Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2075
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2075, 739 aa
1>>>pF1KE2075 739 - 739 aa - 739 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1628+/-0.000732; mu= -5.4098+/- 0.045
mean_var=289.5337+/-58.328, 0's: 0 Z-trim(109.6): 361 B-trim: 33 in 1/53
Lambda= 0.075375
statistics sampled from 17403 (17808) to 17403 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 11.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001069 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pr ( 739) 4801 537.5 7.3e-152
NP_001186763 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion ( 677) 4062 457.1 1.1e-127
NP_542413 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pr ( 647) 2309 266.5 2.5e-70
XP_016857926 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (4976) 401 59.7 3.4e-07
XP_011508340 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (5518) 401 59.7 3.7e-07
NP_114141 (OMIM: 603075,608548) hemicentin-1 precu (5635) 401 59.7 3.7e-07
XP_006713145 (OMIM: 609938) PREDICTED: cell adhesi ( 395) 334 51.5 7.6e-06
XP_016861552 (OMIM: 609938) PREDICTED: cell adhesi ( 397) 334 51.6 7.6e-06
NP_001161147 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule ( 404) 334 51.6 7.7e-06
XP_006713144 (OMIM: 609938) PREDICTED: cell adhesi ( 435) 334 51.6 8.1e-06
NP_001161146 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule ( 435) 334 51.6 8.1e-06
NP_694854 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule 2 ( 437) 334 51.6 8.2e-06
XP_016861551 (OMIM: 609938) PREDICTED: cell adhesi ( 449) 334 51.6 8.3e-06
NP_001243434 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule ( 287) 301 47.9 7.1e-05
NP_001243433 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule ( 287) 301 47.9 7.1e-05
NP_001243432 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule ( 327) 301 47.9 7.9e-05
NP_001243431 (OMIM: 609938) cell adhesion molecule ( 327) 301 47.9 7.9e-05
NP_001106970 (OMIM: 611128) MAM domain-containing ( 956) 286 46.6 0.00055
XP_011534821 (OMIM: 611128) PREDICTED: MAM domain- ( 980) 286 46.6 0.00056
NP_001333012 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 pre (1040) 280 46.0 0.00093
NP_005067 (OMIM: 190197,615400) contactin-2 precur (1040) 280 46.0 0.00093
XP_016857688 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: cont (1182) 280 46.0 0.001
XP_016857687 (OMIM: 190197,615400) PREDICTED: cont (1187) 280 46.0 0.001
XP_011515761 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin ( 757) 265 44.3 0.0023
XP_016873418 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 ( 573) 258 43.4 0.0031
NP_001230200 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 3 ( 911) 262 44.0 0.0033
XP_011541175 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 ( 647) 258 43.5 0.0034
XP_016873416 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 ( 647) 258 43.5 0.0034
XP_016873417 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 ( 647) 258 43.5 0.0034
NP_780775 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 2 pre (1026) 262 44.0 0.0036
XP_011541173 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 (1026) 262 44.0 0.0036
NP_001230199 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 1 (1100) 262 44.1 0.0038
XP_016873415 (OMIM: 607219) PREDICTED: contactin-5 (1100) 262 44.1 0.0038
NP_055176 (OMIM: 607219) contactin-5 isoform 1 pre (1100) 262 44.1 0.0038
NP_705691 (OMIM: 609626) MAM domain-containing gly ( 955) 251 42.8 0.0077
XP_016866223 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 961) 251 42.8 0.0078
XP_011527635 (OMIM: 600751) PREDICTED: sialoadhesi (1173) 253 43.1 0.0078
XP_006715119 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 973) 251 42.8 0.0079
XP_011527634 (OMIM: 600751) PREDICTED: sialoadhesi (1506) 253 43.2 0.0094
XP_011527633 (OMIM: 600751) PREDICTED: sialoadhesi (1620) 253 43.2 0.01
>>NP_001069 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion protei (739 aa)
initn: 4801 init1: 4801 opt: 4801 Z-score: 2847.5 bits: 537.5 E(85289): 7.3e-152
Smith-Waterman score: 4801; 100.0% identity (100.0% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQIDSPLSGKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQIDSPLSGKVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSGGLVNGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSGGLVNGSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 APKILWSRQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APKILWSRQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSIDGAYTIRKAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSIDGAYTIRKAQL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFA
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE2 RKANMKGSYSLVEAQKSKV
:::::::::::::::::::
NP_001 RKANMKGSYSLVEAQKSKV
730
>>NP_001186763 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pro (677 aa)
initn: 4366 init1: 4055 opt: 4062 Z-score: 2413.7 bits: 457.1 E(85289): 1.1e-127
