FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2045, 663 aa
1>>>pF1KE2045 663 - 663 aa - 663 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3236+/-0.000739; mu= 14.5296+/- 0.045
mean_var=79.8933+/-15.837, 0's: 0 Z-trim(109.6): 21 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.143489
statistics sampled from 10975 (10989) to 10975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS32558.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 ( 647) 663 146.9 8.5e-35
CCDS32559.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 ( 602) 410 94.5 4.7e-19
>>CCDS11084.1 ALOX12 gene_id:239|Hs108|chr17 (663 aa)
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Smith-Waterman score: 4613; 100.0% identity (100.0% similar) in 663 aa overlap (1-663:1-663)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEEKRLDFEWTLKA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GALEMALKRVYTLLSSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDELFSYQFLNGANPML
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRRSTSLPSRLVLPSGMEELQAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVIRGEKQYLAAPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLNTHLVAEVIAVATMRCLPGLHPIFKFLIPHIRYTMEINTRARTQLISDGGIFDKAVST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGGGHVQLLRRAAAQLTYCSLCPPDDLADRGLLGLPGALYAHDALRLWEIIARYVEGIVH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 AAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDVRQACLQMAISWHLSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDVRQACLQMAISWHLSRR
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pF1KE2 QPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITARNEQLDWPYEYLKPSCIENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITARNEQLDWPYEYLKPSCIENS
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VTI
:::
CCDS11 VTI
>>CCDS11049.1 ALOX15 gene_id:246|Hs108|chr17 (662 aa)
initn: 3082 init1: 2670 opt: 3058 Z-score: 3417.5 bits: 642.7 E(32554): 4.9e-184
Smith-Waterman score: 3058; 65.5% identity (85.4% similar) in 663 aa overlap (1-663:1-662)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGRYRIRVATGAWLFSGSYNRVQLWLVGTRGEAELELQLRPARGEEEEFDHDVAEDLGLL
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CCDS11 MGLYRIRVSTGASLYAGSNNQVQLWLVGQHGEAALGKRLWPARGKETELKVEVPEYLGPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QFVRLRKHHWLVDDAWFCDRITVQGPGACAEVAFPCYRWVQGEDILSLPEGTARLPGDNA
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CCDS11 LFVKLRKRHLLKDDAWFCNWISVQGPGAGDEVRFPCYRWVEGNGVLSLPEGTGRTVGEDP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEEKRLDFEWTLKA
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CCDS11 QGLFQKHREEELEERRKLYRWGNWKDGLILNMAGAKLYDLPVDERFLEDKRVDFEVSLAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GALEMALKRVYTLLSSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDELFSYQFLNGANPML
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CCDS11 GLADLAIKDSLNVLTCWKDLDDFNRIFWCGQSKLAERVRDSWKEDALFGYQFLNGANPVV
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 LRRSTSLPSRLVLPSGMEELQAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVIRGEKQYLAAPL
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CCDS11 LRRSAHLPARLVFPPGMEELQAQLEKELEGGTLFEADFSLLDGIKANVILCSQQHLAAPL
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310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VMLKMEPNGKLQPMVIQIQPPNPSSPTPTLFLPSDPPLAWLLAKSWVRNSDFQLHEIQYH
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CCDS11 VMLKLQPDGKLLPMVIQLQLPRTGSPPPPLFLPTDPPMAWLLAKCWVRSSDFQLHELQSH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LLNTHLVAEVIAVATMRCLPGLHPIFKFLIPHIRYTMEINTRARTQLISDGGIFDKAVST
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CCDS11 LLRGHLMAEVIVVATMRCLPSIHPIFKLIIPHLRYTLEINVRARTGLVSDMGIFDQIMST
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 GGGGHVQLLRRAAAQLTYCSLCPPDDLADRGLLGLPGALYAHDALRLWEIIARYVEGIVH
