Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2116
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2116, 875 aa
1>>>pF1KE2116 875 - 875 aa - 875 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1025+/-0.00121; mu= 17.2727+/- 0.073
mean_var=86.1773+/-16.836, 0's: 0 Z-trim(103.3): 55 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.138159
statistics sampled from 7290 (7343) to 7290 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 3.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 5775 1161.9 0
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 5695 1146.0 0
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 5607 1128.4 0
CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049) 1029 216.0 2.9e-55
CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057) 1022 214.6 7.6e-55
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 960 202.2 4e-51
CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022) 802 170.7 1.2e-41
CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024) 801 170.5 1.3e-41
CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 ( 986) 752 160.8 1.1e-38
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 732 156.6 8.9e-38
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 732 156.7 1.4e-37
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 732 156.7 1.6e-37
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 717 153.7 1.2e-36
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 717 153.8 1.3e-36
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 717 153.8 1.3e-36
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 717 153.8 1.4e-36
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 717 153.8 1.4e-36
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 717 153.8 1.4e-36
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 717 153.8 1.4e-36
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 710 152.3 3e-36
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 710 152.4 3.4e-36
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 710 152.4 3.5e-36
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 700 150.4 1.4e-35
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 696 149.5 2e-35
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 696 149.5 2.1e-35
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 693 149.0 3.6e-35
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 701 150.9 4.6e-35
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 693 149.1 4.8e-35
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 693 149.1 5e-35
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 693 149.1 5e-35
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 681 146.5 1.6e-34
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 670 144.5 1.1e-33
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 670 144.5 1.4e-33
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 656 141.6 6.1e-33
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 656 141.6 7.1e-33
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 643 139.1 5.8e-32
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 643 139.1 5.9e-32
CCDS60541.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 ( 979) 553 121.1 9.8e-27
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 479 106.3 2.2e-22
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 479 106.3 2.2e-22
CCDS63145.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (1722) 453 101.3 1.6e-20
CCDS33391.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (1992) 453 101.3 1.8e-20
CCDS63146.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (2040) 453 101.3 1.8e-20
CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15 (4861) 409 92.8 1.7e-17
CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834) 405 92.0 2.9e-17
CCDS41939.1 HECTD1 gene_id:25831|Hs108|chr14 (2610) 396 90.0 5.9e-17
CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14 ( 823) 377 86.0 3.1e-16
CCDS64946.1 UBR5 gene_id:51366|Hs108|chr8 (2798) 359 82.7 1e-14
CCDS34933.1 UBR5 gene_id:51366|Hs108|chr8 (2799) 359 82.7 1e-14
CCDS41318.1 HECTD3 gene_id:79654|Hs108|chr1 ( 861) 312 73.0 2.5e-12
>>CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (875 aa)
initn: 5775 init1: 5775 opt: 5775 Z-score: 6219.4 bits: 1161.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5775; 100.0% identity (100.0% similar) in 875 aa overlap (1-875:1-875)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEKLHQCYWKSGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MEKLHQCYWKSGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE2 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
850 860 870
>>CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (872 aa)
initn: 5695 init1: 5695 opt: 5695 Z-score: 6133.2 bits: 1146.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5695; 99.9% identity (100.0% similar) in 866 aa overlap (10-875:7-872)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEKLHQCYWKSGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MATACKRSGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS
780 790 800 810 820 830
850 860 870
pF1KE2 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
840 850 860 870
>>CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (852 aa)
initn: 5607 init1: 5607 opt: 5607 Z-score: 6038.6 bits: 1128.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5607; 100.0% identity (100.0% similar) in 852 aa overlap (24-875:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEKLHQCYWKSGEPQSDDIEASRMKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKRAAAKHLIERYYHQLTEGCGNEACTNEFCASCPTF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LRMDNNAAAIKALELYKINAKLCDPHPSKKGASSAYLENSKGAPNNSCSEIKMNKKGARI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFKDVTYLTEEKVYEILELCREREDYSPLIRVIGRVFSSAEALVQSFRKVKQHTKEELKS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQAKDEDKDEDEKEKAACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVYTRLLSNEKIETAFLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLHSPE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLEMALPLFCKAMSKLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNEFNSRN
