Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2027, 610 aa
1>>>pF1KE2027 610 - 610 aa - 610 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6581+/-0.00154; mu= 13.5488+/- 0.092
mean_var=213.7433+/-40.904, 0's: 0 Z-trim(106.4): 174 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.087726
statistics sampled from 8749 (8936) to 8749 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 4346 564.1 1.8e-160
CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 ( 830) 1878 252.0 2.4e-66
CCDS53427.1 SELL gene_id:6402|Hs108|chr1 ( 385) 1148 159.1 9.8e-39
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 608 91.3 6.5e-18
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 608 91.4 6.7e-18
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 577 88.2 2.1e-16
CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 553 84.0 5.7e-16
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 564 86.5 6.4e-16
CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039) 509 79.2 5.7e-14
CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2489) 509 79.3 6.4e-14
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 510 79.7 7.2e-14
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 510 79.7 7.4e-14
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 510 79.7 7.4e-14
CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 ( 597) 432 68.7 2.4e-11
CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 427 67.8 2.7e-11
>>CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 (610 aa)
initn: 4346 init1: 4346 opt: 4346 Z-score: 2994.3 bits: 564.1 E(32554): 1.8e-160
Smith-Waterman score: 4346; 99.8% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIASQFLSALTLVLLIKESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MIASQFLSALTLVLLIKESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPGEPNNRQKDEDCVEIYIKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPGEPNNRQKDEDCVEIYIKREK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWSAPIPACNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWSAPIPACNVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS12 EKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFSCEEGFELHGSTQLECTSQGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCSGEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCSGEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESD
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE2 GSYQKPSYIL
::::::::::
CCDS12 GSYQKPSYIL
610
>>CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 (830 aa)
initn: 1620 init1: 1206 opt: 1878 Z-score: 1304.7 bits: 252.0 E(32554): 2.4e-66
Smith-Waterman score: 1878; 44.7% identity (70.7% similar) in 552 aa overlap (4-549:21-569)
10 20 30 40
pF1KE2 MIASQFL--SALTLVLLI-KESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYC
::.: ::: : :: .::.:. ::.:.... . ::
CCDS12 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKAYSWNISRKYC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 QQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPG
:.::: :::::::.::.:::..: : ::::::::: :..:.::::.: ::.::.::: .
CCDS12 QNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINN
::::....::::::::: . : ::::.: ::: ::::::.: . ::: .:::.:::.:
CCDS12 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 YTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSME
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CCDS12 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TMQCMSSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMG
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CCDS12 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 AQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFM
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CCDS12 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPSEGTMDCVH-PLTAFAYGSSCKFECQPGYR
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQ
..: ...: .:.:. .:.:::..: : .: .: :.: :: .:.: ..: : : .
CCDS12 VRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSPSLR-AFQYDTNCSFRCAE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 GFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFS
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CCDS12 GFMLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSH-PFGAFRYQSVCSFT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 CEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS---GEPVFGTVCK
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CCDS12 CNEGLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQ
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 FACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLW
: : ::..:.: : .:.:. : :::
CCDS12 FICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGST
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610
pF1KE2 LRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
CCDS12 CHFSCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRH
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 640 init1: 212 opt: 613 Z-score: 439.5 bits: 91.9 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 613; 38.2% identity (62.7% similar) in 233 aa overlap (366-584:571-801)
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 EEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCE
.: : ::.: ..: .. : : ::.:.
CCDS12 DEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDC-SDTRGEFNVGSTCH
550 560 570 580 590
400 410 420 430 440
pF1KE2 FSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEA--------VRCDAVHQPPKGLVRCAHSP
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CCDS12 FSCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHP
600 610 620 630 640 650
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 IGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS
: : ....: :.:. :: : :.. : : .:::: .:.:..:::: : : : :.::
CCDS12 -GTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCS
660 670 680 690 700 710
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 ---GEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEA-PT--ESNIPLVAGL
:. .:..:.: : :: ::::: .: .:::: .:::.: : . . .:
CCDS12 NLWGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGA
720 730 740 750 760 770
570 580 590 600 610
pF1KE2 SAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
:. ..:. . .: ::: .:.
