FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1997, 812 aa
1>>>pF1KE1997 812 - 812 aa - 812 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1787+/-0.000881; mu= 12.2212+/- 0.053
mean_var=108.3847+/-21.656, 0's: 0 Z-trim(109.3): 23 B-trim: 66 in 1/52
Lambda= 0.123194
statistics sampled from 10771 (10789) to 10771 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 4.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2062.1 SLC9A2 gene_id:6549|Hs108|chr2 ( 812) 5322 956.9 0
CCDS33264.1 SLC9A4 gene_id:389015|Hs108|chr2 ( 798) 2770 503.4 6.3e-142
CCDS295.1 SLC9A1 gene_id:6548|Hs108|chr1 ( 815) 2102 384.6 3.5e-106
CCDS3855.1 SLC9A3 gene_id:6550|Hs108|chr5 ( 834) 1748 321.7 3.1e-87
CCDS42178.1 SLC9A5 gene_id:6553|Hs108|chr16 ( 896) 1709 314.8 4.1e-85
CCDS64116.1 SLC9A3 gene_id:6550|Hs108|chr5 ( 825) 1687 310.9 5.7e-84
CCDS13421.1 SLC9A8 gene_id:23315|Hs108|chr20 ( 581) 754 145.0 3.5e-34
CCDS33872.1 SLC9A9 gene_id:285195|Hs108|chr3 ( 645) 691 133.8 8.9e-31
CCDS83492.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 617) 682 132.2 2.6e-30
CCDS55504.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 649) 682 132.2 2.7e-30
CCDS14654.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 669) 682 132.2 2.8e-30
CCDS44003.1 SLC9A6 gene_id:10479|Hs108|chrX ( 701) 682 132.2 2.9e-30
CCDS75967.1 SLC9A7 gene_id:84679|Hs108|chrX ( 726) 672 130.5 1e-29
CCDS14269.1 SLC9A7 gene_id:84679|Hs108|chrX ( 725) 656 127.6 7.4e-29
CCDS58774.1 SLC9A8 gene_id:23315|Hs108|chr20 ( 597) 594 116.6 1.3e-25
>>CCDS2062.1 SLC9A2 gene_id:6549|Hs108|chr2 (812 aa)
initn: 5322 init1: 5322 opt: 5322 Z-score: 5112.7 bits: 956.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5322; 100.0% identity (100.0% similar) in 812 aa overlap (1-812:1-812)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEPLGNWRSLRAPLPPMLLLLLLQVAGPVGALAETLLNAPRAMGTSSSPPSPASVVAPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MEPLGNWRSLRAPLPPMLLLLLLQVAGPVGALAETLLNAPRAMGTSSSPPSPASVVAPGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TLFEESRLPVFTLDYPHVQIPFEITLWILLASLAKIGFHLYHKLPTIVPESCLLIMVGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 TLFEESRLPVFTLDYPHVQIPFEITLWILLASLAKIGFHLYHKLPTIVPESCLLIMVGLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPTRPFFENIGTIFWYAVVGTLWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPTRPFFENIGTIFWYAVVGTLWN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SIGIGVSLFGICQIEAFGLSDITLLQNLLFGSLISAVDPVAVLAVFENIHVNEQLYILVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SIGIGVSLFGICQIEAFGLSDITLLQNLLFGSLISAVDPVAVLAVFENIHVNEQLYILVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 GESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQMKTIETIDVFAGIANFFVVGIGGVLIGIFLGFIAAFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQMKTIETIDVFAGIANFFVVGIGGVLIGIFLGFIAAFTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYITAEMFHLSGIMAITACAMTMNKYVEENVSQKSYTTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYITAEMFHLSGIMAITACAMTMNKYVEENVSQKSYTTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFVCFTLAFCLMWRALGVFVLTQVINRFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 YFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFVCFTLAFCLMWRALGVFVLTQVINRFR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TIPLTFKDQFIIAYGGLRGAICFALVFLLPAAVFPRKKLFITAAIVVIFFTVFILGITIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 TIPLTFKDQFIIAYGGLRGAICFALVFLLPAAVFPRKKLFITAAIVVIFFTVFILGITIR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEIYCRLFDHVKTGIEDVCGHWGHNFWRDKFKKFDDKYLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEIYCRLFDHVKTGIEDVCGHWGHNFWRDKFKKFDDKYLRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LLIRENQPKSSIVSLYKKLEIKHAIEMAETGMISTVPTFASLNDCREEKIRKVTSSETDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LLIRENQPKSSIVSLYKKLEIKHAIEMAETGMISTVPTFASLNDCREEKIRKVTSSETDE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 