Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2064
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2064, 712 aa
1>>>pF1KE2064 712 - 712 aa - 712 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0899+/-0.000966; mu= 12.2039+/- 0.059
mean_var=126.2464+/-24.397, 0's: 0 Z-trim(109.4): 79 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.114147
statistics sampled from 10769 (10848) to 10769 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 4716 788.3 0
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 4139 693.3 3.1e-199
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 3963 664.3 1.5e-190
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 3105 523.1 6.6e-148
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 3052 514.3 2.4e-145
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 3035 511.5 1.7e-144
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 3035 511.5 1.7e-144
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 3032 511.0 2.6e-144
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 3031 510.8 2.9e-144
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 2858 482.3 1.1e-135
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 2823 476.6 5.8e-134
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 2418 409.8 5.6e-114
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 2374 402.5 7.8e-112
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 2350 398.6 1.2e-110
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 2220 377.2 3.3e-104
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 2071 352.7 1e-96
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 2070 352.6 1.4e-96
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 2070 352.6 1.4e-96
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 2070 352.6 1.4e-96
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 2070 352.6 1.4e-96
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 740 133.4 7.2e-31
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 738 133.1 9.5e-31
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 722 130.5 5.6e-30
CCDS34192.1 PDE8B gene_id:8622|Hs108|chr5 ( 788) 603 111.0 6.9e-24
CCDS34190.1 PDE8B gene_id:8622|Hs108|chr5 ( 830) 603 111.0 7.2e-24
CCDS34191.1 PDE8B gene_id:8622|Hs108|chr5 ( 838) 603 111.0 7.3e-24
CCDS34193.1 PDE8B gene_id:8622|Hs108|chr5 ( 865) 603 111.0 7.5e-24
CCDS4037.1 PDE8B gene_id:8622|Hs108|chr5 ( 885) 603 111.1 7.6e-24
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 571 105.6 1.7e-22
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 571 105.6 1.8e-22
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 571 105.6 1.9e-22
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 571 105.6 1.9e-22
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 571 105.6 1.9e-22
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 571 105.7 2e-22
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 571 105.7 2e-22
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 569 105.3 2.1e-22
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 571 105.7 2.1e-22
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 569 105.3 2.2e-22
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 569 105.3 2.2e-22
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 569 105.3 2.3e-22
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 569 105.3 2.5e-22
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 564 104.5 4.1e-22
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 554 102.8 1.3e-21
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 554 102.8 1.4e-21
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 554 102.9 1.4e-21
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 535 99.8 1.4e-20
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 535 99.8 1.5e-20
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 535 99.8 1.6e-20
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 521 97.4 5.5e-20
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 521 97.4 5.7e-20
>>CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (712 aa)
initn: 4716 init1: 4716 opt: 4716 Z-score: 4203.5 bits: 788.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4716; 100.0% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MENLGVGEGAEACSRLSRSRGRHSMTRAPKHLWRQPRRPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MENLGVGEGAEACSRLSRSRGRHSMTRAPKHLWRQPRRPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSPRPELRKSRLSWPVSSCRRFDLENGLSCGRRALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LSPRPELRKSRLSWPVSSCRRFDLENGLSCGRRALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIVTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIVTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGLHGLCHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGLHGLCHSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEILA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQVGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQVGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSKIPRSPSDLTNPERDGPDRFQFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSKIPRSPSDLTNPERDGPDRFQFEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE2 TLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
670 680 690 700 710
>>CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (680 aa)
initn: 4138 init1: 4138 opt: 4139 Z-score: 3690.3 bits: 693.3 E(32554): 3.1e-199
Smith-Waterman score: 4139; 98.3% identity (98.9% similar) in 645 aa overlap (68-712:40-680)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 RPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERDLSPRPELRKSRLSWPVSSCRRFDLENGLSCGRRALDP
:. .. :. : ::::::::::::::::
CCDS42 VPGPGSPRGSPRGSPGLFRKLLVNQSIRLQRRFTVAHPL--C--FDLENGLSCGRRALDP
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 QSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIVTPFAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIVTPFAQ
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCL
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 DQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTEVELPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTEVELPK
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VTAEEAPQPMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNKWGLDVFKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VTAEEAPQPMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNKWGLDVFKV
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVA
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVL
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVET
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 KKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERE
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 SGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSK
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 IPRSPSDLTNPERDGPDRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IPRSPSDLTNPERDGPDRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPE
610 620 630 640 650 660
700 710
pF1KE2 AGPDPGDLPLDNQRT
:::::::::::::::
CCDS42 AGPDPGDLPLDNQRT
670 680
>>CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 (606 aa)
initn: 3963 init1: 3963 opt: 3963 Z-score: 3534.4 bits: 664.3 E(32554): 1.5e-190
Smith-Waterman score: 3963; 100.0% identity (100.0% similar) in 606 aa overlap (107-712:1-606)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 SSCRRFDLENGLSCGRRALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMS
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 RNSSVASDLHGEDMIVTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RNSSVASDLHGEDMIVTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLP
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 PAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGN
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 QVSEYISRTFLDQQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QVSEYISRTFLDQQTEVELPKVTAEEAPQPMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQ
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 EEQLAKELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEQLAKELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLM
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 LEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVS
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 NQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMV
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPL
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 YRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLV
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 HPDAQDLLDTLEDNREWYQSKIPRSPSDLTNPERDGPDRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HPDAQDLLDTLEDNREWYQSKIPRSPSDLTNPERDGPDRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEG
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710
pF1KE2 EETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
580 590 600
>>CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (809 aa)
initn: 3214 init1: 2084 opt: 3105 Z-score: 2768.9 bits: 523.1 E(32554): 6.6e-148
Smith-Waterman score: 3138; 71.3% identity (85.3% similar) in 686 aa overlap (41-710:103-783)
20 30 40 50 60
pF1KE2 EACSRLSRSRGRHSMTRAPKHLWRQPRRPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERDLSP-------
:...: ::: .. :: : .
CCDS47 LQPPPPPPLPPPPPPPGAARGRYASSGATGRVRHRGYSDTERYLYCRAMDRTSYAVETGH
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RPELRKSRLSWPVS--SCRRFDLENGLSCGRRALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFL
:: :.:::.::: : . ::::..:: : :: :::..::: : :.:: :::::::::
CCDS47 RPGLKKSRMSWPSSFQGLRRFDVDNGTSAGRSPLDPMTSPGSGLILQANFVHSQRRESFL
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIVTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGAA
:::::::.::::.::::::.:::.::.:.::::::::::::::::.: :::. : . .
CCDS47 YRSDSDYDLSPKSMSRNSSIASDIHGDDLIVTPFAQVLASLRTVRNNFAALTNLQDRAPS
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRIL
:..:. : : :. .:.. :::: :::.::::::::::::::::::.:::::::::.:
CCDS47 KRSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETLQTRHSVSEMASNKFKRML
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290
pF1KE2 NRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTEVELPKVTAEEAPQ---PMSRISGLHGLCH
::::::::: :::::::::.:: ::::.: :::.:. : .: . :::.:::.. : :
CCDS47 NRELTHLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKKLMH
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 SASLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERD
:.::.....:::::.:.::. :::::::.::::: ::..::::::::::.:. .::::::
CCDS47 SSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKELEDVNKWGLHVFRIAELSGNRPLTVIMHTIFQERD
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEI
:::::.::.::: :::. :: ::::.:::::..:::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS47 LLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPALEAVFTDLEI
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQ
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::
CCDS47 LAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQEENCDIFQ
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 NLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVL
::. ::: :::.::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS47 NLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYSDRIQVL
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 QNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQV
::.::::::::::::: :::::::::: :::.::::::: :..::::::::.::::::::
CCDS47 QNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDKHNASVEKSQV
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 GFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSKIPRSPSDLTN-PE--RDGP-D
::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::: ::.::: . :: :.: .
CCDS47 GFIDYIVHPLWETWADLVHPDAQDILDTLEDNREWYQSTIPQSPSPAPDDPEEGRQGQTE
680 690 700 710 720 730
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 RFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
.::::::::: : : :.. : .. .: :.. : . . . ..:::.:
CCDS47 KFQFELTLEEDGESDTEKDS-GSQV---EEDTSCSDSKTLCTQDS-ESTEIPLDEQVEEE
740 750 760 770 780
CCDS47 AVGEEEESQPEACVIDDRSPDT
790 800
>>CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (687 aa)
initn: 3037 init1: 2084 opt: 3052 Z-score: 2722.8 bits: 514.3 E(32554): 2.4e-145
Smith-Waterman score: 3052; 72.7% identity (86.3% similar) in 656 aa overlap (63-710:13-661)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 WRQPRRPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERDLSPRPELR-KSRLSWPVSSCRRFDLENGLSCG
: : : :::: . :. ::..:: : :
CCDS56 MAFVWDPLGATVPGPSTRAKSRLRF--SKSYSFDVDNGTSAG
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RRALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMI
: :::..::: : :.:: ::::::::::::::::.::::.::::::.:::.::.:.:
CCDS56 RSPLDPMTSPGSGLILQANFVHSQRRESFLYRSDSDYDLSPKSMSRNSSIASDIHGDDLI
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 VTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLD
:::::::::::::::.: :::. : . .:..:. : : :. .:.. :::: :::.
