Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2039
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2039, 648 aa
1>>>pF1KE2039 648 - 648 aa - 648 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8901+/-0.000844; mu= 5.1296+/- 0.051
mean_var=211.1262+/-42.397, 0's: 0 Z-trim(114.9): 51 B-trim: 12 in 1/53
Lambda= 0.088268
statistics sampled from 15411 (15461) to 15411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16
Scan time: 4.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12785.1 TBC1D17 gene_id:79735|Hs108|chr19 ( 648) 4449 579.2 6.2e-165
CCDS54294.1 TBC1D17 gene_id:79735|Hs108|chr19 ( 615) 4197 547.0 2.7e-155
CCDS53814.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 ( 674) 1508 204.7 3.5e-52
CCDS55849.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 ( 682) 1508 204.7 3.6e-52
CCDS31858.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 ( 691) 1508 204.7 3.6e-52
CCDS62351.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 405) 689 100.2 5.9e-21
CCDS11766.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 767) 689 100.4 9.7e-21
CCDS35242.1 TBC1D25 gene_id:4943|Hs108|chrX ( 688) 644 94.6 4.7e-19
CCDS62353.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 392) 633 93.1 8e-19
CCDS62352.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 278) 583 86.6 5.1e-17
>>CCDS12785.1 TBC1D17 gene_id:79735|Hs108|chr19 (648 aa)
initn: 4449 init1: 4449 opt: 4449 Z-score: 3074.6 bits: 579.2 E(32554): 6.2e-165
Smith-Waterman score: 4449; 99.8% identity (99.8% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS12 LFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQLCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QPEGAASDLPPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QPEGAASDLPPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE2 HSPSPTASPLPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HSPSPTASPLPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
610 620 630 640
>>CCDS54294.1 TBC1D17 gene_id:79735|Hs108|chr19 (615 aa)
initn: 4197 init1: 4197 opt: 4197 Z-score: 2901.5 bits: 547.0 E(32554): 2.7e-155
Smith-Waterman score: 4197; 99.7% identity (99.8% similar) in 609 aa overlap (40-648:7-615)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 FEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDSTQILFSKKDSSG
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MEGAGYRDNDVLLHWAPVEEAGDSTQILFSKKDSSG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFSVSLGELKSI
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDSCASEEEPTFDPGYEPDWAVISTVRPQLCHSEPTRGAEPSCPQGSWAFSVSLGELKSI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQDSRLYLVFPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLSRYLLLASSPQDSRLYLVFPH
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQPQPEGAASDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSRVTNFFRGALQPQPEGAASDL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPPPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQERRNSLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQERRNSLLH
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILY
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDSQDSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDSQDSGSL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 CFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLMLSGFGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLMLSGFGSN
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 EILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEPHSPSPTASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGLAPPAEPHSPSPTASP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KE2 LPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPLSPTRAPPTPPPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
580 590 600 610
>>CCDS53814.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 (674 aa)
initn: 2005 init1: 1497 opt: 1508 Z-score: 1050.3 bits: 204.7 E(32554): 3.5e-52
Smith-Waterman score: 2032; 48.5% identity (73.0% similar) in 674 aa overlap (1-643:1-667)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEGAGY---RVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDS
: .:: ....:. :::.:.: : .:.:.::.:..::.::: .:.. : :...: ::
CCDS53 MAAAGVVSGKIIYEQEGVYIHSSCGKTNDQDGLISGILRVLEKDAEVIVDWRPLDDALDS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TQILFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPG------YEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPS
..::...::::. .. . : :: .: ...:: . .. : : ::
CCDS53 SSILYARKDSSSVVEWTQAPKERGHRGSEHLNSYEAEWDMVNTVSFK--RKPHTNGDAPS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 CPQGS--WAFSVSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLS
.:. :.: :: .::::...: :..:.:::. . :::::::.: .. :.. :
CCDS53 HRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQNKEGMGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDSKLLIESLE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 RYLLLASSPQDSRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYSTTFSSFSR
.:..: ::::.: :: ...: ::.::.. :.:. . ...... .:::..:. .::.
CCDS53 KYVVLCESPQDKRTLLVNCQNKS-LSQSFEN--LLDEPAYGLIQKIKKDPYTATMIGFSK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 VTNF----FRGA-----LQPQPEGAA--SDLPP--PPDDEPEPGFEVISCVELGPRPTVE
:::. .::. .: : : :: : ... :::::::. ..:: ::.:.
