Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2134
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2134, 858 aa
1>>>pF1KE2134 858 - 858 aa - 858 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5266+/-0.00132; mu= 13.7744+/- 0.078
mean_var=110.3684+/-22.643, 0's: 0 Z-trim(101.8): 167 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.122082
statistics sampled from 6490 (6679) to 6490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 3.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 5692 1014.9 0
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 653 127.5 1.2e-28
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 653 127.5 1.2e-28
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049) 626 122.7 3.3e-27
CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3 (1032) 521 104.2 1.2e-21
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 449 91.5 6.4e-18
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 401 83.0 2.3e-15
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 ( 839) 388 80.7 1.2e-14
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 356 75.0 4.2e-13
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 357 75.3 4.8e-13
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 328 70.1 1.4e-11
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 328 70.1 1.4e-11
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 ( 593) 323 69.2 2.4e-11
>>CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 (858 aa)
initn: 5692 init1: 5692 opt: 5692 Z-score: 5425.3 bits: 1014.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5692; 99.8% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGDHLDLLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTTERLLLSFNYIRT
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CCDS31 MGDHLDLLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTTERLLLSFNYIRT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VTASSFPFLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTASSFPFLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QIFLVCEHELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QIFLVCEHELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHLDLSHGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHLDLSHGFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIADEAFYGLDNLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIADEAFYGLDNLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KVAYIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KVAYIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 INLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 INLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GENMLQLAWETELCWDVFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GENMLQLAWETELCWDVFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LSHNDLPANLEILDISRNQLLAPNPDVFVSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLNHTNVT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS31 LSHNDLPANLEILDISRNQLLAPNPDVFVSLSVLDITHNKFICECELSTFINWLNHTNVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IAGPPADIYCVYPDSLSGVSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTV
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAGPPADIYCVYPDSFSGVSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 DQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SDLNSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDLNSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKE
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE2 KEKKKDNNIPLQTVATIS
::::::::::::::::::
CCDS31 KEKKKDNNIPLQTVATIS
850
>>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041 aa)
initn: 303 init1: 134 opt: 653 Z-score: 627.6 bits: 127.5 E(32554): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 699; 27.1% identity (56.5% similar) in 874 aa overlap (35-847:210-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LDLLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTTER-LLLSFNYIRTVTA
: .:..:: : .. : :.:: . :. ..
CCDS14 NCYFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQIKYISE
180 190 200 210 220 230
70 80 90 100
pF1KE2 SSFPFLEQLQLLELGSQ-----YTP-----------LTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKI
.: : .: ::.:... .: ..::. ::.:: .:: :.:.:...
CCDS14 EDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSL
240 250 260 270 280 290
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 YFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLY-----L
.. :... :: : : : : . . ... : : :::: : :.. : .
CCDS14 RKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINI
300 310 320 330 340 350
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 HPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPL-QGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMN
.:.:: ::... . . . . : ...:: : .:: ..:. : . . .:. : ..
CCDS14 SRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQ---IDF-KLFQ
360 370 380 390 400 410
230 240 250 260 270
pF1KE2 PFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIM---GAGFGFHNIKDPD
: : :::. .: : . .. . .. ..:..:. .:: .. : : ::
CCDS14 NFSN--LEIIYLSENRIS-PLVKDTRQSYANSSSFQ----RHIRKRRSTDFEF----DPH
420 430 440 450 460
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 QNTFAGLARSSVRHLDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIADEAFYGLDNL
.: : ..: .. ..: :.:.:. :.: :. . : .: ..