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CCDS11 GGGGHVQLLKQAGAFLTYSSFCPPDDLADRGLLGVKSSFYAQDALRLWEIIYRYVEGIVS
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LFYQRDDIVKGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQSQSQLCHFLTMCVFTCTAQH
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CCDS11 LHYKTDVAVKDDPELQTWCREITEIGLQGAQDRGFPVSLQARDQVCHFVTMCIFTCTGQH
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550 560 570 580 590 600
pF1KE2 AAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDVRQACLQMAISWHLSRR
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CCDS11 ASVHLGQLDWYSWVPNAPCTMRLPPPTTK-DATLETVMATLPNFHQASLQMSITWQLGRR
550 560 570 580 590
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pF1KE2 QPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITARNEQLDWPYEYLKPSCIENS
:: :: .:.:.:.:::::.:::::..:: .: :.::: :: .:: :::::.:: .:::
CCDS11 QPVMVAVGQHEEEYFSGPEPKAVLKKFREELAALDKEIEIRNAKLDMPYEYLRPSVVENS
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 VTI
:.:
CCDS11 VAI
660
>>CCDS7212.1 ALOX5 gene_id:240|Hs108|chr10 (674 aa)
initn: 1619 init1: 542 opt: 1742 Z-score: 1945.0 bits: 370.2 E(32554): 5.1e-102
Smith-Waterman score: 1816; 42.0% identity (68.3% similar) in 679 aa overlap (1-663:1-674)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGRYRIRVATGAWLFSGSYNRVQLWLVGTRGEAELELQLRP-----ARGEEEEFDHDVAE
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CCDS72 MPSYTVTVATGSQWFAGTDDYIYLSLVGSAGCSEKHLLDKPFYNDFERGAVDSYDVTVDE
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 DLGLLQFVRLRKH-HWLVDDAWFCDRITVQGPGACAEVAFPCYRWVQGEDILSLPEGTAR
.:: .:.::..:. .:: :: :. ::.. : . . ::::::. :. . : .: :.
CCDS72 ELGEIQLVRIEKRKYWLNDD-WYLKYITLKTPHG-DYIEFPCYRWITGDVEVVLRDGRAK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LPGDNALDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEEKRLDF
: :. . ....::.:::. ::. : : :. :.::.: : . ::: ...: :: .::
CCDS72 LARDDQIHILKQHRRKELETRQKQYRWMEWNPGFPLSIDAKCHKDLPRDIQFDSEKGVDF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 EWTLKAGALEMALKRVYTLL-SSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDELFSYQFL
. . . .. ..: . .. :::: . ::..:: .....:.: . ::.: .:.::::
CCDS72 VLNYSKAMENLFINRFMHMFQSSWNDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDLMFGYQFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 NGANPMLLRRSTSLPSRLVLPSGMEEL----QAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVI
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CCDS72 NGCNPVLIRRCTELPEKLPVTTEMVECSLERQLSLEQEVQQGNIFIVDFELLDGIDANKT
240 250 260 270 280 290
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:.::::. .: . .:. :..::. : :. .: .::::: ::::: ::
CCDS72 DPCTLQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQIPGDENP---IFLPSDAKYDWLLAKIWV
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350 360 370 380 390 400
pF1KE2 RNSDFQLHEIQYHLLNTHLVAEVIAVATMRCLPGLHPIFKFLIPHIRYTMEINTRARTQL
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CCDS72 RSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQL
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pF1KE2 ISDGGIFDKAVSTGGGGHVQLLRRAAAQLTYCSLCPPDDLADRGLLG---LPGALYAHDA
: . :.:::: .::::::::...:: .::: ::: :. . ::. . .: .: :.
CCDS72 ICECGLFDKANATGGGGHVQMVQRAMKDLTYASLCFPEAIKARGMESKEDIPYYFYRDDG
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pF1KE2 LRLWEIIARYVEGIVHLFYQRDDIVKGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQSQSQ
: .:: : .. .: ..:. :..:. ::::: . .. :. .. ::: : .:. :
CCDS72 LLVWEAIRTFTAEVVDIYYEGDQVVEEDPELQDFVNDVYVYGMRGRKSSGFPKSVKSREQ
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pF1KE2 LCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDV
: ..::. .:: .:::::.: :: :: .:.:::: ::: ::::.: ::. .. .:::
CCDS72 LSEYLTVVIFTASAQHAAVNFGQYDWCSWIPNAPPTMRAPPPTAKGVVTIEQIVDTLPDR
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pF1KE2 RQACLQMAISWHLSRRQPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITARNEQ
..: ... : ::. : . . :: . :..: : .. .:: .:: . . :. ::..
