Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2058
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2058, 698 aa
1>>>pF1KE2058 698 - 698 aa - 698 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6937+/-0.000406; mu= 17.9191+/- 0.025
mean_var=78.6083+/-15.949, 0's: 0 Z-trim(111.6): 57 B-trim: 9 in 1/52
Lambda= 0.144657
statistics sampled from 20247 (20301) to 20247 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 8.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001054 (OMIM: 190000,209300) serotransferrin pr ( 698) 4874 1027.5 0
XP_016862579 (OMIM: 190000,209300) PREDICTED: sero ( 698) 4873 1027.3 0
XP_016862578 (OMIM: 190000,209300) PREDICTED: sero ( 698) 4873 1027.3 0
NP_001308050 (OMIM: 150210) lactotransferrin isofo ( 708) 1996 426.8 1.4e-118
NP_001186078 (OMIM: 150210) lactotransferrin isofo ( 666) 1862 398.9 3.4e-110
NP_001308051 (OMIM: 150210) lactotransferrin isofo ( 697) 1862 398.9 3.5e-110
NP_002334 (OMIM: 150210) lactotransferrin isoform ( 710) 1862 398.9 3.6e-110
XP_011511153 (OMIM: 155750) PREDICTED: melanotrans ( 670) 605 136.5 3.2e-31
NP_005920 (OMIM: 155750) melanotransferrin isoform ( 738) 605 136.6 3.4e-31
XP_006713706 (OMIM: 155750) PREDICTED: melanotrans ( 764) 605 136.6 3.5e-31
XP_011511152 (OMIM: 155750) PREDICTED: melanotrans ( 765) 605 136.6 3.5e-31
NP_201573 (OMIM: 155750) melanotransferrin isoform ( 302) 473 108.8 3.2e-23
>>NP_001054 (OMIM: 190000,209300) serotransferrin precur (698 aa)
initn: 4874 init1: 4874 opt: 4874 Z-score: 5496.3 bits: 1027.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4874; 100.0% identity (100.0% similar) in 698 aa overlap (1-698:1-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 APNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 HDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
670 680 690
>>XP_016862579 (OMIM: 190000,209300) PREDICTED: serotran (698 aa)
initn: 4873 init1: 4873 opt: 4873 Z-score: 5495.1 bits: 1027.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4873; 99.9% identity (100.0% similar) in 698 aa overlap (1-698:1-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWN
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 APNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 HDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
670 680 690
>>XP_016862578 (OMIM: 190000,209300) PREDICTED: serotran (698 aa)
initn: 4873 init1: 4873 opt: 4873 Z-score: 5495.1 bits: 1027.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4873; 99.9% identity (100.0% similar) in 698 aa overlap (1-698:1-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWN
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLAR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 APNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 HDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
670 680 690
>>NP_001308050 (OMIM: 150210) lactotransferrin isoform 3 (708 aa)
initn: 2364 init1: 626 opt: 1996 Z-score: 2250.1 bits: 426.8 E(85289): 1.4e-118
Smith-Waterman score: 2893; 60.5% identity (80.8% similar) in 714 aa overlap (1-697:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
:.:. .:: ..:::::: ..:.:::::. ::::: ... .:..: :: :.:.:
NP_001 MKLVFLVLLFLGALGLCLAGRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKV---RGPPVSCIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
. : ..::.::: :.:::::::.:..:.: ::: .:.::.:: ::....:.: :::::::
NP_001 RDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLL--YCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCA
:: ..::.:.:.: ::::::: :.::::.::: : . . : .:.: ::: :::.::.