CCDS14 SN-FYHFTRPLIKPQCAAYG----------------KALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDI
470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 QVLNLSYNLLGELYS-SNFYGLPKVAYIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDN---
:::: : ... : ..: ..:.: :.:: .:.. . . ... : :..::: :
CCDS14 ACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHY
510 520 530 540 550 560
400 410 420 430
pF1KE2 ---ALTTIH--FIPSIPDIF---LSGNKLVTLP-KINL-TANLIHL--SENRLENL----
: .: : :: .. .. :: :.. :: : :: . .:..: : :::. :
CCDS14 FRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDD
570 580 590 600 610 620
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 DILYFLLR--VPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWD
: :. . . .: : :. ::.. .. . :: .: ...:::.. . :
CCDS14 DNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKF-----FNWT
630 640 650 660 670 680
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 VFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLP--ANLEILD
... . .:..: : : : : .. . ..:: : :. ::.. : . : ..:. ::
CCDS14 LLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLD
690 700 710 720 730 740
560 570 580 590 600
pF1KE2 ISRNQLLAPNPDVF-----VSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLN-HTNVTIAGPP-AD
.: : : . : ... ..::.:.. : : : :... : :.. : :: : : .:
CCDS14 LSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKI--PRLVD
750 760 770 780 790 800
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IYCVYPDSLSGVSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFC
. :. : . : :. :: : . . : : :.. :. ... :. :
CCDS14 VICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFI----TTMVMLAALAHHLFYWDV
810 820 830 840 850
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFT---WVQNALLKHLDTQYSDQNR
.. :.. : : . . . . . ::::. ...:: . :: : : ::. . :.:
CCDS14 WFIYNVCLAKV-KGYRSLSTSQTF-YDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLE-ESRDKNV
860 870 880 890 900 910
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLE-AFSYAQGRCLSDL
. ::.::::. :: : :....: .:.: : ...... .. : .. :: : : ...
CCDS14 L-LCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKS-WNFKTAFYLALQRLMDEN
920 930 940 950 960 970
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 NSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEK
...:.... . :.. .. .: . :.. :.::.. . : : . : . .: :...
CCDS14 MDVIIFILLEPVLQHS--QYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLT-ENDS
980 990 1000 1010 1020
850
pF1KE2 KKDNNIPLQTVATIS
. .:
CCDS14 RYNNMYVDSIKQY
1030 1040
>>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059 aa)
initn: 303 init1: 134 opt: 653 Z-score: 627.5 bits: 127.5 E(32554): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 699; 27.1% identity (56.5% similar) in 874 aa overlap (35-847:228-1050)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LDLLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTTER-LLLSFNYIRTVTA
: .:..:: : .. : :.:: . :. ..
CCDS14 NCYFNKVCEKTNIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQIKYISE
200 210 220 230 240 250
70 80 90 100
pF1KE2 SSFPFLEQLQLLELGSQ-----YTP-----------LTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKI
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CCDS14 EDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSL
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 YFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLY-----L
.. :... :: : : : : . . ... : : :::: : :.. : .
CCDS14 RKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYPQHINI
320 330 340 350 360 370
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 HPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPL-QGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMN
.:.:: ::... . . . . : ...:: : .:: ..:. : . . .:. : ..
CCDS14 SRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQ---IDF-KLFQ
380 390 400 410 420 430
230 240 250 260 270
pF1KE2 PFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIM---GAGFGFHNIKDPD
: : :::. .: : . .. . .. ..:..:. .:: .. : : ::
CCDS14 NFSN--LEIIYLSENRIS-PLVKDTRQSYANSSSFQ----RHIRKRRSTDFEF----DPH
440 450 460 470 480
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 QNTFAGLARSSVRHLDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIADEAFYGLDNL
.: : ..: .. ..: :.:.:. :.: :. . : .: ..
CCDS14 SN-FYHFTRPLIKPQCAAYG----------------KALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDI
490 500 510 520
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 QVLNLSYNLLGELYS-SNFYGLPKVAYIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDN---
:::: : ... : ..: ..:.: :.:: .:.. . . ... : :..::: :
CCDS14 ACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHY
530 540 550 560 570 580
400 410 420 430
pF1KE2 ---ALTTIH--FIPSIPDIF---LSGNKLVTLP-KINL-TANLIHL--SENRLENL----
: .: : :: .. .. :: :.. :: : :: . .:..: : :::. :
CCDS14 FRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDD
590 600 610 620 630 640
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 DILYFLLR--VPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWD
: :. . . .: : :. ::.. .. . :: .: ...:::.. . :
CCDS14 DNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKF-----FNWT
650 660 670 680 690 700
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 VFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLP--ANLEILD
... . .:..: : : : : .. . ..:: : :. ::.. : . : ..:. ::
CCDS14 LLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLD
710 720 730 740 750 760
560 570 580 590 600
pF1KE2 ISRNQLLAPNPDVF-----VSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLN-HTNVTIAGPP-AD
.: : : . : ... ..::.:.. : : : :... : :.. : :: : : .:
CCDS14 LSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKI--PRLVD
770 780 790 800 810
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IYCVYPDSLSGVSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFC
. :. : . : :. :: : . . : : :.. :. ... :. :
CCDS14 VICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFI----TTMVMLAALAHHLFYWDV
820 830 840 850 860 870
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFT---WVQNALLKHLDTQYSDQNR
.. :.. : : . . . . . ::::. ...:: . :: : : ::. . :.:
CCDS14 WFIYNVCLAKV-KGYRSLSTSQTF-YDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLE-ESRDKNV
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730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLE-AFSYAQGRCLSDL
. ::.::::. :: : :....: .:.: : ...... .. : .. :: : : ...