CCDS12 VASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP
780 790 800 810 820 830
>>CCDS53427.1 SELL gene_id:6402|Hs108|chr1 (385 aa)
initn: 1278 init1: 1092 opt: 1148 Z-score: 808.9 bits: 159.1 E(32554): 9.8e-39
Smith-Waterman score: 1148; 52.7% identity (78.9% similar) in 279 aa overlap (22-300:52-330)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MIASQFLSALTLVLLIKESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQ
:.:. : . :....: .:.. :: :::::
CCDS53 STQRDLWNIFKLWGWTMLCCDFLAHHGTDCWTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQ
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 NKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPGEPNNRQKDEDC
:: :::::.. : .: :::::::::....:.::::.: :::::.::. :::::... :::
CCDS53 NKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDC
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSG
:::::::.::.: :::. : : : ::::::.: :::::::::: ::::::.:: :. :
CCDS53 VEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYG
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWS
.:. ...: ::.:: :.. :.:::::::..:.:..::..: ...: : :.::
CCDS53 PQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWS
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 APIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGN
.: :.:.:..:. .. : :...: . .:: ....::: : :: ::.: .. : :::
CCDS53 SPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGI
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 WDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFMLQGPAQVECTT
:.: .: :.
CCDS53 WSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYNPLFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGKKSKRSM
330 340 350 360 370 380
>>CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033 aa)
initn: 364 init1: 159 opt: 608 Z-score: 435.1 bits: 91.3 E(32554): 6.5e-18
Smith-Waterman score: 620; 29.4% identity (55.6% similar) in 453 aa overlap (140-568:115-543)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 DCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAAC-TNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPG
: :: :: : .:. ::. :
CCDS14 FNKYSSCPEPIVPGGYKIRGSTPYRHGDSVTFACKTNFSMNGNKSVWCQANNMW-----G
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 FSGLK-CEQI--VNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCM
. : : .. ..: :: ..: . :. .:... . : . ::. ::: . . ..:.
CCDS14 PTRLPTCVSVFPLECPALPMIHNGHHT-SENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCL
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 SSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQ
:::.::: :.:. ..: .. :: : ..: . ..: .: :.::..:.: : .
CCDS14 SSGKWSAVPPTCEEARCKSLGRFPNGKV---KEPPILRVGVTANFFCDEGYRLQGPPSSR
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330
pF1KE2 CTSSGN---WDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTC----EEG
:. .:. : .. :.:. . : . :: : . .. .. : ..:: :::
CCDS14 CVIAGQGVAW-TKMPVCEEIFCPSPPPILNG--RHIGNSLANVSYGSIVTYTCDPDPEEG
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KE2 --FMLQGPAQVECTTQGQ----WTQQIPVCE----AFQCTALSNPE--RGYMNCLPSASG
:.: : . ..::...: :. : :: : :: .:. :: : . . .
CCDS14 VNFILIGESTLRCTVDSQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQCP---HPQILRGRM--VSGQKD
320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 SFRYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAVRCDAVHQPPKGLV-RCAH
. :... :.: ::.:::::...:. : :. :.:: .:.: ::. : .
CCDS14 RYTYNDTVIFACMFGFTLKGSKQIRCNAQGTWEPSAPVCEK-ECQA---PPNILNGQKED
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 SPIGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMS
. .: .: .::. :. : : ...:::.: :: ::.:.:. : . :. ..
CCDS14 RHMVRFDPGTSIKYSCNPGYVLVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEAT---GRQLLT
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 CSGEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAG
. . .: ::. :.::. . : .: : . :. : :.. . . .:
CCDS14 KPQHQFVRPDVNSSCGEGYKLSGSVYQECQGTIPWFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTG
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610
pF1KE2 LSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
::
CCDS14 SSLEDFPYGTTVTYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCKLSLLAV
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 337 init1: 157 opt: 547 Z-score: 393.4 bits: 83.6 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 552; 27.8% identity (51.0% similar) in 467 aa overlap (199-571:545-989)
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 FSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCD----RGYLPSSM--ETM
.: :... . .:. :: : . :.
