Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2085
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2085, 759 aa
1>>>pF1KE2085 759 - 759 aa - 759 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7622+/-0.00106; mu= 18.2218+/- 0.064
mean_var=79.1041+/-15.705, 0's: 0 Z-trim(104.7): 30 B-trim: 60 in 1/49
Lambda= 0.144203
statistics sampled from 8001 (8020) to 8001 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 759) 4978 1045.9 0
CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 659) 4320 909.0 0
CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 667) 4276 899.8 0
CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 895) 4106 864.5 0
CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 900) 4106 864.5 0
CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 913) 4106 864.5 0
CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 768) 1009 220.2 1e-56
CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 702) 932 204.1 6.2e-52
CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 745) 915 200.6 7.5e-51
CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 758) 915 200.6 7.7e-51
CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 764) 915 200.6 7.7e-51
CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 ( 776) 831 183.1 1.4e-45
CCDS31668.1 CUL5 gene_id:8065|Hs108|chr11 ( 780) 441 102.0 3.8e-21
>>CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (759 aa)
initn: 4978 init1: 4978 opt: 4978 Z-score: 5594.5 bits: 1045.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4978; 100.0% identity (100.0% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 CLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPME
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 MFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELY
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 NQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
730 740 750
>>CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (659 aa)
initn: 4320 init1: 4320 opt: 4320 Z-score: 4855.6 bits: 909.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4320; 100.0% identity (100.0% similar) in 659 aa overlap (101-759:1-659)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
580 590 600 610 620 630
740 750
pF1KE2 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650
>>CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (667 aa)
initn: 3829 init1: 3829 opt: 4276 Z-score: 4806.0 bits: 899.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4276; 98.7% identity (98.7% similar) in 667 aa overlap (101-759:1-667)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KE2 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSI--------WDMGLELFRTHI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS73 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSICPVSYCLYRDMGLELFRTHI
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCL
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAI
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMV
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNK
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHE
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 CGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVH
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMF
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKH
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQ
580 590 600 610 620 630
730 740 750
pF1KE2 LKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650 660
>>CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (895 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4106 Z-score: 4613.0 bits: 864.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4106; 82.8% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (13-759:150-895)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
CCDS43 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
120 130 140 150 160 170
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
CCDS43 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
CCDS43 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
240 250 260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS43 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
CCDS43 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
CCDS43 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
CCDS43 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS43 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
CCDS43 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
600 610 620 630 640 650
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::::
CCDS43 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKA
660 670 680 690 700 710
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS43 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
720 730 740 750 760 770
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS43 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
780 790 800 810 820 830
710 720 730 740 750
pF1KE2 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS43 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
840 850 860 870 880 890
>>CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (900 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4106 Z-score: 4612.9 bits: 864.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4106; 82.8% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (13-759:155-900)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
CCDS83 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
130 140 150 160 170 180
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
CCDS83 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
CCDS83 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
250 260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS83 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
310 320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
CCDS83 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
CCDS83 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
430 440 450 460 470 480
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
CCDS83 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
490 500 510 520 530 540
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS83 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
550 560 570 580 590 600
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
CCDS83 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
610 620 630 640 650 660
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::::
CCDS83 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKA
670 680 690 700 710 720
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS83 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
730 740 750 760 770 780
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS83 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
790 800 810 820 830 840
710 720 730 740 750
pF1KE2 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS83 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
850 860 870 880 890 900
>>CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (913 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4106 Z-score: 4612.8 bits: 864.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4106; 82.8% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (13-759:168-913)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
CCDS35 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
CCDS35 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
CCDS35 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS35 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
CCDS35 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
CCDS35 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
CCDS35 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
500 510 520 530 540 550
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS35 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
CCDS35 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
620 630 640 650 660 670
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::::
CCDS35 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKA
680 690 700 710 720 730
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS35 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
740 750 760 770 780 790
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS35 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
800 810 820 830 840 850
710 720 730 740 750
pF1KE2 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS35 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
860 870 880 890 900 910
>>CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 (768 aa)
initn: 1259 init1: 385 opt: 1009 Z-score: 1131.9 bits: 220.2 E(32554): 1e-56
Smith-Waterman score: 1707; 39.6% identity (67.5% similar) in 766 aa overlap (39-759:9-768)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 GSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRP-RLPDNYTQDTWRKLH
::.: . .: : . ..:... : :.
