Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2094
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2094, 796 aa
1>>>pF1KE2094 796 - 796 aa - 796 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4048+/-0.00144; mu= -9.8445+/- 0.081
mean_var=514.6976+/-119.794, 0's: 0 Z-trim(108.3): 284 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.056532
statistics sampled from 9868 (10131) to 9868 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 4.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 5456 461.4 2.7e-129
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 5396 456.5 7.9e-128
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 4886 414.9 2.6e-115
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 2046 183.3 1.4e-45
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 1619 148.4 4.4e-35
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 1615 148.1 5.5e-35
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 1615 148.1 5.6e-35
CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 617) 1031 100.3 1e-20
CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 612) 965 94.9 4.1e-19
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 861 86.7 2e-16
CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 477) 833 84.1 6.1e-16
CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 537) 833 84.1 6.6e-16
CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 553) 833 84.1 6.8e-16
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 832 84.3 9.5e-16
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 836 84.8 1e-15
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 836 84.8 1e-15
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 813 83.0 3.8e-15
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 813 83.0 3.8e-15
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 812 82.9 3.8e-15
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 796 81.3 6.8e-15
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 796 81.3 7.4e-15
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 796 81.4 7.5e-15
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 796 81.4 7.6e-15
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 795 81.3 8.2e-15
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 792 81.3 1.4e-14
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 781 80.1 1.6e-14
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 781 80.1 1.7e-14
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 765 78.8 4.4e-14
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 755 78.0 7.1e-14
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 754 77.9 7.5e-14
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 747 77.3 1e-13
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 747 77.3 1e-13
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 747 77.3 1.1e-13
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 747 77.3 1.1e-13
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 747 77.3 1.2e-13
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 733 76.1 2.3e-13
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 733 76.1 2.4e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 730 75.9 2.7e-13
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 725 75.6 4.3e-13
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 725 75.6 4.5e-13
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 725 75.7 4.6e-13
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 725 75.7 4.7e-13
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 732 76.6 5.2e-13
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 717 75.0 7e-13
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 703 73.7 1.3e-12
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 703 73.7 1.4e-12
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 698 73.2 1.6e-12
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 698 73.3 1.7e-12
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 698 73.3 1.8e-12
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 697 73.2 1.9e-12
>>CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (796 aa)
initn: 5456 init1: 5456 opt: 5456 Z-score: 2434.8 bits: 461.4 E(32554): 2.7e-129
Smith-Waterman score: 5456; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG
::::::::::::::::
CCDS11 LQALAQAPPVYLDVLG
790
>>CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (790 aa)
initn: 5404 init1: 2715 opt: 5396 Z-score: 2408.4 bits: 456.5 E(32554): 7.9e-128
Smith-Waterman score: 5396; 99.1% identity (99.1% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTRDGALDSLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATVMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP------DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSV
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKML
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRF
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQ
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEI
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHAR
720 730 740 750 760 770
790
pF1KE2 LQALAQAPPVYLDVLG
::::::::::::::::
CCDS30 LQALAQAPPVYLDVLG
780 790
>>CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (760 aa)
initn: 4894 init1: 2715 opt: 4886 Z-score: 2183.8 bits: 414.9 E(32554): 2.6e-115
Smith-Waterman score: 4886; 98.8% identity (98.9% similar) in 729 aa overlap (68-796:38-760)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DACCPHGSSGLRCTRDGALDSLHHLPGAENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
:. ::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CLAPSVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLT
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IVKSGLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALR
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 WLQRWEEEGLGGVPEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQV
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVS
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VQVNVSFPASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAA
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIP-----
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 VDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 -DTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLA
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 PEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELG
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG
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pF1KE2 VCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAG
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640 650 660 670 680 690
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPE
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CCDS30 SILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVY
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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:: ... : :: : : ... . : : :: :
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:: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .:::
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: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
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:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
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220 230 240 250 260 270
pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE
: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
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.:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:.
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pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPV
. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .: :
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pF1KE2 SFSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP
:. .. .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. :
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pF1KE2 -AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------D
::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: :
CCDS58 VAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPD
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR
. :.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.::::
CCDS58 TYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQR
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pF1KE2 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-A
:::::: :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. :
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pF1KE2 PGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYST
: :::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.:::
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pF1KE2 DYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAID
:::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:.
