Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2105
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2105, 839 aa
1>>>pF1KE2105 839 - 839 aa - 839 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5130+/-0.00154; mu= 14.6996+/- 0.091
mean_var=115.4027+/-23.882, 0's: 0 Z-trim(100.2): 184 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.119390
statistics sampled from 5826 (6032) to 5826 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 ( 839) 5542 967.2 0
CCDS3992.1 CD180 gene_id:4064|Hs108|chr5 ( 661) 807 151.5 4.4e-36
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 512 100.8 9.9e-21
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 426 86.0 2.9e-16
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 408 82.9 2.4e-15
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 380 78.1 7.4e-14
>>CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 (839 aa)
initn: 5542 init1: 5542 opt: 5542 Z-score: 5167.6 bits: 967.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5542; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLD
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CCDS68 MMSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 AFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NSFQENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NSFQENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 QQVELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QQVELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
790 800 810 820 830
>>CCDS3992.1 CD180 gene_id:4064|Hs108|chr5 (661 aa)
initn: 563 init1: 330 opt: 807 Z-score: 761.3 bits: 151.5 E(32554): 4.4e-36
Smith-Waterman score: 856; 29.5% identity (63.3% similar) in 648 aa overlap (20-652:18-647)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MMSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEP-CVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNL
: ::. :.: : ::.: .:.. .:::.:: .:. :
CCDS39 MAFDVSCFFWVVLFSAGCKVITSWDQMCIEKEANKTYNCENLGLSEIPDTLPNTTEFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLAL
..::: : . . .: . .: :::.::.:. :.. ..:: .::::.:::::. .:
CCDS39 EFSFNFLPTIHNRTFSRLMNLTFLDLTRCQINWIHEDTFQSHHQLSTLVLTGNPLIFMAE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GAFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEH
...: .::..: ..:....:: .:. .:..:. : .. : :.:.:.:. : ::.
CCDS39 TSLNGPKSLKHLFLIQTGISNLEFIPVHNLENLESLYLGSNHISSIKFPKDFPA-RNLKV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LDLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDS
::...: :. : :.: :.: .::::... : .. :. ::: ...: :: .
CCDS39 LDFQNNAIHYISREDMRSLEQA--INLSLNFNGNNVKGIELGAFDSTIFQSL----NFGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LNVMKTCIQGLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDD
... ..:: . .. : :: :.. . : .... :.:::....: . : .. ..:
CCDS39 TPNLSVIFNGLQNSTTQSLWLGTFEDIDD-EDISSAMLKGLCEMSVESLNLQ--EHRFSD
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 IIDL-FNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGW-QHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLT
: . :.:.:... ..:... .. . . ... ..: : .: :. .. .. ::
CCDS39 ISSTTFQCFTQLQELDLTATHLKGLPSGMKGLNLLKKLVLSVNHFDQLCQISAANFPSLT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 FTSNKG-------GNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNG
.: : . : : .:. ::::.: . . ::: . . . :. :.:: :
CCDS39 HLYIRGNVKKLHLGVGCLE-KLGNLQTLDLSHNDIEASDCCSLQLKNLSHLQTLNLSHNE
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE2 VITMSSN-FLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNG
. ..:. : ::: ::. . :. . : : .:. : :.... .. . .. :
CCDS39 PLGLQSQAFKECPQLELLDLAFTRLHINAPQSPFQNLHFLQVLNLTYCFLDTSNQHLLAG
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LSSLEVLKMAGNSFQENFLP--DIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNM
: :. :.. :: ::.. . ... . .: : ::.: : ... ::.::.... ...
CCDS39 LPVLRHLNLKGNHFQDGTITKTNLLQTVGSLEVLILSSCGLLSIDQQAFHSLGKMSHVDL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 SHNNFF--SLDTFPYKCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTC
:::.. :.:.. . :.. :.: :.. . : . :. . .::..: . :::
CCDS39 SHNSLTCDSIDSLSHLKGIYLNLAANSIN-IISPR---LLPILSQQSTINLSHNPLDCTC
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EHQSFLQWIKDQRQLLVEVERMECATPSDKQGMPVLSLNITCQMNKTIIGVSVLSVLVVS
. :: : :.. . : :. ::.: . .:. . .....: . : ::. : :...
CCDS39 SNIHFLTWYKENLHKLEGSEETTCANPPSLRGVKLSDVKLSCGI--TAIGIFFLIVFLL-
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 VVAVLVYKFYFHLMLLAGCIKYGRGENIYDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQL
..:.:..
CCDS39 LLAILLFFAVKYLLRWKYQHI
650 660
>>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 (784 aa)
initn: 580 init1: 239 opt: 512 Z-score: 485.7 bits: 100.8 E(32554): 9.9e-21
Smith-Waterman score: 690; 27.2% identity (55.7% similar) in 795 aa overlap (57-815:79-782)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 EPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLS
. : :. : . . :: :. :. ::::
CCDS37 GLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLA-LGAFSGLSSLQKL-VAVETNLASLENF
.... .. .. :: :. : : ::: ..:. . :: :..:: : :. ......
