Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2108
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2108, 845 aa
1>>>pF1KE2108 845 - 845 aa - 845 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4713+/-0.00159; mu= 16.2611+/- 0.094
mean_var=211.0024+/-39.669, 0's: 0 Z-trim(105.6): 222 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.088294
statistics sampled from 8275 (8521) to 8275 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 845) 6114 793.4 0
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 ( 873) 5506 716.0 7.1e-206
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 858) 2938 388.8 2.1e-107
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 860) 2938 388.8 2.1e-107
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 819) 2702 358.7 2.3e-98
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 700) 2415 322.1 2.1e-87
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 682) 2108 283.0 1.2e-75
CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 ( 692) 2086 280.2 8.7e-75
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 904) 2055 276.4 1.6e-73
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 963) 2055 276.4 1.6e-73
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 ( 793) 2038 274.1 6.5e-73
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2 (4599) 994 142.2 1.9e-32
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2 (4655) 949 136.5 1e-30
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11 (1615) 847 122.9 4.5e-27
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12 (1613) 819 119.3 5.4e-26
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1166) 787 115.0 7.5e-25
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1207) 787 115.1 7.7e-25
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4 (1165) 758 111.3 9.8e-24
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11 (1905) 758 111.6 1.3e-23
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12 (4544) 717 107.0 7.9e-22
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214) 534 83.2 5.5e-15
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14 (1375) 525 81.8 9.2e-15
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1 (1247) 521 81.2 1.2e-14
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 484 77.3 6.7e-13
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 471 75.3 1.7e-12
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 441 71.1 1.5e-11
CCDS54345.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1342) 439 70.8 1.8e-11
CCDS33178.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1395) 439 70.8 1.8e-11
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22 ( 252) 427 68.2 2e-11
CCDS33177.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1721) 439 70.9 2.1e-11
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 431 69.6 3e-11
CCDS63958.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 734) 426 68.8 4e-11
>>CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 (845 aa)
initn: 6114 init1: 6114 opt: 6114 Z-score: 4228.3 bits: 793.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6114; 100.0% identity (100.0% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-845)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGATGTGRKAKCEPSQFQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGATGTGRKAKCEPSQFQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPEQCHMRTCRIHEISC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPEQCHMRTCRIHEISC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIHTKCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIHTKCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINEC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYNPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYNPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRINVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAILPLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRINVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAILPLLLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVST
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DDDLA
:::::
CCDS34 DDDLA
>>CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9 (873 aa)
initn: 5503 init1: 5503 opt: 5506 Z-score: 3809.6 bits: 716.0 E(32554): 7.1e-206
Smith-Waterman score: 6040; 96.7% identity (96.7% similar) in 873 aa overlap (1-845:1-873)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGATGTGRKAKCEPSQFQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGATGTGRKAKCEPSQFQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPEQCHMRTCRIHEISC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDCEDGSDESPEQCHMRTCRIHEISC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIHTKCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIHTKCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINEC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYNPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYNPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCL
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 PAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQR----------------------------I
:::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS64 PAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQSTATTVTYSETKDTNTTEISATSGLVPGGI
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 NVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLKT
790 800 810 820 830 840
820 830 840
pF1KE2 TEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
850 860 870
>>CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (858 aa)
initn: 2755 init1: 1284 opt: 2938 Z-score: 2041.8 bits: 388.8 E(32554): 2.1e-107
Smith-Waterman score: 3018; 50.2% identity (73.3% similar) in 815 aa overlap (68-816:23-835)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 FQCTNGRCITLLWKCDGDEDCVDGSDEKNCVKKTCAESDFVCNNGQCVPSRWKCDGDPDC
: : ...: :..:.:. .: :::. .:
CCDS58 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAEC
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 EDGSDESPEQCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPD
.:::::: : : ::. ..:::.. ..::: :::::. :::.: ::..: ::: :
CCDS58 QDGSDESQETCLSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQD
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 EFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDAD
:: : .:.::::.:::... :: ::::: .: ::: :::..:.::: :.::.: :
CCDS58 EFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPD
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 CSDQSDESLEQCGRQPVIH---TKCPASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCP
: : ::: ..: :.. . : : :..: ::::::..::::: ::::: ::: ::
CCDS58 CEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCA
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 SRTCRPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDI
:::::.:.: ::.::::::::. :: : ::::.: ::. : ::.::::.::::: .
