FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2077, 745 aa
1>>>pF1KE2077 745 - 745 aa - 745 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1324+/-0.00143; mu= 15.9544+/- 0.085
mean_var=77.7857+/-15.481, 0's: 0 Z-trim(99.1): 46 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.145420
statistics sampled from 5604 (5627) to 5604 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.504), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 745) 4872 1032.7 0
CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 758) 4872 1032.7 0
CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 764) 4872 1032.7 0
CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 ( 776) 1609 348.2 2.9e-95
CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 895) 982 216.6 1.3e-55
CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 900) 982 216.6 1.3e-55
CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 913) 982 216.6 1.3e-55
CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 659) 915 202.5 1.7e-51
CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 667) 915 202.5 1.7e-51
CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 759) 915 202.6 1.9e-51
CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 768) 666 150.3 1e-35
CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 702) 664 149.9 1.3e-35
CCDS31668.1 CUL5 gene_id:8065|Hs108|chr11 ( 780) 539 123.7 1.1e-27
>>CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (745 aa)
initn: 4872 init1: 4872 opt: 4872 Z-score: 5523.7 bits: 1032.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4872; 100.0% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (1-745:1-745)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 TKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 IHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 TPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKK
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE2 CIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
:::::::::::::::::::::::::
CCDS71 CIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
730 740
>>CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (758 aa)
initn: 4872 init1: 4872 opt: 4872 Z-score: 5523.5 bits: 1032.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4872; 100.0% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (1-745:14-758)
10 20 30 40
pF1KE2 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MVPGKEFQHYTCTMSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 KNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 QESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 QEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 ENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGY
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 EFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 AIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLA
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 FNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSK
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 RTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQS
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740
pF1KE2 RARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
730 740 750
>>CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (764 aa)
initn: 4872 init1: 4872 opt: 4872 Z-score: 5523.5 bits: 1032.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4872; 100.0% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (1-745:20-764)
10 20 30 40
pF1KE2 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MYRVTWSTFWLRFQHYTCTMSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 IYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 DCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 MLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 EASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 CHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPTLFVE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKYCDNLLKK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 KQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQ
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 APSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQ
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 MAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDAESSFSLN
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 MNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQ
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740
pF1KE2 EVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
730 740 750 760
>>CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 (776 aa)
initn: 1583 init1: 676 opt: 1609 Z-score: 1823.7 bits: 348.2 E(32554): 2.9e-95
Smith-Waterman score: 1726; 37.0% identity (68.2% similar) in 779 aa overlap (8-745:15-776)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPE--
. .:. :. : . :. : . . .. . . .. .: :.. .
CCDS34 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSN
10 20 30 40 50 60
60 70 80
pF1KE2 -------P---------------LGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLE-SEEQVLVMYH
: .: .:: . : ::.:.. .: : . .:.:: .:
CCDS34 QARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYT
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
. ::.: .. .. . ::: ..... : : : :. .:: ::: ::
CCDS34 QQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR----ECD--EGRKGI------YEIYSLALVTWR
130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHV-----EQYKKKFPLKFY
. .::. . .:. :...:.:: : ..: ::..:.:.. . . : : :
CCDS34 DCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVY
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVI
.: ::: ::..: ..: .:....::.. ..::.:. .:: .:. : . ::: :. ..
CCDS34 KESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELA
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 HECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEG
..:.: .. ::...:.: .:.. .:..:.. :: :. .. :: .. . :..:::..:
CCDS34 RKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQG
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
pF1KE2 LRATSNLTQE--NMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNY---
: : . . : : ..:..::.:: :. :. ...:.: :..::::: .:
CCDS34 LAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAV
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 -REPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYAR
. .: :.:::::.:::.:::::.:. : :.:: :.. ..:::::.::::::::::.
CCDS34 TKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAK
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 MLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQ
::::::.: : : :.: .::.:::::::.:.::::.::. :..:: :::..:.. . :.
CCDS34 MLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNS
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 DTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLH
. : ..:.: ::..:.::. : : :::.:.:::.: : : ::... ::::::::.
CCDS34 EP---LDLDFSIQVLSSGSWPFQQ--SCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLY
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 YLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSL
: ::. : . . :. ...:.:::.:: .:. .. . ..: ::::.. :..... :
CCDS34 QLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQIL
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 LDVKMINHDSEKEDIDA-----ESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAV
: :.. ..:. ..: .. ..: .....:. . .:.. :. . ::.: :.. .