NP_001 KKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PCADGTDFPQLCQLCPG-----CGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENL
: :: .::.::.:: : :. :. . ::.::::::::.::::::::...::.::.:
NP_001 PGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHF
...:.::.::::: ::::::::..::::::.::::.:::::..:::: ::.:: ::::.:
NP_001 SDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GKDKSKEFQLFSSPHG-KDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPE
::::: .::::.:: : ::::::::: :: .::::.:. .::: : :::.:::. . :
NP_001 GKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRK-SEEE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 APTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDG
. . . . : :::....: ::..:: : :.. : :: ::::::: ..::::::::::
NP_001 VAARRAR-VVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIA--LKGEADAMSLDG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE2 GFVYIAGKCGLVPVLAENYNK---SD---NCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGK
:.:: ::::::::::::::.. :: :: : : ::.:::::..: ..:::...:::
NP_001 GYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 KSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGS--GLNL
::::::: ::::::::::::.:. . :.:::.::..::::: :.:: ::.:. : :
NP_001 KSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 CEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEK-GDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCL
: ::..: :::::::::::.:. ::::::: :: ::: :.: . :::.:. :. ::::
NP_001 CVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 DGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRS
:: :::: : .:::: :::::::.: :: ....: .:: :: : .:: .::::.:
NP_001 DGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690
pF1KE2 ETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
:::.::: :.: :::.:: ..::::::: .:: .. ::.::::: ::::: : :
NP_001 ETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
660 670 680 690 700
>>NP_001186078 (OMIM: 150210) lactotransferrin isoform 2 (666 aa)
initn: 2515 init1: 626 opt: 1862 Z-score: 2099.4 bits: 398.9 E(85289): 3.4e-110
Smith-Waterman score: 2776; 61.8% identity (81.6% similar) in 662 aa overlap (53-697:6-665)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLD
:: :.:.:. : ..::.::: :.:::::::
NP_001 MRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 AGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLG
.:..:.: ::: .:.::.:: ::....:.: ::::::::: ..::.:.:.: :::::::
NP_001 GGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KE2 RSAGWNIPIGLL--YCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPG-----
:.::::.::: : . . : .:.: ::: :::.::.: :: .::.::.:: :
NP_001 RTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENK
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 CGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVD
:. :. . ::.::::::::.::::::::...::.::.:...:.::.::::: ::::::::
NP_001 CAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVD
160 170 180 190 200 210
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..::::::.::::.:::::..:::: ::.:: ::::.:::::: .::::.:: : :::::
NP_001 KFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLF
220 230 240 250 260 270
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pF1KE2 KDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKC
:::: :: .::::.:. .::: : :::.:::. . :. . . . : :::....: ::
NP_001 KDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRK-SEEEVAARRAR-VVWCAVGEQELRKC
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 DEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNK-
..:: : :.. : :: ::::::: ...:::::::::::.:: ::::::::::::::..
NP_001 NQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQ
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
pF1KE2 --SD---NCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYN
:: :: : : ::.:::::..: ..:::...:::::::::: ::::::::::::.:
NP_001 QSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFN
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pF1KE2 KINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGS--GLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEK
. . :.:::.::..::::: :.:: ::.:. : : : ::..: :::::::::::.:.
NP_001 QTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAEN
460 470 480 490 500 510
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pF1KE2 -GDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHA
::::::: :: ::: :.: . :::.:. :. :::::: :::: : .:::: :::::
NP_001 AGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHA
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pF1KE2 VVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNT
::.: :: ....: .:: :: : .:: .::::.::::.::: :.: :::.:: ..:
NP_001 VVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTT
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pF1KE2 YEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
:::::: .:: .. ::.::::: ::::: : :
NP_001 YEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
640 650 660
>>NP_001308051 (OMIM: 150210) lactotransferrin isoform 4 (697 aa)
initn: 2672 init1: 626 opt: 1862 Z-score: 2099.1 bits: 398.9 E(85289): 3.5e-110
Smith-Waterman score: 2889; 60.9% identity (81.2% similar) in 701 aa overlap (14-697:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
.::::: ..:.:::::. ::::: ... .:..: :: :.:.:
NP_001 MGLCLAGRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKV---RGPPVSCIK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
. : ..::.::: :.:::::::.:..:.: ::: .:.::.:: ::....:.: :::::::
NP_001 RDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLL--YCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCA
:: ..::.:.:.: ::::::: :.::::.::: : . . : .:.: ::: :::.::.