IRELLSRNLYQIRQRTLSYNRHSLTADTSERQAKEILIRRRHSLRESIRKDSSLNREHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 IRELLSRNLYQIRQRTLSYNRHSLTADTSERQAKEILIRRRHSLRESIRKDSSLNREHRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 STSTSRYLSLPKNTKLPEKLQKRRTISIADGNSSDSDADAGTTVLNLQPRARRFLPEQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 STSTSRYLSLPKNTKLPEKLQKRRTISIADGNSSDSDADAGTTVLNLQPRARRFLPEQFS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 KKSPQSYKMEWKNEVDVDSGRDMPSTPPTPHSREKGTQTSGLLQQPLLSKDQSGSEREDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KKSPQSYKMEWKNEVDVDSGRDMPSTPPTPHSREKGTQTSGLLQQPLLSKDQSGSEREDS
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KE1 LTEGIPPKPPPRLVWRASEPGSRKARFGSEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LTEGIPPKPPPRLVWRASEPGSRKARFGSEKP
790 800 810
>>CCDS33264.1 SLC9A4 gene_id:389015|Hs108|chr2 (798 aa)
initn: 1757 init1: 1127 opt: 2770 Z-score: 2661.5 bits: 503.4 E(32554): 6.3e-142
Smith-Waterman score: 2770; 58.3% identity (83.9% similar) in 731 aa overlap (12-732:10-728)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEPLGNWRSLRAPLPPMLLLLLLQVAGPVGALAETLLNAPRAMGTSSSPPSPASVVAPGT
.: .:::. :. . . : :. ..:.. . . : ..
CCDS33 MALQMFVTYSPWNCLLLLVALECSEASSDLNES--------ANSTAQYASNAWFAAAS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TLFEESRLPVFTLDYPHVQIPFEITLWILLASLAKIGFHLYHKLPTIVPESCLLIMVGLL
. ::. . :: ::: .::::.:.::::::::::::::::::.:: ..:::::::.:: :
CCDS33 SEPEEG-ISVFELDYDYVQIPYEVTLWILLASLAKIGFHLYHRLPGLMPESCLLILVGAL
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPTRPFFENIGTIFWYAVVGTLWN
.::::::.:.::::.: ....::::::::::..::::::::::::::.:.:.::.:.: :
CCDS33 VGGIIFGTDHKSPPVMDSSIYFLYLLPPIVLEGGYFMPTRPFFENIGSILWWAVLGALIN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SIGIGVSLFGICQIEAFGLSDITLLQNLLFGSLISAVDPVAVLAVFENIHVNEQLYILVF
..:::.::. :::..::::.:..::::::::::::::::::::::::. .::::::...:
CCDS33 ALGIGLSLYLICQVKAFGLGDVNLLQNLLFGSLISAVDPVAVLAVFEEARVNEQLYMMIF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE1 GESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQM---KTIETIDVFAGIANFFVVGIGGVLIGIFLGFIAA
::.::::..::::::.. .: .: . :::.:..:: : :.:::.::::.:: .:::.:
CCDS33 GEALLNDGITVVLYNMLIAFTKMHKFEDIETVDILAGCARFIVVGLGGVLFGIVFGFISA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FTTRFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYITAEMFHLSGIMAITACAMTMNKYVEENVSQKSYT
: ::::.:: .::::.::..:::::..:: ..::::.::::::.::.::::::::: :::
CCDS33 FITRFTQNISAIEPLIVFMFSYLSYLAAETLYLSGILAITACAVTMKKYVEENVSQTSYT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFVCFTLAFCLMWRALGVFVLTQVIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::..::.: . :
CCDS33 TIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFICFTLAFCQIWRAISVFALFYISN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 RFRTIPLTFKDQFIIAYGGLRGAICFALVFLLPAAVFPRKKLFITAAIVVIFFTVFILGI
.:::.:...::: :: :.:.::: :.:.:::: ..:::::.:.::..:::.::::: ::
CCDS33 QFRTFPFSIKDQCIIFYSGVRGAGSFSLAFLLPLSLFPRKKMFVTATLVVIYFTVFIQGI
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 TIRPLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEIYCRLFDHVKTGIEDVCGHWGHNFWRDKFKKFDDKY
:. :::..::::..:::. ...::.. ::.::.:.:::::::::.: :::::::: .:
CCDS33 TVGPLVRYLDVKKTNKKE-SINEELHIRLMDHLKAGIEDVCGHWSHYQVRDKFKKFDHRY
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 LRKLLIRENQPKSSIVSLYKKLEIKHAIEMAETGMISTVPTFASLNDCREEKIRKVTSSE
:::.:::.: :::::::::::::.:.::::.:::..:.. . : . :.... .
