Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1991
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1991, 569 aa
1>>>pF1KE1991 569 - 569 aa - 569 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2041+/-0.000834; mu= 20.4293+/- 0.051
mean_var=86.7876+/-16.633, 0's: 0 Z-trim(109.8): 74 B-trim: 3 in 1/49
Lambda= 0.137672
statistics sampled from 11055 (11136) to 11055 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 ( 569) 4094 823.2 0
CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231) 1661 340.3 8.3e-93
CCDS55671.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 577) 1370 282.2 1.2e-75
CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 ( 330) 1133 234.9 1.2e-61
CCDS30959.1 CFHR2 gene_id:3080|Hs108|chr1 ( 270) 929 194.3 1.6e-49
CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 ( 661) 924 193.7 6.2e-49
CCDS41451.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 ( 331) 719 152.7 6.8e-37
CCDS53453.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 269) 710 150.8 2e-36
CCDS30958.1 CFHR3 gene_id:10878|Hs108|chr1 ( 330) 684 145.7 8.4e-35
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 475 105.2 1.5e-21
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 471 104.4 2.5e-21
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 471 104.4 2.6e-21
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 471 104.4 2.6e-21
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 470 104.2 2.9e-21
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 457 101.6 1.7e-20
CCDS53452.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 ( 449) 415 92.4 1.3e-18
CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 399 89.3 1.4e-17
CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 344 78.4 2.7e-14
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 339 77.7 8.4e-14
CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039) 316 73.4 3.1e-12
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 312 72.3 3.3e-12
>>CCDS1387.1 CFHR5 gene_id:81494|Hs108|chr1 (569 aa)
initn: 4094 init1: 4094 opt: 4094 Z-score: 4395.6 bits: 823.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4094; 100.0% identity (100.0% similar) in 569 aa overlap (1-569:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
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CCDS13 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGYSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QNNEKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKVGDVLKFSCRKNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNNEKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKVGDVLKFSCRKNLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RVGSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEVVEYDCNPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RVGSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEVVEYDCNPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPELEYGYVQPSVPPYQHGVSVEVNCRNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPELEYGYVQPSVPPYQHGVSVEVNCRNE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YAMIGNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNSRIRYRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YAMIGNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNSRIRYRCS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DIFRYRHSVCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DIFRYRHSVCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 YLLPEAKEIVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YLLPEAKEIVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 FYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQ
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE1 CKFPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CKFPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
550 560
>>CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231 aa)
initn: 2082 init1: 1465 opt: 1661 Z-score: 1779.6 bits: 340.3 E(32554): 8.3e-93
Smith-Waterman score: 1661; 46.2% identity (70.9% similar) in 519 aa overlap (53-566:475-981)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 CDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPK
:.:. ..:. . ::: ..::: :
CCDS13 VKTCSKSSIDIENGFISESQYTYALKEKAKYQCKLGYVTADGETSGSITCGKDGWSAQPT
450 460 470 480 490 500
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 CLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGY--SLQNNEKNISCVERGWSTPPIC
:.. :..: :...... .::.. :. :: . .. .: : ::: :::
CCDS13 CIKSCDIPVFMNARTKNDFTWFKLNDTLDYECHDGYESNTGSTTGSIVCGYNGWSDLPIC
510 520 530 540 550 560
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKVGDVLKFSCRKNLIRVGSDSVQCYQFGWSPNFPT
. . ::..: ..... . ::..::::.::::::. .. :: .:::::.:: ::..:
CCDS13 -YER-ECELPKIDVHLVPDRKKDQYKVGEVLKFSCKPGFTIVGPNSVQCYHFGLSPDLPI
570 580 590 600 610 620
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 CKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEVVEYDCNPNFIINGPKKIQCVDGEWTTLP
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CCDS13 CKEQVQSCGPPPELLNGNVKEKTKEEYGHSEVVEYYCNPRFLMKGPNKIQCVDGEWTTLP
630 640 650 660 670 680
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 TCVEQVKTCGYIPELEYGYVQPSVPPYQHGVSVEVNCRNEYAMIGNNMITCINGIWTELP
.:. . .::: :::::.:..: : ::: .: ::: :: . ..:::. ::::.:.::.::
CCDS13 VCIVEESTCGDIPELEHGWAQLSSPPYYYGDSVEFNCSESFTMIGHRSITCIHGVWTQLP
690 700 710 720 730 740
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 MCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHSVCINGKWNPEVD
.::: .::.:: ... : . :::.::: ::::: . :.:::::.:.:::.