CCDS72 GRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLEAIVSVIAERNKK
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650 660
pF1KE2 LDWPYEYLKPSCIENSVTI
. :: ::.:. : :::.:
CCDS72 KQLPYYYLSPDRIPNSVAI
660 670
>>CCDS11128.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 (676 aa)
initn: 1561 init1: 1000 opt: 1529 Z-score: 1706.7 bits: 326.2 E(32554): 9.6e-89
Smith-Waterman score: 1631; 38.0% identity (66.1% similar) in 682 aa overlap (1-663:1-676)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGRYRIRVATGAWLFSGSYNRVQLWLVGTRGEAE---LE-LQLRPARGEEEEFDHDVAED
:...:.::.:: . .:....:.. .::::::. :. : . . : ::.:. . ::
CCDS11 MAEFRVRVSTGEAFGAGTWDKVSVSIVGTRGESPPLPLDNLGKEFTAGAEEDFQVTLPED
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.: . ..:..: :. ::::: . . : . ... ::::.:..: : :
CCDS11 VGRVLLLRVHKAPPVLPLLGPLAPDAWFCRWFQLTPPRG-GHLLFPCYQWLEGAGTLVLQ
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pF1KE2 EGTARLPGDNALDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEE
::::.. . ..:..:..::. ::..: : ... : : . .:: :...
CCDS11 EGTAKVSWADHHPVLQQQRQEELQARQEMYQWKAYNPGWPHCLDEKTVEDLELNIKYSTA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 KRLDFEWTLKAGAL--EMALKRVYTLLSSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDEL
: .: :.::. :: .: . . : :... .:: ... ::.. . ::.: .
CCDS11 KNANFY--LQAGSAFAEMKIKGLLDRKGLWRSLNEMKRIFNFRRTPAAEHAFEHWQEDAF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 FSYQFLNGANPMLLRRSTSLPSRLVLPSGMEEL----QAQLEKELQNGSLFEADFILLDG
:. ::::: ::.:.:: ::. . . ..: ..:. ::..:::: .: .:.:
CCDS11 FASQFLNGLNPVLIRRCHYLPKNFPVTDAMVASVLGPGTSLQAELEKGSLFLVDHGILSG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 IPANVIRGEKQYLAAPLVMLKMEPN-GKLQPMVIQI-QPPNPSSPTPTLFLPSDPPLAWL
: .::: :. :. :::...: . :. : : :..::. : :.:.:: .:::.: ::
CCDS11 IQTNVINGKPQFSAAPMTLLYQSPGCGPLLPLAIQLSQTPGPNSP---IFLPTDDKWDWL
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 LAKSWVRNSDFQLHEIQYHLLNTHLVAEVIAVATMRCLPGLHPIFKFLIPHIRYTMEINT
:::.::::..:..:: :::..::. ::...::.: :: ::.::.:::: :::..:::
CCDS11 LAKTWVRNAEFSFHEALTHLLHSHLLPEVFTLATLRQLPHCHPLFKLLIPHTRYTLHINT
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 RARTQLISDGGIFDKAVSTGGGGHVQLLRRAAAQLTYCSLCPPDDLADRGLLGLPGALYA
:: :: : . :.... : : .:..: ::.: :: :.:. ::. .:: :
CCDS11 LARELLIVPGQVVDRSTGIGIEGFSELIQRNMKQLNYSLLCLPEDIRTRGVEDIPGYYYR
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 HDALRLWEIIARYVEGIVHLFYQRDDIVKGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQS
:....: . :.: :. ..: :. :. : ::::: ::: :. . .. :.: :...