CCDS14 L-LCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKS-WNFKTAFYLALQRLMDEN
940 950 960 970 980
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pF1KE2 NSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEK
...:.... . :.. .. .: . :.. :.::.. . : : . : . .: :...
CCDS14 MDVIIFILLEPVLQHS--QYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLT-ENDS
990 1000 1010 1020 1030 1040
850
pF1KE2 KKDNNIPLQTVATIS
. .:
CCDS14 RYNNMYVDSIKQY
1050
>>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049 aa)
initn: 412 init1: 178 opt: 626 Z-score: 601.9 bits: 122.7 E(32554): 3.3e-27
Smith-Waterman score: 750; 26.9% identity (57.1% similar) in 856 aa overlap (37-836:215-1033)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTT-ERLLLSFNYIRTVTASS
:.: :: :: .: .: : :.: . ..
CCDS14 YRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKIQEDD
190 200 210 220 230 240
70 80 90 100
pF1KE2 FPFLEQLQLLELGSQ----Y------------TPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYF
: :.:::.:.:... : .:: : .:: : .:..: : :...
CCDS14 FNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQH
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110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKN---QIR--SLYLHP
. : :... .: :: : :. . ... : .: .:::: : :. :. :
CCDS14 VPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQ
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170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQG-KTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPF
.:..:.::: . . . . . .: ::.. ..: ..:..: . . .... : .. .
CCDS14 AFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTN-FIKIANLSMFKQFKRL
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230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFS---LILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQN
. . : . .: .: . .. : ::: .. ... : :.. .. .
CCDS14 KVIDLSVNKISPSGDSSEV-GFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNKEA
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 TFAGLARSSVRH---LDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINK-IADEAFYGLD
.: .. .: .. ::::.. .: ..: :. :. :: :::. : :.. . : :
CCDS14 SFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLA
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pF1KE2 NLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLPKVAYIDLQKN-HI----AIIQDQTF-KFLEKLQTLD
.:. :..: : : :.:. : : :. .:...: : .: . .: : :. :: :
CCDS14 ELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLM
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pF1KE2 LRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLP-KINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPH
. :: .. : . . ...: :: . : : . ..:: :... ::.. .
CCDS14 MNDNDIS------SSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRY--LQLFKNLLKLEE
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pF1KE2 LQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQ-LAWETELCWDVFEGLSHLQVLY
:.: ..: .: . . :.:..: :..: :. ..:. : :..:..:
CCDS14 LDI---SKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQC------LKNLETLD
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pF1KE2 LNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEI--LDISRN--QLLAPN
:.:: :...: . . .:..: :..:.. :.. : ... ::.: : :.. .
CCDS14 LSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKT
710 720 730 740 750 760
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pF1KE2 --PD-VFVSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTIAGPPADIYCVYPDSLSGVSL
:. :. .:..: . ::.:.: :. :. :.:::.::: .:. :: : . .: :.
CCDS14 SFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSV
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pF1KE2 FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFR--------GFCFICYKT
.::. : : .. . . ::: .....::::...:.... :: :
CCDS14 ISLDLYTC-ELDLTNLILFSL----SISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKG
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pF1KE2 AQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKD---FTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFE
:::. :: :::.. ...:: :: :. .:. ...::::.:
CCDS14 YQRLI--------SPDCC-YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPR--EKHFNLCLE
890 900 910 920
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pF1KE2 ERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMV
:::..::. . :....: :.: : ... .. . :: .. : ... ...:..
CCDS14 ERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILI
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pF1KE2 VVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIP
. . .: : ..: . .. :.:: . : .: . :.. .
CCDS14 FLE--KPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE
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pF1KE2 LQTVATIS
CCDS14 TV
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.. ::: ::. : .. : ::::.: : ..