CCDS33 LRKILIRKNLPKSSIVSLYKKLEMKQAIEMVETGILSSTAFSIPHQAQRIQGIKRLSPED
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 TDEIRELLSRNLYQIRQRTLSYNRHSLTADTSERQAKEILIRRRHSLRESIRKDSSLNRE
.. ::..:. :.::.::::::::...: .:::.:::::::::...::::.:: ::
CCDS33 VESIRDILTSNMYQVRQRTLSYNKYNLKPQTSEKQAKEILIRRQNTLRESMRKGHSLPWG
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 HRASTSTSRYLSLPKNTKLPEKLQK-RRTISIADGNSSDSDA-----DAGTTVLNLQPR-
. :.:.. :::: : .. :.. . :. ...: .::: . .: . . .:: .
CCDS33 KPAGTKNIRYLSYPYGN--PQSAGRDTRAAGFSDDDSSDPGSPSITFSACSRIGSLQKQE
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 ARRFLPEQFSKKSPQSYKMEWKNEVDVDSGRDMPSTPPTPHSREKGTQTSGLLQQPLLSK
:....: . ... ..... ..
CCDS33 AQEIIPMKSLHRGRKAFSFGYQRNTSQEEYLGGVRRVALRPKPLFHAVDEEGESGGESEG
710 720 730 740 750 760
>>CCDS295.1 SLC9A1 gene_id:6548|Hs108|chr1 (815 aa)
initn: 1871 init1: 1744 opt: 2102 Z-score: 2019.7 bits: 384.6 E(32554): 3.5e-106
Smith-Waterman score: 2230; 46.8% identity (72.8% similar) in 809 aa overlap (14-801:28-799)
10 20 30 40
pF1KE1 MEPLGNWRSLRAPLPPMLLLLLLQVAGPVGALAETLLNAPRAMG-T
: :.: ::.. .... . :..: .
