Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2039
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2039, 648 aa
1>>>pF1KE2039 648 - 648 aa - 648 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2896+/-0.000328; mu= 2.3867+/- 0.021
mean_var=213.6635+/-44.688, 0's: 0 Z-trim(122.7): 161 B-trim: 1548 in 1/57
Lambda= 0.087742
statistics sampled from 41045 (41211) to 41045 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.483), width: 16
Scan time: 10.640
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_078958 (OMIM: 616659) TBC1 domain family member ( 648) 4449 575.8 1.6e-163
NP_001161694 (OMIM: 616659) TBC1 domain family mem ( 615) 4197 543.9 6.3e-154
XP_011525619 (OMIM: 616659) PREDICTED: TBC1 domain ( 501) 3285 428.4 3e-119
XP_006719630 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 445) 1508 203.4 1.4e-51
XP_011536984 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 445) 1508 203.4 1.4e-51
XP_016875317 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 530) 1508 203.5 1.6e-51
XP_016875316 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 547) 1508 203.5 1.7e-51
XP_016875315 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 575) 1508 203.5 1.7e-51
XP_016875314 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 575) 1508 203.5 1.7e-51
XP_011536981 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 592) 1508 203.5 1.8e-51
XP_011536982 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 592) 1508 203.5 1.8e-51
XP_006719629 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 592) 1508 203.5 1.8e-51
XP_016875313 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 592) 1508 203.5 1.8e-51
NP_001139685 (OMIM: 612662) TBC1 domain family mem ( 674) 1508 203.5 2e-51
XP_006719628 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 682) 1508 203.6 2e-51
NP_001139686 (OMIM: 612662) TBC1 domain family mem ( 682) 1508 203.6 2e-51
NP_073608 (OMIM: 612662) TBC1 domain family member ( 691) 1508 203.6 2e-51
XP_006719627 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 699) 1508 203.6 2e-51
XP_011536983 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain ( 456) 715 103.1 2.4e-21
XP_011522625 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 521) 700 101.2 9.9e-21
XP_016879676 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 543) 700 101.2 1e-20
NP_001258774 (OMIM: 616637) TBC1 domain family mem ( 405) 689 99.7 2.1e-20
XP_011522626 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 396) 688 99.6 2.3e-20
XP_016879677 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 462) 689 99.8 2.4e-20
XP_016879675 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 599) 689 99.8 2.9e-20
XP_005257107 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 766) 689 99.9 3.6e-20
XP_005257106 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 767) 689 99.9 3.6e-20
XP_006721757 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 767) 689 99.9 3.6e-20
NP_061893 (OMIM: 616637) TBC1 domain family member ( 767) 689 99.9 3.6e-20
NP_002527 (OMIM: 311240) TBC1 domain family member ( 688) 644 94.2 1.7e-18
NP_001258773 (OMIM: 616637) TBC1 domain family mem ( 392) 633 92.6 2.8e-18
XP_011522624 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 753) 633 92.8 4.8e-18
NP_001258775 (OMIM: 616637) TBC1 domain family mem ( 278) 583 86.2 1.7e-16
XP_016879674 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 639) 583 86.4 3.4e-16
XP_005257109 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 640) 583 86.4 3.4e-16
XP_006721758 (OMIM: 616637) PREDICTED: TBC1 domain ( 634) 437 68.0 1.2e-10
NP_001091968 (OMIM: 611417) small G protein signal (1032) 409 64.5 2.1e-09
NP_597711 (OMIM: 611417) small G protein signaling (1087) 409 64.6 2.2e-09
NP_001091967 (OMIM: 611417) small G protein signal (1093) 409 64.6 2.2e-09
NP_001035037 (OMIM: 611417) small G protein signal (1148) 409 64.6 2.3e-09
XP_016880964 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1047) 395 62.8 7.3e-09
XP_011522405 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1092) 395 62.8 7.6e-09
NP_001091979 (OMIM: 611418) small G protein signal (1006) 393 62.5 8.5e-09
NP_055668 (OMIM: 611418) small G protein signaling (1051) 393 62.5 8.8e-09
XP_016880963 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1052) 393 62.5 8.8e-09
XP_011522404 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1097) 393 62.5 9.1e-09
XP_016880965 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro ( 785) 387 61.7 1.2e-08
XP_011522410 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1012) 387 61.8 1.4e-08
XP_011522409 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1042) 387 61.8 1.5e-08
XP_011522408 (OMIM: 611418) PREDICTED: small G pro (1057) 387 61.8 1.5e-08
>>NP_078958 (OMIM: 616659) TBC1 domain family member 17 (648 aa)
initn: 4449 init1: 4449 opt: 4449 Z-score: 3056.6 bits: 575.8 E(85289): 1.6e-163
Smith-Waterman score: 4449; 99.8% identity (99.8% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
