 DPFCPPGFSSQKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSD
70 80 90 100 110 120
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 KTKGQEIKERSKLLNKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNT
...: : : . : :: .: .. ::: ::. : : : : : .: :. .:. :: .:
CCDS74 QAEGPE-GEGAMPLFGRTKKRTLG-AFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEET
130 140 150 160 170 180
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 GKLFVGVGISRIAKVKYGECGQGFSVKSDVITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLI
::. . . .. :. :::: .:: .....::: :.::: ::: : .::: :. :
CCDS74 DKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLAR
190 200 210 220 230 240
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 HQRIHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRR
::. :.:::: :::::::::. .:.:. :.:::.:::::.: :::::::..: :. :::
CCDS74 HQKAHSGEKPIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRT
250 260 270 280 290 300
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 HTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLSHQRTHTGE
:.:::::::::::.:::..:... ::: : :: :: .:: ::: .: :.::::::.::
CCDS74 HSGEKPYVCRECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGE
310 320 330 340 350 360
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYV
:::.:.:::: : ...:..:::::. :::::: ::..::..: :. :.::::::::::
CCDS74 KPYACKECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYV
370 380 390 400 410 420
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 CRECGRGFRDKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCREC
: ::::: :::: ::: :.:::: ::..::::: ..:::. :::::.::::.:: ::
CCDS74 CGVCGRGFSLKSHLNRHQNIHSGEKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGEC
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:::::.::.:. :::::.::.::::::::::: ... :.::.: :. ::::.::.:: ::
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...:.: :.:.:. ::: ::::
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::. . . .. :. :::: .:: .....::: :.::: ::: : .::: :. :
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:::.:.:::: : ...:..:::::. :::::: ::..::..: :. :.::::::::::
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: ::::: :::: ::: :.:::: ::..::::: ..:::. :::::.::::.:: ::
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:::::.::.:. :::::.::.::::::::::: ... :.::.: :. ::::.::.:: ::
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::. . . .. :. :::: .:: .....::: :.::: ::: : .::: :. :
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::. :.:::: :::::::::. .:.:. :.:::.:::::.: :::::::..: :. :::
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CCDS74 GNKSALITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKS
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CCDS63 RTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSALITHKRAHS
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::: ::::
CCDS63 EEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRHRKTTSVHHR
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: :. .:: .: ::::...:: . . .:...: : : . : :: .:
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.:: .....::: :.::: ::: : .::: :. : ::. :.:::: :::::::::.
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. ::: : :: :: .:: ::: .: :.::::::.:::::.:.:::: : ...:..::
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:::. :::::: ::..::..: :. :.::::::::::: ::::: :::: ::: :.
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:::: ::..::::: ..:::. :::::.::::.:: :::::::.::.:. :::::.::.:
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:::::::::: ... :.::.: :. ::::.::.:: ::...:.: :.:.:. ::: :::
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pF1KE2 EDE
:
CCDS63 ECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRHRKTTSVHHRLPVQPDPE
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CCDS63 FSKPELITQLEQGKETWREEKKCSPATCPADPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLCNH
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.:: .....::: :.::: ::: : .::: :. : ::. :.:::: :::::::::.
CCDS63 SFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGFNR
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CCDS63 KSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKSAV
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pF1KE2 LTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQ
. ::: : :: :: .:: ::: .: :.::::::.:::::.:.:::: : ...:..::
CCDS63 VRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVNHQ
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pF1KE2 EDE
:
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CCDS74 QRTH
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pF1KE2 RVIRPGCELLVWYGDEYGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLS
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CCDS13 QHVL-----QIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKPW
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pF1KE2 NKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAK
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CCDS13 SARTEERETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDK-----GLKELET
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CCDS13 LRFGAINCREYEPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEK
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 PYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVC
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CCDS13 PYVCSECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVC
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CCDS13 SECGRGFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECG
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CCDS13 QRTH
894 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]