CCDS58 VATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLCEGPNKFKCHSGECITL
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTC
.::::. .:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: ::::: : ::.:. .. :
CCDS58 DKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRC
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 GDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKI
::::::.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::::. :.::::...::.
CCDS58 EDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKM
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 GLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYN
:.:.:: .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :...: : :. :.: .
CCDS58 TLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHG--VSSYDTVIS
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560
pF1KE2 -----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGF
: ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . .: .:.:::. ::
CCDS58 RDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGF
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 VYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDL
.::.::: ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::...::::.::::: .::.:.
CCDS58 MYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDV
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 NGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQ
:: .:. .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::..:::.. :..:: . .
CCDS58 NGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPE
600 610 620 630 640 650
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 DIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRD
:....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::.::.::.:. . .. :.
CCDS58 DMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTCACPDGMLLARDMRS
660 670 680 690 700 710
750 760
pF1KE2 CQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP-----------------------
: :..:. ::: . ::
CCDS58 CLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIVTMSHQ
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810
pF1KE2 -------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLK
:... : .::..:::. .: .:.:.::. ::..:.::::::: :
CCDS58 ALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDNPVYQK
780 790 800 810 820 830
820 830 840
pF1KE2 TTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
:::..
CCDS58 TTEDEVHICHNQDGYSYPSMVSLEDDVA
840 850
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: : ...: :..:.:. .: :::. .:
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100 110 120 130 140 150
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CCDS12 QDGSDESQETCLSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPPKTCSQD
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pF1KE2 EFTCSSGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDAD
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CCDS12 EFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQCNSSTCIPQLWACDNDPD
120 130 140 150 160 170
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: : ::: ..: :.. . : : :..: ::::::..::::: ::::: ::: ::
CCDS12 CEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWRCDGGPDCKDKSDEENCA
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CCDS12 VATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLCEGPNKFKCHSGECITL
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pF1KE2 SKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTC
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CCDS12 DKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRC
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pF1KE2 GDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKI
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CCDS12 EDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKM
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 GLERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYN
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CCDS12 TLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHG--VSSYDTVIS
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560
pF1KE2 -----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGF
: ..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . .: .:.:::. ::
CCDS12 RDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGF
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 VYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDL
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CCDS12 MYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDV
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 NGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQ
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CCDS12 NGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPE
600 610 620 630 640 650
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 DIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRD
:....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::.::.::.:. . .. :.
CCDS12 DMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTCACPDGMLLARDMRS
660 670 680 690 700 710
750 760
pF1KE2 CQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP-----------------------
: :..:. ::: . ::
CCDS12 CLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIVTMSHQ
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810
pF1KE2 -------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLK
:... : .::..:::. .: .:.:.::. ::..:.::::::: :
CCDS12 ALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDNPVYQK
780 790 800 810 820 830
820 830 840
pF1KE2 TTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
:::..
CCDS12 TTEDEVHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA
840 850 860
>>CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (819 aa)
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90 100 110 120 130 140
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CCDS56 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQC--QDGKCISYKWVCDGSAECQD
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CCDS56 GSDESQETCSPKTCSQDEFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLTCGPASFQC
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250
pF1KE2 STSSCIPISWVCDDDADCSDQSDESLEQCGRQPVIH---TKCPASEIQCGSGECIHKKWR
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CCDS56 NSSTCIPQLWACDNDPDCEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSSWR
120 130 140 150 160 170
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CCDS56 CDGGPDCKDKSDEENCAVATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 CLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIG
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CCDS56 CEGPNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIG
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 YECDCAAGFELIDRKTCGDIDECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV
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CCDS56 YECLCPDGFQLVAQRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAV
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CCDS56 GSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQ
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 IDDKVGRHVKMIDNVYN-----PAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFN
.: : :. :.: . : ..::::....:::::.. :.::: :.::: ::
CCDS56 LDRAHG--VSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFR
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 SDLREPASIAVDPLSGFVYWSDWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKS
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CCDS56 ENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSG
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 RLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANK
::::.::::: .::.:.:: .:. .:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::.
