Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2060
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2060, 705 aa
1>>>pF1KE2060 705 - 705 aa - 705 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5209+/-0.00111; mu= 13.3739+/- 0.065
mean_var=138.2753+/-27.607, 0's: 0 Z-trim(106.5): 225 B-trim: 9 in 2/50
Lambda= 0.109069
statistics sampled from 8736 (8995) to 8736 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS81658.1 C1R gene_id:715|Hs108|chr12 ( 705) 4998 799.2 0
CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 699) 1430 237.8 4.2e-62
CCDS8573.1 C1RL gene_id:51279|Hs108|chr12 ( 487) 1320 220.3 5.3e-57
CCDS33908.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 728) 1298 217.0 7.7e-56
CCDS123.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1 ( 686) 1028 174.5 4.6e-43
CCDS33909.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 380) 757 131.6 2.1e-30
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 502 91.8 4.2e-18
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 502 91.8 4.2e-18
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 473 87.0 6.3e-17
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 473 87.0 6.7e-17
CCDS10476.1 PRSS27 gene_id:83886|Hs108|chr16 ( 290) 466 85.7 1e-16
CCDS42110.1 PRSS33 gene_id:260429|Hs108|chr16 ( 280) 462 85.1 1.6e-16
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 454 84.2 6.6e-16
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 450 83.4 7.7e-16
CCDS45525.1 HP gene_id:3240|Hs108|chr16 ( 347) 447 82.8 9.3e-16
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 445 82.4 9.8e-16
CCDS82010.1 HP gene_id:3240|Hs108|chr16 ( 347) 446 82.7 1e-15
CCDS45524.1 HP gene_id:3240|Hs108|chr16 ( 406) 447 82.9 1e-15
CCDS45469.1 PRSS8 gene_id:5652|Hs108|chr16 ( 343) 444 82.3 1.3e-15
CCDS73602.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 382) 443 82.2 1.5e-15
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 441 81.8 1.7e-15
CCDS9529.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 444) 443 82.3 1.7e-15
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 447 83.2 1.8e-15
CCDS9528.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 466) 443 82.3 1.8e-15
CCDS42193.1 HPR gene_id:3250|Hs108|chr16 ( 348) 439 81.6 2.2e-15
CCDS2145.1 PROC gene_id:5624|Hs108|chr2 ( 461) 439 81.7 2.7e-15
CCDS9530.1 F10 gene_id:2159|Hs108|chr13 ( 488) 437 81.4 3.5e-15
CCDS76517.1 C1RL gene_id:51279|Hs108|chr12 ( 187) 430 79.9 3.8e-15
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 439 81.9 4.3e-15
CCDS58452.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 752) 437 81.6 4.8e-15
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 434 80.9 4.9e-15
CCDS73431.1 C1RL gene_id:51279|Hs108|chr12 ( 314) 431 80.3 5e-15
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 434 80.9 5.2e-15
CCDS58453.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 850) 437 81.6 5.3e-15
CCDS32436.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 855) 437 81.6 5.3e-15
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 424 79.2 1.1e-14
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 425 79.5 1.4e-14
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 425 79.6 1.5e-14
CCDS10478.1 PRSS21 gene_id:10942|Hs108|chr16 ( 314) 421 78.7 1.5e-14
CCDS14101.1 ACR gene_id:49|Hs108|chr22 ( 421) 420 78.7 2e-14
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 421 79.0 2.5e-14
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 420 78.8 2.5e-14
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 416 78.0 3.1e-14
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 416 78.0 3.3e-14
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 416 78.1 3.3e-14
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 399 75.6 2.9e-13
CCDS46816.1 PRSS42 gene_id:339906|Hs108|chr3 ( 293) 391 73.9 3.7e-13
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 391 74.1 5.1e-13
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 396 75.2 5.2e-13
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 394 74.9 6.7e-13
>>CCDS81658.1 C1R gene_id:715|Hs108|chr12 (705 aa)
initn: 4998 init1: 4998 opt: 4998 Z-score: 4262.6 bits: 799.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4998; 100.0% identity (100.0% similar) in 705 aa overlap (1-705:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLLYLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVKLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MWLLYLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVKLVF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFHTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFHTDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIGGQKAKMGNFPWQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIGGQKAKMGNFPWQVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNVEELMKLGNHPIRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNVEELMKLGNHPIRRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYDLGLMGYVSGFGVME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYDLGLMGYVSGFGVME
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE2 RDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
670 680 690 700
>>CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 (699 aa)
initn: 1544 init1: 567 opt: 1430 Z-score: 1228.4 bits: 237.8 E(32554): 4.2e-62
Smith-Waterman score: 1737; 36.9% identity (66.7% similar) in 718 aa overlap (2-699:3-693)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWLL--YLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVK
::: : : .: .. .. . ...::.. :: .: ::.. :.: :::: :.:.:
CCDS33 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVEL-NNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LVFQQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFH
: :..:.:: : : :::::. .. . :. :::. . . ::.. .: :. : .::.