CCDS37 YNYLSNLSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KE2 PIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNK-----------IQSIYCT
.. : :.::.. . .::.. :. .... :. :: : .. .:. :
CCDS37 DFAGLTFLEELEIDASDLQSYE-PKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECL
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 DLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMN-FIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAG
.:: .. ...: .:: . : .:. .:..... .: :. ..... :.::
CCDS37 ELRDT-DLDTFHFS-ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESL---FQVMKLLNQ-ISGLLE
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300
pF1KE2 LEVHRLVL---GEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTN
:: .: :.:: : . .: . .: .:::..... . : . :. :..
CCDS37 LEFDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVE---TLTIRRLHIPRF-YLFYDLSTLYSLTER
290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLTFTSNKG-----G
:. .:.: : : :: : ..: .::::. : .. :
CCDS37 VK-----RITVENSKVF----------LVPCLLSQ----HLKSLEYLDLSENLMVEEYLK
340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVITMSSNFLGLEQL
:. : :::. : : .: :. : : : .: :..:
CCDS37 NSACEDAWPSLQTLILRQNHLA-----SLEKTGET------------------LLTLKNL
380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQ
..:........: : . ... ::..: :. . . .: . ..::.: ...:..
CCDS37 TNIDISKNSFHSMPETCQWP--EKMKYLNLSSTRIH-SVTGCIP--KTLEILDVSNNNL-
420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLN
:: :.: : :. : .:.:....: . :
CCDS37 ------------NLFSLNLPQ----------------LKELYISRNKLMTLP--DASLLP
470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEV
: :: : : : : .:..:. : .: :. :.: :.:: :: : . ..:..
CCDS37 MLLVLKISRNAITTFSKEQLDSF-HTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDW
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650
pF1KE2 E-RMECATPSDKQGMPVLSLNIT---CQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFY--FHL
. : .:: .:. : .. .. :. . . :. :.. ...:: ..:. ...
CCDS37 PANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYM
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 MLLAGCIKYGR------GENI-YDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRD
.. . .. : ..:: ::::: :: .: ::.: .:..::. :::.:::: ::
CCDS37 KMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRD
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 FIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVL
:::: : ::: ....::.:.. :.:..:..:.:: .: .... : . . :.:.:
CCDS37 FIPGKWIIDNII-DSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILL
680 690 700 710 720 730
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 QKVEKTLLRQQV-ELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
. .:: . :. .: .... .::::: . :. :: :: :.
CCDS37 EPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
740 750 760 770 780
pF1KE2 CNWQEATSI
>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 (796 aa)
initn: 523 init1: 126 opt: 426 Z-score: 405.5 bits: 86.0 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 600; 24.6% identity (57.0% similar) in 825 aa overlap (32-815:8-781)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSASRLAGTLIPAMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKN---
.: .. . :. . . . . :: :
CCDS34 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIII--VGTRIQFSDGNEFA
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LDLSFNPLRHLGSYSFFSFP-ELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSL
.: : : :. . ..: . .:::.:. : .. . .. ::.:..: :. : :: :
CCDS34 VDKSKRGLIHVPK----DLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLL
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ALGAFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNL
:..:. ..:. : ...: .. :: ....:... : .... . . :.::..:
CCDS34 DLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI---VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQL
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 EHLDLSSNKIQSIYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNF
. : ::. :.:.. :: . .. : . ::: .. . ... . . : : .
CCDS34 NFLGLSAMKLQKL---DLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHP
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DSLNVMKTCIQ--GLAGLEVHRLVLGEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDY
:: .... :. :. :.. . : :. : . : : : . :. .: : ...
CCDS34 TSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKL----NDDNCQVFIKFLSELTRGSTLLNFTLNHIET
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YLDDIIDLFNCL--TNVSSFSLVSVTI-ERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKS
.. .:. : : ... ..:: : ... ..... :. . :.. .
CCDS34 TWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYSKTTLKAL--------TIEHIT
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LKRLTFTSNKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVI
. . :... ..:::... : . : . : .. ...:.:... : :.
CCDS34 NQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHM----LCPHAP---STFKFLNFTQN-VF
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
pF1KE2 TMS--SNFLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNG-
: : . : .:: : .:...::.. :.: : ... :.: :..:.. .:
CCDS34 TDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDL--FKVGLMTKDMPSLEI----LDVSWNSLESGR
370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 -------LSSLEVLKMAGNSFQENFLPDIFTELR-NLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSS
. :. ::....: . .. .: : . ::: . ..... : .: .
CCDS34 HKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDS----VFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSV-PKQVVKLEA
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570
pF1KE2 LQVLNMSHNNFFSLDTFPYKC--LNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQN
:: ::.. : :: .: : ..::.:: . : . . . .: ... .. .:
CCDS34 LQELNVAFN---SLTDLP-GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSC-QKMRSIKAGDN
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: :::: . :.. : . . ..: . ..: : . .: :. ..... :... :.
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. ... ::.:.:... .: . ..: :. :..:: . ::. ::
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.::.:: .: .:. : . ..:.:.:. . .. . .. .: :... :::.:
CCDS34 VQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKE
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CCDS34 KSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
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. . . ::.: :.:. . : .:.. :. :..:: . ::.
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. ::. ..: : . .:: ..:: . . .: : .: . : . . .. :.. :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]