CCDS56 RLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANR
540 550 560 570 580 590
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 FTGSELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPK
.:::.. :..:: . .:....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::
CCDS56 LTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPK
600 610 620 630 640 650
740 750 760
pF1KE2 YTCSCPSGYNVEENGRDCQ---------------RINVT-TAV-----SEVSVP------
.::.::.:. . .. :.: :..:. ::: . ::
CCDS56 FTCACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLP
660 670 680 690 700 710
770 780 790
pF1KE2 ------------------------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNW
:... : .::..:::. .: .:.:.::
CCDS56 GATPGLTTVEIVTMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNW
720 730 740 750 760 770
800 810 820 830 840
pF1KE2 QHKNMKSMNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
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CCDS56 RLKNINSINFDNPVYQKTTEDEVHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA
780 790 800 810
>>CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1 (700 aa)
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170 180 190 200 210 220
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CCDS57 LLLLLLLLQLQHLAAAAADPLLGGQGPAKDCEKDQFQCRNERCIPSVWRCDEDDDCLDHS
20 30 40 50 60 70
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DESLEQCGRQPVIHTKCPASEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDE--VNCPSRTCRP
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CCDS57 DE--DDCPKK-----TCADSDFTCDNGHCIHERWKCDGEEECPDGSDESEATCTKQVCPA
80 90 100 110 120
290 300 310 320 330
pF1KE2 DQFECEDGS--CIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCK-NVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKV
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CCDS57 EKLSCGPTSHKCVPASWRCDGEKDCEGGADEAGCATSLGTCRGD-EFQCGDGTCVLAIKH
130 140 150 160 170 180
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 CNQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDI
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CCDS57 CNQEQDCPDGSDEAGCLQGLNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLLDQKTCGDI
190 200 210 220 230 240
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 DECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV-GKEPSLIFTNRRDIRKIGL
:::..: :::::.: :: .:::: ::.::: : :::. :: ::::::::...:.: :
CCDS57 DECKDPDACSQICVNYKGYFKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVRRIDL
250 260 270 280 290 300
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ERKEYIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASID---DKVGRHVKMIDNVY
...: .:. .:.:.::::...:.....: ::: . :.:: .: : ..: . ....
CCDS57 VKRNYSRLIPMLKNVVALDVEVATNRIYWCDLSYRKIYSAYMDKASDPKEQEVLIDEQLH
310 320 330 340 350 360
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 NPAAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWS
.: ..:::::.: :::::...:::::::.:: .:. ::. .: :: .:::::: ::.:::
CCDS57 SPEGLAVDWVHKHIYWTDSGNKTISVATVDGGRRRTLFSRNLSEPRAIAVDPLRGFMYWS
370 380 390 400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 DWGEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQD
:::. :::::.:.:: ::. ::. .:.:::::::::...::::.:::::.:::.:..: .
CCDS57 DWGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSIDFSGGN
430 440 450 460 470 480
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 RRIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIV
:. ...: .::.::.....:::.:.: : ::::...::...: :.. :..:::. .::..
CCDS57 RKTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNPHDIVI
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 YHELVQPSGKNWCEEDME-NGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRI
.::: :: . . :: ... ::::::::::::::..:::::::.::. . . . . : :
CCDS57 FHELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYR-
550 560 570 580 590 600
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 NVTTAVSEVSVPPKGTSAAWAIL-PLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDNPVYLK
: . .. :.:. .:. :...... ..:::.::::..:: :::::::::: :
CCDS57 ---DANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKSMNFDNPVYRK
610 620 630 640 650 660
820 830 840
pF1KE2 TTEEDLS--IDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
::::. . ::: .:..::.::: ..: .::