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK
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CCDS32 LVNDDDAIVAASKCLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELTLQELLGEERRNK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC
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CCDS32 KGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTC
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL
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CCDS32 PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW
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CCDS32 EMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFW
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ
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CCDS32 FNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQ
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY
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CCDS32 SLKDLLEYEGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDY
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGY
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTS
760 770 780 790 800 810
850 860 870
pF1KE2 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
820 830 840 850
>>CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049 aa)
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Smith-Waterman score: 1029; 37.9% identity (67.9% similar) in 446 aa overlap (443-875:610-1049)
420 430 440 450 460
pF1KE2 LGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYT------F
.: ...: . ..:.... .::
CCDS72 PSERRIFNSFLHTALKVLEILHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQA
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470 480 490 500 510 520
pF1KE2 FKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRMY-----SERR-ITVLYSLVQGQQLN
. . .. .. : ::...: .:. : : ..: ..:. .. :. : ...:
CCDS72 YGMLADIPVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF-LPVIESVN
640 650 660 670 680 690
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pF1KE2 PYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVE
: : : :::..:. :: .:.. . : :: : : : ::..:: ::: :::: :...
CCDS72 PCLILVVRRENIVGDA---MEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMR
700 710 720 730 740 750
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRK
:...: ::: : :...:.::. ..:: : :::.. :::::: :.:.:::...:.:
CCDS72 ELLDPKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKK
760 770 780 790 800 810
650 660 670 680 690
pF1KE2 LMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEY-EGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKEN
:. :: .. :: . : . .:...::.: : ..:. . ..: :. .. :: . .: :
CCDS72 LLKKKPSLDDLKELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTIT-VENFGATEVKELVLN
820 830 840 850 860 870
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 GDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLI
: ....::.:::. : :::.:::: . : ::. ::: : . . : ::.:.:.. ..
CCDS72 GADTAVNKQNRQEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVL-LLFQPNELQAMV
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pF1KE2 CGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGG
:. : :.. ::..::: : : . :. :::. : . :.:. :: : ::.:: :. :
CCDS72 IGNTNYDWKELEKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILG
940 950 960 970 980 990
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 LGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
. .::..: ..: : ::.::::::.: ::.:. :: :. .:..:: . .::...
CCDS72 MKSLKLVIQSTGGGEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057 aa)
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Smith-Waterman score: 1022; 38.6% identity (68.5% similar) in 435 aa overlap (448-875:630-1057)
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pF1KE2 RNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSF
..:: ... :: .. . .. .. ..
CCDS41 LHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMDVNHGLTEL-ADIPVTI
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pF1KE2 MTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRMY-----SERR-ITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDH
: ::...: .:. : : ..: ..:. .. :. : ...:: : : :::..
CCDS41 CTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLF-LPVIESVNPCLILVVRREN
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pF1KE2 IIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFT
:. ::. :.. . : :: : : : ::..:: ::: :::: :...:...: :::
CCDS41 IVGDAM---EVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMFR
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600 610 620 630 640 650
pF1KE2 YDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDL
: :...:.::. ..:: : :::.. :::::: :.:.:::...:.::. :: .. ::
CCDS41 YYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKKKPSLDDL
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pF1KE2 GDSHPVLYQSLKDLLEY-EGNVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENR
. : . .:...::.: : ..:. . ..: :. .. :: . .: :: ....::
CCDS41 KELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTIT-VENFGATEVKELVLNGADTAVNKQNR
840 850 860 870 880 890
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pF1KE2 KEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQAL
.:::. : :::.:::: . : ::. ::: : . . : ::.:.:.. .. :. : :.. :
CCDS41 QEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVL-LLFQPNELQAMVIGNTNYDWKEL
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pF1KE2 EETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKN
:..::: : : . :. :::. : . :.:. :: : ::.:: :. :. .::..: ..
