Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2105
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2105, 839 aa
1>>>pF1KE2105 839 - 839 aa - 839 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9625+/-0.000692; mu= 18.2560+/- 0.042
mean_var=153.4616+/-32.374, 0's: 0 Z-trim(107.2): 398 B-trim: 668 in 1/53
Lambda= 0.103532
statistics sampled from 14768 (15285) to 14768 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 10.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_612564 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor ( 839) 5542 841.8 0
NP_003257 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor ( 799) 5262 799.9 0
NP_612567 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor ( 639) 4236 646.6 1.1e-184
NP_005573 (OMIM: 602226) CD180 antigen precursor [ ( 661) 807 134.4 1.6e-30
XP_005248561 (OMIM: 602226) PREDICTED: CD180 antig ( 648) 779 130.2 2.9e-29
XP_011530517 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 512 90.5 3.3e-17
XP_011530518 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 512 90.5 3.3e-17
XP_016864062 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305720 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305724 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
XP_016864065 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305722 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305725 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305719 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
XP_016864064 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305718 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_001305716 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 512 90.5 3.3e-17
XP_016864063 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 512 90.5 3.3e-17
NP_003255 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-like r ( 784) 512 90.5 3.3e-17
XP_011511914 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 426 77.6 2.5e-13
XP_005262694 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 426 77.6 2.5e-13
NP_006059 (OMIM: 605403) toll-like receptor 6 prec ( 796) 426 77.6 2.5e-13
XP_011511916 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 426 77.6 2.5e-13
XP_011511915 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 426 77.6 2.5e-13
XP_016864061 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_011512044 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_011512046 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_005262719 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_011512045 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
NP_003254 (OMIM: 601194,613223) toll-like receptor ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_011512047 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_016864060 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 408 74.9 1.6e-12
XP_006711567 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_006711568 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_005273300 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_005273298 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
NP_003259 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) toll ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_006711569 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_011508239 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_005273299 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
XP_016857697 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 380 70.8 3e-11
NP_001288116 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288126 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288128 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288123 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288124 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288115 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288118 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
NP_001288129 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 313 60.6 2.5e-08
XP_011520420 (OMIM: 609791) PREDICTED: leucine-ric ( 614) 313 60.6 2.5e-08
>>NP_612564 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor 4 i (839 aa)
initn: 5542 init1: 5542 opt: 5542 Z-score: 4490.0 bits: 841.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5542; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 MMSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 AFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 DLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 NVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 IDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 NKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NSFQENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 NSFQENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 KCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 NIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 QQVELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 QQVELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
790 800 810 820 830
>>NP_003257 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor 4 i (799 aa)
initn: 5262 init1: 5262 opt: 5262 Z-score: 4264.2 bits: 799.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5262; 100.0% identity (100.0% similar) in 799 aa overlap (41-839:1-799)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 LIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLG
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 SYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALGAFSGLSSLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALGAFSGLSSLQK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNKIQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNKIQSI
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 YCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 AGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTNV
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 SSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSNKGGNAFSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSNKGGNAFSEV
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 DLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQLEHLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQLEHLDFQ
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 HSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQENFLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQENFLPD
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 IFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLNSLQVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLNSLQVLD
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 YSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEVERMECA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEVERMECA
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 TPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLMLLAGCIKYGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLMLLAGCIKYGRG
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 ENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAANIIHEGFHKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAANIIHEGFHKS
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 RKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLRQQVELYRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLRQQVELYRLLS
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830
pF1KE2 RNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
760 770 780 790
>>NP_612567 (OMIM: 603030,611488) toll-like receptor 4 i (639 aa)
initn: 4236 init1: 4236 opt: 4236 Z-score: 3437.0 bits: 646.6 E(85289): 1.1e-184
Smith-Waterman score: 4236; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (201-839:1-639)
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FSNLTNLEHLDLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 MPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHK
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRL
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AYLDYYLDDIIDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 AYLDYYLDDIIDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKL
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KSLKRLTFTSNKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 KSLKRLTFTSNKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNG
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VITMSSNFLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 VITMSSNFLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGL
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SSLEVLKMAGNSFQENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 SSLEVLKMAGNSFQENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHN
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pF1KE2 NFFSLDTFPYKCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 NFFSLDTFPYKCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LQWIKDQRQLLVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVL
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pF1KE2 VYKFYFHLMLLAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 VYKFYFHLMLLAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYR
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pF1KE2 DFIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 DFIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIV
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pF1KE2 LQKVEKTLLRQQVELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LQKVEKTLLRQQVELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
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pF1KE2 CNWQEATSI
:::::::::
NP_612 CNWQEATSI
>>NP_005573 (OMIM: 602226) CD180 antigen precursor [Homo (661 aa)
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Smith-Waterman score: 856; 29.5% identity (63.3% similar) in 648 aa overlap (20-652:18-647)
10 20 30 40 50
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: ::. :.: : ::.: .:.. .:::.:: .:. :
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..::: : . . .: . .: :::.::.:. :.. ..:: .::::.:::::. .:
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...: .::..: ..:....:: .:. .:..:. : .. : :.:.:.:. : ::.