Smith-Waterman score: 4246; 91.6% identity (91.6% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTG---------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPE
:::::::
NP_001 -----------------------------------------------------SFPKDPE
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEV
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGG
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQIDSPLSGKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQIDSPLSGKVR
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSGGLVNGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSGGLVNGSS
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKA
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFP
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 APKILWSRQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APKILWSRQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSIDGAYTIRKAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSIDGAYTIRKAQL
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFA
600 610 620 630 640 650
730
pF1KE2 RKANMKGSYSLVEAQKSKV
:::::::::::::::::::
NP_001 RKANMKGSYSLVEAQKSKV
660 670
>>NP_542413 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion protei (647 aa)
initn: 2925 init1: 2199 opt: 2309 Z-score: 1383.7 bits: 266.5 E(85289): 2.5e-70
Smith-Waterman score: 3986; 87.4% identity (87.6% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 TQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 TFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQIDSPLSGKVR
:::::::::
NP_542 RKEVELIVQ---------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSGGLVNGSS
.::::::::::::::::::
NP_542 -----------------------------------------AFPRDPEIEMSGGLVNGSS
310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKA
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 LVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFP
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 APKILWSRQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 APKILWSRQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSIDGAYTIRKAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSIDGAYTIRKAQL
510 520 530 540 550 560
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFA
570 580 590 600 610 620
730
pF1KE2 RKANMKGSYSLVEAQKSKV
:::::::::::::::::::
NP_542 RKANMKGSYSLVEAQKSKV
630 640
>>XP_016857926 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemicent (4976 aa)
initn: 370 init1: 126 opt: 401 Z-score: 250.2 bits: 59.7 E(85289): 3.4e-07
Smith-Waterman score: 463; 25.0% identity (52.3% similar) in 709 aa overlap (38-685:2028-2677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 ILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWRTQIDSPL
.......: : . . : .:: . .::
XP_016 KHYEVKVYIPPIINKGDLWGPGLSPKEVKIKVNNTLTLECEAYAIPSASLSWYKD-GQPL
2000 2010 2020 2030 2040 2050
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 --NGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPEI-HLS
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.:. .. . .. . :. ..... :..::. : .: : : : : ..:::
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.....: .: : .. . :.: :.::. : .:: ..:. . : :. :.
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:.... : :... .: .: .. .: . .. . ..: ::. ::. : :
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pF1KE2 HSYLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPKDPEIHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEI
: : :. . ... .. :: .. . : ...:... . : ..
NP_114 --YGCLASNSAGTDKQNSTLRYIEAPKLMVVQSELLVALGDITVMECKTSGIPPP---QV
680 690 700 710 720 730
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEVTFTPVIEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSVPTV
.::: .. . :: .: :.. : . : : .: : :.:
NP_114 KWFKGDLELRPSTFLIIDPLLGL----LKIQETQDL-DAGDY-TCVA---INEAG-----
740 750 760 770
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pF1KE2 RQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGGSVTMTCSSEGLPAPEIFWSKKLDN------
.:. .. . .. . :. ..... :..::. : .: : : : : ..:::
NP_114 -RATGKITLDVGSPPVFIQEPADVSMEIGSNVTLPCYVQGYPEPTIKW-RRLDNMPIFSR
780 790 800 810 820 830
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pF1KE2 ----GNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKNRKEVELIVQE--KPFTVEIS
.....: .: : .. . :.: :.::. : .:: ..:. . : :. :.
NP_114 PFSVSSISQLRTGA-LFILNLWASDKGTYICEAENQFGKIQSETTVTVTGLVAPL---IG
840 850 860 870 880 890
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pF1KE2 PGPRIAAQI-GDSVMLTCSVM-GCESPSFSWRTQ----IDSPLSGKVRSEGTNSTLTLSP
.: .: : :... : :... : : : . ...: :::.:. : .
NP_114 ISPSVANVIEGQQLTLPCTLLAGNPIPERRWIKNSAMLLQNPYI-TVRSDGS---LHIER
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pF1KE2 VSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSGGLVNGSSVTVSCKVPSVYP
:.... : :... .: .: .. .: . .. . ..: ::. ::. : :
NP_114 VQLQDGGEYTCVASNVAGTNNKTTSVVVHVLPTIQHGQQILSTIEGIPVTLPCKA-SGNP
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pF1KE2 LDRLEIELLKGETI-LENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKALVCQAKLHIDD
. : ::: : . .: .: :: : : :..:. :: : .