NP_001 KKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCV
110 120 130 140 150 160
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pF1KE2 PCADGTDFPQLCQLCPG-----CGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENL
: :: .::.::.:: : :. :. . ::.::::::::.::::::::...::.::.:
NP_001 PGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHF
...:.::.::::: ::::::::..::::::.::::.:::::..:::: ::.:: ::::.:
NP_001 SDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GKDKSKEFQLFSSPHG-KDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPE
::::: .::::.:: : ::::::::: :: .::::.:. .::: : :::.:::.. :
NP_001 GKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSE-EE
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pF1KE2 APTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDG
. . . . : :::....: ::..:: : :.. : :: ::::::: ...::::::::::
NP_001 VAARRAR-VVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE2 GFVYIAGKCGLVPVLAENYNK---SD---NCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGK
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NP_001 GYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGK
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pF1KE2 KSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGS--GLNL
::::::: ::::::::::::.:. . :.:::.::..::::: :.:: ::.:. : :
NP_001 KSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENK
470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 CEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEK-GDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCL
: ::..: :::::::::::.:. ::::::: :: ::: :.: . :::.:. :. ::::
NP_001 CVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCL
530 540 550 560 570 580
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pF1KE2 DGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRS
:: :::: : .:::: :::::::.: :: ....: .:: :: : .:: .::::.:
NP_001 DGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQS
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KE2 ETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
:::.::: :.: :::.:: ..::::::: .:: .. ::.::::: ::::: : :
NP_001 ETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
650 660 670 680 690
>>NP_002334 (OMIM: 150210) lactotransferrin isoform 1 pr (710 aa)
initn: 2674 init1: 626 opt: 1862 Z-score: 2098.9 bits: 398.9 E(85289): 3.6e-110
Smith-Waterman score: 2908; 60.5% identity (81.0% similar) in 714 aa overlap (1-697:1-709)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
:.:. .:: ..:::::: ..:.:::::. ::::: ... .:..: :: :.:.:
NP_002 MKLVFLVLLFLGALGLCLAGRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKV---RGPPVSCIK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
. : ..::.::: :.:::::::.:..:.: ::: .:.::.:: ::....:.: :::::::
NP_002 RDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVV
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLL--YCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCA
:: ..::.:.:.: ::::::: :.::::.::: : . . : .:.: ::: :::.::.
NP_002 KKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCV
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pF1KE2 PCADGTDFPQLCQLCPG-----CGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENL
: :: .::.::.:: : :. :. . ::.::::::::.::::::::...::.::.:
NP_002 PGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHF
...:.::.::::: ::::::::..::::::.::::.:::::..:::: ::.:: ::::.:
NP_002 SDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKF
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 GKDKSKEFQLFSSPHG-KDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPE
::::: .::::.:: : ::::::::: :: .::::.:. .::: : :::.:::. . :
NP_002 GKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRK-SEEE
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 APTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDG
. . . . : :::....: ::..:: : :.. : :: ::::::: ...::::::::::
NP_002 VAARRAR-VVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE2 GFVYIAGKCGLVPVLAENYNK---SD---NCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGK
:.:: ::::::::::::::.. :: :: : : ::.:::::..: ..:::...:::
NP_002 GYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 KSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGS--GLNL
::::::: ::::::::::::.:. . :.:::.::..::::: :.:: ::.:. : :
NP_002 KSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENK
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 CEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEK-GDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCL
: ::..: :::::::::::.:. ::::::: :: ::: :.: . :::.:. :. ::::
NP_002 CVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCL
540 550 560 570 580 590
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pF1KE2 DGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRS
:: :::: : .:::: :::::::.: :: ....: .:: :: : .:: .::::.:
NP_002 DGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690
pF1KE2 ETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
:::.::: :.: :::.:: ..::::::: .:: .. ::.::::: ::::: : :
NP_002 ETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
660 670 680 690 700 710
>>XP_011511153 (OMIM: 155750) PREDICTED: melanotransferr (670 aa)
initn: 934 init1: 277 opt: 605 Z-score: 681.6 bits: 136.5 E(85289): 3.2e-31
Smith-Waterman score: 908; 41.1% identity (66.3% similar) in 421 aa overlap (1-394:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
:: ::: . .:.: .. :::::.:. : :: .. . .. . . ::. ::.
XP_011 MRGPSGALWL--LLALRTVLGGMEVRWCATSDPEQHKCGNMSEAFREA--GIQPSLLCVR
10 20 30 40 50
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pF1KE2 KASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVV
.: :.. :::.::::.:::.: .:.: ..:::::.: : .. : :::::::
XP_011 GTSADHCVQLIAAQEADAITLDGGAIYEAG-KEHGLKPVVGEVYD--QEVGTSYYAVAVV
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 KKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCD--LPEPRKPLEKAVANFFSGSCA
...: .. :.: ::::::..:..:::.:.: : . : . :::...:.:::.