CCDS41 EKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQST
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pF1KE2 GPDTERLPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
: : ::.::::::.: ::.:. :: :. .:..:: . .::...
CCDS41 GGGEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
1020 1030 1040 1050
>>CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050 aa)
initn: 898 init1: 507 opt: 960 Z-score: 1031.4 bits: 202.2 E(32554): 4e-51
Smith-Waterman score: 966; 30.5% identity (59.3% similar) in 659 aa overlap (226-874:450-1049)
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 AACSAAAMEEDSEASSSRIGDSSQGDNNLQKLGPDDVSVDIDAIRRVYTRLLSNEKIETA
: .: ..:... : .. .:.... ..
CCDS34 ANTINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQ--HSM
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260 270 280 290 300 310
pF1KE2 FLNALVYLSPNVECDLTYHNVYSRDPNYLNLFIIVMENRNLH-SPEYLEMALPLFCKAMS
.:. . :. : . . : . . ...:. : :. : :. ...:: :.
CCDS34 ILEQI--LNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPL-AMAIL
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pF1KE2 KLPLAAQGKLIRLWSKYNADQIRRMMETFQQLITYKVISNE-FNSRNLVNDDDAIVAASK
.: . : ::. . .... .. . : . . . : : :. :.:: :
CCDS34 RLDTNPSKVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVLYLLRGRKTFLIPVLFNN--YITAALK
540 550 560 570 580 590
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 CLKMVYYANVVGGEVDTNHNEEDDEEPIPESSELT-LQELLGEERRNKKGPRVDPLETEL
:. .: .: . ..: : : ::: :.:. .:: : : :
CCDS34 LLEKLYKVN-----LKVKHVEYDTFY-IPEISNLVDIQE--------------DYLMWFL
600 610 620 630
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pF1KE2 GVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLEMDKDYTFFKVETENKFSFMTCPFILNAVTKNLG
. : .: .. .. . :::..: .:.
CCDS34 HQAGMKARPSII---------------------------QDTVTLCSYPFIFDAQAKTKM
640 650 660
500 510 520 530 540
pF1KE2 LYYDNRIRMY------SERRITVLYSLVQGQQLNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAME
: : ...: . . . .: .: .:.: :.:::.... ::: .: ...
CCDS34 LQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALREL---SIH
670 680 690 700 710 720
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pF1KE2 NPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGGVSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSF
. :::: : : :.::..:: :::.:::: :...:..:: ::::: ....:.::. . :
CCDS34 SDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCF
730 740 750 760 770 780
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLL
.. : ::::. ::::::. ..:.:::...:.::.. : ..:: . :. .::..::
CCDS34 VEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELL
790 800 810 820 830 840
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EYEG-NVEDDMMITFQISQTDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKS
.: : .::. . ..: : . . .: . : .::.. . ..::.:::. : .:... :
CCDS34 DYPGEDVEETFCLNFTICR-ESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQIS
850 860 870 880 890 900
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 VEKQFKAFRRGFHMVTNESPLKYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSV
:.. . :: :: : . . :. ::.: :.. .. :. : ... ::::. : : :.
CCDS34 VHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLE-LFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
910 920 930 940 950 960
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pF1KE2 LIREFWEIVHSFTDEQKRLFLQFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTERLPTSHTCFN
.. ::: : : :.:. :: : ::.:: :. :...:...: ... : ::..:::.:
CCDS34 TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTASGEEYLPVAHTCYN
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850 860 870
pF1KE2 VLLLPEYSSKEKLKERLLKAITYAKGFGML
.: ::.::::: :. :: .:. .::..