CCDS29 MVLRSGICGLSPHRIFPSLLVVVALVGLLPVLRSHGLQLSPTASTIRSSEPPRERSIGDV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE1 SSSPP--SPASV-VAPGTT---LFEESRLPVFTLDYPHVQIPFEITLWILLASLAKIGFH
...:: .: : : ..: . .. .::. .:: ::. ::::.:::::: : :::::
CCDS29 TTAPPEVTPESRPVNHSVTDHGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 LYHKLPTIVPESCLLIMVGLLLGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPT
. . .:::::::::.::::.::.: :: : .:: ...:::::.:::::.::::::.:
CCDS29 VIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGE-TPPFLQSDVFFLFLLPPIILDAGYFLPL
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 RPFFENIGTIFWYAVVGTLWNSIGIGVSLFGICQIEAFGLSDITLLQNLLFGSLISAVDP
: : ::.:::. .::::::::.. .: ....: . . ...: ::.::::::.::::::
CCDS29 RQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VAVLAVFENIHVNEQLYILVFGESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQMKTIETIDVFAGIANFF
::::::::.::.:: :.::::::::::::::::::.::. : ... . .:.: :. .::
CCDS29 VAVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VVGIGGVLIGIFLGFIAAFTTRFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYITAEMFHLSGIMAITAC
::..::::.:. : :::::.::: .::::::::::::::..:..::.::::::::. :
CCDS29 VVALGGVLVGVVYGVIAAFTSRFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIAS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 AMTMNKYVEENVSQKSYTTIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFVCFTLA
...: ::: :.:.::.::::::.:: :::::::::::.:::::. .:.:::.:: ::
CCDS29 GVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGVSTVAGSHHWNWTFVISTLL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 FCLMWRALGVFVLTQVINRFRTIPLTFKDQFIIAYGGLRGAICFALVFLLPAAVFPRKKL
:::. :.:::. :: ::.:: . :: ::::::::::::::: :.: .:: :: :
CCDS29 FCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 FITAAIVVIFFTVFILGITIRPLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEIYCRLFDHVKTGIEDVCG
:.:: :.:::::::. :.::::::..: ::.... .....:::. ...::. :::::.::
CCDS29 FLTAIITVIFFTVFVQGMTIRPLVDLLAVKKKQETKRSINEEIHTQFLDHLLTGIEDICG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 HWGHNFWRDKFKKFDDKYLRKLLIR-ENQPKSSIVSLYKKLEIKHAIEMAETGMISTVPT
:.::. :.::...:. ::..: :: : . . .....:.:.:.:.:::..:.: .. .:.
CCDS29 HYGHHHWKDKLNRFNKKYVKKCLIAGERSKEPQLIAFYHKMEMKQAIELVESGGMGKIPS
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KE1 FASLNDCRE--------EKIRKVTSSETDE-IRELLSRNLYQIRQRTLSYNRHSLTADTS
.: . .. :.: . :.. .: ::..: :: . ::: :::::.:.::
CCDS29 AVSTVSMQNIHPKSLPSERILPALSKDKEEEIRKILRNNLQKTRQRLRSYNRHTLVADPY
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 ERQAKEILIRRRHSLRESIRKDSSLNREHRASTSTSRYLSLPKNTKLPEKLQKRRTISIA
:. ...:.::. : .:... . ::..: . :: ..: :. .
CCDS29 EEAWNQMLLRRQ--------KARQLEQK------INNYLTVPAH-KLDSPTMSRARIG-S
660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 DGNSSDSDADAGTTVLNLQPRARRFLPEQFSKKSPQSYKM---EWKNEVDVDSGRDMPST
: . . : :....: : .::.: . : :..: . .::
CCDS29 DPLAYEPKED--LPVITIDPA---------SPQSPESVDLVNEELKGKV-LGLSRD----
710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 PPTPHSREKGTQTSGLLQQPLLSKDQSGSEREDSLTEGIPPKPPPRLVWRA-SEPGSRKA
:. ..: . .:.... ::. :. .: .: . .: . . : :.::
CCDS29 -PAKVAEEDEDDDGGIMMR---SKETSSPGTDDVFTPAPSDSPSSQRIQRCLSDPGPHPE
750 760 770 780 790 800
810
pF1KE1 RFGSEKP
CCDS29 PGEGEPFFPKGQ
810
>>CCDS3855.1 SLC9A3 gene_id:6550|Hs108|chr5 (834 aa)
initn: 1805 init1: 805 opt: 1748 Z-score: 1679.5 bits: 321.7 E(32554): 3.1e-87
Smith-Waterman score: 1803; 41.3% identity (69.2% similar) in 780 aa overlap (56-789:30-795)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 AGPVGALAETLLNAPRAMGTSSSPPSPASVVAPGTTLFEESRLPVFTLDYPHVQIPFEIT
: :: . : . . : :... ::: :. :.
