Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2022, 599 aa
1>>>pF1KE2022 599 - 599 aa - 599 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4681+/-0.000987; mu= 18.5263+/- 0.059
mean_var=77.9738+/-15.421, 0's: 0 Z-trim(104.3): 49 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.145245
statistics sampled from 7790 (7829) to 7790 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 ( 599) 4040 856.7 0
CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX ( 686) 749 167.1 6.6e-41
CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX ( 696) 687 154.1 5.4e-37
CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 ( 541) 561 127.7 3.9e-29
CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 570) 544 124.1 4.8e-28
CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 569) 521 119.3 1.4e-26
CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 687) 512 117.5 5.9e-26
CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 ( 575) 480 110.7 5.3e-24
CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 556) 460 106.5 9.5e-23
>>CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 (599 aa)
initn: 4040 init1: 4040 opt: 4040 Z-score: 4575.7 bits: 856.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4040; 100.0% identity (100.0% similar) in 599 aa overlap (1-599:1-599)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPEPQKSHFCHRN
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CCDS20 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPEPQKSHFCHRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHFLTPGVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHFLTPGVNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSASHKQDLLLGSTGSISCPSLSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSASHKQDLLLGSTGSISCPSLSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYHQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYHQGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKWYIKDSDLEWEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKWYIKDSDLEWEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 GLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW
550 560 570 580 590
>>CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX (686 aa)
initn: 469 init1: 205 opt: 749 Z-score: 847.9 bits: 167.1 E(32554): 6.6e-41
Smith-Waterman score: 749; 30.7% identity (62.4% similar) in 508 aa overlap (82-565:74-562)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTL
..::. ..:: : : : .. ... ..
CCDS14 LAGEPVRVKCALFYSYIRTNYSTAQSTGLRLMWYK--NKGDLEEPIIFSEVRMSKEEDSI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE2 HFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVK--MILEVKPQTNASCEYS-ASHKQDLLLG
: . ...:: : : . .: : :.: : : : . .. : : . . .
CCDS14 WFHSAEAQDSGFYTCVLR--NSTY----CMKVSMSLTVAENESGLCYNSRIRYLEKSEVT
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 STGSISCPSLS-CQSDAQSPAVTWYKNGK-----LLSVERSNRIVVDEVYDYHQGTYVCD
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CCDS14 KRKEISCPDMDDFKKSDQEPDVVWYKECKPKMWRSIIIQKGNALLIQEVQEEDGGNYTCE
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KE2 YTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVED---TLEVELGKPLTISCKARFGF
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CCDS14 LKYEGKLVRRTTE--LKVTALLTDKPPKP--LFPMENQPSVIDVQLGKPLNIPCKAFFGF
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ERVFNPVIKWYIKDS---DLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFV
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CCDS14 SGESGPMIYWMKGEKFIEELAGHIREGEIRLLKEHLGEKEVELALIFDSVVEADLA-NYT
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 CFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHW-IEIVLLYRTY
: :.: : :: :. :. .. : : .:.. .:. ...:. . ::..:.:: .
CCDS14 CHVENRNGRKHASVLLR-KKDLIYKIELAGGLGAIFLLLVLLVVIYKCYNIELMLFYRQH
340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCLLER
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CCDS14 FGADETNDDNKEYDAYLSYTKVDQ-DTLDCDNPEEEQFALEVLPDVLEKHYGYKLFIPER
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 DVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYV--NGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIK
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CCDS14 DLIPSGTYMEDLTRYVEQSRRLIIVLTPDYILRRGWSIFELESRLHNMLVSGEIKVILIE
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560
pF1KE2 FCYF------QEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGF
. :: ::: :.....: . :.: :: ::.:: .. :.::.:...
CCDS14 CTELKGKVNCQEVESL----KRSIKLLSLIKWKGSKSSKLNSKFWKHLVYEMPIKKKEML
510 520 530 540 550 560
570 580 590
pF1KE2 TWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW
CCDS14 PRCHVLDSAEQGLFGELQPIPSIAMTSTSATLVSSQADLPEFHPSDSMQIRHCCRGYKHE
570 580 590 600 610 620
>>CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX (696 aa)
initn: 497 init1: 194 opt: 687 Z-score: 777.6 bits: 154.1 E(32554): 5.4e-37
Smith-Waterman score: 691; 29.4% identity (60.0% similar) in 527 aa overlap (76-571:69-571)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 CDLPEPQKSHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHII
: :: ..::.. . :: : : . ..