CCDS34 LLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
1030 1040 1050
>>CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022 aa)
initn: 501 init1: 262 opt: 802 Z-score: 861.4 bits: 170.7 E(32554): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 804; 33.3% identity (64.6% similar) in 457 aa overlap (434-872:572-1014)
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLE--MD
:. .:: : :. ::: :...:. .:
CCDS47 IISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFN--INE-LSNLLNFYID
550 560 570 580 590
470 480 490 500 510
pF1KE2 KDYTFFK------VETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRM-YSERRITVLY--S
. .:. .:: . : :::.:...: : :..:.: .::.. .:. .
CCDS47 RGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHET
600 610 620 630 640 650
520 530 540 550 560
pF1KE2 LVQGQQL---NPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGG
..: .. .: . :.:::.... ::: .: .. . .:. : : ::: .: . ::
CCDS47 ILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQL---SQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGG
660 670 680 690 700 710
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 VSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCIL
::.:::. . ::. .:. ::: : : . .:: . . .. :.:.. ::...: .
CCDS47 VSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVA
720 730 740 750 760 770
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pF1KE2 DVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEGN-VEDDMMITFQI--SQTD
.. ::...:.::. .: ...:: . : : .::...:. .. . : . : :.: .:.:
CCDS47 NLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQND
780 790 800 810 820 830
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pF1KE2 LFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPL
. :: :: .::. . :....:. : :::.: ::. .. :.:::. : .. :
CCDS47 V-------DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
840 850 860 870 880
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pF1KE2 KYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFL
.. : :::. : :. . :.. .:....:. :: .. :. ::. :..: ..:. ::
CCDS47 RH-FYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFL
890 900 910 920 930 940
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pF1KE2 QFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTER-LPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKA
: :: :: . :. :..... .:: ::: :: :.: ::.::. :...: : :
CCDS47 FFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVA
950 960 970 980 990 1000
870
pF1KE2 ITYAKGFGML
:. .::
CCDS47 INNNRGFVSPMLTQS
1010 1020
>>CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024 aa)
initn: 485 init1: 305 opt: 801 Z-score: 860.3 bits: 170.5 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 815; 33.0% identity (66.3% similar) in 460 aa overlap (434-873:580-1024)
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKP--LIPFEEFINEPLNEVLEMD
:. . :. : .. .:.... :: .:.
CCDS36 VICQLDYWDESAEENGNVQALLEMLKKLHRVNQVKCQLPESIFQVDELLHR-LNFFVEVC
550 560 570 580 590 600
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pF1KE2 KDYTFFKVETENKFSFMTC------PFILNAVTKNLGLYYDNRIRMYSERRITVLYSLVQ
. : ..:. .. . . . : :::.: ..: :. :. ... :... . : : .
CCDS36 RRY-LWKMTVDASENVQCCVIFSHFPFIFNNLSKIKLLHTDTLLKIESKKHKAYLRSAAI
610 620 630 640 650 660
520 530 540 550 560
pF1KE2 GQQ------LNPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGG
.. : : . : :::.:.:.:.: .: .. : ::.:.:.: : :: : : ::
CCDS36 EEERESEFALRPTFDLTVRRNHLIEDVLNQLSQFENE---DLRKELWVSFSGEIGYDLGG
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pF1KE2 VSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWF--NPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNC
:.:::: . :...:. ::: : :... .:: .:. :: . : ..:.. ::...:
CCDS36 VKKEFFYCLFAEMIQPEYGMFMYPEGASCMWFPVKPK-FEKKRYF-FFGVLCGLSLFNCN
730 740 750 760 770 780
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pF1KE2 ILDVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLEYEG-NVEDDMMITFQI--SQ
. .. ::.....::. . ...:: . : : ..:. ::. :: : :. ..: :.. ..
CCDS36 VANLPFPLALFKKLLDQMPSLEDLKELSPDLGKNLQTLLDDEGDNFEEVFYIHFNVHWDR
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pF1KE2 TDLFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNES
.: .: ::..: ... :....:. : .::.: ::. .. :::::. . .:.
CCDS36 NDT-------NLIPNGSSITVNQTNKRDYVSKYINYIFNDSVKAVYEEFRRGFYKMCDED
850 860 870 880 890
750 760 770 780 790 800
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:
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