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:::::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
CCDS58 CITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL
:: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .:::
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pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE
: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
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:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
CCDS10 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
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220 230 240 250 260 270
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: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
CCDS10 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
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280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL
.:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:.
CCDS10 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY
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. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. :
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pF1KE2 S-FSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINR
. ::. ... : .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::..
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: ::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .:::::::
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470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQ
:. :.:::::::::: :::::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::
CCDS10 DTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQ
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560 570 580 590 600 610
pF1KE2 REAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-
::::::: :::.:::.:.::: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :.
CCDS10 REAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQ
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pF1KE2 APGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYS
: : :::.:.: .:::.:.::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::
CCDS10 AKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYS
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680 690 700 710 720 730
pF1KE2 TDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAI
::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::.::::::.:
CCDS10 TDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVI
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740 750 760 770 780 790
pF1KE2 DCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
.:::::: :::::.:: ::: .: :::::::::: .::... :.::..: :.:::.::
CCDS10 ECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
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CCDS35 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
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: : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . :
CCDS35 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
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. .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : ..
CCDS35 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
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:.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::.
CCDS35 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
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:..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : ::. : : . : ...
CCDS35 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYP-DVIYEDYGTAAND
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pF1KE2 -GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR
:: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::..
CCDS35 IGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKG
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pF1KE2 PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFS--------
:: :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .:::::::.
CCDS35 PASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKP
470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQ
:. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::.
CCDS35 DTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFH
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pF1KE2 REAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVA
::::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :.
CCDS35 REAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGN--P
590 600 610 620 630 640
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pF1KE2 PGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYST
: : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.:::
CCDS35 PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYST
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pF1KE2 DYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAID
:::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.
CCDS35 DYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIE
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 CITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
:::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.::
CCDS35 CITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
770 780 790 800 810 820
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pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
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CCDS66 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF
. :.. ::.::..: ::..:. .. :... ::::::: :::.::: ::
CCDS66 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
. :...:.. : : ::: : . :.:.::.: :::. ::: . :.. .: . :.
CCDS66 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI
: : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . :
CCDS66 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPASV
. .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : ..
CCDS66 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 Q-LHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR
:.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::.
CCDS66 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPF---EFNPEDPIPVSFSPVDTNSTS
:..:::.:::.:::.: : .:. .: : :: : ::. : : . : ...
CCDS66 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYP-DVIYEDYGTAAND
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE2 -GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR
:: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::..
CCDS66 IGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKD
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490
pF1KE2 ----------------PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHI
:: :.. .: : :: .. :... : .:: ... . .
CCDS66 FSWFGFGKVKSRQGVGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPV
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KE2 IENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVA
:::::::. :. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::
CCDS66 IENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVA
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLR
::.::.::..::.::.::::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::
CCDS66 VKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLR
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGL
.::::: :.: :. : : .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:
CCDS66 AHGPDAVLMAEGNP--PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENL
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFT
.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
CCDS66 LVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFT
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 YGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQ
:::::::::::.:.:.:::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. ::
CCDS66 YGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQ
770 780 790 800 810 820
790
pF1KE2 ALAQAPPVYLDVLG
::.: :::::.::
CCDS66 NLAKASPVYLDILG
830
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:..::: .:::: . : :: .:.: .::
CCDS81 MELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINL
10 20 30
130 140 150 160 170
pF1KE2 SFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPEQKLQC----H
: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.:.: . . :.: :
CCDS81 SSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADG
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pF1KE2 GQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILTELEQSATV
.: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. : : .. ::.: : :: ..
CCDS81 SQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGL-QSINT
100 110 120 130 140 150
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... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ...:: ..: .: : .:.
CCDS81 HQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALTVYYPPRVVSLEEP
160 170 180 190 200 210
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pF1KE2 -VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPT
....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:. . . . .::: .:.::
CCDS81 ELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGE---ISEGCLLFNKPT
220 230 240 250 260 270
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pF1KE2 HVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVS-FSPVDTNSTSGDPVEKK
: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. : . ::. ... :
CCDS81 HYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKP----
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pF1KE2 DETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRP-AVLAPEDGLAMSLHFMT
.: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. : ::.. :. : :: ..