CCDS53 VTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRIDLGERPVVQ
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 RGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEH
: ::. :::.... :::. .: ..:. :: :::: .::..::::::::. :..: ::.
CCDS53 RREPVSLEEWTKNIDSEGRILNVDNMKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFPWDSTKEER
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 KAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKFYEGPENPG
..::::::::::::::.: :::.::: :. ::::::.::.::::::::::: .:::
CCDS53 TQLQKQKTDEYFRMKLQWKSISQEQEKRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKFYEGQDNPG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQ
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CCDS53 LILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDLLSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQM
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPDVLRLWEVL
. :: :: .: :::.:: .:..:.::::: : :::::::: ::::: : :.::::::.
CCDS53 QGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVM
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 WTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVLTRAEALHR
:: :: :.:::. ::::. :.. .: . .: ::::::::::.::..:::.: .:::.
CCDS53 WTELPCTNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDILCKAEAISL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KE2 QLTACPELPHNVQEILGL--APPAEPHSP-----SPTASPLPLSPTRAPPTPPPSTDTAP
:.. : :::. : ::::: . . : : . . .: : : .. : :.. :
CCDS53 QMVKCKELPQAVCEILGLQGSEVTTPDSDVGEDENVVMTPCPTSAFQSNALPTLSASGA-
600 610 620 630 640 650
630 640
pF1KE2 QPDSSLEILPEEEDEGADS
. :: .: : :
CCDS53 RNDSPTQI-PVSSDVCRLTPA
660 670
>>CCDS55849.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 (682 aa)
initn: 2002 init1: 1497 opt: 1508 Z-score: 1050.2 bits: 204.7 E(32554): 3.6e-52
Smith-Waterman score: 2027; 48.8% identity (73.3% similar) in 664 aa overlap (8-643:19-675)
10 20 30 40
pF1KE2 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWA
...:. :::.:.: : .:.:.::.:..::.::: .:.. :
CCDS55 MCPGLYPYSSLLEYGRSMIIYEQEGVYIHSSCGKTNDQDGLISGILRVLEKDAEVIVDWR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 PVEEAGDSTQILFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPG------YEPDWAVISTVRPQPCHSE
:...: ::..::...::::. .. . : :: .: ...:: . ..
CCDS55 PLDDALDSSSILYARKDSSSVVEWTQAPKERGHRGSEHLNSYEAEWDMVNTVSFK--RKP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PTRGAEPSCPQGS--WAFSVSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGT
: : :: .:. :.: :: .::::...: :..:.:::. . :::::::.: .
CCDS55 HTNGDAPSHRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQNKEGMGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 RALLRVLSRYLLLASSPQDSRLYLVFPHDSSALSNSFHHLQLFDQDSSNVVSRFLQDPYS
. :.. : .:..: ::::.: :: ...: ::.::.. :.:. . ...... .:::.
CCDS55 KLLIESLEKYVVLCESPQDKRTLLVNCQNKS-LSQSFEN--LLDEPAYGLIQKIKKDPYT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KE2 TTFSSFSRVTNF----FRGA-----LQPQPEGAA--SDLPP--PPDDEPEPGFEVISCVE
.:. .::.:::. .::. .: : : :: : ... :::::::. ..
CCDS55 ATMIGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADFLSDAIPGLKINQQEEPGFEVITRID
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 LGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLS
:: ::.:.: ::. :::.... :::. .: ..:. :: :::: .::..::::::::.
CCDS55 LGERPVVQRREPVSLEEWTKNIDSEGRILNVDNMKQMIFRGGLSHALRKQAWKFLLGYFP
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 WEGTAEEHKAHIRKKTDEYFRMKLQWKSVSPEQERRNSLLHGYRSLIERDVSRTDRTNKF
:..: ::. ..::::::::::::::.: :::.::: :. ::::::.::.::::::::
CCDS55 WDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSISQEQEKRNSRLRDYRSLIEKDVNRTDRTNKF
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 YEGPENPGLGLLNDILLTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELV
::: .:::: ::.:::.::::: :::::::::::::::.:::..::::::::: ..:. .
