Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2024
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2024, 604 aa
1>>>pF1KE2024 604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1188+/-0.000828; mu= 4.0665+/- 0.051
mean_var=214.0963+/-43.723, 0's: 0 Z-trim(115.4): 26 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.087654
statistics sampled from 15930 (15953) to 15930 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6256.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 604) 4148 537.0 2.7e-152
CCDS56544.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 615) 3946 511.4 1.3e-144
CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 577) 3944 511.2 1.5e-144
CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 663) 3945 511.3 1.5e-144
CCDS75767.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 584) 3940 510.7 2.1e-144
CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 567) 3892 504.6 1.4e-142
CCDS46590.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 ( 595) 2563 336.5 5.7e-92
CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 ( 604) 2563 336.6 5.8e-92
CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 ( 567) 1497 201.7 2.1e-51
CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 ( 653) 1320 179.4 1.3e-44
>>CCDS6256.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (604 aa)
initn: 4148 init1: 4148 opt: 4148 Z-score: 2847.8 bits: 537.0 E(32554): 2.7e-152
Smith-Waterman score: 4148; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMIT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 HKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIE
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TTPR
::::
CCDS62 TTPR
>>CCDS56544.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (615 aa)
initn: 3946 init1: 3946 opt: 3946 Z-score: 2709.6 bits: 511.4 E(32554): 1.3e-144
Smith-Waterman score: 3946; 99.8% identity (100.0% similar) in 576 aa overlap (29-604:40-615)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SDKLQCVFNEYKAAVWVPPRPRPLSRAPLPEDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PPTTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PPTTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPAC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 NGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 HYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDM
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 ITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 CQHKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CQHKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPST
550 560 570 580 590 600
600
pF1KE2 IETTPR
::::::
CCDS56 IETTPR
610
>>CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (577 aa)
initn: 3944 init1: 3944 opt: 3944 Z-score: 2708.6 bits: 511.2 E(32554): 1.5e-144
Smith-Waterman score: 3944; 100.0% identity (100.0% similar) in 575 aa overlap (30-604:3-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MPDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHY
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMIT
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQ
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIE
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 TTPR
::::
CCDS47 TTPR
>>CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (663 aa)
initn: 3945 init1: 3945 opt: 3945 Z-score: 2708.4 bits: 511.3 E(32554): 1.5e-144
Smith-Waterman score: 3945; 99.8% identity (100.0% similar) in 576 aa overlap (29-604:88-663)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPFVVWGEEEASTPGLDAISHHLCYPDRTHRDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PPTTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PPTTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPAC
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLR
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNE
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 NGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQ
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 HYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLD
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSP
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDM
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 ITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSF
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 CQHKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CQHKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPST
600 610 620 630 640 650
600
pF1KE2 IETTPR
::::::
CCDS75 IETTPR
660
>>CCDS75767.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (584 aa)
initn: 3940 init1: 3940 opt: 3940 Z-score: 2705.8 bits: 510.7 E(32554): 2.1e-144
Smith-Waterman score: 3940; 99.8% identity (99.8% similar) in 576 aa overlap (29-604:9-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP
: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MVGLSGPVQYRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHY
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVN
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMIT
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQ
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HKDWEKHHHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIE
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 TTPR
::::
CCDS75 TTPR
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 TWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPPTTQGAPR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPPTTQGAPR
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pF1KE2 TSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALD
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430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKME
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKH
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 HHICGQTLQAQQQGDTPAVSSSVTPNSGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
520 530 540 550 560
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 TWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP-PPTTQGAP
:: :::.:: ::: .:::::: :: . :.:
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pF1KE2 RTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKL
: :::::.:.:: .::: .::::::::. :::::.::.::.:.::::: .:::::::::
CCDS46 RPVSFTPTALSNGINHSPPTLNGAPSPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKL
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pF1KE2 KRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLK
::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::: :::::::::::::::::::
CCDS46 KRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPD
::::::::::::::: :::.:.:::::::.:::..: .::.::::::..:. :::: .:.
CCDS46 ANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLS-YQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDM
: .::.:::. . : :.:: :::::. :.:: . ..:.: :::::: ::: :.:.
CCDS46 RREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIM
: .: ::. . ::..:::.. .::.: :.:..:::::.::::.::::::: :::::
CCDS46 ATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIM
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVA
.::::::::..:::::::.:::::::: :::.. .:.: : . :::.:: . : ..
CCDS46 EMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTELRKTG--TELVSRQHSPGSADSLS
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAK
:..::: ::..:::: :.:::.:::::.:: :::.:.::::.:::.:: ..:.::::.