CCDS13 QCVAIDKLKKCKSSNLIILEEHLKNKKEFDHNSNIRYRCRGKEGWIHTVCINGRWDPEVN
750 760 770 780 790 800
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 CTEKREQFCPPPPQIPNAQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEIVCKDGRWQSLP
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CCDS13 CSMAQIQLCPPPPQIPNSHNMTTTLNYRDGEKVSVLCQENYLIQEGEEITCKDGRWQSIP
810 820 830 840 850 860
450 460 470 480 490
pF1KE1 RCVESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLS--VYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWS
:::. :. ::.:..: .: : : :. ..: :.. .... .:: .::
CCDS13 LCVEKIP-CSQPPQIEHGTINSSRSSQESYAHGTKLSYTCEGGFRISEENETTCYMGKWS
870 880 890 900 910 920
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 EPPRCLD-PCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAI
::.: :: : . .. .:. : :. : ..: : . :..: . :
CCDS13 SPPQCEGLPCKSPPEISHGVVAHM---SDSYQY---GEEVTYKC-FEGFG-IDGPAI-AK
930 940 950 960 970
560
pF1KE1 CQEGKFEYPICE
: :. .:
CCDS13 CLGEKWSHPPSCIKTDCLSLPSFENAIPMGEKKDVYKAGEQVTYTCATYYKMDGASNVTC
980 990 1000 1010 1020 1030
>--
initn: 884 init1: 631 opt: 713 Z-score: 762.0 bits: 152.0 E(32554): 4e-36
Smith-Waterman score: 713; 38.8% identity (65.9% similar) in 255 aa overlap (320-568:982-1228)
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GVSVEVNCRNEYAMIGNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKE-
: :. : : .. .... . .. :.
CCDS13 GEEVTYKCFEGFGIDGPAIAKCLGEKWSHPPSCIKTD----C-LSLPSFENAIPMGEKKD
960 970 980 990 1000
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 -FNHNSRIRYRCSDIFRY---RHSVCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQNMTTT
.. . .. : :. ... . .:::..:. . : :. : :: . :: ..
CCDS13 VYKAGEQVTYTCATYYKMDGASNVTCINSRWTGRPTC---RDTSCVNPPTVQNAYIVSRQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 VN-YQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEIVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDTTSF
.. : .::.: :. : . .:..: .: : :.: .::. ::::: :.::: :::
CCDS13 MSKYPSGERVRYQCRSPYEMFGDEEVMCLNGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 PLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQLKW
::::: :.:.: :.::..:.:.:. .:::: ::::::.:: :::.:.: :.. :: :.:
CCDS13 PLSVYAPASSVEYQCQNLYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRW
1130 1140 1150 1160 1170 1180
530 540 550 560
pF1KE1 RNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
:::..::..::: :: .. : .:. : .::.::: :
CCDS13 TAKQKLYSRTGESVEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR
1190 1200 1210 1220 1230
>--
initn: 475 init1: 413 opt: 413 Z-score: 440.0 bits: 92.4 E(32554): 3.5e-18
Smith-Waterman score: 413; 39.8% identity (70.3% similar) in 118 aa overlap (23-140:325-442)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFY
::.: :.:: :: :. :. : .:. .
CCDS13 RNGFYPATRGNTAKCTSTGWIPAPRCTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPYFPVAVGKYYS
300 310 320 330 340 350
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 YSCEYNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQI
: :. .: .:: :.: .: ::..::::. ::: : ::...::.... : ..: ....