CCDS55 YEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDLLSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQM
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 QGNFEESQETMKRQLGRLLLLLRVLDPLLCDFLDSQDSGSLCFCFRWLLIWFKREFPFPD
. ::::... :: :: .: :::.:: .:..:.::::: : :::::::: ::::: : :
CCDS55 HQNFEEQMQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLD
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 VLRLWEVLWTGLPGPNLHLLVACAILDMERDTLMLSGFGSNEILKHINELTMKLSVEDVL
.::::::.:: :: :.:::. ::::. :.. .: . .: ::::::::::.::..:::.:
CCDS55 ILRLWEVMWTELPCTNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDIL
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 TRAEALHRQLTACPELPHNVQEILGL--APPAEPHSP-----SPTASPLPLSPTRAPPTP
.:::. :.. : :::. : ::::: . . : : . . .: : : .. :
CCDS55 CKAEAISLQMVKCKELPQAVCEILGLQGSEVTTPDSDVGEDENVVMTPCPTSAFQSNALP
600 610 620 630 640 650
630 640
pF1KE2 PPSTDTAPQPDSSLEILPEEEDEGADS
:.. : . :: .: : :
CCDS55 TLSASGA-RNDSPTQI-PVSSDVCRLTPA
660 670 680
>>CCDS31858.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 (691 aa)
initn: 2005 init1: 1497 opt: 1508 Z-score: 1050.1 bits: 204.7 E(32554): 3.6e-52
Smith-Waterman score: 1986; 47.5% identity (71.6% similar) in 682 aa overlap (7-643:10-684)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEGAGYRVVFEKGGVYLHTSAKKYQDRDSLIAGVIRVVEKDNDVLLHWAPVEEAGDS
....:. :::.:.: : .:.:.::.:..::.::: .:.. : :...: ::
CCDS31 MAAAGVVSGKIIYEQEGVYIHSSCGKTNDQDGLISGILRVLEKDAEVIVDWRPLDDALDS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TQILFSKKDSSGGDSCASEEEPTFDPG------YEPDWAVISTVRPQPCHSEPTRGAEPS
..::...::::. .. . : :: .: ...:: . .. : : ::
CCDS31 SSILYARKDSSSVVEWTQAPKERGHRGSEHLNSYEAEWDMVNTVSFK--RKPHTNGDAPS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE2 CPQGS--WAFSVSLGELKSIRRSKPGLSWAYLVLVTQAGGSLPALHFHRGGTRALLRVLS
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CCDS31 HRNGKSKWSFLFSLTDLKSIKQNKEGMGWSYLVFCLKDDVVLPALHFHQGDSKLLIESLE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
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CCDS31 KYVVLCESPQDKRTLLVNCQNKS-LSQSFENL--LDEPAYGLIQAGLLDRRKLLWAIHHW
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KE2 -RFLQDPYSTTFSSFSRVTNF----FRGA-----LQPQPEGAA--SDLPP--PPDDEPEP
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CCDS31 KKIKKDPYTATMIGFSKVTNYIFDSLRGSDPSTHQRPPSEMADFLSDAIPGLKINQQEEP
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260 270 280 290 300 310
pF1KE2 GFEVISCVELGPRPTVERGPPVTEEEWARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSGGLSPSLRREA
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CCDS31 GFEVITRIDLGERPVVQRREPVSLEEWTKNIDSEGRILNVDNMKQMIFRGGLSHALRKQA
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320 330 340 350 360 370
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CCDS31 WKFLLGYFPWDSTKEERTQLQKQKTDEYFRMKLQWKSISQEQEKRNSRLRDYRSLIEKDV
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CCDS31 NRTDRTNKFYEGQDNPGLILLHDILMTYCMYDFDLGYVQGMSDLLSPLLYVMENEVDAFW
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440 450 460 470 480 490
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CCDS31 CFASYMDQMHQNFEEQMQGMKTQLIQLSTLLRLLDSGFCSYLESQDSGYLYFCFRWLLIR
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500 510 520 530 540 550
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CCDS31 FKREFSFLDILRLWEVMWTELPCTNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELS
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560 570 580 590 600 610
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CCDS31 MKIDVEDILCKAEAISLQMVKCKELPQAVCEILGLQGSEVTTPDSDVGEDENVVMTPCPT
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620 630 640
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: .. : :.. : . :: .: : :
CCDS31 SAFQSNALPTLSASGA-RNDSPTQI-PVSSDVCRLTPA
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CCDS62 AWLNHLNELGQVEEEYKLRKAIFFGGIDVSIRGEVWPFLLRYYSHESTSEEREALRLQKR
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:: ... . :..::..: .. .. . ...:: ::::.:.:..: .::.. . ::
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:.: .:. .:: ::::::..::: . .: :.:::: :.:. . .: :..::
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CCDS62 DYFHLFICVAIVAIYGDDVIEQQLATDQMLLHFGNLAMHMNGELVLRKARSLLYQFRLLP
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CCDS62 RIPCSLHDLCKLCGSGMWDSGSMPAVECTGHHPGSESCPYGGTVEMPSPKSLREGKKGPK
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640
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.