CCDS14 WFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTGSSLEDFPYGTTVTYTCNPGPERGVEFSLIGESTI
520 530 540 550 560 570
230 240 250 260 270
pF1KE2 QCMSS----GEWSAPIPACNV----VECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEE
.: :. : ::.: : :.. :.:. : . :::. .. : .: : :: :
CCDS14 RCTSNDQERGTWSGPAPLCKLSLLAVQCSHV-HIANGYKISGKEAPYF-YNDTVTFKCYS
580 590 600 610 620 630
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 GFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFT
:: : :.....: ....:: : :.:. ::. ::: :.. . ::: . : .
CCDS14 GFTLKGSSQIRCKADNTWDPEIPVCEKETCQHVRQ----SLQ--ELPAG--SRVELVNTS
640 650 660 670 680
340 350 360 370 380
pF1KE2 CEEGFMLQGPAQVEC--TTQGQWTQQIPVCEAFQC----TALSNPERGYMNCLPSASGSF
:..:..: : : : . .: : ..::.:....: . ... . :.: . .:
CCDS14 CQDGYQLTGHAYQMCQDAENGIWFKKIPLCKVIHCHPPPVIVNGKHTGMM------AENF
690 700 710 720 730
390 400 410 420
pF1KE2 RYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPT----GEWDNEKPTC-------------------
::. . :.::: : : :.::: : :.. .: :
CCDS14 LYGNEVSYECDQGFYLLGEKKLQCRSDSKGHGSWSGPSPQCLRSPPVTRCPNPEVKHGYK
740 750 760 770 780 790
430 440
pF1KE2 ---------------------------EAVRC--DAVHQP--P----KGLVRCAHSP---
...:: : . : : :... : :
CCDS14 LNKTHSAYSHNDIVYVDCNPGFIMNGSRVIRCHTDNTWVPGVPTCIKKAFIGCPPPPKTP
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450 460 470 480 490
pF1KE2 --------IGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVP
:..:. : .::..:. : : . : :: .: :.. .: :. :.::: :
CCDS14 NGNHTGGNIARFSPGMSILYSCDQGYLLVGEALLLCTHEGTWSQPAPHCKEVNCSS---P
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500 510 520 530 540 550
pF1KE2 GKINMSCSG-EPV----FGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESN
. .. .: :: .:.: . : .:. :.:: : . .:. : .:. ..:
CCDS14 ADMDGIQKGLEPRKMYQYGAVVTLECEDGYMLEGSPQSQCQSDHQWNPPLAVCR--SRSL
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pF1KE2 IPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
:.. :. :::: :::.
CCDS14 APVLCGI-AAGLILLTFLIVITLYVISKHRARNYYTDTSQKEAFHLEAREVYSVDPYNPA
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. : : .. ..: :: ..: . :. .:... . : . ::. ::: . . ..:.
CCDS31 PTRLPTCVSVFPLECPALPMIHNGHHT-SENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCL
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:::.::: :.:. ..: .. :: : ..: . ..: .: :.::..:.: : .
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:. .:. : .. :.:. . : . :: : . .. .. : ..:: :::
CCDS31 CVIAGQGVAW-TKMPVCEEIFCPSPPPILNG--RHIGNSLANVSYGSIVTYTCDPDPEEG
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:.: : . ..::...: :. : :: : :: .:. :: : . . .
CCDS31 VNFILIGESTLRCTVDSQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQCP---HPQILRGRM--VSGQKD
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. :... :.: ::.:::::...:. : :. :.:: .:.: ::. : .
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. .: .: .::. :. : : ...:::.: :: ::.:.:. : . :. ..