CCDS11 DDGMQIWGAVERFVSEIIGIYYPSDESVQDDRELQAWVREIFSKGFLNQESSGIPSSLET
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 QSQLCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSL
. : ...:: .:::.:.:::.. ::.: ::.:: : .:..::::.: .: ...:
CCDS11 REALVQYVTMVIFTCSAKHAAVSAGQFDSCAWMPNLPPSMQLPPPTSKGLATCEGFIATL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 PDVRQACLQMAISWHLSRRQPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITAR
: : .: . : ::.. :. ::: . ...:. :. . :.. : .. . : :
CCDS11 PPVNATCDVILALWLLSKEPGDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIATFQSRLAQISRGIQER
600 610 620 630 640 650
650 660
pF1KE2 NEQLDWPYEYLKPSCIENSVTI
:. : :: :: : :::::.:
CCDS11 NQGLVLPYTYLDPPLIENSVSI
660 670
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: .:: : .. .: ..:. :..:. ::::: . .. :. .. ::: : .:. :
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10 20 30 40 50
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CCDS11 RTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQEMESDKKFALTKTTT
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160 170 180 190
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200 210 220 230 240 250
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260 270 280 290 300
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310 320 330 340 350 360
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370 380 390 400 410 420
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CCDS11 CEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEGLVDQVTSIGRQGLIY
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CCDS11 LMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSDA
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CCDS11 GTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQISRDIQERNQGLALPYTYLDPPLIENSVSI
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10 20 30 40
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CCDS54 MESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNA
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CCDS54 IPASLGMKLRGLLDRKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNP
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CCDS54 VMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDTCLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQ
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.:: . :.: :::. :..:.::.: :: :::.:.:.:: :::...:: ::. :.. :.
CCDS54 VHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEGL
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CCDS54 VDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIES
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CCDS54 FVSEIVGYYYPSDASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAII
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:.:.:::::.:.:: :. ::.:::: .::.::: :: .:. : . .::.: .: .. .
CCDS54 FNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSSMRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLPEVNISCNNLLL
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: .:.. :. ::: . ...:. :. . :.. : .. ..: ::. : :: ::
CCDS54 FWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQISRDIQERNQGLALPYTYLD
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CCDS54 PPLIENSVSI
840
>>CCDS11129.1 ALOX12B gene_id:242|Hs108|chr17 (701 aa)
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:::::. :.::. . ..: .:::.::.. .: . .: : .. . .:
CCDS11 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD
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:: : ..::.:... . : :.:. . . .:.. :: :.:..: . :.: :.:..
CCDS11 LGELIIIRLHKERYAFFPKDPWYCNYVQICAPNGRI-YHFPAYQWMDGYETLALREATGK
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CCDS11 TTADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRPEWNG
120 130 140 150 160 170
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CCDS11 YIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFK-VRGLLDCKHSWKRLKD
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CCDS11 IRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVAPFL
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pF1KE2 AQ---LEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVIRGEKQYLAAPLVMLKMEPNGKLQPMVIQI
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CCDS11 GEGTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGKMMPIAIQL
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CCDS11 SQTPGPDCP---IFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALLR
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CCDS11 NLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSELT
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CCDS11 YDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQS
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CCDS11 WVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNF
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CCDS11 PASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVE
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pF1KE2 PKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITARNEQLDWPYEYLKPSCIENSVTI
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CCDS11 EAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRNKCLPIPYYYLDPVLIENSISI
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CCDS32 MAEFRVRVSTGEAFGAGTWDKVSVSIVGTRGESPPLPLDNLGKEFTAGAEEDFQVTLPED
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CCDS32 VGRVLLLRVHKAPPVLPLLGPLAPDAWFCRWFQLTPPRG-GHLLFPCYQWLEGAGTLVLQ
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CCDS32 EGTAKVSWADHHPVLQQQRQEELQARQEMYQWKAYNPGWPHCLDEKTVEDLELNIKYSTA
120 130 140 150 160 170
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CCDS32 KNANFY--LQAGSAFAEMKIKGLLDRKGLWRSLNEMKRIFNFRRTPAAEHAFEHWQEDAF
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