XP_011 RRSSHVTIDTLKGVKSCHTGINRTVGWNVPVGYLVESGRLSVMGCDVLKAVSDYFGGSCV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 PCADGTDFPQ-LCQLCPG-------CGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIF
: : :.. . ::.:: : : : :..:. :::::.:: .::::::::::::..
XP_011 PGAGETSYSESLCRLCRGDSSGEGVCDKSPLERYYDYSGAFRCLAEGAGDVAFVKHSTVL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 ENLANK-------ADRDQ-YELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVAR--SMGGKED
:: .: : .: .:::: :..: : :...::::.::.:.::.: . ::
XP_011 ENTDGKTLPSWGQALLSQDFELLCRDGSRADVTEWRQCHLARVPAHAVVVRADTDGG---
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 LIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSP-HG-KDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEY
::..:::..:. :... :. ::.::: .: ::::::::. .. . . . .::.::
XP_011 LIFRLLNEGQRLFSHEGSS-FQMFSSEAYGQKDLLFKDSTSELVPIATQT-YEAWLGHEY
300 310 320 330 340
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pF1KE2 VTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGK-----IECVSAETT
. :...: : :. ..::.:: : :: . .: . :.::::..
XP_011 LHAMKGL---LCD--PNRLPPYLRWCVLSTPEIQKCGDMAVAFRRQRLKPEIQCVSAKSP
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 EDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKK
.
XP_011 QHCMERIQAEQVDAVTLSGEDIYTAGKTYGLVPAAGEHYAPEDSSNSYYVVAVVRRDSSH
410 420 430 440 450 460
>--
initn: 633 init1: 255 opt: 647 Z-score: 728.9 bits: 145.3 E(85289): 7.3e-34
Smith-Waterman score: 647; 43.7% identity (70.0% similar) in 247 aa overlap (396-625:406-647)
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKC-GLV
:. .:. ..::..:.: .: ::: :::
XP_011 IQKCGDMAVAFRRQRLKPEIQCVSAKSPQHCMERIQAEQVDAVTLSGEDIYTAGKTYGLV
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 PVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASD-LTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPM
:. .:.: :. .. :..::::....: .: :.:.::.:::.. : :::..:.
XP_011 PAAGEHYAPEDSSNS-----YYVVAVVRRDSSHAFTLDELRGKRSCHAGFGSPAGWDVPV
440 450 460 470 480 490
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pF1KE2 GLL----YNKINHCRF----DEFFSEGCAP-GSKKD--SSLCKLCMGS--GLNLCEPNNK
: : . . . : .:::. .:.: .. :. :::: ::.:. : : : :..
XP_011 GALIQRGFIRPKDCDVLTAVSEFFNASCVPVNNPKNYPSSLCALCVGDEQGRNKCVGNSQ
500 510 520 530 540 550
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pF1KE2 EGYYGYTGAFRCLVEK-GDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKP
: :::: ::::::::. ::::::.: :: .::.:.: .::: .: .:::::: .:.:
XP_011 ERYYGYRGAFRCLVENAGDVAFVRHTTVFDNTNGHNSEPWAAELRSEDYELLCPNGARAE
560 570 580 590 600 610
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pF1KE2 VEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEA-CVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDL
: ..: :.::. : :::..: : . :. .: . :.
XP_011 VSQFAACNLAQIPPHAVMVRPDTNIFTVYGLLDKAQNPSIPGVLYSGSLGFPRGLLSPLK
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650 660 670 680 690
pF1KE2 LFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
>>NP_005920 (OMIM: 155750) melanotransferrin isoform 1 p (738 aa)
initn: 934 init1: 277 opt: 605 Z-score: 680.9 bits: 136.6 E(85289): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 908; 41.1% identity (66.3% similar) in 421 aa overlap (1-394:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRLAVGALLVCAVLGLCLAVPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVK
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NP_005 MRGPSGALWL--LLALRTVLGGMEVRWCATSDPEQHKCGNMSEAFREA--GIQPSLLCVR
10 20 30 40 50
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...: .. :.: ::::::..:..:::.:.: : . : . :::...:.:::.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]