CCDS28 NCYYKNPCRQALEVAPGALLGLGNLTHLSLKYNNLTVVPRNLPSSLEYLLLSYNRIVKLA
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.. : :..:..:.. ..: . ..: .: :. : : .:..
CCDS28 PEDLANLTALRVLDVGGNCRRCDHAPNPCMECPRHFPQLHPDTFSHLSRLEGLVLKDSSL
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.:. . :.:: .: : : : . : :..: : .:.:: : : : . :
CCDS28 SWLNASWFRGLGNLRVLDLSENFLYKCITKTKAFQGLTQLRKLNLSFNYQKRVSFAHLSL
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::::.: .:: .:. . . . : :.:: . :. . : : . ..... . .
CCDS28 APSFGSLVALKELDMHGIFFRSLDETTLRPLARLPMLQTLRLQMN-FINQAQLGIFRAFP
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.: . : .:: . ..:.....: . ... .. . .. . :...
CCDS28 GLRYVDLSDNRISGAS---ELTATMGEADGGEKVW-------LQPGDLAPAPVDTPSSED
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: . ::::.. . ... ..: :. :. : :..: :.. . : : .:::
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:.::.: : . .: ::.. .::. : . .: ..:.:. .:.:: . : .
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.:: .. . . : ..: .....: : :. .:. : :.:. . : : :
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CCDS28 SQNRLHTLL-PQTLRNLPKSLQVLRLRDNYLAF-----FKWWSLHFLPKLEVLDLAGNQL
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..: : . : :: :... : .. .. . . :. :..: : : . . . :
CCDS28 KALTNGSLPAGTRLRRLDVSCNSISFVAPGFFSKAKELRELNLSANALKTVDHSWFGPLA
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.:..::.. : . : : ..:...: ...... : :. . : : .:.:.:.:. . .
CCDS28 SALQILDVSANPLHCACG-AAFMDFLLEVQAAVPGLPSRVKCGSPGQLQGLSIFAQDLRL
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pF1KE2 C-DEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCF-ICYKTAQRLVFKDHPQGT
: :: . .::. : .. : . .. : . .:: .: : .. . .:
CCDS28 CLDEALSWDCFALSLLAV-ALGLGVPMLHHLCGWDLW-YCFHLCL---AWLPWRGRQSGR
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pF1KE2 EPDMYKYDAYLCFSSKDFT---WVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIAN
. : :::.. :.. . . :: : : .:. . . . ::.::::..::.. . :
CCDS28 DEDALPYDAFVVFDKTQSAVADWVYNELRGQLE-ECRGRWALRLCLEERDWLPGKTLFEN
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pF1KE2 IQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEA-FSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQLMK
. ....::: . .: : : . :.: : :: : : : ......:... .. . .
CCDS28 LWASVYGSRKTL-FVLAHTDRVSGLLRASFLLAQQRLLEDRKDVVVLVILSPDGRRS--R
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pF1KE2 HQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
. .: . .:. : ::
CCDS28 YVRLRQRLCRQSVLLWPHQPSGQRSFWAQLGMALTRDNHHFYNRNFCQGPTAE
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CCDS33 ELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTV----
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CCDS33 NLKHLDLSFNAFDALPICK-EFGNM--SQLKFLGLSTTHL-EKSSVLPIAHLN-----IS
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CCDS33 KVLLVLGETYGEKEDPEG--------LQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLE
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:... . : . .. .:. ... . :..: . :. ..:.. .: . ... ..
CCDS33 LSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWH--TTVWY
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...: .: :.: .: :. .. ..... . ... :. .... ... .. ..
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.:.. :: . :: . .: .. : ::.: :.:..:. : .
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.. :: : ..:: : : . :: .: .. :.: :. .:. : ..
CCDS33 QMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNIL-----TDT---IFRCLPPRI
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.:: :. : ..:.: : . : ::. :.. : :: : ..: .: :..:.. :.
CCDS33 KVLDLHSNKIKSIPKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPS
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: : : . . : : : :::. :.. ..... . : : . : ::.: :.
CCDS33 ADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTL
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: : .: .:. .. .. ..... .::.: : . : . . . ..: : :
CCDS33 LKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL-AVTVTS-LCSYLDLPWY--LRMVCQWTQTRRR
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.. : .. :.. .:..: ::.: :: .:. .. ...:..::.::::.