CCDS57 TTEEEDEDELHIGR-TAQIGHVYPARVALSLEDDGLP
670 680 690 700
>>CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19 (682 aa)
initn: 2119 init1: 1209 opt: 2108 Z-score: 1471.4 bits: 283.0 E(32554): 1.2e-75
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170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SGRCISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTSSCIPISWVCDDDADCSDQS
: .::::. ..:: .:::: .:.:.: :
CCDS56 MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAECQDGS
10 20 30 40 50
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pF1KE2 DESLEQCGRQPVIHTKCPASEIQCGS--GECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTCRP
::: : : . . : .....::. ..:: . :::::. :: .:::: .:: ::::
CCDS56 DESQETC-----LSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPVATCRP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 DQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVCNQ
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CCDS56 DEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNVTLCEGPNKFKCHSGECITLDKVCNM
120 130 140 150 160 170
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDIDEC
.:::::::::.::: :::: :::::::.:.:: ::::: : ::.:. .. : :::::
CCDS56 ARDCRDWSDEPIKECGTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRCEDIDEC
180 190 200 210 220 230
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 QNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAVGKEPSLIFTNRRDIRKIGLERKE
:.: :::.:.::.:::::.: .:.:.: : .:::::. :.::::...::. :.:.:
CCDS56 QDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSE
240 250 260 270 280 290
470 480 490 500 510
pF1KE2 YIQLVEQLRNTVALDADIAAQKLFWADLSQKAIFSASIDDKVGRHVKMIDNVYN-----P
: .:. .:::.::::...:.....:.::::. : :...: : :. :.: . :
CCDS56 YTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHG--VSSYDTVISRDIQAP
300 310 320 330 340
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 AAIAVDWVYKTIYWTDAASKTISVATLDGTKRKFLFNSDLREPASIAVDPLSGFVYWSDW
..::::....:::::.. :.::: :.::: :: . .: .:.:::. ::.::.::
CCDS56 DGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDW
350 360 370 380 390 400
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 GEPAKIEKAGMNGFDRRPLVTADIQWPNGITLDLIKSRLYWLDSKLHMLSSVDLNGQDRR
: ::::.:.:.:: : ::: .:::::::::::...::::.::::: .::.:.:: .:.
CCDS56 GTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRK
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 IVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVYH
.:.. . ::::..:..:::.:.: : :::...::..:::.. :..:: . .:....:
CCDS56 TILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFH
470 480 490 500 510 520
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 ELVQPSGKNWCEEDMENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRINVT
.:.:: . .:.. . . ..:. : :. . ....
CCDS56 NLTQPREAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTT--TRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIV
530 540 550 560 570 580
760 770 780 790 800
pF1KE2 T----AVSEVS-----VPPKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKSMNFDN
: :...:. :... : .::..:::. .: .:.:.::. ::..:.::::
CCDS56 TMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLKNINSINFDN
590 600 610 620 630 640
810 820 830 840
pF1KE2 PVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
::: ::::... : :. . :..::. ..:: .::.:
CCDS56 PVYQKTTEDEVHIC---HNQD-GYSYPSRQMVSLEDDVA
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210 220 230 240 250 260
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CCDS56 SKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLY
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pF1KE2 SELATLVNNLNDAQDIIVYHELVQPSGKNWCEED-MENGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTC
:.. :..:: . .:....:.:.:: : ::::. . ::::.:::::::::: ::::.::
CCDS56 SDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKFTC
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.::.:. . .. :.: :..:. ::: . ::
CCDS56 ACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGAT
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pF1KE2 ---------------------------PKGTSAAWAILPLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHK
:... : .::..:::. .: .:.:.::. :
CCDS56 PGLTTVEIVTMSHQALGDVAGRGNEKKPSSVRALSIVLPIVLLVFLCLGVFLLWKNWRLK
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:..:.::::::: ::::..