CCDS13 YYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGKSIDV
360 370 380 390 400 410
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ICNTGYSLQNNEKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKVGDVLK
:. ::.: . . ...:.: ::: : :
CCDS13 ACHPGYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCIRVKTCSKSSIDIENGFISESQYTYALKEKAK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS55671.1 CFHR4 gene_id:10877|Hs108|chr1 (577 aa)
initn: 1182 init1: 629 opt: 1370 Z-score: 1471.5 bits: 282.2 E(32554): 1.2e-75
Smith-Waterman score: 1370; 36.5% identity (62.4% similar) in 595 aa overlap (1-569:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
::::..::: ::: ..:. ::::.:.:: :: . . . .:. . : :. :::
CCDS55 MLLLINVILTLWVSCANGQVKPCDFPEIQHGGLYYKSLRRLYFPAAAGQSYSYYCDQNFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFP--FVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGY
.:: :.: : ::..::::: ::: :: ..:: :. :.. .. .: :. ::
CCDS55 TPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPCLRTCSKSDVEIENGFISESSSIYILNEETQYNCKPGY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SLQ--NNEKNISCVERGWSTPPIC-SFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKVGDVLKFSC
. :. .:.:.. :::: ::: .: : .:..: : :. . .:. :.: . :
CCDS55 ATAEGNSSGSITCLQNGWSTQPICIKF----CDMPVFE-NSRAKSNGMWFKLHDTLDYEC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RKNL-IRVG--SDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEV
. : .::. : . ::: ..::: .. ..::::: .:::.. . .. :
CCDS55 YDGYESSYGNTTDSIVCGEDGWS-HLPTCYNSSENCGPPPPISNGDTTSFPQKVYLPWSR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 VEYDCNPNFIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPELEYG--YVQPSVPPY---
:::.:. . ..: : . : .:.:. : :. ..: : . ::...: : . . ::
CCDS55 VEYQCQSYYELQGSKYVTCSNGDWSEPPRCI-SMKPCEF-PEIQHGHLYYENTRRPYFPV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 QHGVSVEVNCRNEYAMIGN---NMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKT-LLK
: : : .... .. ..: : . : : :. :. . ..:.. ...
CCDS55 ATGQSYSYYCDQNFVTPSGSYWDYIHCTQDGWLPTVPC-----LRTCSKSDIEIENGFIS
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE1 LSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHS------VCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPN
:.. . :..:.:.:. . . .:... :. . : .:: : . :
CCDS55 ESSSIYILNKEIQYKCKPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICI----KFCDMPV-FEN
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 AQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKENYLLPEAKE---IVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPS
.. .. . .. . . : ..: . .. ::: . :. .: : .:. :::::
CCDS55 SRAKSNGMRFKLHDTLDYECYDGYEISYGNTTGSIVCGEDGWSHFPTCYNSSEKCGPPPP
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 INNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENM
:.::::::: :.:: : : : :.:::.:.:::: ::: : .:::::::. ::...::::
CCDS55 ISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENM
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KE1 NKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
:::::::: ..: : ::::::..::.::. ..: : :.:.:.:: ::: ::
CCDS55 NKNNIQLKGKSDIKYYAKTGDTIEFMCKLGYNANTSVLSFQAVCREGIVEYPRCE
530 540 550 560 570
>>CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 (330 aa)
initn: 1639 init1: 1031 opt: 1133 Z-score: 1220.2 bits: 234.9 E(32554): 1.2e-61
Smith-Waterman score: 1133; 51.7% identity (68.4% similar) in 329 aa overlap (1-322:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
: :: :::::: .:.::::.:.::::::.::.::::: :.::::::::::::::::::::
CCDS13 MWLLVSVILISRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGYSL
:::::::::::::::::::::::::.: ::::.:::::::: ::::::::::::::: :
CCDS13 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 QNNEKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKES-YKVGDVLKFSCRKNL
::::.::::::::::::: : : : : :. .. : : :. ... ::.
CCDS13 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVRYECRSPY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IRVGSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHNEVVEYDCNP
:.. :.: . .:. : :: .. .::::: ..::.. . :. :::.:.
CCDS13 EMFGDEEVMCLNGNWTEP-PQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASSVEYQCQN
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NFIINGPKKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPE---LEYGYVQPSVPPYQHGVSVEVN
. ..: :.: : .:.:. : :.. : : . .. . . : :.:
CCDS13 LYQLEGNKRITCRNGQWSEPPKCLHPCVISREIMENYNIALRWTAKQKLYLRTGESAEFV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 CRNEYAMIGNNMI---TCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHNS
:. : . . . :: .: : : :
CCDS13 CKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGK-LEYPTCAKR
300 310 320 330
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLLLFSVILISWVSTVGGEGTLCDFPKIHHGFLYDEEDYNPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
: :: :::::: .:.::::. .::::::.::.::::: :.::::::::::::::::::::
CCDS30 MWLLVSVILISRISSVGGEAMFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFYYSCEYNFV
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 SPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNTGYSL
::::::::::::.::::::::::::.: ::::.:::::::: ::::::::::::::: :
CCDS30 SPSKSFWTRITCAEEGWSPTPKCLRLCFFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 QNNEKNISCVERGWSTPPIC--SFTKGECHVPILEANVDAQPKKES-YKVGDVLKFSCRK
::::.::::::::::::: : ... .: : : : : : :. ....: .