CCDS38 MWGLGARGPDRGLLLALALGGLARAGGVEVEPGGAHGESGGFQVVTFEWAHVQDPYVIA
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 LWILLASLAKIGFHLYHKLPTIVPESCLLIMVGLLLGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYL
::::.:::::::::: ::. ..:::: :::..::.::::....:. . .. :::.::
CCDS38 LWILVASLAKIGFHLSHKVTSVVPESALLIVLGLVLGGIVWAADHIASFTLTPTVFFFYL
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 LPPIVLDAGYFMPTRPFFENIGTIFWYAVVGTLWNSIGIGVSLFGICQIEAFGLSDITLL
:::::::::::::.: :: :.:::. ::::::.::. :.::.:. .: .: ::
CCDS38 LPPIVLDAGYFMPNRLFFGNLGTILLYAVVGTVWNAATTGLSLYGVFLSGLMGDLQIGLL
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 QNLLFGSLISAVDPVAVLAVFENIHVNEQLYILVFGESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQM--
. ::::::..::::::::::::..:::: :.:.:::::::::::::::::.:.:: .
CCDS38 DFLLFGSLMAAVDPVAVLAVFEEVHVNEVLFIIVFGESLLNDAVTVVLYNVFESFVALGG
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KTIETIDVFAGIANFFVVGIGGVLIGIFLGFIAAFTTRFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYI
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CCDS38 DNVTGVDCVKGIVSFFVVSLGGTLVGVVFAFLLSLVTRFTKHVRIIEPGFVFIISYLSYL
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pF1KE1 TAEMFHLSGIMAITACAMTMNKYVEENVSQKSYTTIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTV
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CCDS38 TSEMLSLSAILAITFCGICCQKYVKANISEQSATTVRYTMKMLASSAETIIFMFLGISAV
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 GK-NHEWNWAFVCFTLAFCLMWRALGVFVLTQVINRFRTIPLTFKDQFIIAYGGLRGAIC
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CCDS38 NPFIWTWNTAFVLLTLVFISVYRAIGVVLQTWLLNRYRMVQLEPIDQVVLSYGGLRGAVA
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 FALVFLLPAAVFPRKKLFITAAIVVIFFTVFILGITIRPLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEI
:::: :: . .:.::....:.:.::::.. :.::.:::..: ::::.... ..:..
CCDS38 FALVVLLDGDKVKEKNLFVSTTIIVVFFTVIFQGLTIKPLVQWLKVKRSEHREPRLNEKL
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 YCRLFDHVKTGIEDVCGHWGHNFWRDKFKKFDDKYLRKLLIRENQPKSS--IVSLYKKLE
. : :::. ..:::. :. :::. :::...:: :.: ..:.:.. :: :......:.
CCDS38 HGRAFDHILSAIEDISGQIGHNYLRDKWSHFDRKFLSRVLMRRSAQKSRDRILNVFHELN
480 490 500 510 520 530
570 580
pF1KE1 IKHAIEMAETGM------------------ISTVPTFASLND-------------CR---
.: :: .. : .. .: .... :
CCDS38 LKDAISYVAEGERRGSLAFIRSPSTDNVVNVDFTPRSSTVEASVSYLLRENVSAVCLDMQ
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 --EEKIRKVTSSETDEIRELLSRNLYQIRQRTLS-YNRHSLTADTSERQAKEILIRRRHS
:.. :.. ..: .. :.. ::. ::. :.:: :: .:.: .::. : ..
CCDS38 SLEQRRRSIRDAEDMVTHHTLQQYLYKPRQEYKHLYSRHELTPTEDEKQDREIFHRTMRK
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650 660 670 680 690 700
pF1KE1 LRESIRKDS-SLNREHRASTSTSRYLSLPKNTKLPEKLQKRRTISIADGN-SSDSDADAG
::... . .::....:. .: :. ::::. :: .:. .: :.