CCDS33 ARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE-----KEGMQICLHERNFVPGK
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pF1KE2 NRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQY
. . :: : .: : . ..: .:... :: . .:. . . ...::.... . ::
CCDS33 SIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQY
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pF1KE2 QL-MKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATI
.. ......... .. ::.::.. . : : .: : : :. :
CCDS33 SIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK
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pF1KE2 S
>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 (796 aa)
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pF1KE2 TASSFPFLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAFRNLP-NLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFH
..:: . ..::.... : :. . .. : .
CCDS34 MIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSE
20 30 40 50 60 70
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pF1KE2 LFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSN
: ::: .. .: . :. . : ::::.::.... :: . :.. .:.: :
CCDS34 LTVLRLSHNRIQ--LLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHP----IVSFRHLDLSFN
80 90 100 110 120 130
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pF1KE2 --QIFLVCEH--ELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGN
. . .:.. .: :. :: ..: .: . . . . .::. .. . .
CCDS34 DFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIK--ENETE
140 150 160 170 180
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pF1KE2 GWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAG-FGFHNIKDPDQNT------FAGLAR-S
. . . .. .. .. :.. . . : . . ::: :.: .. :.: :
CCDS34 SLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 SVRHLDLSH-GFVFSLNSRVFETL--KDLKVLNLAYNK--INKIADEAF-YGLDNLQVLN
.. .. :.: ... :::. : : .. ::. :: :..: .: : :. .:..:.
CCDS34 TLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNI-YNLTIIESIREEDFTYSKTTLKALT
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 LSYNLLGELYSSNFYGLPKVA-YIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHF
. : ... . . ..: : ... .: .. . :.. : .: .:..:
CCDS34 I------EHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCP-----HAPSTFKF
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pF1KE2 IPSIPDIFLSG--NKLVTLPKINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLR-VPHLQILILNQN
. ..: .. .: :: :.. .:: :..: :..: . .. . .: :.:: .. :
CCDS34 LNFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLE---TLI-LQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWN
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 RFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLS-HLQVLYLNHNYLNSL
. : .. . :. : :. ::: :. .::. : ...:: :. : ..:.
CCDS34 SLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNML-----TD---SVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSV
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pF1KE2 PPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEILDISRNQLLAPNPDVFVS---LSVL
: : . : ::. :.. : :: : ..: .: :..:.. :. : : : . .
CCDS34 PKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSI
470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 DITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTI-AGPPADIYCVYPDSLSGVSL--FSLSTEGCDE
: : : ::: :.. ..... . : : . : ::.: : : : .: .:.
CCDS34 KAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNI
530 540 550 560 570 580
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pF1KE2 EEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMY
.. .. ..... .::.: . . . .: ..: : : .. :
CCDS34 TLLIVTIGATMLVL-AVTVTSLCIYLDLPWYLR---MVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNL
590 600 610 620 630 640
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 KYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNS
.. :.. .: .: .::.. :. .:. .. ...:..::.::::.. . :: . : .:
CCDS34 QFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLE-----KEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKS
650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 RKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL-MKHQSIRGFV
: . ..: .:... :: . .:. . . .. ::.... . : .. :........
CCDS34 YKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALM
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850
pF1KE2 QKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
.. ::.::.. . : :
CCDS34 TQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
760 770 780 790
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10 20 30 40 50 60
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:. ..:. : .:. : :::: .: . . :
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: . .::.:.: :. ::. :...: .: : : .. : : ::.:: : .:
CCDS68 FFSFPELQVLDL-SRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALGAFSGLSSLQKLV
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130 140 150 160 170 180
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.: : :.. . .::.: .:....: :.:. : :..:..:. .:.:::.: .
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140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
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.:. :. : .:: .:.. . ..: :... :. : . .: ....
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200 210 220 230 240
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. .... .. :.:.. . . : :.. :.... :: ..... :.. . . :
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.. . :. : ... ..:. :... : .. .: ..:...: ... . :
CCDS68 DDIIDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLT
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..:: : ::.. ..::..: ... .:. .:. ::: :.. :
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. . ::. ..: : . .:: ..:: . . .: : .: . : . . .. :.
CCDS68 --MSSNFLGLEQLEHLDFQH--SNLKQMSEFSVFLSLRNLIYL-DISHTHTRVAFNGIFN
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. : ::: : .. : .: .. :.: : .: : :.. :..: : .
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:. :..:. :... : . .: . .: .:..:: : :.... . . . ::.