NP_078 LFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQLCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 VSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 SRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QPEGAASDLPPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QPEGAASDLPPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 ELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 SDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 LDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 LMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE2 HSPSPTASPLPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 HSPSPTASPLPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
610 620 630 640
>>NP_001161694 (OMIM: 616659) TBC1 domain family member (615 aa)
initn: 4197 init1: 4197 opt: 4197 Z-score: 2884.5 bits: 543.9 E(85289): 6.3e-154
Smith-Waterman score: 4197; 99.7% identity (99.8% similar) in 609 aa overlap (40-648:7-615)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 FEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQILFSKKDSSG
.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEGAGYRDNDVLLHWAPVEEAGDSTQILFSKKDSSG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFSVSLGELKSI
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQLCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFSVSLGELKSI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQDSRLYLVFPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQDSRLYLVFPH
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQPQPEGAASDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQPQPEGAASDL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQERRNSLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQERRNSLLH
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILY
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDSQDSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDSQDSGSL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 CFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLMLSGFGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLMLSGFGSN
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEPHSPSPTASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEPHSPSPTASP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KE2 LPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
580 590 600 610
>>XP_011525619 (OMIM: 616659) PREDICTED: TBC1 domain fam (501 aa)
initn: 3319 init1: 3285 opt: 3285 Z-score: 2261.9 bits: 428.4 E(85289): 3e-119
Smith-Waterman score: 3285; 99.4% identity (99.6% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
XP_011 LFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQLCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QPEGAASDLPPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPEGAASDLPPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDT
: .
XP_011 LGTVAHTCNPSTLGGQGGRIT
490 500
>>XP_006719630 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain fam (445 aa)
initn: 1497 init1: 1497 opt: 1508 Z-score: 1046.9 bits: 203.4 E(85289): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 1522; 54.9% identity (74.8% similar) in 437 aa overlap (227-643:4-438)
200 210 220 230 240
pF1KE2 SFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNF----FRGA-----LQPQPEGAA-
::.:::. .::. .: : :
XP_006 MIGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADF
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 -SDLPP--PPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELK
:: : ... :::::::. ..:: ::.:.: ::. :::.... :::. .: ..:
XP_006 LSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLEEWTKNIDSEGRILNVDNMK
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQER
. :: :::: .::..::::::::. :..: ::. ..::::::::::::::.: :::.
XP_006 QMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSISQEQEK
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDL
::: :. ::::::.::.::::::::::: .:::: ::.:::.::::: ::::::::::::
XP_006 RNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDL
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDS
:::.:::..::::::::: ..:. .. ::::... :: :: .: :::.:: .:..:.:
XP_006 LSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQMQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLES
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLML
:::: : :::::::: ::::: : :.::::::.:: :: :.:::. ::::. :.. .:
XP_006 QDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVMWTELPCTNFHLLLCCAILESEKQQIME
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. .: ::::::::::.::..:::.: .:::. :.. : :::. : ::::: . . :
XP_006 KHYGFNEILKHINELSMKIDVEDILCKAEAISLQMVKCKELPQAVCEILGLQGSEVTTPD
340 350 360 370 380 390
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: . . .: : : .. : :.. : . :: .: : :
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::.:::. .::. .: : :
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:: : ... :::::::. ..:: ::.:.: ::. :::.... :::. .: ..:
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::: :. ::::::.::.::::::::::: .:::: ::.:::.::::: ::::::::::::
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:::.:::..::::::::: ..:. .. ::::... :: :: .: :::.:: .:..:.:
XP_011 LSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQMQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLES
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:::: : :::::::: ::::: : :.::::::.:: :: :.:::. ::::. :.. .:
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. .: ::::::::::.::..:::.: .:::. :.. : :::. : ::::: . . :
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: . . .: : : .. : :.. : . :: .: : :
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. : .:..: ::::.: :: ...: ::.::.. :.:. . ...... .:::..:.