CCDS30 QNNENNISCVERGWSTPPKCRSTISAEKCGPPPPIDNGDITSFLLSVYAPGSSVEYQC-Q
130 140 150 160 170
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pF1KE1 NLIRV-GSDSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEE-YGHN-EVVE
:: .. :.... : . :: : : . : ..: ... :... ..::
CCDS30 NLYQLEGNNQITCRNGQWSEP-PKCLDPCVISQEIMEKYNIKLKWTNQQKLYSRTGDIVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YDCNPNFIINGPK--KIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPELEYGYVQPSVPPYQHGVS
. :. .. . . . .: .:. . :.: :.
CCDS30 FVCKSGYHPTKSHSFRAMCQNGK-LVYPSCEEK
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VEVNCRNEYAMIGNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKTLLKLSGKEFNHN
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:.:: :.:: .. .: . . :
CCDS13 MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSIDKK
10 20 30 40 50
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pF1KE1 VQIICNTGYSLQNN--EKNISCVERGWSTPPICSFTKGECHVPILEANVDAQPKKESYKV
....: .::. ... :.. .:. .::: : : : : : : : .: . : ::.
CCDS13 LSFFCLAGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRC-FKK--CTKPDL-SNGYISDVKLLYKI
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 GDVLKFSCRKNLIRVGS---DSVQCYQFGWSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRK
. ....: .. .:. . ::: . ::: . :::. . ..: : .: ::. . .:
CCDS13 QENMRYGCASGYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQ-PTCRKEHETCLAP-ELYNGNYSTTQK
120 130 140 150 160
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pF1KE1 EEYGHNEVVEYDCNPNFIINGPKK---IQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPELEYGYVQ
. .. :.:.: .. : :: ..:. :. : :. ..: :. . .: :: .
CCDS13 T-FKVKDKVQYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCT-KLK-CSSLRLIENGYFH
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: :..: :. :...: . :...: : : : : :.: . .. :: . :..
CCDS13 PVKQTYEEGDVVQFFCHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRN--RCPPPPLPINS
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 LLKLSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHSV---CINGKWNPEVDCTEKREQF-CPPPPQIP
.. . . :. .. .: :. . :. : .:::. : : .:. : :: :
CCDS13 KIQTHSTTYRHGEIVHIECELNFEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIE
290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 N-AQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEIVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSI
: : :. . . : .:.::. :: .::: ..::.:. :.: :.:::.. : :: .
CCDS13 NGAANLHSKI-YYNGDKVTYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVV
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
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:: ... :. : ::.: :::. .: :.:: :.. .:: :: ::.::.:. . ::
CCDS13 MNGAVADGILASYATGSSVEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMN
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560
pF1KE1 KNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSP--PFRAICQEGKFEYPICE
.:::..::. .::. :: ..: :: . .: . . :..:. .::.:
CCDS13 RNNIEMKWKYEGKVLH--GDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKES
470 480 490 500 510 520
CCDS13 KGMCTSPPLIKHGVIISSTVDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLE
530 540 550 560 570 580
>--
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pF1KE1 AVLCKENYLLPEAKEIVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGST
:: ..: :: :..: : ...: ::.
CCDS13 GYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISSTVDTYENGSS
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pF1KE1 VTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKT
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CCDS13 VEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWDFDNRPHILH
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pF1KE1 GDAVEFQCK---FPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
:. .:: :. .: . .:.. .: :..:...:: :
CCDS13 GEYIEFICRGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYPRCIPRQSTLSYQEPLRT
610 620 630 640 650 660
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.:. ..:: : . ::...: : .
CCDS41 MLLLINVILTLWVSCANGQEVKPCDF-PEIQHGGLYYKSLRRL
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pF1KE1 VPPYQHGVSVEVNCRNEYAMIGN---NMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKT
: : : : .... .. ..: : . :. : :. :. . ..:..