CCDS33 LYFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCR
.:::::: . :: :.:.:::.::: : :: . .:.: ::::.:::.::::
CCDS33 SDFSNEER-----FTGFDAHYMAVDVDECKER-----EDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFL
:: :. : ..:..:::..:.:. .: :.: ..: :: . .: :.:..:.:. ..:.:
CCDS33 FGYILHTDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRG
. :::.:: .: :::: ..: .. : .: :::.. : ..:.:..: .:: .:.::..::
CCDS33 DIFDIEDHPEVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 WKLRYTTEIIKCP--QPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFT
:.: : . .:: :: . . :. : .: :.: ...: ::.... : . .:
CCDS33 WRLSYRAAGNECPELQPPVHGK---IEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KE2 AVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQT
: :::: .: ::: :: : .: .: . ..: ...:::..:.: :.:::::: .
CCDS33 IECLKDGTWSNKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIGGQKAKMGNF
.. :.:::.:::.: :. :...: :::::: : . ::..:. :. :.
CCDS33 ------NNTGIYTCSAQGVWMNKVLGRSLPTCLPVCGLPKFSRKLMARIFNGRPAQKGTT
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE2 PW-QVFTNIHGRG--GGALLGDRWILTAAHTLY----P-----KEHEAQSNASLDVFLG-
:: ......:. ::.:::. ::.:::: :. : .. . : ... ..::
CCDS33 PWIAMLSHLNGQPFCGGSLLGSSWIVTAAHCLHQSLDPEDPTLRDSDLLSPSDFKIILGK
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 HTNVEELMKLGNHPIRRVSVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDND
: .. . . ......::.: . .::.:.::.:: .: .:. ..:::::..
CCDS33 HWRLRSDENEQHLGVKHTTLHPQY---DPNTFENDVALVELLESPVLNAFVMPICLPEGP
530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 TFYDLGLMGYVSGFGVME-EKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAG
. : : :::.: . ... . : ...:... ..:.. .. ...:.:::
CCDS33 Q--QEGAMVIVSGWGKQFLQRFPETLMEIEIPIVDHSTCQKAYAPLKKK--VTRDMICAG
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690
pF1KE2 HPSLKQDACQGDSGGVFAVRDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRG--YGFYTKVLNYVDWIKK
. .::: ::::: ... . . .: .: :::: :.. :: :. . . :::..
CCDS33 EKEGGKDACAGDSGGPMVTLNRERGQWYLVGTVSWGDDCGKKDRYGVYSYIHHNKDWIQR
640 650 660 670 680 690
700
pF1KE2 EMEEED
CCDS33 VTGVRN
>>CCDS8573.1 C1RL gene_id:51279|Hs108|chr12 (487 aa)
initn: 1693 init1: 853 opt: 1320 Z-score: 1136.9 bits: 220.3 E(32554): 5.3e-57
Smith-Waterman score: 1353; 42.6% identity (67.1% similar) in 516 aa overlap (187-701:34-483)
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 PQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPP
..: .. : : : ..: ::. :
CCDS85 PRVWGKYLWRSPHSKGCPGAMWWLLLWGVLQACPTRGSVLLAQELPQQLTSPGYPEPYGK
10 20 30 40 50 60
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 DLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDL
. . .:.. .:....: : . ::.. :. : :.. : :.. ..:::.: : :
CCDS85 GQESSTDIKAPEGFAVRLVF-QDFDLEPSQD--CAGDSVTISFVGSDPSQFCGQQGSP-L
70 80 90 100 110
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 DTSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKLRYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIA
. ... : : .:: : . ::.. .. . ... :.:
CCDS85 GRPPGQREFV--------SSGRSLRLTFRT----QPSSENKTA---------HLHKGFLA
120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 TCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVN
:: . : ..: . . .. : : ::
CCDS85 L----YQTVAVNY-----------------SQPISEASRGSEAINAP-GD----------
160 170 180
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 TYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVN
:..: .:.:::: :. :. :. ::.. : ::..: ::.. .:.::::.::.