NP_114 KPSV-IWSKKGELISTSSAKFSAGAD-GSLYVVS------PGGEESGE-YVCTAT---NT
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pF1KE2 MEFEPKQRQSTQTLYVNVAPR---DTTVLVSPSSI---LEEGSSVNMTCLSQGFPAPKIL
. .. : : : : :: : : . . . . : :.. : ...: : :
NP_114 AGYAKRKVQ----LTVYVRPRVFGDQRGLSQDKPVEISVLAGEEVTLPCEVKSLPPPIIT
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pF1KE2 WSR--QL--PNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTPK
:.. :: : . . . .... . :. :::.::: . : :: . :.: ..: ::
NP_114 WAKETQLISPFSPRHTFLPSGSMKITETRTSDSGMYLCVATNIAGNVTQAVKLNVHVPPK
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pF1KE2 DIKLTAFPSE-SVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAET----GDTVLKSIDGAYTIR
. :.. .:. :. : : :. ..: : .: . : :. ... ::. .:
NP_114 ---IQRGPKHLKVQVGQRVDIPCNAQGTPLPVITWSKGGSTMLVDGEHHVSNPDGTLSID
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pF1KE2 KAQLKDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMI
.: .:::.: : . : .:.. .:: :: . .: :
NP_114 QATPSDAGIYTCVATNIAGTDETEITLHVQEPPTVEDLEPPYNTTFQERVANQRIEFPCP
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pF1KE2 IYFARKANMKGSYSLVEAQKSKV
NP_114 AKGTPKPTIKWLHNGRELTGREPGISILEDGTLLVIASVTPYDNGEYICVAVNEAGTTER
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.......: : . . : .:: . .::
NP_114 KHYEVKVYIPPIINKGDLWGPGLSPKEVKIKVNNTLTLECEAYAIPSASLSWYKD-GQPL
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. .:. .. :: .. ..... : :.:. . . : ..:.: :. .. ...
NP_114 KSDDHVNIAANGHTLQIKEAQISDTGRYTCVASNIAGEDELDFDVNIQVPPSFQKLWEIG
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pF1KE2 GPLEAGK-----------PITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSL
. :..:. ::.. : . . : . : : . :.. : :
NP_114 NMLDTGRNGEAKDVIINNPISLYCETNAAPPP---TLTWYKDGHPLTSSD-------KVL
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pF1KE2 ETKSLEVTFTPV--IEDIGKVLVCRAKLHIDEMDSV---------PTVRQAVKELQVYIS
. .: : .:: :. .: : . : ::. : .. : ..:
NP_114 ILPGGRVLQIPRAKVEDAGRY-TCVAVNEAGE-DSLQYDVRVLVPPIIKGANSDL-----
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:..... :: :. .. : : : :::. :.: :.. . . ::.. : .
NP_114 PEEVTVLVNKSALIE--------CLSSGSPAPRNSWQKDGQPLLEDDHHKFLSNGRILQI
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. .. : : ::: . : :. .: .: :. : .. ::. ... ... . :::
NP_114 LNTQITDIGRYVCVAENTAGSAKKYFNLNVHVPPSVI----GPKSENLTVVVNNFISLTC
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: : :..:: . ..:.. .. . . . ::. . . . : : . . .
NP_114 EVSGFPPPDLSW-LKNEQPIKLNTNTLIVPGGRTLQIIRAKVSDGGEYTCIAINQAGESK
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: ... .: : .: . : : ..:: :.::.. :. .: : : : :. :
NP_114 KKFSLTVYVPPSIKDHDSE-SLSVVNVREGTSVSLECESNAVPPP---VITWYKNGRMIT
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pF1KE2 EN--IEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKALVCQAKLHI---DDMEFEPKQRQST
:. .:.: : .: :. :. :.. :::. ::.: ... :: .:.
NP_114 ESTHVEILADGQM--LHIKKAEVS------DTGQ-YVCRA-INVAGRDDKNFH-------
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: : : : . .: :.: :. :..:: . :.: : : : ... :.