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::...: :. : :.: :.: .::::... : .. :. ::: ...: :: .
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... ..:: . .. : :: :.. . : .... :.:::....: . : .. ..:
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: . :.:.:... ..:... .. . . ... ..: : .: :. .. .. ::
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.: : . : : .:. ::::.: . . ::: . . . :. :.:: :
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. ..:. : ::: ::. . :. . : : .:. : :.... .. . .. :
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: :. :.. :: ::.. . ... . .: : ::.: : ... ::.::.... ...
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:::.. :.:.. . :.. :.: :.. . : . :. . .::..: . :::
NP_005 SHNSLTCDSIDSLSHLKGIYLNLAANSIN-IISPR---LLPILSQQSTINLSHNPLDCTC
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pF1KE2 EHQSFLQWIKDQRQLLVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVS
. :: : :.. . : :. ::.: . .:. . .....: . : ::. : :...
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pF1KE2 VVAVLVYKFYFHLMLLAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQL
..:.:..
NP_005 LLAILLFFAVKYLLRWKYQHI
650 660
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initn: 563 init1: 330 opt: 779 Z-score: 646.3 bits: 130.2 E(85289): 2.9e-29
Smith-Waterman score: 828; 29.4% identity (63.8% similar) in 632 aa overlap (35-652:21-634)
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.::..: ..:....:: .:. .:..:. : .. : :.:.:.:. : ::. ::...
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: :. : :.: :.: .::::... : .. :. ::: ...: :: . ..
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. ..:: . .. : :: :.. . : .... :.:::....: . : .. ..:: .
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:.:.:... ..:... .. . . ... ..: : .: :. .. .. :: .
XP_005 FQCFTQLQELDLTATHLKGLPSGMKGLNLLKKLVLSVNHFDQLCQISAANFPSLTHLYIR
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pF1KE2 G-------GNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMS
: : . : : .:. ::::.: . . ::: . . . :. :.:: : . ..
XP_005 GNVKKLHLGVGCLE-KLGNLQTLDLSHNDIEASDCCSLQLKNLSHLQTLNLSHNEPLGLQ
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pF1KE2 SN-FLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLE
:. : ::: ::. . :. . : : .:. : :.... .. . .. :: :.
XP_005 SQAFKECPQLELLDLAFTRLHINAPQSPFQNLHFLQVLNLTYCFLDTSNQHLLAGLPVLR
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pF1KE2 VLKMAGNSFQENFLP--DIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNF
:.. :: ::.. . ... . .: : ::.: : ... ::.::.... ...:::..
XP_005 HLNLKGNHFQDGTITKTNLLQTVGSLEVLILSSCGLLSIDQQAFHSLGKMSHVDLSHNSL
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pF1KE2 F--SLDTFPYKCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSF
:.:.. . :.. :.: :.. . : . :. . .::..: . ::: . :
XP_005 TCDSIDSLSHLKGIYLNLAANSIN-IISPR---LLPILSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHF
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pF1KE2 LQWIKDQRQLLVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVL
: : :.. . : :. ::.: . .:. . .....: . : ::. : :... ..:.:
XP_005 LTWYKENLHKLEGSEETTCANPPSLRGVKLSDVKLSCGI--TAIGIFFLIVFLL-LLAIL
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pF1KE2 VYKFYFHLMLLAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYR
..
XP_005 LFFAVKYLLRWKYQHI
640
>>XP_011530517 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTED: t (784 aa)
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pF1KE2 EPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLS
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pF1KE2 RCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLA-LGAFSGLSSLQKL-VAVETNLASLENF
.... .. .. :: :. : : ::: ..:. . :: :..:: : :. ......