CCDS85 -NPAKVQNHCQEPYY--QAAAA------GALTCATPGTWKDRQDGEEVLQCMPVCGRPVT
190 200 210 220 230
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 PVEQRQRIIGGQKAKMGNFPWQVFTNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEA-QSNA
:. : : .:...::.::::::.::.:::::::::::::::::::::.:::. . ..:
CCDS85 PIAQNQTTLGSSRAKLGNFPWQAFTSIHGRGGGALLGDRWILTAAHTIYPKDSVSLRKNQ
240 250 260 270 280 290
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 SLDVFLGHTNVEELMKLGNHPIRRVSVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLP
:..:::::: ..:..::::::..:: :::::::.::.:: ::::::::..:. ::::.::
CCDS85 SVNVFLGHTAIDEMLKLGNHPVHRVVVHPDYRQNESHNFSGDIALLELQHSIPLGPNVLP
300 310 320 330 340 350
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 ICLPDNDTFYDLGLMGYVSGFGVMEEKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQ
.:::::.:.: ::.:::::::. .. .:.. ::::: .::. ::. ..: .:::.
CCDS85 VCLPDNETLYRSGLLGYVSGFGMEMGWLTTELKYSRLPVAPREACNAWLQKRQRPEVFSD
360 370 380 390 400 410
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 NMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAVRDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVD
::::.: . ....::::::.:..: : .. .:::::::::::::..:: ::::::.:::
CCDS85 NMFCVGDETQRHSVCQGDSGSVYVVWDNHAHHWVATGIVSWGIGCGEGYDFYTKVLSYVD
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700
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::: :
CCDS85 WIKGVMNGKN
480
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CCDS33 LYFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFR
60 70 80 90 100 110
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CCDS33 WRLSYRAAGNECPELQPPVHGK---IEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQ
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CCDS33 IECLKDGTWSNKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLN
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pF1KE2 RAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQR-QRIIGGQKAKMGN
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CCDS33 ------NNTGIYTCSAQGVWMNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGL
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CCDS33 FPWQALIVVEDTSRVPNDKWFGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYL
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CCDS33 EPEGPAPHMLGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECKTSYESR
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CCDS33 SGNYSVTENMFCAGYYEGGKDTCLGDSGGAFVIFDDLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQV
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pF1KE2 YGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
:: :::: :::::. ..:
CCDS33 YGVYTKVSNYVDWVWEQMGLPQSVVEPQVER
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CCDS12 RLRLYFTHFDLELSHLCEYDFVKLSSGAKVLATLCGQESTDTERAPGKDTFYSLGSSLDI
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CCDS12 SCRAGYVLHRNKRTCSALCSGQVFTQRSGELSSPEYPRPYPKLSSCTYSISLEEGFSVIL
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CCDS12 DFVESFDVETHPETLCPYDFLKIQTDREEHGPFCGKTLPHRIETKSNTVTITFVTDESGD
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CCDS12 V-------NDGKYVCEADGFWTS-SKGEKSLPVCEPVCG--LSARTTGGRIYGGQKAKPG
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CCDS12 PHYTQAWSEAVFIHEGYTHDAG--FDNDIALIKLNNKVVINSNITPICLPRKEAESFMRT
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CCDS12 DDIGTASGWGLTQRGFLARNLMYVDIPIVDHQKCTAAYEKPPYPRGSVTANMLCAGLESG
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CCDS12 GKDSCRGDSGGALVFLDSETERWFVGGIVSWGSMNCGEAGQYGVYTKVINYIPWIENIIS
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CCDS12 DF
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CCDS33 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVEL-NNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIK
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CCDS33 LYFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFR
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CCDS33 FGYILHTDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFE
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CCDS33 DIFDIEDHPEVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRG
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CCDS33 WRLSYRAAGNECPELQPPVHGK---IEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQ
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CCDS33 IECLKDGTWSNKIPTCKKNEIDLESELKSEQVTE
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pF1KE2 AYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGYELQEDRHSCQAECSS
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. ...: .:. .: : :. .:.. . : . ::.: ... . . .:. :
CCDS13 DNRLDSQGVLSTPYFPSYYSPQTHCSWHLTVPSLDYGLAL---WFDAYALR-RQKYDLPC
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CCDS13 TQGQWTIQNRRL---CGLRILQPYAERIPVVATAGITIN--FTSQISLTGPGVRVHYGLY
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pF1KE2 IIKCPQPKTLDEFTIIQN--LQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQDDGT
. : : :: : : . . : .: : : : : .. : :..:.:
CCDS13 NQSDPCP---GEFLCSVNGLCVPACDG----VKDCPNG--LDERNCVCRA-TFQCKEDST
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pF1KE2 WHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSRESE
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CCDS13 -CISLP--KVCD-GQPDCL-NGSDEEQCQEGVP---------CGTFTFQCEDRSCVKKPN
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CCDS13 RGRHICGGALIADRWVITAAHCF--QEDSMASTVLWTVFLGKVWQNSRWPGEV-SFKVSR
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CCDS13 LLLHP-YHEEDSHDY--DVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGAL
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CCDS13 REGGPISNALQKVDVQLIPQDLCSEVYRYQ-----VTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]