CCDS56 VTPFAQVLASLRTVRNNFAALTNLQDRAPSKRSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLE
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 ELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQT
::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::: :::::::::.:: ::::.:
CCDS56 ELDWCLDQLETLQTRHSVSEMASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQH
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320
pF1KE2 EVELPKVTAEEAPQ---PMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTN
:::.:. : .: . :::.:::.. : ::.::.....:::::.:.::. :::::::.:
CCDS56 EVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKELEDVN
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 KWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYH
:::: ::..::::::::::.:. .:::::::::::.::.::: :::. :: ::::.::::
CCDS56 KWGLHVFRIAELSGNRPLTVIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYH
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 NSLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELA
:..:::::.:::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NNIHAADVVQSTHVLLSTPALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELA
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 LMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLL
:::::.:::::::::::::::: :::::::::. ::: :::.::::.:::::::::::::
CCDS56 LMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLL
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 ADLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEF
:::::::::::::: :::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ::
CCDS56 ADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEF
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 FQQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLE
:.::::::: :..::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::
CCDS56 FRQGDRERERGMEISPMCDKHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPDAQDILDTLE
530 540 550 560 570 580
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 DNREWYQSKIPRSPSDLTN-PE--RDGP-DRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKE
:::::::: ::.::: . :: :.: ..::::::::: : : :.. : .. .:
CCDS56 DNREWYQSTIPQSPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDS-GSQV---EE
590 600 610 620 630
690 700 710
pF1KE2 ALELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
:.. : . . . ..:::.:
CCDS56 DTSCSDSKTLCTQDS-ESTEIPLDEQVEEEAVGEEEESQPEACVIDDRSPDT
640 650 660 670 680
>>CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (673 aa)
initn: 3035 init1: 2084 opt: 3035 Z-score: 2707.8 bits: 511.5 E(32554): 1.7e-144
Smith-Waterman score: 3035; 73.1% identity (86.4% similar) in 647 aa overlap (71-710:11-647)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 RIQQRFYSDPDKSAGCRERDLSPRPELRKSRLSWPVSSCRRFDLENGLSCGRRALDPQSS
: :: : ::..:: : :: :::..:
CCDS54 MMHVNNFPFRRHSWI---C--FDVDNGTSAGRSPLDPMTS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIVTPFAQVLA
:: : :.:: ::::::::::::::::.::::.::::::.:::.::.:.::::::::::
CCDS54 PGSGLILQANFVHSQRRESFLYRSDSDYDLSPKSMSRNSSIASDIHGDDLIVTPFAQVLA
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDELDWCLDQL
::::::.: :::. : . .:..:. : : :. .:.. :::: :::.:::::::::
CCDS54 SLRTVRNNFAALTNLQDRAPSKRSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTEVELPKVTA
:::::::::.:::::::::.:::::::::: :::::::::.:: ::::.: :::.:. :
CCDS54 ETLQTRHSVSEMASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQ
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330
pF1KE2 EEAPQ---PMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNKWGLDVFKV
.: . :::.:::.. : ::.::.....:::::.:.::. :::::::.::::: ::..
CCDS54 KEKEKKKRPMSQISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKELEDVNKWGLHVFRI
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHNSLHAADVA
::::::::::.:. .:::::::::::.::.::: :::. :: ::::.:::::..:::::.
CCDS54 AELSGNRPLTVIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVV
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDASVL
:::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 QSTHVLLSTPALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVL
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLADLKTMVET
::::::::::::: :::::::::. ::: :::.::::.::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENHHLAVGFKLLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVET
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 KKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFFQQGDRERE
::::: :::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: :::.:::::::
CCDS54 KKVTSSGVLLLDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERE
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 SGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSK
:..::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS54 RGMEISPMCDKHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPDAQDILDTLEDNREWYQST
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 IPRSPSDLTN-PE--RDGP-DRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTEL
::.::: . :: :.: ..::::::::: : : :.. : .. .: :..