NP_114 --LNVYVPPS----IEGPEREVIVETISNPVTLTCDATGIPPPTIAWLKNHKRIENSDSL
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:.. :: .. : . .. ::: : : . :. :...: : ::: :. . . .::. :
NP_114 EVRILSGGSKLQIARSQHSDSGNYTCIASNMEGKAQKYYFLSIQVPPS-VAGAEIPSDVS
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: :..: . :. ...: :. : .:.: . : .:. .: : .:.: :
NP_114 VLLGENVELVCNANGIPTPLIQWLKDGKPIASGETERIRVSANGSTLNIYGALTSDTGKY
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pF1KE2 ECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYFASSLIIPAIGMIIYFARKANMK
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NP_114 TCVATNPAGEEDRIFNLNVYVTPTIRGNKDEAEKLMTLVDTSINIECRATGTPPPQINWL
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: ..: .: ..: . :.:.: :..
NP_114 FEVTVHVPPTIKSSGLSERVVVKYKPVALQCIANGIPNPSITW-LKDDQPVNTAQGNLKI
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... .: . . . . : :.:: . . .. ::.... : .: :. . ...
NP_114 QSSGRVLQIAKTLLEDAGRYTCVATNAAGETQQHIQLHVHEPPSLEDAGKMLNETVLVSN
1880 1890 1900 1910 1920 1930
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:. ..:..: . : : : ..:.... . .: . .. .: ... :
NP_114 PVQLECKAAGNPVPV----ITWYKDNRLLSGSTSMTFLNRGQIIDIESAQIS------DA
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pF1KE2 GKVLVCRAKLHIDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGGSVTMTCSSE
: . : : ..:. .. . :::...: .. . : . . .. : . : ..
NP_114 G-IYKCVA------INSAGAT-ELFYSLQVHVAP--SISGSNNMVAVVVNNPVRLECEAR
1990 2000 2010 2020 2030
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pF1KE2 GLPAPEIFWSK------KLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKNRKE
:.::: . : : ...:: :: :::. :.: . .. :.: :.: .:: :.....
NP_114 GIPAPSLTWLKDGSPVSSFSNG-LQVLSGGRILALTSAQISDTGRYTCVAVNAAGEKQRD
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pF1KE2 VELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQIDSPL---SGKVR
..: : : .. ... :...: : :. . :...: . :: :
NP_114 IDLRVYVPPNI--MGEEQNVSVLISQAVELLCQSDAIPPPTLTW-LKDGHPLLKKPGLSI
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::. :.: . .. .. : : .: : ::. .:... : : ... ..
NP_114 SENR-SVLKIEDAQVQDTGRYTCEATNVAGKTEKNYNVNIWVPPNIGGSDELTQLT--VI
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pF1KE2 NGSSVTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIED
.:. ... :. .. : . . . :: .: . . . . : ...:.... :
NP_114 EGNLISLLCESSGIPPPNLIWKK--KGSPVLTDS--MGRVRILS-GGRQLQISIA---EK
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pF1KE2 TGKALV-CQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSIL-EEGSSVNMTC
. :: : : ... :.. . : : . : :. :. :. .:.:... :
NP_114 SDAALYSCVA----SNVAGTAKKEYNLQ---VYIRPTITNSGSHPTEIIVTRGKSISLEC
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::.: : . : .. . .. :.:. : : . .. :.: :.: ..: :: . :
NP_114 EVQGIPPPTVTWMKDGHPLIKAKGVEILDEGHILQLKNIHVSDTGRYVCVAVNVAGMTDK
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. .: ... :. : : . :: : ..: ..: ...: ::. . ...:
NP_114 KYDLSVHAPPSIIGNHRSPENISVVEKNSVSLTCEASGIPLPSITWFKDGWPVSLSNSV-
2380 2390 2400 2410 2420 2430
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pF1KE2 KSIDGAYTIRKAQ--LKDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLVLYF
. ..:. .: : ..::: : : .: .: . . . :.:
NP_114 RILSGGRMLRLMQTTMEDAGQYTCVVRNAAGEERKIFGLSVLVPPHIVGENTLEDVKVKE
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pF1KE2 ASSLIIPAIGMIIYFARKANMKGSYSLVEAQKSKV
NP_114 KQSVTLTCEVTGNPVPEITWHKDGQPLQEDEAHHIISGGRFLQITNVQVPHTGRYTCLAS
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pF1KE2 GASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWRTQIDSPLNG
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NP_114 GVDNKHYNLQVFAPPNMDNSMGTEEITVLKGSSTSMACITDGTPAPSMAW-LRDGQPLGL
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pF1KE2 KVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHS--YLCTATCESRKLEKGIQVEIYSFPK--DPEIHLSG
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NP_114 DAHLTVSTHGMVLQLLKAETEDSGKYTCIASNEAGEVSKHFILKVLEPPHINGSEEHEEI
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. ...:. . : .:. : .. ::. . : ..:. ..: . :
NP_114 SVIVNNPLELTC-IASGIPAPKMT--------WMKDGRPLPQTDQVQTLGGGEVLRISTA
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.:: :. .: :. . :. :: :.. : : . . .: . . .. .::
NP_114 QVEDTGRY-TCLASSPAGDDDKEYLVR-------VHVPP-NIAGTDEPRDITVLRNRQVT
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NP_114 LECKSDAVPPPVITW---LRNGERLQATPRVRILSGGRYLQINNADLGDTANYTCVASNI
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::. .: : :. : .:. ::. .. .. :..: : . : .: ..:: . . :
NP_114 AGKTTREFILTVNVPP---NIKGGPQSLVILLNKSTVLECIAEGVPTPRITWRKD-GAVL
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pF1KE2 SGK-VR-SEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVELYSFPRDPEIEMSG
.:. .: : :. : .. . . ::: .: . .. :..... : .