CCDS46 NDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERAR
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 MERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWE
::.:.:..::::::::. :::.::.:.:.:::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS46 MEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE2 KHHHICGQTLQAQQ---QGDTPAV-----SSSVTPNSGAGSP-MDTPPAATPRSTTPGTP
.::..:::.:..:. :: : . ::. . . .. :: .: :.: ::.::..
CCDS46 RHHRLCGQNLHGQSPHGQG-RPLLPVGRGSSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASV
530 540 550 560 570 580
600
pF1KE2 STIETTPR
..:.:
CCDS46 TAIDTNGL
590
>>CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 (604 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 TWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP-PPTTQGAP
:: :::.:: ::: .:::::: :: . :.:
CCDS13 MAKESGISLKEIQVLARQWKVGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPPLPPINPGGP
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pF1KE2 RTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKL
: :::::.:.:: .::: .::::::::. :::::.::.::.:.::::: .:::::::::
CCDS13 RPVSFTPTALSNGINHSPPTLNGAPSPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 KRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLK
::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::: :::::::::::::::::::
CCDS13 KRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPD
::::::::::::::: :::.:.:::::::.:::..: .::.::::::..:. :::: .:.
CCDS13 ANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLS-YQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDM
: .::.:::. . : :.:: :::::. :.:: . ..:.: :::::: ::: :.:.
CCDS13 RREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIM
: .: ::. . ::..:::.. .::.: :.:..:::::.::::.::::::: :::::
CCDS13 ATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIM
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVA
.::::::::..:::::::.:::::::: :::.. .:.: : . :::.:: . : ..
CCDS13 EMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTELRKTG--TELVSRQHSPGSADSLS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAK
:..::: ::..:::: :.:::.:::::.:: :::.:.::::.:::.:: ..:.::::.
CCDS13 NDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERAR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 MERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWE
::.:.:..::::::::. :::.::.:.:.:::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS13 MEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWE
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 KHHHICGQTLQAQQ---QGDTPAV-----SSSVTPNSGAGSP-MDTPPAATPRSTTPGTP
.::..:::.:..:. :: : . ::. . . .. :: .: :.: ::.::..
CCDS13 RHHRLCGQNLHGQSPHGQG-RPLLPVGRGSSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASV
540 550 560 570 580 590
600
pF1KE2 STIETTPR
..:.:
CCDS13 TAIDTNGL
600
>>CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 (567 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 TWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP--TTQGA
:::::..:::: : :::.::::: ..:::
CCDS10 MPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
10 20 30
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pF1KE2 PRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSK
: :::: :: ::.::::::.:::: ::::::::..::..::..:.::::::::::::
CCDS10 TRPPSFTPHTLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFL
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTP
::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..::.:::::::.::::::::::
CCDS10 KANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTP
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pF1KE2 DRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDM
::::::: ::.::: :: ::::::..:.:::::.:: : :.::::: ::::.:.
CCDS10 DRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDI
220 230 240 250 260
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pF1KE2 AIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIM
:.:::.::.::::. :.::.:.::. . :.::::.:::.::.::::::::::..::::::
CCDS10 AMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIM
270 280 290 300 310 320
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pF1KE2 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVA
:::::::::::::::::::::::::.: :::::::: ::: . .... :..: ..:.
CCDS10 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQ
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAK
::. :::: : .:::::.::.::::::::::::::.:::::::.::::::..:::::::
CCDS10 LDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAK
390 400 410 420 430 440
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pF1KE2 MERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWE
:::..:::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::
CCDS10 MERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWE
450 460 470 480 490 500
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pF1KE2 KHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAVSSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPS
::::.:::.:: :. : .. :. :. ::.:: .. :. : .:. :.
CCDS10 KHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPG
510 520 530 540 550 560
600
pF1KE2 TIETTPR
..:.::
CCDS10 PLDTVPR
>>CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 (653 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPP
:: : :.:::::..:::: : :::.::::
CCDS10 QTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPP
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90
pF1KE2 P--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPS
: ..::: : :::: : : ::.::::::.::::
CCDS10 PPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPC
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 PPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLV
::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS10 TPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLV
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS10 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLA
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 QHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISP
::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..:
CCDS10 QHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 GQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGL
.:::::.:: : :.::::: ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. .
CCDS10 AQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVV
330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 HGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYW
:.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS10 PGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHW
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 IRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEA
:::::::: ::: . .... :..: ..:. ::. :::: : .:::::.::.:::::
CCDS10 ARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEA
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 VNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSS
:::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::
CCDS10 VNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSS
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KE2 ESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAV
::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.:: :. : .
CCDS10 ESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEA
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600
pF1KE2 SSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
. :. :. ::.:: .. :. : .:. :. ..:.::
CCDS10 AHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
620 630 640 650
604 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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