CCDS41 YFPAAAGQSYSYYCDQNFVTPSGSYWDYIHCTQDGWSPTVPC-----LRTCSKSDIEIEN
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pF1KE1 -LLKLSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHS------VCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPP
... :.. . :..:.:.:. . . .:... :. . : .:: :
CCDS41 GFISESSSIYILNKEIQYKCKPGYATADGNSSGSITCLQNGWSAQPICI----KFCDMPV
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 QIPNAQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKENYLLPEAKE---IVCKDGRWQSLPRCVESTAYCG
. :.. .. . .. . . : ..: . .. ::: . :. .: : .:. ::
CCDS41 -FENSRAKSNGMRFKLHDTLDYECYDGYEISYGNTTGSIVCGEDGWSHFPTCYNSSEKCG
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 PPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVS
::: :.::::::: :.:: : : : :.:::.:.:::: ::: : .:::::::. ::...
CCDS41 PPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQCQSYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIIT
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 EENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
:::::::::::: ..: : ::::::..::.::. ..: : :.:.:.:: ::: ::
CCDS41 EENMNKNNIQLKGKSDIKYYAKTGDTIEFMCKLGYNANTSVLSFQAVCREGIVEYPRCE
280 290 300 310 320 330
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pF1KE1 GYVQPSVPPYQHGVSVEVNCRNEYAMIGNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVN
:. :: : : : :. :.: : . ..
CCDS53 MLLLINVILTLWVSC-ANGQVKPCDFPDIK
10 20
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pF1KE1 IKTLLKLSGKE----FNHNSRIRYRCSDIFR--------YRHSVCINGKWNPEVDCTEKR
:.. . .. .. : :.. :. : : : .. :.: : : .:
CCDS53 HGGLFHENMRRPYFPVAVGKYYSYYCDEHFETPSGSYWDYIH--CTQNGWSPAVPCLRK-
30 40 50 60 70 80
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pF1KE1 EQFCPPPPQIPNAQNMTTTVNYQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEIV-CKDGRWQSLPRC--
: : . :. :.. .. .:... : :. .: ::.:. : : . :. :::
CCDS53 ---CYFP-YLENGYNQNYGRKFVQGNSTEVACHPGYGLPKAQTTVTCTEKGWSPTPRCIR
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pF1KE1 VESTAYCGPPPSINNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPR
:.:. ::::: :.::::::: :.:: : : : :.:: .:.:::: ::: : .::::::
CCDS53 VNSSEKCGPPPPISNGDTTSFLLKVYVPQSRVEYQCQPYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPR
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pF1KE1 CLDPCVVSEENMNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAICQEGK
:. ::...:::::::::.:: :.: : ::::::..::.::. ..: : :.:.:.::
CCDS53 CIHPCIITEENMNKNNIKLKGRSDRKYYAKTGDTIEFMCKLGYNANTSILSFQAVCREGI
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 FEYPICE
::: ::
CCDS53 VEYPRCE
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pF1KE1 VLKFSCRKNLIRVGSDSVQCYQFGWSPNFPTC-KGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEY-
.: .:::. : : .: .: .. :
CCDS30 MLLLINVILTLWVSCANGQVKPCDFPDIKHGGLFHENMRRPYF
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pF1KE1 --GHNEVVEYDCNPNF-IINGP--KKIQCVDGEWTTLPTCVEQVKTCGYIPELEYGYVQP
. .. : :. .: .: :.:... :. :... : :.: :: :: :
CCDS30 PVAVGKYYSYYCDEHFETPSGSYWDYIHCTQNGWSPAVPCLRK---C-YFPYLENGYNQN
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pF1KE1 SVPPYQHGVSVEVNCRNEYAMI-GNNMITCINGIWTELPMCVATHQLKRCKIAGVNIKT-
. .: :.:: :. :.. ... .:: . :. : :. ... :. . ..:..
