Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2053, 688 aa
1>>>pF1KE2053 688 - 688 aa - 688 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2165+/-0.000509; mu= 14.6804+/- 0.031
mean_var=143.6913+/-29.381, 0's: 0 Z-trim(113.5): 438 B-trim: 4 in 1/51
Lambda= 0.106994
statistics sampled from 22259 (22805) to 22259 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 10.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_958850 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688) 4868 764.5 0
NP_001725 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688) 4868 764.5 0
XP_005253817 (OMIM: 120580,613783) PREDICTED: comp ( 688) 4868 764.5 0
NP_006601 (OMIM: 605102,613791) mannan-binding lec ( 686) 1656 268.7 5.3e-71
NP_001870 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 699) 1466 239.4 3.6e-62
XP_011511292 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 706) 1466 239.4 3.7e-62
NP_624302 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 728) 1280 210.7 1.6e-53
XP_011511291 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 735) 1280 210.7 1.7e-53
XP_016862358 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 702) 1277 210.2 2.2e-53
XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668) 1257 207.1 1.8e-52
XP_016862360 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 660) 1198 198.0 9.9e-50
XP_016862361 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 615) 1034 172.6 4e-42
NP_001027019 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding ( 380) 996 166.5 1.7e-40
XP_011511293 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 387) 996 166.5 1.7e-40
XP_006713764 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 354) 993 166.0 2.2e-40
XP_016855586 (OMIM: 605102,613791) PREDICTED: mann ( 332) 804 136.8 1.3e-31
NP_631947 (OMIM: 605102,613791) mannan-binding lec ( 185) 479 86.4 1.1e-16
NP_005134 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin isofor ( 406) 480 86.9 1.7e-16
NP_001119574 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 476 86.2 2.3e-16
NP_001305067 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 475 86.0 2.6e-16
XP_006723244 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 476 86.3 2.6e-16
NP_002142 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 476 86.3 2.6e-16
XP_016882220 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 476 86.3 2.6e-16
NP_892028 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 476 86.3 2.6e-16
XP_005258895 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 476 86.3 2.6e-16
XP_016882221 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 393) 471 85.5 4.3e-16
NP_066275 (OMIM: 140210) haptoglobin-related prote ( 348) 460 83.7 1.3e-15
NP_001298186 (OMIM: 176930,188050,601367,613679,61 ( 606) 456 83.4 2.8e-15
NP_000497 (OMIM: 176930,188050,601367,613679,61439 ( 622) 456 83.4 2.9e-15
NP_000303 (OMIM: 176860,612283,612304) vitamin K-d ( 461) 451 82.5 4e-15
XP_005263774 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 482) 451 82.5 4.1e-15
XP_016859995 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 495) 451 82.5 4.2e-15
XP_016859994 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 542) 451 82.6 4.5e-15
NP_062562 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulation ( 444) 425 78.4 6.3e-14
NP_000122 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulation ( 466) 425 78.5 6.5e-14
NP_001254483 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulat ( 382) 422 77.9 7.9e-14
XP_011535777 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 433) 422 78.0 8.6e-14
NP_009203 (OMIM: 167800,601405) chymotrypsin-C pre ( 268) 419 77.3 8.6e-14
XP_011535776 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 495) 419 77.6 1.3e-13
XP_011535778 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 364) 415 76.8 1.6e-13
XP_006720026 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 412) 410 76.1 3e-13
NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 414 77.1 3.6e-13
XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 402 75.2 1.1e-12
XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 400 74.8 1.3e-12
NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 400 74.8 1.3e-12
NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 400 75.0 1.6e-12
NP_002764 (OMIM: 600823) prostasin preproprotein [ ( 343) 387 72.5 3.1e-12
NP_114154 (OMIM: 608018) serine protease 27 isofor ( 290) 383 71.8 4.3e-12
NP_077078 (OMIM: 191081) tryptase beta-2 prepropro ( 275) 381 71.4 5.1e-12
NP_001306118 (OMIM: 173370,612348) tissue-type pla ( 473) 383 72.0 5.9e-12
>>NP_958850 (OMIM: 120580,613783) complement C1s subcomp (688 aa)
initn: 4868 init1: 4868 opt: 4868 Z-score: 4075.2 bits: 764.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4868; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 EKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCG
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE2 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
670 680
>>NP_001725 (OMIM: 120580,613783) complement C1s subcomp (688 aa)
initn: 4868 init1: 4868 opt: 4868 Z-score: 4075.2 bits: 764.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4868; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
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pF1KE2 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCG
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE2 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
670 680
>>XP_005253817 (OMIM: 120580,613783) PREDICTED: compleme (688 aa)
initn: 4868 init1: 4868 opt: 4868 Z-score: 4075.2 bits: 764.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4868; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
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XP_005 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
670 680
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::::.:.:::. : :: :.. :: . ::::.:... ..: . : ..:.. :.:
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. . :::::::.: ... ..:. :.. : :.: : :::: :.
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NP_006 VFLD-SETERWFVGGIVSWGSMNCGEAGQYGVYTKVINYIPWIENIISDF
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:.:.. :..:::: .. . ..::. . : : :.: : .. : : :
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pF1KE2 LLEV-PEGRTN-FDNDIALVRL-KDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGR
. :. : :.::.:::.: ..:: .. : ::::: . ..: . ..::::.
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NP_001 SGGPMVTLN-RERGQWYLVGTVSWGDDCGKKDRYGVYSYIHHNKDWIQRVTGVRN
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pF1KE2 NSTPRED
XP_011 RN
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NP_624 EVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEP--ISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRA
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pF1KE2 DPMPCPKEDTP-NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWS
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NP_624 AGNECPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWS
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NP_624 LGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECK-TSYESRSGN---YS
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10 20 30 40
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670 680
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