CCDS34 LKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNI
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 DEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIE
.::::. .::::::::: ::::.:. :. ::..: .::.: . .:::::..::.:.:.:
CCDS34 EEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLE
710 720 730 740 750 760
740
pF1KE2 RSQASADEYSYVA
: .. : :::.:
CCDS34 RVDGEKDTYSYLA
770
>>CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (895 aa)
initn: 841 init1: 326 opt: 982 Z-score: 1111.8 bits: 216.6 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1076; 29.0% identity (63.1% similar) in 753 aa overlap (4-745:187-895)
10 20 30
pF1KE2 MSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
::.. . ::::.:: ...:. .
CCDS43 GLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80
pF1KE2 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVMYH--
. . .. .. . :: .: .. :: . . . :.:.. ..:. .: ..:: . .
CCDS43 KYNLEELYQAVENLC-SY--KISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKID
220 230 240 250 260 270
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
: :... . .. .. .:. .. .:.. : : ...:...:
CCDS43 RCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSM-----------------LPSIWDMGLELFR
280 290 300 310
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLMV--EPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
.. . .: : .: :. .:.:: .......... . :..::.
CCDS43 AHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSD---------LQIYQDS
320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
::. :: ::.. : :...:.:: . .:...: ::..: : :: .. ..:
CCDS43 FEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATV
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
.......:: .:. .:.. ... .:.. .: :. : :. ..:. ..:. :
CCDS43 EKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFG--
430 440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
.: .. :. :. :. .:. . : ..:. . ...:..:. .:. . .: : :.
CCDS43 STIVINPEKDKTM-VQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKR-PN---
490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
: ::.::: :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS43 KPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGI
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.....::. . .:
CCDS43 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQN--VPGNI
600 610 620 630 640 650
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 SFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVK
. . .: : :: : .: . .: :. : ..:. :: . ::::: : : .:
CCDS43 ELTVNILTMGYWP-TYVPMEVH-LPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLK
660 670 680 690 700 710
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 MNYL-GKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVKM
.. :: . .:. .: ::: ::..: : .:....: ... :: .:..:: ...
CCDS43 AEFKEGKKEL-QVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARV
720 730 740 750 760 770
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 INHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQA
. .. . .::. ..: : .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..:
CCDS43 LAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDA
780 790 800 810 820 830
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 AIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYS
::::::: ::.: :: :..:: .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:.
CCDS43 AIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPAD--LKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYN
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 YVA
:.:
CCDS43 YIA
>>CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (900 aa)
initn: 841 init1: 326 opt: 982 Z-score: 1111.7 bits: 216.6 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1076; 29.0% identity (63.1% similar) in 753 aa overlap (4-745:192-900)
10 20 30
pF1KE2 MSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
::.. . ::::.:: ...:. .
CCDS83 GLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-
170 180 190 200 210 220
40 50 60 70 80
pF1KE2 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVMYH--
. . .. .. . :: .: .. :: . . . :.:.. ..:. .: ..:: . .
CCDS83 KYNLEELYQAVENLC-SY--KISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKID
230 240 250 260 270
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
: :... . .. .. .:. .. .:.. : : ...:...:
CCDS83 RCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSM-----------------LPSIWDMGLELFR
280 290 300 310 320
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLMV--EPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
.. . .: : .: :. .:.:: .......... . :..::.
CCDS83 AHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSD---------LQIYQDS
330 340 350 360 370
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
::. :: ::.. : :...:.:: . .:...: ::..: : :: .. ..:
CCDS83 FEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATV
380 390 400 410 420 430
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
.......:: .:. .:.. ... .:.. .: :. : :. ..:. ..:. :
CCDS83 EKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFG--
440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
.: .. :. :. :. .:. . : ..:. . ...:..:. .:. . .: : :.
CCDS83 STIVINPEKDKTM-VQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKR-PN---
490 500 510 520 530 540
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
: ::.::: :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS83 KPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
550 560 570 580 590 600
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGI
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.....::. . .:
CCDS83 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQN--VPGNI
610 620 630 640 650 660
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 SFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVK
. . .: : :: : .: . .: :. : ..:. :: . ::::: : : .:
CCDS83 ELTVNILTMGYWP-TYVPMEVH-LPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLK
670 680 690 700 710 720
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 MNYL-GKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVKM
.. :: . .:. .: ::: ::..: : .:....: ... :: .:..:: ...
CCDS83 AEFKEGKKEL-QVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARV
730 740 750 760 770
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 INHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQA
. .. . .::. ..: : .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..:
CCDS83 LAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDA
780 790 800 810 820 830
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 AIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYS
::::::: ::.: :: :..:: .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:.