CCDS68 FNSLSSLQVLNMSHNNF--FSLDTFPYKCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAF
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
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:..:.: : : :: ..:..:.. .. . :. :.. .:. ..::. :. ..
CCDS68 LNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLV-EVERMECATPSDKQGMPVLSLNIT-CQMNK
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 VLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKY
. :. . .:.........: .. : : . : . . : ..:
CCDS68 T---------IIGVSVLSVLVVSVVAVLVYK-FYFHLMLLAGCIKY-----GRGENIY--
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::.. .::.: ::.: :.:.:. :.::.. :::.:: ::: .... .::
CCDS68 DAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPP---FQLCLHYRDFIPGVAIAANIIHEGFHKSR
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pF1KE2 KIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQK
:.. .::.::... ::. . :: . . ...:..:. .. . : .. . ....
CCDS68 KVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLRQQVELYRLLSR
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pF1KE2 QQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
. ::.: ... : ..: . .:
CCDS68 NTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
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CCDS33 LKTLRLSRNKITHLPGALLDKMVLLEQLFLDHNALRGIDQNMFQKLV--NLQELALNQNQ
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. : . .: .:..::.:.:. :..... . . .:. : : : : : :. . .:
CCDS33 LDFLPASLFTNLENLKLLDLSGNNLTHLPKGLLGAQAKLERLLLHSNRLVSLDSGLLNSL
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.. .....::: : .: : .:..: : : :. :.:: .:: ..
CCDS33 GALTELQFHRNHIRSIAPGAFDRLPNLSSLTLSRNHLA---FLPSA--LFLHSH------
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::: :. : :: : .: . : .. :: : ::.... . :. .: .:
CCDS33 --NLT--LLTLFENPLAELPGVLFG-EMGGLQELWLNRTQLRT-----LPAAAFRNLSRL
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.:: .. . : .:.::..:::: :. : :..:: :.. : :: .:: ::
CCDS33 RYLGVTLSPRL--SALPQGAFQGLGELQVLALHSNGLTALPDGLLRGLGKLRQVSLRRNR
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: .: . . ..:: .....::: . ::: .: : . ::.. :.: :. :..
CCDS33 LRALPRALFRNLSSLESVQLDHNQLETLPGDVFGALPRLTEVLLGHNSWRCDCGLGPFLG
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:: . ..: :: :. : . .:. :..: : : :
CCDS33 WLRQHLGLVGGEEPP---RCAGPGAHAGLPLWALP--GGDAECPGPRGPPPRPAADSSSE
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CCDS33 APVHPALAPNSSEPWVWAQPVTTGKGQDHSPFWGFYFLLLAVQAMITVIIVFAMIKIGQL
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CCDS37 IISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQ
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: . ::. : : :. : .. :.:..: : .: : . ::. :....:. :..:: :.
CCDS37 RCV-NLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN--LSSSWFKPLSSLTFLN
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CCDS37 LLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK--DFAGLTFLEELEIDASDLQS
140 150 160 170 180
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pF1KE2 RVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFG
: .. ..:. :: .. . ..: : .. :. . . :
CCDS37 YEP----KSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEI---FVDVTSSVECLEL------------
190 200 210 220
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pF1KE2 FHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHL-DLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIAD
.: : .:: :. .:: : . :: .. :....:. . . .. :. .
CCDS37 ----RDTDLDTF---------HFSELSTGETNSLIKKF--TFRNVKITDESLFQVMKLLN
230 240 250 260 270
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. . :: .:. . . : .:.. .:. . : :: . ... :: .. : . ..
CCDS37 Q-ISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYS
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. :... . ... . . ..: . :: ..: .: ..:. :: . :. :.:
CCDS37 LTERVKRITVEN---SKVFLVPCL----LS-QHLKSLEYLDLSENL--MVEEYLKNSACE
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: :: ::: ::...: . .: .: .. ...: .. :: : :
CCDS37 DAW---PSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHSMPET--CQWPEKM
390 400 410 420 430
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. .:: : :..: ...: :: .:: .: :. : .. :.: .:
CCDS37 KYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLN-----LFSLNLPQLKELYISRNKLMTLP
440 450 460 470 480 490
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CCDS37 DASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAK
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CCDS37 VLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL-------LILLTG
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CCDS37 RLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAI
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pF1KE2 LKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
CCDS37 KS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]