CCDS38 RLESFKSTKLGLNQNKKAAKLYKR-----------ERAQKRRNSSIPNGKLPMESPAQNF
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pF1KE1 TTVLNLQPRARRFLPEQFSKKSPQSYKMEWKNEVDVDSGRDMPSTPPTP-HSREKGTQTS
: . . : ..... .: .:. : :.. : :. .: : ... . :
CCDS38 TIKEKDLELSDTEEPPNYDEE--MSGGIEFLASVTKDTASDSPAGIDNPVFSPDEALDRS
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810
pF1KE1 GLLQ-QPLLSKDQSGSEREDSLTEGIPPKPPPRLVWRASEPGSRKARFGSEKP
: . : :: .. . . :. :: .:
CCDS38 LLARLPPWLSPGETVVPSQRARTQ-IPYSPGTFCRLMPFRLSSKSVDSFLQADGPEERPP
770 780 790 800 810 820
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: .:: : : :.. : . : : ::
CCDS42 MLRAALSLLALPLA-GAAEEPTQKPES---PGEP
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70 80 90 100 110 120
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: .: .. .:. :. ..::::.:::::: ::: .:. ..::::::::..::.:
CCDS42 ---PPGLELFRWQWHEVEAPYLVALWILVASLAKIVFHLSRKVTSLVPESCLLILLGLVL
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CCDS42 GGIVLAVAKKAEYQLEPGTFFLFLLPPIVLDSGYFMPSRLFFDNLGAILTYAVVGTLWNA
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CCDS42 FTTGAALWGLQQA---GLVAPRVQAGLLDFLLFGSLISAVDPVAVLAVFEEVHVNETLFI
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CCDS42 IVFGESLLNDAVTVVLYKVCNSFVEMGSANVQATDYLKGVASLFVVSLGGAAVGLVFAFL
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CCDS42 LALTTRFTKRVRIIEPLLVFLLAYAAYLTAEMASLSAILAVTMCGLGCKKYVEANISHKS
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CCDS42 RTTVKYTMKTLASCAETVIFMLLGISAVDSS-KWAWDSGLVLGTLIFILFFRALGVVLQT
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:.:.:: .:: :: ...:::::::. ::::.:: . : : :....:::.::::.
CCDS42 WVLNQFRLVPLDKIDQVVMSYGGLRGAVAFALVILLDRTKVPAKDYFVATTIVVVFFTVI
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pF1KE1 ILGITIRPLVEFLDVKRSNKKQQAVSEEIYCRLFDHVKTGIEDVCGHWGHNFWRDKFKKF
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CCDS42 VQGLTIKPLVKWLKVKRSEHHKPTLNQELHEHTFDHILAAVEDVVGHHGYHYWRDRWEQF
450 460 470 480 490 500
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: ::: .::.:.. . ...: ..: .:.:. :: ... : ..: :.:.. : :.
CCDS42 DKKYLSQLLMRRSAYRIRDQIWDVYYRLNIRDAISFVDQGGHVLSSTGLTLPSMPSRNSV
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pF1KE1 REEKI----RKVTSSET------DEIR-----------ELLSRNLYQIRQR-TLSYNRHS
: .. :. :. : .: .:: .::. :.: : .::
CCDS42 AETSVTNLLRESGSGACLDLQVIDTVRSGRDREDAVMHHLLCGGLYKPRRRYKASCSRHF
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pF1KE1 LTADTSERQAKEILIRRRHSLRESIRKDSSLNREHRASTSTSRYLSLPKNTKLPEKLQKR
.. :..::: ::.. .....:. .. ::.. . . :. :.: .:
CCDS42 ISEDAQERQDKEVF-------------QQNMKRRLESFKSTKHNICFTKSKPRPRKTGRR
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pF1KE1 RTISIADGNSSDSDADAGTTVLNLQPRARRFLPEQFSKKSPQSYKMEWKNEVDVDSGRDM
. ..:....... . :..: : .: . .. .: . : ..: :
CCDS42 KKDGVANAEATNGKHRG----LGFQDTAAVILTVESEEEEEESDSSETEKEDDEGIIFVA
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pF1KE1 PSTPPTPHSREKGTQTSGLLQQPLLSKDQSGSEREDSLTEGIPPKPPPRLVWRASEPGSR
CCDS42 RATSEVLQEGKVSGSLEVCPSPRIIPPSPTCAEKELPWKSGQGDLAVYVSSETTKIVPVD
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CCDS64 LWILVASLAKIGFHLSHKVTSVVPESALLIVLGLVLGGIVWAADHIASFTLTPTVFFFYL
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:::::::::::::.: :: :.:::. ::::::.::. :.::.:. .: .: ::
CCDS64 LPPIVLDAGYFMPNRLFFGNLGTILLYAVVGTVWNAATTGLSLYGVFLSGLMGDLQIGLL
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. ::::::..::::::::::::..:::: :.:.:::::::::::::::::.:.:: .