CCDS31 RHMVRFDPGTSIKYSCNPGYVLVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEAT---GRQLLT
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. . .: ::. :.::. . : .: : . :. : :.. . . .:
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::
CCDS31 SSLEDFPYGTTVTYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCKLSLLAV
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:....:. . .:. : .. . . ...:. ::.:.:
CCDS60 TKLHSIFYKLLFDVLSSPSLTKAGHCGTPEPIVNGHINGENYSYRGSVVYQCNAGFRLIG
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. : .. .:... : : .:: .: :: . ...:.... .:.:. :.:
CCDS60 MSVRICQQDHHWSGKTPFCVPITCGHPGNPVNGL-----TQGNQFNLNDVVKFVCNPGYM
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.: :. .: ..:::....:.:. ..:: .. : . . :. : .:.. . :..
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:: : :. :.: : :: .: : : : .:: :: . :. .: .
CCDS60 GFYLLGTPVLSCQGDGTWDRPRPQCLLVSCGHPGSPP-------HSQMSGDSYTVGAVVR
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.:: : :.. : .:.:: .: :. : :.. ..:.. : .. : .: ::
CCDS60 YSCIGKRTLVGNSTRMCGLDGHWTGSLPHCSGTSVGVCGDPGIPAHGIRLGDSFDP--GT
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: .:.: : .: ::. ::: :.: ::: : :
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CCDS60 IVYECREGYYATGLLSRHCSVNGTWTGSDPECLVINCGDPGIPANGLRLGNDFRYNKTVT
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::.. .: .: .: .: . .... :. . :: .:: . . :. :
CCDS44 TSAKDKCKRK-SCRNPPDPVNG---MAHVIKDIQFRSQIKYSCPKGYRLIGSSSATCIIS
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:. :. :.:. . : . ::: .. : .... :. :. : :::
CCDS44 GNTVIWDNKTPVCDRIICGLPPTIANGDFTSISRE-YFHYGSVVTYHCNLGSRGKKVFEL
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.: :. :::. : :.. : : . . . .:: . .. :... .:
CCDS44 VGEPSIYCTSKDDQVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNVENGILVSDNRSL--FSLNEVVEFR
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:. :: ..::..:.: . ..: ..: : : :. . . . .: :.
CCDS44 CQPGFGMKGPSHVKCQALNKWEPELPSCSRV-CQ--PPPDVLHAERTQRDKDNFSPGQEV
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.::: :. :.:: :.: : :.:. : ::. :: . : :.: : :.. .
CCDS44 FYSCEPGYDLRGSTYLHCTPQGDWSPAAPRCEVKSCDDFLGQLPNGHVLF---PLN-LQL
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.. : :.:::.: ::. :. :. :. :: :. .: . :: . . .
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:. ...: : : : .. : : :.::: : :. : : . . .:
CCDS44 HVGSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWSMKPPICQQIFCPNPPAILNGRHTGTP
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:
CCDS44 LGDIPYGKEVSYTCDPHPDRGMTFNLIGESTIRRTSEPHGNGVWSSPAPRCELPVGAGSH
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. . ..:.: . :.::. : :.:. ....: .:
CCDS55 HVIWRLVSGSLNEYGAQVLLSCSPGYYLEGWRLLRCQANGTWNIGDERPSCRVISCGSLS
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: .:. .:... :... ..:. :: . .. .:...: ::. : . .:
CCDS55 FPPNGN-----KIGTLTVYGATAIFTCNTGYTLVGSHVRECLANGLWSGSETRCLAGHCG
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. .:: . . .: . : ...:. ::.:.:.. : .. .:... :.: .:
CCDS55 SPDPIVNGHI----SGDGFSYRDTVVYQCNPGFRLVGTSVRICLQDHKWSGQTPVCVPIT
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: .: .: . ..::.... ::::. :..::: ....: ..:::.. .:.:.
CCDS55 CGHPGNPAHG-----FTNGSEFNLNDVVNFTCNTGYLLQGVSRAQCRSNGQWSSPLPTCR
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. .:. . : . . . ::.:: : . :..:: : ::. : : .: :: :
CCDS55 VVNCSDPGFVENAIRHGQQNFPESFEYGMSILYHCKKGFYLLGSSALTCMANGLWDRSLP
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: :. : : .... :: ::: . .::. . : :. : ...:.
