Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2094
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2094, 796 aa
1>>>pF1KE2094 796 - 796 aa - 796 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5283+/-0.000646; mu= -8.8911+/- 0.039
mean_var=782.9712+/-180.599, 0's: 0 Z-trim(115.7): 714 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.045835
statistics sampled from 25641 (26396) to 25641 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 8.980
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002520 (OMIM: 155240,191315,256800) high affini ( 796) 5456 378.1 8.3e-104
NP_001012331 (OMIM: 155240,191315,256800) high aff ( 790) 5396 374.1 1.3e-102
NP_001007793 (OMIM: 155240,191315,256800) high aff ( 760) 4886 340.4 1.8e-92
NP_001230030 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 817) 2046 152.6 6.4e-36
XP_006720607 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 817) 2046 152.6 6.4e-36
XP_016877741 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 448) 1619 124.0 1.5e-27
XP_016877740 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 456) 1619 124.0 1.5e-27
XP_016877733 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.3 1.9e-27
XP_016877735 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.3 1.9e-27
XP_016877734 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.3 1.9e-27
XP_016877732 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 727) 1619 124.3 1.9e-27
XP_016877730 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 763) 1619 124.3 1.9e-27
XP_016877729 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 825) 1619 124.4 2e-27
XP_006720606 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 825) 1619 124.4 2e-27
NP_002521 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor recept ( 825) 1619 124.4 2e-27
NP_001018074 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growt ( 822) 1615 124.1 2.4e-27
XP_011517020 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1615 124.1 2.4e-27
XP_016870241 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1615 124.1 2.4e-27
XP_016870242 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1615 124.1 2.4e-27
XP_016870243 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 822) 1615 124.1 2.4e-27
XP_016870240 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.1 2.5e-27
XP_005252060 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.1 2.5e-27
XP_005252061 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.1 2.5e-27
NP_006171 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growth f ( 838) 1615 124.1 2.5e-27
XP_005252058 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 838) 1615 124.1 2.5e-27
NP_001307064 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 617) 1031 85.3 8.8e-16
XP_006720608 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 715) 1031 85.4 9.5e-16
XP_016877731 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 750) 1026 85.1 1.2e-15
XP_016877737 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 559) 972 81.3 1.2e-14
XP_016877738 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 550) 970 81.2 1.4e-14
XP_016877736 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 604) 970 81.2 1.4e-14
NP_001307063 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 567) 967 81.0 1.6e-14
XP_006720611 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 528) 965 80.8 1.7e-14
NP_001007157 (OMIM: 191316) NT-3 growth factor rec ( 612) 965 80.9 1.8e-14
XP_011519939 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 612) 965 80.9 1.8e-14
XP_006720613 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 495) 900 76.5 3.2e-13
XP_006720612 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 503) 900 76.5 3.2e-13
XP_011519940 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 469) 895 76.1 3.9e-13
XP_016877739 (OMIM: 191316) PREDICTED: NT-3 growth ( 482) 895 76.1 3.9e-13
XP_016856866 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 874) 861 74.3 2.6e-12
XP_011539828 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 874) 861 74.3 2.6e-12
XP_016856865 (OMIM: 602336) PREDICTED: inactive ty ( 917) 861 74.3 2.6e-12
NP_005003 (OMIM: 602336) inactive tyrosine-protein ( 937) 861 74.3 2.7e-12
NP_001007098 (OMIM: 600456,613886) BDNF/NT-3 growt ( 477) 833 72.0 6.7e-12
XP_016870250 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 477) 833 72.0 6.7e-12
XP_016870248 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 477) 833 72.0 6.7e-12
XP_005252064 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 477) 833 72.0 6.7e-12
XP_016870247 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 477) 833 72.0 6.7e-12
XP_016870249 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 477) 833 72.0 6.7e-12
XP_016870246 (OMIM: 600456,613886) PREDICTED: BDNF ( 537) 833 72.1 7.2e-12
>>NP_002520 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinity n (796 aa)
initn: 5456 init1: 5456 opt: 5456 Z-score: 1984.7 bits: 378.1 E(85289): 8.3e-104
Smith-Waterman score: 5456; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG
::::::::::::::::
NP_002 LQALAQAPPVYLDVLG
790
>>NP_001012331 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinit (790 aa)
initn: 5404 init1: 2715 opt: 5396 Z-score: 1963.2 bits: 374.1 E(85289): 1.3e-102
Smith-Waterman score: 5396; 99.1% identity (99.1% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
NP_001 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP------DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
720 730 740 750 760 770
790
pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG
::::::::::::::::
NP_001 LQALAQAPPVYLDVLG
780 790
>>NP_001007793 (OMIM: 155240,191315,256800) high affinit (760 aa)
initn: 4894 init1: 2715 opt: 4886 Z-score: 1781.1 bits: 340.4 E(85289): 1.8e-92
Smith-Waterman score: 4886; 98.8% identity (98.9% similar) in 729 aa overlap (68-796:38-760)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DACCPHGSSGLRCTRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
:. ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLAPSVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP-----
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pF1KE2 VDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 AIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
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:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
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: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
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.:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:.
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. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: :
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:. .. .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. :
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::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :
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. :.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.::::
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:::::: :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. :
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pF1KE2 PGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYST
: :::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:::
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:::::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
NP_001 CITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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XP_006 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ
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XP_006 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
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XP_006 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
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pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL
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::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :
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. :.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.::::
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pF1KE2 PGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYST
: :::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:::
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pF1KE2 DYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAID
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XP_006 DYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIE
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:::::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
XP_006 CITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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pF1KE2 SVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLS
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XP_016 SIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPS
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. : . . : .::::::: :. :.:::::::::: ::::::::::
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XP_016 LIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLAS
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::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.:::
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::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: :::::.:: ::: .: ::
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pF1KE2 WQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
:::::::: .::... :.::..: :.:::.::
XP_016 WQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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XP_016 MAQPQFMSRLFLGVLDKRSSQPAGAVRESTDNFILFDEVSPTP----PITVT-------H
10 20 30 40 50
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XP_016 KPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHH
60 70 80 90 100 110
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.. : .. : . : . . : .::::::: :. :.:::::::::: :
XP_016 INHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRE
120 130 140 150 160 170
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 LGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRF
::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:
XP_016 LGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 FGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGLGQLLAVASQV
.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::.:.: .:::.
XP_016 YGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQI
240 250 260 270 280 290
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:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::::.::::::::
XP_016 ASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWM
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pF1KE2 PPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPP
:::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.:::::: :::::.::
XP_016 PPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPK
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 EVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
XP_016 EVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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pF1KE2 PGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNL
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XP_016 MELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]