CCDS64 DFLLFGSLMAAVDPVAVLAVFEEVHVNEVLFIIVFGESLLNDAVTVVLYNVFESFVALGG
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pF1KE1 KTIETIDVFAGIANFFVVGIGGVLIGIFLGFIAAFTTRFTHNIRVIEPLFVFLYSYLSYI
.. .: ::..::::..::.:.:. ..:. ...::::...:.::: :::. :::::.
CCDS64 DNVTGVDCVKGIVSFFVVSLGGTLVGVVFAFLLSLVTRFTKHVRIIEPGFVFIISYLSYL
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pF1KE1 TAEMFHLSGIMAITACAMTMNKYVEENVSQKSYTTIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTV
:.::. ::.:.::: :.. .:::. :.:..: ::..: ::::.: .::.::.:.:.:.:
CCDS64 TSEMLSLSAILAITFCGICCQKYVKANISEQSATTVRYTMKMLASSAETIIFMFLGISAV
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. :: ::: .::.: ..::.:: . : ..::.: . : :: ...:::::::.
CCDS64 NPFIWTWNTAFVLLTLVFISVYRAIGVVLQTWLLNRYRMVQLEPIDQVVLSYGGLRGAVA
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:::: :: . .:.::....:.:.:::: . ..: ::::.... ..:..
CCDS64 FALVVLLDGDKVKEKNLFVSTTIIVVFFTV---------IFQWLKVKRSEHREPRLNEKL
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. : :::. ..:::. :. :::. :::...:: :.: ..:.:.. :: :......:.
CCDS64 HGRAFDHILSAIEDISGQIGHNYLRDKWSHFDRKFLSRVLMRRSAQKSRDRILNVFHELN
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pF1KE1 IKHAIEMAETGM------------------ISTVPTFASLND-------------CR---
.: :: .. : .. .: .... :
CCDS64 LKDAISYVAEGERRGSLAFIRSPSTDNVVNVDFTPRSSTVEASVSYLLRENVSAVCLDMQ
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pF1KE1 --EEKIRKVTSSETDEIRELLSRNLYQIRQRTLS-YNRHSLTADTSERQAKEILIRRRHS
:.. :.. ..: .. :.. ::. ::. :.:: :: .:.: .::. : ..
CCDS64 SLEQRRRSIRDAEDMVTHHTLQQYLYKPRQEYKHLYSRHELTPTEDEKQDREIFHRTMRK
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pF1KE1 LRESIRKDS-SLNREHRASTSTSRYLSLPKNTKLPEKLQKRRTISIADGN-SSDSDADAG
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CCDS64 RLESFKSTKLGLNQNKKAAKLYKR-----------ERAQKRRNSSIPNGKLPMESPAQNF
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pF1KE1 TTVLNLQPRARRFLPEQFSKKSPQSYKMEWKNEVDVDSGRDMPSTPPTP-HSREKGTQTS
: . . : ..... .: .:. : :.. : :. .: : ... . :
CCDS64 TIKEKDLELSDTEEPPNYDEE--MSGGIEFLASVTKDTASDSPAGIDNPVFSPDEALDRS
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: . : :: .. . . :. :: .:
CCDS64 LLARLPPWLSPGETVVPSQRARTQ-IPYSPGTFCRLMPFRLSSKSVDSFLQADGPEERPP
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pF1KE1 IMVGLLLGGIIFGVDEKS------PPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPTRPFFENIGT
. .:.:.:..: .. :. .. ..::: :::::....:: . ::.:::.
CCDS13 VSLGILMGAVIKIIEFKKLANWKEEEMFRPNMFFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGS
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: .:: :: ... .: ... . : .. .: ... ... ::::::::::::..:.:.
