Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2092
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2092, 782 aa
1>>>pF1KE2092 782 - 782 aa - 782 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.5663+/-0.00134; mu= -25.4835+/- 0.080
mean_var=780.0406+/-164.342, 0's: 0 Z-trim(114.4): 374 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.045921
statistics sampled from 14575 (14952) to 14575 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 5169 358.4 2.5e-98
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 5077 352.3 1.7e-96
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 4935 342.9 1.1e-93
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 4787 333.1 1e-90
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 4350 304.2 5.3e-82
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 4283 299.7 1.2e-80
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 3666 258.9 2.4e-68
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 1224 96.8 6.8e-20
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 974 80.1 5.4e-15
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 912 76.0 1e-13
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 905 75.6 1.4e-13
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 834 70.9 3.6e-12
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 827 70.4 5.5e-12
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 814 69.6 9.9e-12
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 809 69.2 1.1e-11
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 808 69.4 1.8e-11
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 804 69.1 2.1e-11
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 800 68.8 2.4e-11
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 800 68.8 2.5e-11
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 800 68.9 2.7e-11
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 784 67.6 3.8e-11
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 774 67.0 7.2e-11
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 774 67.0 7.5e-11
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 774 67.1 7.7e-11
>>CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 (782 aa)
initn: 5169 init1: 5169 opt: 5169 Z-score: 1878.8 bits: 358.4 E(32554): 2.5e-98
Smith-Waterman score: 5169; 100.0% identity (100.0% similar) in 782 aa overlap (1-782:1-782)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KF
::
CCDS72 KF
>>CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 (780 aa)
initn: 4322 init1: 4322 opt: 5077 Z-score: 1845.9 bits: 352.3 E(32554): 1.7e-96
Smith-Waterman score: 5077; 98.6% identity (99.2% similar) in 782 aa overlap (1-782:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS44 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: ::.::::::::
CCDS44 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKCRHHSHSAEGGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HARVK--EREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS44 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS44 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKK
:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::.:::
CCDS44 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKK
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 KF
::
CCDS44 KF
780
>>CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 (748 aa)
initn: 4935 init1: 4935 opt: 4935 Z-score: 1795.3 bits: 342.9 E(32554): 1.1e-93
Smith-Waterman score: 4935; 99.6% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (35-782:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 KDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEITIRN
...:::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSQSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEITIRN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGKHARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGKHARV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERKMREQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPRERFE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEEEEEG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 STSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 STSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVPESRF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNW
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYST
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFS
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPT
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 WPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 WPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
700 710 720 730 740
>>CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 (779 aa)
initn: 4081 init1: 4081 opt: 4787 Z-score: 1742.1 bits: 333.1 E(32554): 1e-90
Smith-Waterman score: 4956; 96.3% identity (96.8% similar) in 791 aa overlap (1-782:1-779)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS81 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :
CCDS81 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKW----------K
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRER---------DRLEQL
::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS81 HARVK--EREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERGNDGVCLFRDRLEQL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ERKRERERKMREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERKRERERKMREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHW
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SRSPPRPPRERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SRSPPRPPRERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS81 NENHLLVVPESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 YLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLR
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 EINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMI
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540 550 560 570 580 590
pF1KE2 QLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS81 QLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYR
530 540 550 560 570 580
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pF1KE2 APELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::
CCDS81 APELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPG
590 600 610 620 630 640
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YSELPVVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFR
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720 730 740 750 760 770
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGA
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780
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:::::::::::
CCDS81 SAAGPGFSLKF
770
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS44 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
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pF1KE2 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :
CCDS44 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKW----------K
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::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HARVK--EREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERFELGDGRKPVKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESGSGSEEEEEEEEEE
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pF1KE2 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSEDEERENENHLLVVP
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pF1KE2 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS44 ESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCR
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pF1KE2 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQ
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pF1KE2 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS44 HDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAK
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pF1KE2 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKK
:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::.:::
CCDS44 EYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSL
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pF1KE2 KF
::
CCDS44 KF
770
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS81 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHCMEI
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pF1KE2 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :
CCDS81 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKVHHRKDEKRKEKW----------K
70 80 90 100 110
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pF1KE2 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HARVK--EREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
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::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERFELGDGRKPGEARPAPAQKPAQLKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSED
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pF1KE2 EERENENHLLVVPESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS81 EERENENHLLVVPESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALLPIELKQ
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pF1KE2 ELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPI
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 TSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVT
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pF1KE2 LWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::
CCDS81 QWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEK
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pF1KE2 IWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKH
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IWPGYSELPVVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKH
650 660 670 680 690 700
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pF1KE2 EYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTT
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770 780
pF1KE2 NQGASAAGPGFSLKF
:::::::::::::::
CCDS81 NQGASAAGPGFSLKF
770 780
>>CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 (795 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MGDEKDSWKVKTLDEILQEKKRRKEQEEKAEIKRLKNSDDRDSKRDSLEEGELRDHRMEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TIRNSPYRREDSMEDRGEEDDSLAIKPPQQMSRKEKAHHRKDEKRKEKRRHRSHSAEGGK
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pF1KE2 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HARVKEKEREHERRKRHREEQDKARREWERQKRREMAREHSRRERDRLEQLERKRERERK
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pF1KE2 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MREQQKEQREQKERERRAEERRKEREARREVSAHHRTMREDYSDKVKASHWSRSPPRPPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE2 ERFELGDGRKP-------------VKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESG
::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERFELGDGRKPGEARPAPAQKPAQLKEEKMEERDLLSDLQDISDSERKTSSAESSSAESG
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290 300 310 320 330 340
pF1KE2 SGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SGSEEEEEEEEEEEEEGSTSEESEEEEEEEEEEEEETGSNSEEASEQSAEEVSEEEMSED
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 EERENENHLLVVPESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EERENENHLLVVPESRFDRDSGESEEAEEEVGEGTPQSSALTEGDYVPDSPALSPIELKQ
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 ELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 TSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVK
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pF1KE2 TLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVT
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pF1KE2 LWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEK
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 IWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKH
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 EYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTT
730 740 750 760 770 780
770 780
pF1KE2 NQGASAAGPGFSLKF
:::::::::::::::
CCDS72 NQGASAAGPGFSLKF
790
>>CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 (360 aa)
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Smith-Waterman score: 1224; 53.8% identity (82.3% similar) in 327 aa overlap (419-745:33-353)
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 TEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKDKKTD
::::.::. :::: :::::.::::.: .::
CCDS10 EPDLECEQIRLKCIRKEGFFTVPPEHRLGRCRSVKEFEKLNRIGEGTYGIVYRARDTQTD
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 EIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYIVMNYVEH
::::::...:.:::.:.::.:::::. .:. .::::: ..:.:::.....:..::.: :.
CCDS10 EIVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 DLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAGILKVGDF
:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.:::::.::::.. : .:..::
CCDS10 DLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 GLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQKPLFPGK
:::: :: :.: .:: ::::::::::::::. .:..:::.::::..:::...::.::
CCDS10 GLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSIDMWAVGCILAELLAHRPLLPGT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 SEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSDQGFDLMN
::: ::. . . ::::::.::::.:.:: : .... ..:::::...: ::. :. :..
CCDS10 SEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQPYNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH
250 260 270 280 290 300
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSPRPPEGGLG
.. : : .: .: : :. ::.: ::: .: ..::.: ..: ::. .: ::
CCDS10 FLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP----HHRNKRA-APATSEGQSK
310 320 330 340 350
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pF1KE2 YSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
CCDS10 RCKP
360
>>CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 (272 aa)
initn: 965 init1: 883 opt: 974 Z-score: 382.7 bits: 80.1 E(32554): 5.4e-15
Smith-Waterman score: 974; 53.1% identity (82.4% similar) in 262 aa overlap (458-717:1-261)
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV
:.:::.:.::.:::::. .:. .::::: .
CCDS32 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL
10 20 30
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH
.:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.:
CCDS32 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH
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