CCDS14 KKYQVLVGEPVRIKCALFYGYIRTNYSLAQSAGLS-LMWYKSSGPGDFEEPIAFDGSRMS
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 QDKCTLHFLTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVK--MILEVKPQTNASCEYSASHK-
... .. : ...:: : : . .: : :.: . : : . .. : :... :
CCDS14 KEEDSIWFRPTLLQDSGLYACVIR--NSTY----CMKVSISLTVGENDTGLC-YNSKMKY
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KE2 -QDLLLGSTGSISCPSL-SCQSDAQSPAVTWYKNGKLLS-----VERSNRIVVDEVYDYH
. :... ::: .. . .. : . :::. . . : . . ... :: .
CCDS14 FEKAELSKSKEISCRDIEDFLLPTREPEILWYKECRTKTWRPSIVFKRDTLLIREVREDD
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 QGTYVCDYTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTL---EVELGKPLTIS
:.:.:. . : :: .... . . : : .: :.:. : :..:: ...
CCDS14 IGNYTCELKYGGFV----VRRTTELTVTAPLTDKPPKLLYPMESKLTIQETQLGDSANLT
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KE2 CKARFGFERVFNPVIKW-----YIKDSDLE--WEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEK
:.: ::. .:.: : .:.: : . :: .. . .: : .. . ..:...
CCDS14 CRAFFGYSGDVSPLIYWMKGEKFIEDLDENRVWESDI---RILKEHLGEQEVSISLIVDS
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 VTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQSVQLKEKRGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHW
: . :: .. :.:.:. : :: :. :: .. : : .:... .:. . .:. .
CCDS14 VEEGDLG-NYSCYVENGNGRRHASVLLH-KRELMYTVELAGGLGAILLLLVCLVTIYKCY
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 -IEIVLLYRTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEH-LALSLFPDVLE
:::.:.::.. . .. ::.::.::..::.: . :.. .. .::. .:: ..::.::
CCDS14 KIEIMLFYRNHFGAEELDGDNKDYDAYLSYTKVD--PDQWNQETGEEERFALEILPDMLE
390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 NKYGYSLCLLERDVAPGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYV--NGPSIFELQAAVNLA
..:::.: . .::. : :.: ::.. . .:.: :....:::: : :::::.. .
CCDS14 KHYGYKLFIPDRDLIPTGTYIEDVARCVDQSKRLIIVMTPNYVVRRGWSIFELETRLRNM
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550
pF1KE2 LDDQTLKLILIKFCY-------FQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAK
: .:.:::. : .:: :.: : .: .: .. :.: : ::.:: .
CCDS14 LVTGEIKVILIE-CSELRGIMNYQEVEALKHTIK----LLTVIKWHGPKCNKLNSKFWKR
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590
pF1KE2 MRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSRIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW
..:.:: : . .: .:
CCDS14 LQYEMPFKRIEPITHEQALDVSEQGPFGELQTVSAISMAAATSTALATAHPDLRSTFHNT
560 570 580 590 600 610
>>CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 (541 aa)
initn: 399 init1: 233 opt: 561 Z-score: 636.5 bits: 127.7 E(32554): 3.9e-29
Smith-Waterman score: 605; 29.6% identity (59.7% similar) in 496 aa overlap (84-562:56-523)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SHFCHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPHIIQDKCTLHF
::.. .. . .: .: .: :.:.:
CCDS20 PHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEF
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASC--EYSASHKQDLLLGSTG
.:..:::. . : . : :.: ... :: : ... : . . .
CCDS20 WPVELNDTGSYFFQMKNYTQ--------KWKLNVIRRNKHSCFTERQVTSKI-VEVKKFF
90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SISCPSLSCQSDAQSPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEVYDYH-QGTYVCDYTQSDTVS
.:.: . :. ..: .. ::: : : .: .. .. . ... :: : : . . .
CCDS20 QITCENSYYQTLVNSTSL--YKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGK
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KE2 SWTVRAVVQVRTIVGD-TKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKW
... . .. ::: : ... : .: : . . ::::: . ..:.: .. : :: :
CCDS20 LFNITKTFNI-TIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSALLNEE----DVIYW
200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 YIKDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIIL--EKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTT
.. . . . .. : : .. . . . .: :.. . .: . : : .. :. :
CCDS20 MFGEENGS-DPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDT
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390
pF1KE2 QSVQLKEKR------GVVLLYILLGTIGTLVAV--LAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKD
.: : .: : :. .. .. :::: :.. ..:: ...::.:: .:
CCDS20 KSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYR--VDLVLFYRHLTRRD
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEH-LALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVA
.:: : : .:::::: : : .::: .:. ..: :::...::.::..::::.