CCDS83 AIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPAD--LKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYN
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 YVA
:.:
CCDS83 YIA
900
>>CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (913 aa)
initn: 841 init1: 326 opt: 982 Z-score: 1111.6 bits: 216.6 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1076; 29.0% identity (63.1% similar) in 753 aa overlap (4-745:205-913)
10 20 30
pF1KE2 MSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
::.. . ::::.:: ...:. .
CCDS35 GLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80
pF1KE2 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVMYH--
. . .. .. . :: .: .. :: . . . :.:.. ..:. .: ..:: . .
CCDS35 KYNLEELYQAVENLC-SY--KISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKID
240 250 260 270 280 290
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
: :... . .. .. .:. .. .:.. : : ...:...:
CCDS35 RCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSM-----------------LPSIWDMGLELFR
300 310 320 330
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLMV--EPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
.. . .: : .: :. .:.:: .......... . :..::.
CCDS35 AHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSD---------LQIYQDS
340 350 360 370 380
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
::. :: ::.. : :...:.:: . .:...: ::..: : :: .. ..:
CCDS35 FEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATV
390 400 410 420 430 440
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
.......:: .:. .:.. ... .:.. .: :. : :. ..:. ..:. :
CCDS35 EKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFG--
450 460 470 480 490 500
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
.: .. :. :. :. .:. . : ..:. . ...:..:. .:. . .: : :.
CCDS35 STIVINPEKDKTM-VQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKR-PN---
510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
: ::.::: :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS35 KPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGI
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.....::. . .:
CCDS35 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQN--VPGNI
620 630 640 650 660 670
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 SFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVK
. . .: : :: : .: . .: :. : ..:. :: . ::::: : : .:
CCDS35 ELTVNILTMGYWP-TYVPMEVH-LPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLK
680 690 700 710 720 730
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 MNYL-GKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVKM
.. :: . .:. .: ::: ::..: : .:....: ... :: .:..:: ...
CCDS35 AEFKEGKKEL-QVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARV
740 750 760 770 780 790
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 INHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQA
. .. . .::. ..: : .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..:
CCDS35 LAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDA
800 810 820 830 840 850
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 AIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYS
::::::: ::.: :: :..:: .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:.
CCDS35 AIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPAD--LKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYN
860 870 880 890 900 910
pF1KE2 YVA
:.:
CCDS35 YIA
>>CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (659 aa)
initn: 611 init1: 314 opt: 915 Z-score: 1037.9 bits: 202.5 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 947; 28.8% identity (61.9% similar) in 698 aa overlap (57-745:2-659)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 LEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLV
:: . . :.::. .. .: ..::
CCDS95 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 M--YHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELA
. . :... . .. .. .:. .. :: : : : ...
CCDS95 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYV---------LQ--------NSTLPSIWDMG
40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LDMWRKLMVEP--LQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLK
:...: .. .:. : .: :. .:.:: .......... . .. :: .: ::
CCDS95 LELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELK
80 90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTK
: : ::. : :.. :.:: . .:...: ::..: : :: :.
CCDS95 F---------LEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKP
140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VIHECQQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIH
.: .......:: .:. ... ... :.:.:: :. : : ..:. ...:.
CCDS95 LIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIK
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 DEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYRE
: . : ... .:...:. . : ..:.. .. ...:.. . ... . .: :
CCDS95 TFGTAIVINPEKDKD---MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKR-
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 PKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLA
:. : ::.::. :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . ::
CCDS95 PN---KPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLA
310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 KRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTV
:::. : : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.. ..::.
CCDS95 KRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQS--
360 370 380 390 400 410
510 520 530 540 550
pF1KE2 IDLG-ISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYL
: : :.. . .: : :: : .: . : :. : ..:. :: . ::::: : :
CCDS95 -DSGPIDLTVNILTMGYWP-TYTPMEVHLTP-EMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTL
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 CTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL-
. .: .. .:. .: ::: ::... :..:.. .: ....:: .:..::
CCDS95 GHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLAC
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 -DVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRK
.... .. . .... ..: .: .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.
CCDS95 GKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQ
540 550 560 570 580 590
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 MYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQAS
. ..:::::::: ::.: :: :..:. .: . .:. .:: :: :::..:.::.. .