CCDS30 YGRKFVQGNSTEVACHPGYGLPKAQTTVTCTEKGWSPTPRCI---RVRTCSKSDIEIENG
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 LLKLSGKEFNHNSRIRYRCSDIFRYRHSVCINGKWNPEVDCTEKREQFCPPPPQIPNAQN
... :.. . :..:.:.:. : .:
CCDS30 FISESSSIYILNKEIQYKCK--------------------------------PGYATA--
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pF1KE1 MTTTVNYQDGEKVAVLCKENYLLPEAKEIVCKDGRWQSLPRCVESTAYCGPPPSINNGDT
::.. . :.: .. :.. : :..:. ::::: :.::::
CCDS30 --------DGNS-------------SGSITCLQNGWSAQPICINSSEKCGPPPPISNGDT
190 200 210 220
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pF1KE1 TSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQWSEPPRCLDPCVVSEENMNKNNIQ
::: :.:: : : : :.:: .:.:::: ::: : .:::::::. ::...:::::::::.
CCDS30 TSFLLKVYVPQSRVEYQCQPYYELQGSNYVTCSNGEWSEPPRCIHPCIITEENMNKNNIK
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 LKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAICQEGKFEYPICE
:: :.: : ::::::..::.::. ..: : :.:.:.:: ::: ::
CCDS30 LKGRSDRKYYAKTGDTIEFMCKLGYNANTSILSFQAVCREGIVEYPRCE
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pF1KE1 YNFVSPSKSFWTRITCTEEGWSPTPKCLRMCSFPFVKNGHSESSGLIHLEGDTVQIICNT
:. : . .:. ..: .:.:.. :::
CCDS55 PGFRLVGTSVRICLQDHKWSGQTPVCVPITCGHPG-NPAHGFTNGSEFNLNDVVNFTCNT
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:: ::. . .: : ::.: : : .. : : . :. : ::.. : .
CCDS55 GYLLQGVSRA-QCRSNGQWSSPLPTCRVVN--CSDPGFVENAIRHGQQNFPESFEYGMSI
2770 2780 2790 2800 2810 2820
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pF1KE1 KFSCRKNLIRVGSDSVQCYQFG-WSPNFPTCKGQVRSCGPPPQLSNGEVKEIRKEEYGHN
. :.:.. .::... :. : :. ..: : . ::: : .:. . : . ..
CCDS55 LYHCKKGFYLLGSSALTCMANGLWDRSLPKCLAI--SCGHPGVPANAV---LTGELFTYG
2830 2840 2850 2860 2870
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::.:.: . . .:.. .. :..:. .:: :. .. :: .: . .
CCDS55 AVVHYSCRGSESLIGNDTRVCQEDSHWSGALPHCTGNNPGFCGDPGTPAHGSRLGD--DF
2880 2890 2900 2910 2920 2930
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. .. .:. . . :. ::. :: :. : :.: :. : :. . .. .:
CCDS55 KTKSLLRFSCEMGHQLRGSPERTCLLNGSWSGLQPVCEAVS----CGNPGTPTNGMI-VS
2940 2950 2960 2970 2980 2990
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. . .: . : : . .. :: . :: :. . ::: : : . :.
CCDS55 SDGILFSSSVIYACWEGYKTSGLMTRHCTA-NGTWTGTAPDCTIIS---CGDPGTLANGI
3000 3010 3020 3030 3040
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.. : ... . :. :. .:.. . : : :::::. : : : ... : :: .
CCDS55 QFGTDFTFN--KTVSYQCNPGYVMEAVTSATIRCTKDGRWNPSKPVC--KAVLCPQPPPV
3050 3060 3070 3080 3090 3100
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 NNGDTTSFPLSVYPPGSTVTYRCQSFYKLQGSVTVTCRNKQ-WS-EPPRCLDPCVVSEEN
.:: . . : . ::...: :.. :.:. :. ..:... :. : :.:: : .. .
CCDS55 QNGTVEG---SDFRWGSSISYSCMDGYQLSHSAILSCEGRGVWKGEIPQCL-PVFCGDPG
3110 3120 3130 3140 3150
520 530 540 550 560
pF1KE1 MNKNNIQLKWRNDGKLYAKTGDAVEFQCKFPHKAMISSPPFRAICQ-EGKFE--YPICE
: . : .:: .. .. : :::: : . :: : .:: .: . : :
CCDS55 -----IPAEGRLSGKSFTYKSE-VFFQCKSPFILVGSS---RRVCQADGTWSGIQPTCID
3160 3170 3180 3190 3200 3210
CCDS55 PAHNTCPDPGTPHFGIQNSSRGYEVGSTVFFRCRKGYHIQGSTTRTCLANLTWSGIQTEC
3220 3230 3240 3250 3260 3270
569 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]