CCDS62 TPQDGFGFRR
400
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CCDS11 GGLDKLSDVFQQWKYCTEMQLKDQQVAPDKTCMQFSIRRPKLPSSETHPEESMYKRLGVS
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CCDS11 AWLNHLNELGQVEEEYKLRKAIFFGGIDVSIRGEVWPFLLRYYSHESTSEEREALRLQKR
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CCDS11 LNYAVYNPAVGYSQGMSDLVAPILAEVLDESDTFWCFVGLMQNTIFVSSPRDEDMEKQLL
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CCDS11 DYFHLFICVAIVAIYGDDVIEQQLATDQMLLHFGNLAMHMNGELVLRKARSLLYQFRLLP
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CCDS11 RIPCSLHDLCKLCGSGMWDSGSMPAVECTGHHPGSESCPYGGTVEMPSPKSLREGKKGPK
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CCDS11 TPQDGFGFRR
760
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CCDS35 GGVEPSLRKVVWRYLLNVYPDGLTGRERMDYMKRKSREYEQLKSEWAQRANPED------
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CCDS35 LEFIRSTVLKDVLRTDRAHPYYAGPEDGPHLRALHDLLTTYAVTHPQVSYCQGMSDLASP
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CCDS35 ILAVMDHEGHAFVCFCGIMKRLAANFHPDGRAMATKFAHLKLLLRHADPDFYQYLQEAGA
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CCDS35 DDLFFCYRWLLLELKREFAFDDALRMLEVTWSSLPPDPPEHEVELVGPPSQVADAGFGGH
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.::: . ... .:: .::.: : . : ::. . .:: . ...: :
CCDS35 RDPLVQLPHPAA-LISSKSLSEPLLNSPDPLLSSFSHPDSPSSS--SPPSTQEASPTGDM
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CCDS35 AVGSPLMQEVGSPKDPGKSLPPVPPMGLPPPQEFGRGNPFMLFLCLAILLEHRDHIMRNG
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. :..::..: .. .. . ...:: ::::.:.:..: .::.. . :::.: .:.
CCDS62 KRLSMTPEEHR--AFWRNVQFTVDKDVVRTDRNNQFFRGEDNPNVESMRRILLNYAVYNP
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CCDS62 AVGYSQGMSDLVAPILAEVLDESDTFWCFVGLMQNTIFVSSPRDEDMEKQLLYLRELLRL
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CCDS62 THVRFYQHLVSLGEDGLQMLFCHRWLLLCFKREFPEAEALRIWEACWAHYQTDYFHLFIC
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CCDS62 VAIVAIYGDDVIEQQLATDQMLLHFGNLAMHMNGELVLRKARSLLYQFRLLPRIPCSLHD
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CCDS62 LCKLCGSGMWDSGSMPAVECTGHHPGSESCPYGGTVEMPSPKSLREGKKGPKTPQDGFGF
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CCDS62 RR
>>CCDS62352.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 (278 aa)
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CCDS62 MKVAPDKTCMQFSIRRPKLPSSETHPEESMYKRLGVS
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pF1KE2 -WARHVGPEGRLQQVPELKNRIFSGGLSPSLRREAWKFLLGYLSWEGTAEEHKAHIRKKT
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CCDS62 AWLNHLNELGQVEEEYKLRKAIFFGGIDVSIRGEVWPFLLRYYSHESTSEEREALRLQKR
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CCDS62 KEYSEIQQKRLSMTPEEHR--AFWRNVQFTVDKDVVRTDRNNQFFRGEDNPNVESMRRIL
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pF1KE2 LTYCMYHFDLGYVQGMSDLLSPILYVIQNEVDAFWCFCGFMELVQGNFEESQETMKRQLG
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CCDS62 LNYAVYNPAVGYSQGMSDLVAPILAEVLDESDTFWCFVGLMQNTIFVSSPRDEDMEKQLL
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CCDS62 YLRELLRLTHVRFYQHLVSLGEDGLQMLFCHRWLLLCFKREFPEAEALRIWEACWAHYQG
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CCDS62 ADV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]