CCDS13 ITLFAVFGTAISAFVVGGGIYFLGQADV--ISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNA
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.::. : .::::::.:::::..:: : ... . :. . ..: ..:. . .:.
CCDS13 LHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTNTAEGLTRKNMSDVSGWQTFLQALDYFLKMFFGS
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. .: . :.:.:.. . ..: : ......:: : :: . ::::::: ...
CCDS13 AALGTLTGLISALVLKHI-DLRKTPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIV
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pF1KE1 MNKYVEENVSQKSYTTIKYFMKMLSSVSETLIFIFMGVSTVGKNHEWNWAFVCFTLAFCL
:..:...:.: . .. .. .. . :: .: :.:.: . :... .:: . ... :
CCDS13 MSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRTVAFLCETCVFAFLGLSIFSFPHKFEISFVIWCIVLVL
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pF1KE1 MWRALGVFVLTQVINRFRTIPLTFKDQFIIAYGGLRGAICFALVFLLPAAVFPRKKLFIT
. ::...: :. ..: :: .: : .::. ..:::::: .:: . : . ...:. :
CCDS13 FGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKITPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDLEPMEKRQLIGT
400 410 420 430 440 450
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pF1KE1 AAIVVIFFTVFILGITIRPLVEFLDVK-----RSNKKQQAVS--EEIYCRLF-DHVKTGI
..::...::...:: . ::....:.. : :::. .: :.. . .:..
CCDS13 TTIVIVLFTILLLGGSTMPLIRLMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELT
460 470 480 490 500 510
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pF1KE1 EDVCGHWGHNFWRDKFKKF---DDKYLRKLLIRENQPKSSIVSLYKKLEIKHAIEMAETG
:. . .: . :. .: : : ::: .. :
CCDS13 EE--EYEAHYIRRQDLKGFVWLDAKYLNPFFTRRLTQEDLHHGRIQMKTLTNKWYEEVRQ
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pF1KE1 MISTVPTFASLNDCREEKIRKVTSSETDEIRELLSRNLYQIRQRTLSYNRHSLTADTSER
CCDS13 GPSGSEDDEQELL
570 580
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pF1KE1 PESCLLIMVGLLLGGIIFGVDEKSPPAMKTDVFFLYLLPPIVLDAGYFMPTRPFFENIGT
..:: :::::.. ::: . : ::.:.:.
CCDS33 YEYKYKREISQHNINPHQGNAILEKMTFDPEIFFNVLLPPIIFHAGYSLKKRHFFQNLGS
110 120 130 140 150 160
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pF1KE1 IFWYAVVGTLWNSIGIGVSLFGICQ--IEAFGLS--DITLLQNLLFGSLISAVDPVAVLA
:. :: .:: . : ::. ..:. . :.: :. :. . . :.::::.::.:::.:::
CCDS33 ILTYAFLGTAISCIVIGLIMYGFVKAMIHAGQLKNGDFHFTDCLFFGSLMSATDPVTVLA
170 180 190 200 210 220
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pF1KE1 VFENIHVNEQLYILVFGESLLNDAVTVVLYNLFKSFCQMKTIETIDV---FAGIANFFVV
.:...::. .:: :.::::.:::::..:: .. . .. ...:. : ...::. .
CCDS33 IFHELHVDPDLYTLLFGESVLNDAVAIVLTYSISIYSPKENPNAFDAAAFFQSVGNFLGI
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 GIGGVLIGIFLGFIAAFTTRFTH--NIRVIEPLFVFLYSYLSYITAEMFHLSGIMAITAC
:. .: ..:.:. :.::. .. ..: . :: :. ....:: :.::.:. :
CCDS33 FAGSFAMGSAYAIITALLTKFTKLCEFPMLETGLFFLLSWSAFLSAEAAGLTGIVAVLFC
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..:. .:. .:.:. : : ...... ..:..:: .::.. .:: .: :. ..
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.. :: ... :. ..: : . :: .: : .. ..:::::: :::. . . :.
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. .: :......::::...: :.. .:... . : :.. :.. .:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]