CCDS81 EEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHIN
330 340 350 360 370 380
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pF1KE2 LGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELG
: .. : . : . . : .::::::: :. :.:::::::::: :::
CCDS81 HGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELG
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 EGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFG
::::::::::::.:: : .:::::::::::. . .::.:::::::::: :::.:::.:.:
CCDS81 EGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYG
450 460 470 480 490 500
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pF1KE2 VCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDV-APGPLGLGQLLAVASQVAA
:: .: ::.::::::.:::::.:::.::::: .:. :. : : :::.:.: .:::.:.
CCDS81 VCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIAS
510 520 530 540 550 560
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pF1KE2 GMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPP
::::::. ::::::::::::::: .:.:::::::::::.::::::::
CCDS81 GMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVVQA
570 580 590 600 610
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 ESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEV
>>CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (612 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MLRGGRRGQLGWHSWAAEPGSLLAWLILASAGAAPCPDACCPHGSSGLRCTR--DGAL--
:: ... : :: : : ... . : : :: :
CCDS32 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLA-CP-ANCVCSKTEINCRRPDDGNLFP
10 20 30 40 50
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pF1KE2 -----DSLHHLPGA--------ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGL
:: . .: .:.: ..::: . :. :. :.. :..::: .:::
CCDS32 LLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 RFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWE
: . : :: .:.: .::: : : .:::. : :::.:: : : ..::: .::.: :.
CCDS32 RSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 EEGLGGVPEQKLQC----HGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEG
:.: . . :.: : .: :: .: ..: .: ..:. : .: ::.... :. :
CCDS32 EQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 RGLEQAGWILTELEQSATVMKSG----GLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAE
: .. ::.: : :: .. ... .. ...:::.::::. : ..:: ::: :: ..
CCDS32 SPLPDVDWIVTGL-QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VSVQVNVSFPASV-QLHTA-VEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFL
.:: ..: .: : .:. ....: :: : : :.: :.:.:: ::. : :...: .:.
CCDS32 ASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEH-CIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYY
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340 350 360 370 380 390
pF1KE2 EPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPV
. . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. :
CCDS32 QEGE---ISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILF
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 S-FSPVDTNSTSGDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINR
. ::. ... : .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::..
CCDS32 DEVSPTPPITVTHKP----EEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKG
420 430 440 450 460
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pF1KE2 P-AVLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTE-GKGSGLQGH----IIENPQYFSDACVHHIK
: ::.. :. : :: .. : .. : . : . . : .::::::: .. :. .
CCDS32 PVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQG--HNCH
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTM
. :
CCDS32 KPDTWVFSNIDNHGILNLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPIS
530 540 550 560 570 580
>>CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 (937 aa)
initn: 808 init1: 612 opt: 861 Z-score: 408.6 bits: 86.7 E(32554): 2e-16
Smith-Waterman score: 866; 34.4% identity (66.2% similar) in 468 aa overlap (335-783:291-748)
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAA
: : . .: : . . .: . :. :. ..
CCDS62 QTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIG-IPMADPINKNHKCYNSTGV
270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KE2 NPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSG------DPVEKKDETPFGV
. : .:.. .. . .:. : . : .:. . .: .: ..: :.:.
CCDS62 DYRGTVSVT-KSGRQCQPW--NSQYPHTHTFTALRFPELNGGHSYCRNPGNQK-EAPWCF
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTL------G
.. .. : . . .. .. . . : :.: : ::..: :. .
CCDS62 TLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIP---LAIALLFFFICVCRNNQ
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 GSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQ---YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAEC
:: .:.. . . ..:. .: . : . .... . . :::: ::::.. .
CCDS62 KSSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY--KG
440 450 460 470 480 490
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pF1KE2 HNLLPEQDK-MLVAVKALKEASESARQ-DFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLM
: :: .:. .:::.:.::. .. . .::.:: :.. :.: .:: ..:. :. .:. :
CCDS62 HLYLPGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCM
500 510 520 530 540 550
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CCDS62 LFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIAAGMEYLSSHF
560 570 580 590 600 610
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pF1KE2 FVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFT
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CCDS62 FVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPEAIMYGKFS
620 630 640 650 660 670
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pF1KE2 TESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQ
..::.:::::::::::..: ::.: .:: :.:. . . . : . :::..:..: ::.
CCDS62 SDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMYSLMTECWN
680 690 700 710 720 730
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pF1KE2 REPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
. :..: .::.:.::..
CCDS62 EIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLSNPRYPNYM
740 750 760 770 780 790
796 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:09:27 2016 done: Sun Nov 6 09:09:28 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]