CCDS56 NINSINFDNPVYQKTTEDEVHICHNQDGYSYPSRQMVSLEDDVA
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110 120 130 140 150 160
pF1KE2 QCHMRTCRIHEISCGAHSTQCIPVSWRCDGENDCDSGEDEENCGNITCSPDEFTCSSGRC
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CCDS30 TCTKQVCPAEKLSCGPTSHKCVPASWRCDGEKDCEGGADEAGCATL-CAPHEFQCGNRSC
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170 180 190 200 210 220
pF1KE2 ISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTS---SCIPISWVCDDDADCSDQSD
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230 240 250 260 270
pF1KE2 ESLEQCGRQPVIHTKCPA-----SEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTC
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CCDS30 EAAELCGRPGPGATSAPAACATASQFACRSGECVHLGWRCDGDRDCKDKSDEADCPLGTC
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pF1KE2 RPDQFECEDGSCIHGSRQCNGIRDCVDGSDEVNCKNVNQCLGPGKFKCRSGECIDISKVC
: :.:.: ::.:. . ..:: .:: :::::..: . :
CCDS30 RGDEFQCGDGTCVLAIKHCNQEQDCPDGSDEAGCLQ--------------G---------
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.:::: ::::::::: :: ::.:: : :::.:.:.:::::::
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pF1KE2 ECQNPGICSQICINLKGGYKCECSRGYQMDLATGVCKAV-GKEPSLIFTNRRDIRKIGLE
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CCDS30 ECKDPDACSQICVNYKGYFKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVRRIDLV
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CCDS30 WGDQAKIEKSGLNGVDRQTLVSDNIEWPNGITLDLLSQRLYWVDSKLHQLSSIDFSGGNR
560 570 580 590 600 610
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pF1KE2 RIVLKSLEFLAHPLALTIFEDRVYWIDGENEAVYGANKFTGSELATLVNNLNDAQDIIVY
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CCDS30 KTLISSTDFLSHPFGIAVFEDKVFWTDLENEAIFSANRLNGLEISILAENLNNPHDIVIF
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pF1KE2 HELVQPSGKNWCEEDME-NGGCEYLCLPAPQINDHSPKYTCSCPSGYNVEENGRDCQRI-
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CCDS30 HELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYRAP
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..:.:: : :::: :.
CCDS30 QSTSTTTLASTMTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPRAPSISP
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pF1KE2 ---------------------GTSAAWAIL----PLLLLVMAAVGGYLMWRNWQHKNMKS
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CCDS30 STLSPATSNHSQHYANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKS
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810 820 830 840
pF1KE2 MNFDNPVYLKTTEEDLSIDIGRHSASVGHTYPAISVVSTDDDLA
:::
CCDS30 MNFDNPVYRKTTEEEDEDELHIGRTAQIGHVYPARVALSLEDDGLP
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10 20 30 40
pF1KE2 MGTSALWALWLLLALCWAPRESGAT------GTGRKAKCEPSQFQCTNGRCI
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CCDS57 MGLPEPGPLRLLALLLLLLLLLLLQLQHLAAAAADPLLGGQGPAKDCEKDQFQCRNERCI
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CCDS57 PSVWRCDEDDDCLDHSDEDDCPKKTCADSDFTCDNGHCIHERWKCDGEEECPDGSDESEA
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CCDS57 TCTKQVCPAEKLSCGPTSHKCVPASWRCDGEKDCEGGADEAGCATL-CAPHEFQCGNRSC
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pF1KE2 ISRNFVCNGQDDCSDGSDELDCAPPTCGAHEFQCSTS---SCIPISWVCDDDADCSDQSD
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CCDS57 LAAVFVCDGDDDCGDGSDERGCADPACGPREFRCGGDGGGACIPERWVCDRQFDCEDRSD
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230 240 250 260 270
pF1KE2 ESLEQCGRQPVIHTKCPA-----SEIQCGSGECIHKKWRCDGDPDCKDGSDEVNCPSRTC
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CCDS57 EAAELCGRPGPGATSAPAACATASQFACRSGECVHLGWRCDGDRDCKDKSDEADCPLGTC
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CCDS57 RGDEFQCGDGTCVLAIKHCNQEQDCPDGSDEAGCLQ--------------G---------
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pF1KE2 NQEQDCRDWSDEPLKECHINECLVNNGGCSHICKDLVIGYECDCAAGFELIDRKTCGDID
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CCDS57 ------------------LNECLHNNGGCSHICTDLKIGFECTCPAGFQLLDQKTCGDID
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CCDS57 ECKDPDACSQICVNYKGYFKCECYPGYEMDLLTKNCKAAAGKSPSLIFTNRHEVRRIDLV
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CCDS57 HELKQPRAPDACELSVQPNGGCEYLCLPAPQISSHSPKYTCACPDTMWLGPDMKRCYRAP
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760
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CCDS57 QSTSTTTLASTMTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPRAPSISP
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CCDS57 STLSPATSNHSQHYANEDSKMGSTVTAAVIGIIVPIVVIALLCMSGYLIWRNWKRKNTKS
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810 820 830 840
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CCDS57 MNFDNPVYRKTTEEEDEDELHIGRTAQIGHVYPAAISSFDRPLWAEPCLGETREPEDPAP
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845 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 20:39:00 2016 done: Sun Nov 6 20:39:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]