NP_114 AGNHARYSILENGFLHIQSAHVTDTGRYLCMATNAAGTDRRRIDLQVHVPPSIAPGPTNM
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pF1KE2 GLVNGSSVTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENIEFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPT
.. . ..:..:.. .. : . :. :. .: :.. ...... : . :: . . :.
NP_114 TVIVNVQTTLACEATGI-P--KPSINWRKNGHLL-NVD-QNQNSYRLLSSGSL-VIISPS
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pF1KE2 IEDTGKALVCQAKLHIDDMEFEPKQRQSTQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSIL-EEGSSVNM
..::. . : . : . : : :.: : .. :...: . . . .
NP_114 VDDTA-TYECTVTNGAGD-------DKRTVDLTVQVPP---SIADEPTDFLVTKHAPAVI
3870 3880 3890 3900 3910
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pF1KE2 TCLSQGFPAPKILWS----RQLPNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRS
:: ..: : :.: :. : :: :. . .... ...:... .: : : . : :: .
NP_114 TCTASGVPFPSIHWTKNGIRLLPRGDGYRILSSGAIEILATQLNHAGRYTCVARNAAGSA
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pF1KE2 RKEVELIIQVTPKDIKLTAFPSE-SVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDT---
...: : .. : . ::: : .. ... : ..: .: .:.. . .:
NP_114 HRHVTLHVHEPP---VIQPQPSELHVILNNPILLPCEATGTPSPFITWQKEGINVNTSGR
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pF1KE2 ---VLKSIDGAYTIRKAQLKDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELLV
:: : :. : .: .:::.: : ..: .:. :
NP_114 NHAVLPS--GGLQISRAVREDAGTYMCVAQNPAGTALGKIKLNVQVPPVISPHLKEYVIA
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pF1KE2 LYFASSLIIPAIGMIIYFARKANMKGSYSLVEAQKSKV
NP_114 VDKPITLSCEADGLPPPDITWHKDGRAIVESIRQRVLSSGSLQIAFVQPGDAGHYTCMAA
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pF1KE2 ASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTTGCESPFFSWRTQIDSPLNGK
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XP_006 QGSQGQFPLTQNVTVVEGGTAILTCRVDQNDNTSLQWSNPAQQTLYFDDKKALRDNRIEL
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: ..... ::...: .: :. : :. . . . :. :.: .:.:.
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Smith-Waterman score: 334; 27.7% identity (57.4% similar) in 310 aa overlap (41-340:59-352)
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:..:: :. . .. .:. . . .
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NP_001 VRASWHELSISVSDVSLSDEGQYTCSLFTMPVKTSKAY-LTVLGVPEKPQISGFSSPVME
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20 30 40 50 60 70
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XP_006 VRASWHELSISVSDVSLSDEGQYTCSLFTMPVKTSKAY-LTVLGVPEKPQISGFSSPVME
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GKPITVKCSVADVYPFDRLEIDLLKGDHLMKSQEFL--EDADRKSLETKSLEVTFTPVIE
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190 200 210 220 230 240
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250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SSEGLPAPE-IFWSKKLDNGNLQH-----LSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
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XP_006 ESKGKPLPEPVLWTK--DGGELPDPDRMVVSGRE-LNILFLNKTDNGTYRCEATNTIGQS
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQ-IDSP--LSG
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XP_006 SAEYVLIVHDVPNT--LLPTTIIPSLTTATVTTTVAIT--TSPTTSATTSSIRDPNALAG
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.
XP_006 QNGPDHALIGGIVAVVVFVTLCSIFLLGRYLARHKGTYLTNEAKGAEDAPDADTAIINAE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]