CCDS54 IPQSPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDS-GSQV---EEDTSCSDSKT
580 590 600 610 620 630
700 710
pF1KE2 LSPEAGPDPGDLPLDNQRT
: . . ..:::.:
CCDS54 LCTQ-DSESTEIPLDEQVEEEAVGEEEESQPEACVIDDRSPDT
640 650 660 670
>>CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (679 aa)
initn: 3035 init1: 2084 opt: 3035 Z-score: 2707.7 bits: 511.5 E(32554): 1.7e-144
Smith-Waterman score: 3035; 72.4% identity (86.3% similar) in 655 aa overlap (64-710:6-653)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 RQPRRPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERDLSPRPELRK-SRLSWPVSSCRRFDLENGLSCGR
.:. :. : : . : ::..:: : ::
CCDS56 MSIIMKPRSRSTSSLRTAEAVC--FDVDNGTSAGR
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMSRNSSVASDLHGEDMIV
:::..::: : :.:: ::::::::::::::::.::::.::::::.:::.::.:.::
CCDS56 SPLDPMTSPGSGLILQANFVHSQRRESFLYRSDSDYDLSPKSMSRNSSIASDIHGDDLIV
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLPPAEDTGQKLALETLDE
::::::::::::::.: :::. : . .:..:. : : :. .:.. :::: :::.:
CCDS56 TPFAQVLASLRTVRNNFAALTNLQDRAPSKRSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEE
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGNQVSEYISRTFLDQQTE
:::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::: :::::::::.:: ::::.: :
CCDS56 LDWCLDQLETLQTRHSVSEMASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHE
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KE2 VELPKVTAEEAPQ---PMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQEEQLAKELEDTNK
::.:. : .: . :::.:::.. : ::.::.....:::::.:.::. :::::::.::
CCDS56 VEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKELEDVNK
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 WGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLMLEGHYHANVAYHN
::: ::..::::::::::.:. .:::::::::::.::.::: :::. :: ::::.:::::
CCDS56 WGLHVFRIAELSGNRPLTVIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHN
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 SLHAADVAQSTHVLLATPALEAVFTDLEILAALFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELAL
..:::::.:::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NIHAADVVQSTHVLLSTPALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELAL
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 MYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVLATDMSKHMNLLA
::::.:::::::::::::::: :::::::::. ::: :::.::::.::::::::::::::
CCDS56 MYNDSSVLENHHLAVGFKLLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLA
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 DLKTMVETKKVTSLGVLLLDNYSDRIQVLQNLVHCADLSNPTKPLPLYRQWTDRIMAEFF
::::::::::::: :::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: :::
CCDS56 DLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFF
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 QQGDRERESGLDISPMCDKHTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLED
.::::::: :..::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::
CCDS56 RQGDRERERGMEISPMCDKHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPDAQDILDTLED
520 530 540 550 560 570
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pF1KE2 NREWYQSKIPRSPSDLTN-PE--RDGP-DRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEA
::::::: ::.::: . :: :.: ..::::::::: : : :.. : .. .:
CCDS56 NREWYQSTIPQSPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDS-GSQV---EED
580 590 600 610 620
690 700 710
pF1KE2 LELPDTELLSPEAGPDPGDLPLDNQRT
:.. : . . . ..:::.:
CCDS56 TSCSDSKTLCTQDS-ESTEIPLDEQVEEEAVGEEEESQPEACVIDDRSPDT
630 640 650 660 670
>>CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (745 aa)
initn: 3035 init1: 2084 opt: 3032 Z-score: 2704.5 bits: 511.0 E(32554): 2.6e-144
Smith-Waterman score: 3043; 71.8% identity (85.6% similar) in 667 aa overlap (61-710:58-719)
40 50 60 70 80
pF1KE2 HLWRQPRRPIRIQQRFYSDPDKSAGCRERDLSPR--PEL-RKSRLSWPVSSCRRF-----
.::: :.: :. :: . . :::
CCDS56 DLVKSLRENLLQHEKSKTARKSVSPKLSPVISPRNSPRLLRRMLLSSNIPKQRRFTVAHT
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 --DLENGLSCGRRALDPQSSPGLGRIMQAPVPHSQRRESFLYRSDSDYELSPKAMSRNSS
:..:: : :: :::..::: : :.:: ::::::::::::::::.::::.::::::
CCDS56 CFDVDNGTSAGRSPLDPMTSPGSGLILQANFVHSQRRESFLYRSDSDYDLSPKSMSRNSS
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 VASDLHGEDMIVTPFAQVLASLRTVRSNVAALARQQCLGAAKQGPVGNPSSSNQLPPAED
.:::.::.:.::::::::::::::::.: :::. : . .:..:. : : :. .:.