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.: : . . . :: . : : . .:.: : : :: ::: .: :
CCDS55 GALPHCTGNNPGFCGDPGTPAHGSRLGDDFKTKSLLRFSCEMGHQLRGSPERTCLLNGSW
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::: :.::: . .:
CCDS55 SGLQPVCEAVSCGNPGTPTNGMIVSSDGILFSSSVIYACWEGYKTSGLMTRHCTANGTWT
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pF1KE2 CTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVC-SHPLGNFS
.:: : ..::. .. . :...:
CCDS44 RGMTFNLIGESTIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPTIPINDFE
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. ..: . : ::. ..: ...:. . ::. : : .: ::.:. ...
CCDS44 FPVGTSLNYECRPGYF-GKMFSISCLENLVWSSVEDNCRRKSCGPPPEPFNGMVH-INTD
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CCDS44 TQF--GSTVNYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTISNGDFY
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CCDS44 SNNRTSFHNGTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRCISTNKC
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:: :: .:. . : .: :. :::. ::. .:: .:.: . : :
CCDS44 TA---PEVENAIRVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPHCSR
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: : ::: ... : : .:. . .::: ...: :...:.:: ::.:. :.
CCDS44 V-C----QPPPEILHGEHTLSHQDNFSPGQEVFYSCEPSYDLRGAASLHCTPQGDWSPEA
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: : : .:... .: :.. . . . .:. .:.: ::. :.: .: : : .
CCDS44 PRCTVKSCDDFLGQLPHGRVLLPLNLQ--LGAKVSFVCDEGFRLKGRSASHCVLAGMKAL
1710 1720 1730 1740 1750 1760
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pF1KE2 WSGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLES
:.. .:.:: : : .
CCDS44 WNSSVPVCEQIFCPNPPAILNGRHTGTPFGDIPYGKEISYACDTHPDRGMTFNLIGESSI
1770 1780 1790 1800 1810 1820
>--
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pF1KE2 PGEPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGH---GECV
: . : : . . .: .:. : :
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. :.. : .: :: .:. : : ..:.: ..: . ..: ..: .
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: : . .. :... ::.: .:. : . .:.::.:. . . . ..
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...: : .:.: .: .: ::: :... : :. . : ::. .. .
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: . : .. :. : : : : .. ::.. : :. : : .:: :
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: : . . . . : . :: :. :::.:: .:..: ..:. : :.: : :
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::: ... .. . :. . .::: :..: :.....:: ::.:. .:.:.:
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.:... :.. . :: .:. :.: ::. :.::.: : : . :.. .:
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.:: . :.. . .: : .. ::
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.: . ..: ..: . : : . .. :... ::.: .:. : . .:.
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::.:. . . . .. ...: : .:.: .: .: ::: :... : :. . :
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::. .. .: . : .. :. : : : : .. ::.. : :.
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..:. : :.: : : ::: ... :.: . :. . .::: :..: :...:
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.:: ::.:. :.: : : .:... .: :.. . . . .:. .:.: ::. :.::.
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. : : . :.. .:.:: : : .
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CCDS44 GMTFNLIGESTIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPTIPINDFEF
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.:. :.: ::. :.::.: : : . :.. .:.:: :. ::
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CCDS44 LEVFPFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAP
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CCDS44 TQF--GSTVNYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTISNGDFY
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1990 2000 2010 2020 2030 2040
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:: :: .:. . : .: :. :::. ::. .:: .:.: . : :
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CCDS44 INYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIANGDFISTNRE--N
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CCDS44 ENGIL--VSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRV-C---
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CCDS44 -QPPPDVLHAERTQRDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGAASMRCTPQGDWSPAAPTCEVK
750 760 770 780 790 800
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pF1KE2 KCSSLAVPGKINMSCSGEPV---FGTVCKFACPEGWTLNGSAARTC---GATGHWSGLLP
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CCDS44 SCDDFM--GQLLNGRVLFPVNLQLGAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVP
810 820 830 840 850 860
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CCDS44 VCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVF-PFGKTVNYTCDPHPDRGTSFDLIGESTIRCTSD
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]