XP_011 YNYLSNLSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK
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pF1KE2 PIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNK-----------IQSIYCT
.. : :.::.. . .::.. :. .... :. :: : .. .:. :
XP_011 DFAGLTFLEELEIDASDLQSYE-PKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECL
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pF1KE2 DLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMN-FIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAG
.:: .. ...: .:: . : .:. .:..... .: :. ..... :.::
XP_011 ELRDT-DLDTFHFS-ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESL---FQVMKLLNQ-ISGLLE
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260 270 280 290 300
pF1KE2 LEVHRLVL---GEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTN
:: .: :.:: : . .: . .: .:::..... . : . :. :..
XP_011 LEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVE---TLTIRRLHIPRF-YLFYDLSTLYSLTER
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pF1KE2 VSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSNKG-----G
:. .:.: : : :: : ..: .::::. : .. :
XP_011 VK-----RITVENSKVF----------LVPCLLSQ----HLKSLEYLDLSENLMVEEYLK
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pF1KE2 NAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQL
:. : :::. : : .: :. : : : .: :..:
XP_011 NSACEDAWPSLQTLILRQNHLA-----SLEKTGET------------------LLTLKNL
380 390 400 410
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pF1KE2 EHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQ
..:........: : . ... ::..: :. . . .: . ..::.: ...:..
XP_011 TNIDISKNSFHSMPETCQWP--EKMKYLNLSSTRIH-SVTGCIP--KTLEILDVSNNNL-
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pF1KE2 ENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLN
:: :.: : :. : .:.:....: . :
XP_011 ------------NLFSLNLPQ----------------LKELYISRNKLMTLP--DASLLP
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pF1KE2 SLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEV
: :: : : : : .:..:. : .: :. :.: :.:: :: : . ..:..
XP_011 MLLVLKISRNAITTFSKEQLDSF-HTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDW
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pF1KE2 E-RMECATPSDKQGMPVLSLNIT---CQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFY--FHL
. : .:: .:. : .. .. :. . . :. :.. ...:: ..:. ...
XP_011 PANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYM
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pF1KE2 MLLAGCIKYGR------GENI-YDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRD
.. . .. : ..:: ::::: :: .: ::.: .:..::. :::.:::: ::
XP_011 KMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRD
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pF1KE2 FIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVL
:::: : ::: ....::.:.. :.:..:..:.:: .: .... : . . :.:.:
XP_011 FIPGKWIIDNII-DSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILL
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pF1KE2 QKVEKTLLRQQV-ELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
. .:: . :. .: .... .::::: . :. :: :: :.
XP_011 EPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
740 750 760 770 780
pF1KE2 CNWQEATSI
>>XP_011530518 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTED: t (784 aa)
initn: 580 init1: 239 opt: 512 Z-score: 429.9 bits: 90.5 E(85289): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 690; 27.2% identity (55.7% similar) in 795 aa overlap (57-815:79-782)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 EPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLS
. : :. : . . :: :. :. ::::
XP_011 GLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
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pF1KE2 RCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLA-LGAFSGLSSLQKL-VAVETNLASLENF
.... .. .. :: :. : : ::: ..:. . :: :..:: : :. ......
XP_011 YNYLSNLSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KE2 PIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNK-----------IQSIYCT
.. : :.::.. . .::.. :. .... :. :: : .. .:. :
XP_011 DFAGLTFLEELEIDASDLQSYE-PKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECL
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 DLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMN-FIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAG
.:: .. ...: .:: . : .:. .:..... .: :. ..... :.::
XP_011 ELRDT-DLDTFHFS-ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESL---FQVMKLLNQ-ISGLLE
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300
pF1KE2 LEVHRLVL---GEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTN
:: .: :.:: : . .: . .: .:::..... . : . :. :..
XP_011 LEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVE---TLTIRRLHIPRF-YLFYDLSTLYSLTER
290 300 310 320 330
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pF1KE2 VSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSNKG-----G
:. .:.: : : :: : ..: .::::. : .. :
XP_011 VK-----RITVENSKVF----------LVPCLLSQ----HLKSLEYLDLSENLMVEEYLK
340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQL
:. : :::. : : .: :. : : : .: :..:
XP_011 NSACEDAWPSLQTLILRQNHLA-----SLEKTGET------------------LLTLKNL
380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQ
..:........: : . ... ::..: :. . . .: . ..::.: ...:..
XP_011 TNIDISKNSFHSMPETCQWP--EKMKYLNLSSTRIH-SVTGCIP--KTLEILDVSNNNL-
420 430 440 450 460
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