CCDS56 IASDIHGDDLIVTPFAQVLASLRTVRNNFAALTNLQDRAPSKRSPMCNQPSINKATITEE
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 TGQKLALETLDELDWCLDQLETLQTRHSVGEMASNKFKRILNRELTHLSETSRSGNQVSE
. :::: :::.::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::: :::::::::
CCDS56 AYQKLASETLEELDWCLDQLETLQTRHSVSEMASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSE
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310
pF1KE2 YISRTFLDQQTEVELPKVTAEEAPQ---PMSRISGLHGLCHSASLSSATVPRFGVQTDQE
.:: ::::.: :::.:. : .: . :::.:::.. : ::.::.....:::::.:.::
CCDS56 FISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQE
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 EQLAKELEDTNKWGLDVFKVAELSGNRPLTAIIFSIFQERDLLKTFQIPADTLATYLLML
. :::::::.::::: ::..::::::::::.:. .:::::::::::.::.::: :::. :
CCDS56 DVLAKELEDVNKWGLHVFRIAELSGNRPLTVIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTL
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
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: ::::.:::::..:::::.:::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS56 EDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSN
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 QFLINTNSELALMYNDASVLENHHLAVGFKLLQAENCDIFQNLSAKQRLSLRRMVIDMVL
::::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::. ::: :::.::::.::
CCDS56 QFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVL
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
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::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::.::::::::::::: ::
CCDS56 ATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLY
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
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:::::::: :::.::::::: :..::::::::.::::::::::::::.::::::::::::
CCDS56 RQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDKHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVH
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650 660 670
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CCDS56 PDAQDILDTLEDNREWYQSTIPQSPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKD
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680 690 700 710
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: .. .: :.. : . . . ..:::.:
CCDS56 S-GSQV---EEDTSCSDSKTLCTQDS-ESTEIPLDEQVEEEAVGEEEESQPEACVIDDRS
690 700 710 720 730 740
CCDS56 PDT
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CCDS54 VHSQRRESFLYRSDSDYDLSPKSMSRNSSIASDIHGDDLIVTPFAQVLASLRTVRNNFAA
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CCDS54 LTNLQDRAPSKRSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETLQTRHSVSE
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240 250 260 270 280
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CCDS54 MASNKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMS
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290 300 310 320 330 340
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CCDS54 QISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKELEDVNKWGLHVFRIAELSGNRPLTV
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CCDS54 IMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPA
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:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS54 LEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKL
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CCDS54 LQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLL
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CCDS54 DNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDK
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pF1KE2 HTASVEKSQVGFIDYIAHPLWETWADLVHPDAQDLLDTLEDNREWYQSKIPRSPSDLTN-
:.::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::: ::.::: .
CCDS54 HNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPDAQDILDTLEDNREWYQSTIPQSPSPAPDD
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650 660 670 680 690 700
pF1KE2 PE--RDGP-DRFQFELTLEEAEEEDEEEEEEGEETALAKEALELPDTELLSPEAGPDPGD
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CCDS54 PEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDS-GSQV---EEDTSCSDSKTLCTQ-DSESTE
670 680 690 700 710
710
pF1KE2 LPLDNQRT
.:::.:
CCDS54 IPLDEQVEEEAVGEEEESQPEACVIDDRSPDT
720 730 740
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CCDS30 MTAKDSSKELTASEPEVCIKTFKEQ-MHLELELPRLPGNRPTSP-KISPR--SSP-RNSP
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CCDS30 CFFRKLLVNKSIRQRRRFTVAHTC--FDVENGPSPGRSPLDPQASSSAGLVLHATFPGHS
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CCDS30 QRRESFLYRSDSDYDLSPKAMSRNSSLPSEQHGDDLIVTPFAQVLASLRSVRNNFTILTN
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CCDS30 LHGT-SNKRSPAASQPPVSRVNPQEESYQKLAMETLEELDWCLDQLETIQTYRSVSEMAS
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CCDS30 NKFKRMLNRELTHLSEMSRSGNQVSEYISNTFLDKQNDVEIPSPTQKDREKKKKQQLMTQ
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CCDS30 ISGVKKLMHSSSLNNTSISRFGVNTENEDHLAKELEDLNKWGLNIFNVAGYSHNRPLTCI
300 310 320 330 340 350
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...:::::::::::.: .::. ::.. :: :::..::::::::::::::::::::.::::
CCDS30 MYAIFQERDLLKTFRISSDTFITYMMTLEDHYHSDVAYHNSLHAADVAQSTHVLLSTPAL
360 370 380 390 400 410
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CCDS30 DAVFTDLEILAAIFAAAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDESVLENHHLAVGFKLL
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CCDS30 NRDCQGLMEKFQFELTLDEEDSEGPEKEGEGHSYFSSTKTLCVIDPENRDSLGETDIDIA
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CCDS30 TEDKSPVDT
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712 residues in 1 query sequences
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start: Sun Nov 6 13:24:35 2016 done: Sun Nov 6 13:24:36 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]