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.::.:::. .::. .: : : :: : ... :::::::. ..:: :
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:.:.: ::. :::.... :::. .: ..:. :: :::: .::..::::::::. :..:
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::. ..::::::::::::::.: :::.::: :. ::::::.::.:::::::::::
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::... :: :: .: :::.:: .:..:.::::: : :::::::: ::::: : :.:::
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. : . :: .: : :
XP_016 SGA-RNDSPTQI-PVSSDVCRLTPA
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>>XP_016875316 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain fam (547 aa)
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XP_016 MGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDSKLLI
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.. .:::..:. .::.:::. .::. .: : : :: : ..
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. :::::::. ..:: ::.:.: ::. :::.... :::. .: ..:. :: :::: .:
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::: ::::: : :.::::::.:: :: :.:::. ::::. :.. .: . .: :::::::
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:::.::..:::.: .:::. :.. : :::. : ::::: . . : : . . .
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: : : .. : :.. : . :: .: : :
XP_016 PCPTSAFQSNALPTLSASGA-RNDSPTQI-PVSSDVCRLTPA
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>>XP_016875315 (OMIM: 612662) PREDICTED: TBC1 domain fam (575 aa)
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::.::..: .:. . ...... .:::..:. .::.:::. .::. .: :
XP_016 -LSQSFENL--LDEPAYGLIQKIKKDPYTATMIGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSE
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: :: : ... :::::::. ..:: ::.:.: ::. :::.... :::. .:
XP_016 MADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLEEWTKNIDSEGRILNV
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pF1KE2 PELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSP
..:. :: :::: .::..::::::::. :..: ::. ..::::::::::::::.:
XP_016 DNMKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSISQ
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pF1KE2 EQERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQG
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XP_016 EQEKRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQG
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:::::::.:::..::::::::: ..:. .. ::::... :: :: .: :::.:: .:.
XP_016 MSDLLSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQMQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCS
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.: . .: ::::::::::.::..:::.: .:::. :.. : :::. : ::::: .
XP_016 QIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDILCKAEAISLQMVKCKELPQAVCEILGLQGSEV
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initn: 1773 init1: 1497 opt: 1508 Z-score: 1045.3 bits: 203.5 E(85289): 1.7e-51
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XP_016 MVNTVSFKRKPHTNGDAPSHRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQN
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XP_016 -LSQSFENL--LDEPAYGLIQKIKKDPYTATMIGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSE
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: :: : ... :::::::. ..:: ::.:.: ::. :::.... :::. .:
XP_016 MADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLEEWTKNIDSEGRILNV
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..:. :: :::: .::..::::::::. :..: ::. ..::::::::::::::.:
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pF1KE2 EQERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQG
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pF1KE2 MSDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCD
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XP_016 MSDLLSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQMQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCS
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pF1KE2 FLDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERD
.:.::::: : :::::::: ::::: : :.::::::.:: :: :.:::. ::::. :..
XP_016 YLESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVMWTELPCTNFHLLLCCAILESEKQ
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pF1KE2 TLMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGL--APP
.: . .: ::::::::::.::..:::.: .:::. :.. : :::. : ::::: .
XP_016 QIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDILCKAEAISLQMVKCKELPQAVCEILGLQGSEV
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