CCDS24 MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDEKYVNSIWDLLK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLD
.:.. .: ... ..::::. . .. :: . :: ::.. .:. .. ::: :.
CCDS24 NAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKV---REDVLN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SVL--FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISD
:. ::. .: :.:: :.:::.:....::.:: ::. . .....:: .:: ...
CCDS24 SLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNN-VENVYNLGLIIFRDQVVRY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDL-----QVYKDSFELKFLEETN
.... . .: .: :::.::.:::. .:. :: : .::...:: ::: .
CCDS24 GCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 CLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLT
.. :.:... : . :...: :..:: .::. ::.::..:.. ::..:...:.
CCDS24 EFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE2 AILQ---KGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEK
.:.. .:: :.: .... ::. ::.::::: .: ... . : :.. : :.: . .
CCDS24 TIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGE
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DK---DMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVD
: :..: :::.:.. :. . :.... : . . .:: :.: .: : .. .:
CCDS24 GKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSLFID
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKS
.::. : : :..:.: ::: :.::::.. ::::: .::. ::.:::..::.: :.::.
CCDS24 DKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 MLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDS-GPIDLTVNILTMGYW
:.:::: ::: :::::::::.:: .:. : .:.::.: . : : .:::: .:: :::
CCDS24 MISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYW
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KE2 PTY--TPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEF-----KEGK
:: :: . .. : . :.:. :::.:::::.: : .: : :.: : ::
CCDS24 PTQSATP-KCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDG
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620
pF1KE2 KE-----------------FQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQ
.: .::: :: .:..::. . ..::::.. : : . :: :.::
CCDS24 SEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQ
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 SLACGKA--RVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQVSTT
:::::: ::: : ::.::.:.: : : .: :: :.::. . : :. :. :
CCDS24 SLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETR
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 ERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLK--FPVKPGDLKKRIESLIDRD
..: .::...:.:::::::: :: . ::.::.:. .::: : .: .:::::.::.:.
CCDS24 QKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIERE
700 710 720 730 740 750
750
pF1KE2 YMERDKDNPNQYHYVA
:. : .. . : :::
CCDS24 YLARTPEDRKVYTYVA
760
>>CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 (702 aa)
initn: 1315 init1: 385 opt: 932 Z-score: 1045.9 bits: 204.1 E(32554): 6.2e-52
Smith-Waterman score: 1615; 40.8% identity (68.3% similar) in 693 aa overlap (111-759:13-702)
90 100 110 120 130
pF1KE2 YNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL--FLKKINTC
. ... . .: ::: :.:. ::. .:
CCDS58 MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPVREDVLNSLNNNFLQTLNQA
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 WQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILL
:.:: :.:::.:....::.:: ::. . .....:: .:: ... .... . .:
CCDS58 WNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNN-VENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLD
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 LIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDL-----QVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQE
.: :::.::.:::. .:. :: : .::...:: ::: . .. :.:... :
CCDS58 MIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAE
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 REVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQ---KGLDHL
. :...: :..:: .::. ::.::..:.. ::..:...:. .:.. .:: :.
CCDS58 NSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHM
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360
pF1KE2 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDK---DMVQDLLD
: .... ::. ::.::::: .: ... . : :.. : :.: . . : :..: :::
CCDS58 LKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLD
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDE
.:.. :. . :.... : . . .:: :.: .: : .. .:.::. : : :..
CCDS58 LKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQ
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAF
:.: ::: :.::::.. ::::: .::. ::.:::..::.: :.::.:.:::: ::: :
CCDS58 EVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQF
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDS-GPIDLTVNILTMGYWPTY--TPMEVHLT
::::::::.:: .:. : .:.::.: . : : .:::: .:: ::::: :: . ..
CCDS58 TSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATP-KCNIP
410 420 430 440 450
550 560 570 580
pF1KE2 PEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEF-----KEGKKE-----------
: . :.:. :::.:::::.: : .: : :.: : :: .:
CCDS58 PAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGS
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 ------FQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKA--RVLI
.::: :: .:..::. . ..::::.. : : . :: :.:::::::: :::
CCDS58 NTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLT
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690
pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDA
: ::.::.:.: : : .: :: :.::. . : :. :. : ..: .::...:.:
CCDS58 KEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEA
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 AIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLK--FPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYH
::::::: :: . ::.::.:. .::: : .: .:::::.::.:.:. : .. . :
CCDS58 AIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYT
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 YVA
:::
CCDS58 YVA
700
>>CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (745 aa)
initn: 642 init1: 314 opt: 915 Z-score: 1026.4 bits: 200.6 E(32554): 7.5e-51
Smith-Waterman score: 993; 28.6% identity (61.3% similar) in 754 aa overlap (51-759:4-745)
30 40 50 60 70
pF1KE2 LTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSI-
.::. : ..:: :: ...:: .