CCDS20 ETLTDGKTYDAFVSYLK------ECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVV
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 PGGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQ
:::. ...: :.:..::: :..:: .:... .::..... :: .. .:.:::.:
CCDS20 PGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 EPESLPHLVK--KALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITS
. ::. .: :. ::: :.. ::. ::::: .. : ::.:
CCDS20 DFTFLPQSLKLLKSHRVLK---WKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPV
490 500 510 520 530
580 590
pF1KE2 RIFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW
CCDS20 LSES
540
>>CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (570 aa)
initn: 456 init1: 297 opt: 544 Z-score: 616.9 bits: 124.1 E(32554): 4.8e-28
Smith-Waterman score: 670; 27.5% identity (57.9% similar) in 604 aa overlap (8-573:3-568)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MLCLGWIFLWLVAGERIKGFNISGCSTKKLLWTYSTRSEEEFVLFCDLPE----PQKSHF
.:: :.. . :. : : . : .: ... .: : : : ::
CCDS32 MTLLWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTM--RQIQVFEDEPARIKCPLFEHF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 CHRNRLSPKQVPEHLPFMGSNDLSDVQWYQQPSNGDPLEDIRKSYPH--IIQDKCTLHFL
. : . : : :. . :: .. : : : :. : ..: .: :
CCDS32 LKFNYST-----AH-----SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFR
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASCEYSAS----HKQDLLLGST
.:..:.: : :.. ... : :. . .. . :: : :: . :
CCDS32 PTLLNDTGNYTC---MLR---NTTYCSKVAFPLEVVQKDSCFNSPMKLPVHKLYIEYG-I
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KE2 GSISCPSLSCQSDAQ-SPAVTWYKNGKLLSVERSNRIVVDEV-YDY------HQGTYVCD
:.::... .. .:..::: . ... : .. . . .. ..:.:.:
CCDS32 QRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYMG--CYKIQNFNNVIPEGMNLSFLIALISNNGNYTCV
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KE2 YTQSDTVSSWTVRAVVQVRTIVGDTK--LKPDILDPVEDTL-EVELGKPLTISCKARFGF
: .. .. . .. :. .::. : . : : .: . .. : : :. : : : . :.:
CCDS32 VTYPENGRTFHLTRTLTVK-VVGSPKNAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSF
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ERVFNPVIKWYI---KDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIILEKVTQRDLRRKFV
. : : : .:. .:.. :. : .: .:: . . ..:::..::.:..:
CCDS32 LMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTINESIS-HSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYV
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 CFVQNSIGNTTQSVQLKEK----RGVVLLYILLGTIGTLVAVLAASALLYRHWIEIVLLY
: .... :........:.: : .: : .:. ::..: . .: :.:.::.:
CCDS32 CHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVELACGFGATVLLVVILIVVYHVY--WLEMVLFY
340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 RTYQSKDQTLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEHLALSLFPDVLENKYGYSLCL
:.. . :.:. : :..: .::::. . ::...: . ::::..::.::.
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..:: :::. ... .:.:..::: . .:::::: .: ...::.:... . ....:
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:... .: . . .:.: :: .. :.: :: :..::: ... ::::.:
CCDS32 LVQYKAVKETKV--KELKRAKTVLTVIKWKGEKSKYPQGRFWKQLQVAMPVKKSPRRSSS
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::.....:.
CCDS32 DEQGLSYSSLKNV
560 570
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:. . :.::: :: :. .: : .::.. : : . :...: . . ......
CCDS20 YKIFKIDIVLWYRDSCYDFLPIKASDGKTYDAYILYPKTVG---EGSTS-DCDIFVFKVL
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:.:::.. ::.: . :: : .: : .:.::: :.:: . ....: : :
CCDS20 PEVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSS--E
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pF1KE2 LQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQEPESLPHLVKKALRVLPTVTWRGLKSVPPNS---R
: :. :: .. .:..:... .:. :..:. .: . .. : : . :.: :
CCDS20 EQIAMYNALVQDGIKVVLLELEKIQDYEKMPESIKFIKQKHGAIRWSGDFTQGPQSAKTR
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CCDS20 FWKNVRYHMPVQRRSPSSKHQLLSPATKEKLQREAHVPLG
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. : . : : :. . :: .. : : : :. : ..: .: :
CCDS54 LKFNYST-----AH-----SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFR
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. : : : .:. .:.. :. : .: .:: . . ..:::..::.:..:
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: .... :........:.: : .: : .:. ::..: . .: :.:.::.:
CCDS54 CHARSAKGEVAKAAKVKQKVPAPRYTVELACGFGATVLLVVILIVVYHVY--WLEMVLFY
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CCDS54 RAHFGTDETILDGKEYDIYVSYAR----------NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCI
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.
CCDS54 ESCSSQSDISLDHVQRRRSRLKEPPELQSSERAAGSPPAPGTMSKHRGKSSATCRCCVTY
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CCDS20 AEDRGNYACQAILTHSGKQYEVLNGITVSITERAGYGGSVPKIIYPKNHSIEVQLGTTLI
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. .: ..: :.: . : .: . :. :.. : :. :::: .. . .:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]