CCDS95 YQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD--LKKRIESLIDRDYMERDKDN
600 610 620 630 640 650
740
pF1KE2 ADEYSYVA
..: :::
CCDS95 PNQYHYVA
>>CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (667 aa)
initn: 638 init1: 314 opt: 915 Z-score: 1037.8 bits: 202.5 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 949; 28.5% identity (62.5% similar) in 698 aa overlap (57-745:2-667)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 LEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLV
:: . . :.::. .. .: ..::
CCDS73 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 M--YHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELA
. . :... . .. .. .:. .. .:. . .: :.. ...
CCDS73 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSICPVSYC-------LYR--DMG
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LDMWRKLMVEP--LQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLK
:...: .. .:. : .: :. .:.:: .......... . .. :: .: ::
CCDS73 LELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELK
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTK
: : ::. : :.. :.:: . .:...: ::..: : :: :.
CCDS73 F---------LEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKP
150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VIHECQQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIH
.: .......:: .:. ... ... :.:.:: :. : : ..:. ...:.
CCDS73 LIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIK
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 DEGLRATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYRE
: . : ... .:...:. . : ..:.. .. ...:.. . ... . .: :
CCDS73 TFGTAIVINPEKDKD---MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKR-
260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 PKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLA
:. : ::.::. :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . ::
CCDS73 PN---KPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLA
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 KRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTV
:::. : : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.. ..::.
CCDS73 KRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQS--
370 380 390 400 410 420
510 520 530 540 550
pF1KE2 IDLG-ISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYL
: : :.. . .: : :: : .: . : :. : ..:. :: . ::::: : :
CCDS73 -DSGPIDLTVNILTMGYWP-TYTPMEVHLTP-EMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTL
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 CTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL-
. .: .. .:. .: ::: ::... :..:.. .: ....:: .:..::
CCDS73 GHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLAC
490 500 510 520 530 540
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 -DVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRK
.... .. . .... ..: .: .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.
CCDS73 GKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQ
550 560 570 580 590 600
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 MYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQAS
. ..:::::::: ::.: :: :..:. .: . .:. .:: :: :::..:.::.. .
CCDS73 YQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD--LKKRIESLIDRDYMERDKDN
610 620 630 640 650
740
pF1KE2 ADEYSYVA
..: :::
CCDS73 PNQYHYVA
660
>>CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (759 aa)
initn: 642 init1: 314 opt: 915 Z-score: 1036.9 bits: 202.6 E(32554): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 993; 28.4% identity (61.1% similar) in 753 aa overlap (4-745:51-759)
10 20 30
pF1KE2 MSLKPRVVD--FDETWNKLLTTIKAVVMLEYVE
.::. : ..:: :: ...:: .
CCDS41 LTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSI-
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE2 RATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVR-HLHKRVLESEEQVLVM--YH
: . .. .. . :: :. :: . . :.::. .. .: ..:: . .
CCDS41 RYNLEELYQAVENLCSHKVSPM---LYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKIN
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
:... . .. .. .:. .. :: : : : ...:...:
CCDS41 TCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYV---------LQ--------NSTLPSIWDMGLELFR
140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLMVEP--LQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEI
.. .:. : .: :. .:.:: .......... . .. :: .: :::
CCDS41 THIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKF----
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHEC
: ::. : :.. :.:: . .:...: ::..: : :: :. .:
CCDS41 -----LEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACV
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 QQRMVADHLQ-FLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLR
.......:: .:. ... ... :.:.:: :. : : ..:. ...:. :
CCDS41 EKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTA
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVC
. : ... .:...:. . : ..:.. .. ...:.. . ... . .: : :.
CCDS41 IVINPEKDKD---MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKR-PN---
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 KAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIH
: ::.::. :. :. . : :..:.: : ... .:..: ::::. :: . :::::.
CCDS41 KPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLV
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLG-
: : :.:.:..:..:::. :: :::::. :. :: .: :. .:.. ..::. : :
CCDS41 GKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQS---DSGP
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 ISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEV
:.. . .: : :: : .: . : :. : ..:. :: . ::::: : : . .
CCDS41 IDLTVNILTMGYWP-TYTPMEVHLTP-EMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVL
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 KMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSLL--DVKM
: .. .:. .: ::: ::... :..:.. .: ....:: .:..:: ...
CCDS41 KAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARV
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 INHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQA
. .. . .... ..: .: .:. : ..::. ..:.: .:. .: : .::.. ..:
CCDS41 LIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDA
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 AIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYS
::::::: ::.: :: :..:. .: . .:. .:: :: :::..:.::.. . ..:
CCDS41 AIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD--LKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYH
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 YVA
:::
CCDS41 YVA
745 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 15:32:46 2016 done: Sun Nov 6 15:32:47 2016
Total Scan time: 2.910 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]