CCDS71 MSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RYNLEELYQAVENLCSHKVSPM---LYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKIN
: . .. .. . :: :. :: . . :.::. .. .: ..:: . .
CCDS71 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVM--YH
40 50 60 70 80
140 150 160 170
pF1KE2 TCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYV---------LQ--------NSTLPSIWDMGLELFR
:... . .. .. .:. .. :: : : : ...:...:
CCDS71 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 THIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKF----
.. .:. : .: :. .:.:: .......... . .. :: .: :::
CCDS71 KLMVEP--LQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 -----LEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACV
: ::. : :.. :.:: . .:...: ::..: : :: :. .:
CCDS71 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTA
.......:: .:. ... ... :.:.:: :. : : ..:. ...:. :
CCDS71 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE2 IVINPEKDKD---MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKR-PN---
. : ... .:...:. . : ..:.. .. ...:.. . ... . .: : :.
CCDS71 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 KPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
: ::.::. :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS71 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQS---DSGP
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.. ..::. : :
CCDS71 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLG-
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KE2 IDLTVNILTMGYWP-TYTPMEVHLTP-EMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVL
:.. . .: : :: : .: . : :. : ..:. :: . ::::: : : . .
CCDS71 ISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEV
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 KAEFKEGKKEF-QVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKAR
: .. :: .:. .: ::: ::... :..:.. .: ....:: .:..:: ..
CCDS71 KMNYL-GKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVK
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 VLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQID
.. .. . .... ..: .: .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..
CCDS71 MINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQ
630 640 650 660 670 680
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 AAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD--LKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQY
:::::::: ::.: :: :..:. .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:
CCDS71 AAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEY
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 HYVA
:::
CCDS71 SYVA
>>CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (758 aa)
initn: 642 init1: 314 opt: 915 Z-score: 1026.3 bits: 200.6 E(32554): 7.7e-51
Smith-Waterman score: 993; 28.6% identity (61.3% similar) in 754 aa overlap (51-759:17-758)
30 40 50 60 70
pF1KE2 LTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSI-
.::. : ..:: :: ...:: .
CCDS73 MVPGKEFQHYTCTMSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RYNLEELYQAVENLCSHKVSPM---LYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKIN
: . .. .. . :: :. :: . . :.::. .. .: ..:: . .
CCDS73 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVM--YH
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170
pF1KE2 TCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYV---------LQ--------NSTLPSIWDMGLELFR
:... . .. .. .:. .. :: : : : ...:...:
CCDS73 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 THIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKF----
.. .:. : .: :. .:.:: .......... . .. :: .: :::
CCDS73 KLMVEP--LQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 -----LEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACV
: ::. : :.. :.:: . .:...: ::..: : :: :. .:
CCDS73 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTA
.......:: .:. ... ... :.:.:: :. : : ..:. ...:. :
CCDS73 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KE2 IVINPEKDKD---MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKR-PN---
. : ... .:...:. . : ..:.. .. ...:.. . ... . .: : :.
CCDS73 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 KPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
: ::.::. :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS73 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQS---DSGP
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.. ..::. : :
CCDS73 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLG-
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570
pF1KE2 IDLTVNILTMGYWP-TYTPMEVHLTP-EMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVL
:.. . .: : :: : .: . : :. : ..:. :: . ::::: : : . .
CCDS73 ISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEV
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 KAEFKEGKKEF-QVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKAR
: .. :: .:. .: ::: ::... :..:.. .: ....:: .:..:: ..
CCDS73 KMNYL-GKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVK
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 VLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQID
.. .. . .... ..: .: .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..
CCDS73 MINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQ
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 AAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD--LKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQY
:::::::: ::.: :: :..:. .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:
CCDS73 AAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEY
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 HYVA
:::
CCDS73 SYVA
759 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:32:02 2016 done: Sun Nov 6 14:32:03 2016
Total Scan time: 3.660 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]