Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1990, 567 aa
1>>>pF1KE1990 567 - 567 aa - 567 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5639+/-0.000284; mu= 14.9172+/- 0.018
mean_var=118.6828+/-23.969, 0's: 0 Z-trim(121.0): 170 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.117728
statistics sampled from 36897 (37071) to 36897 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16
Scan time: 11.660
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005265851 (OMIM: 602513) PREDICTED: regulator o ( 567) 3742 646.3 7.7e-185
NP_006471 (OMIM: 602513) regulator of G-protein si ( 566) 3724 643.2 6.4e-184
XP_005265852 (OMIM: 602513) PREDICTED: regulator o ( 467) 3043 527.5 3.6e-149
NP_937870 (OMIM: 602512) regulator of G-protein si ( 799) 711 131.6 9.4e-30
NP_002917 (OMIM: 602512) regulator of G-protein si (1376) 704 130.6 3.2e-29
XP_006713968 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o (1447) 704 130.6 3.4e-29
NP_937872 (OMIM: 602512) regulator of G-protein si (1447) 704 130.6 3.4e-29
XP_016864018 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o (1447) 704 130.6 3.4e-29
XP_016864023 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o ( 509) 694 128.6 4.9e-29
XP_006713969 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o (1157) 687 127.6 2.1e-28
XP_016864021 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o ( 646) 455 88.0 9.8e-17
XP_016864020 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o ( 646) 455 88.0 9.8e-17
XP_006713970 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o ( 646) 455 88.0 9.8e-17
XP_011511845 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o ( 646) 455 88.0 9.8e-17
XP_016864022 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator o ( 646) 455 88.0 9.8e-17
NP_002916 (OMIM: 602856) regulator of G-protein si ( 167) 446 86.1 9.9e-17
NP_001005339 (OMIM: 602856) regulator of G-protein ( 181) 446 86.1 1.1e-16
NP_001273415 (OMIM: 603895) regulator of G-protein ( 283) 341 68.4 3.5e-11
NP_003825 (OMIM: 603895) regulator of G-protein si ( 446) 341 68.6 4.9e-11
NP_001273414 (OMIM: 603895) regulator of G-protein ( 456) 341 68.6 5e-11
NP_899180 (OMIM: 603895) regulator of G-protein si ( 467) 341 68.6 5.1e-11
XP_011521022 (OMIM: 603895) PREDICTED: regulator o ( 478) 341 68.6 5.2e-11
XP_011521021 (OMIM: 603895) PREDICTED: regulator o ( 499) 341 68.6 5.4e-11
NP_001273604 (OMIM: 607193) regulator of G-protein ( 180) 329 66.2 1e-10
XP_011515924 (OMIM: 607193) PREDICTED: regulator o ( 217) 329 66.3 1.2e-10
NP_003693 (OMIM: 607193) regulator of G-protein si ( 241) 329 66.3 1.3e-10
NP_001273602 (OMIM: 607193) regulator of G-protein ( 273) 329 66.4 1.4e-10
XP_005260240 (OMIM: 605071) PREDICTED: regulator o ( 195) 326 65.7 1.5e-10
XP_005260239 (OMIM: 605071) PREDICTED: regulator o ( 195) 326 65.7 1.5e-10
NP_001034556 (OMIM: 605071) regulator of G-protein ( 217) 326 65.8 1.7e-10
NP_005864 (OMIM: 605071) regulator of G-protein si ( 217) 326 65.8 1.7e-10
XP_011526787 (OMIM: 605071) PREDICTED: regulator o ( 217) 326 65.8 1.7e-10
XP_011526788 (OMIM: 605071) PREDICTED: regulator o ( 217) 326 65.8 1.7e-10
NP_733466 (OMIM: 607193) regulator of G-protein si ( 388) 329 66.5 1.8e-10
XP_011526786 (OMIM: 605071) PREDICTED: regulator o ( 246) 326 65.8 1.8e-10
NP_001273603 (OMIM: 607193) regulator of G-protein ( 152) 322 65.0 2e-10
XP_016877311 (OMIM: 603894) PREDICTED: regulator o ( 522) 317 64.5 9.4e-10
XP_011523728 (OMIM: 604067,608415) PREDICTED: regu ( 478) 315 64.2 1.1e-09
NP_001159405 (OMIM: 604067,608415) regulator of G- ( 484) 315 64.2 1.1e-09
NP_570138 (OMIM: 607192) regulator of G-protein si ( 235) 309 62.9 1.3e-09
NP_001075424 (OMIM: 604067,608415) regulator of G- ( 671) 315 64.3 1.4e-09
NP_003826 (OMIM: 604067,608415) regulator of G-pro ( 674) 315 64.3 1.4e-09
NP_036551 (OMIM: 607191) regulator of G-protein si ( 210) 307 62.5 1.5e-09
XP_016857502 (OMIM: 602517) PREDICTED: regulator o ( 385) 310 63.3 1.7e-09
XP_016857497 (OMIM: 602517) PREDICTED: regulator o ( 443) 310 63.3 1.9e-09
XP_016857499 (OMIM: 602517) PREDICTED: regulator o ( 443) 310 63.3 1.9e-09
XP_016857498 (OMIM: 602517) PREDICTED: regulator o ( 443) 310 63.3 1.9e-09
NP_003608 (OMIM: 145500,603276) regulator of G-pro ( 181) 304 62.0 1.9e-09
XP_016857493 (OMIM: 602517) PREDICTED: regulator o ( 452) 310 63.3 1.9e-09
NP_001269707 (OMIM: 602517) regulator of G-protein ( 469) 310 63.3 2e-09
>>XP_005265851 (OMIM: 602513) PREDICTED: regulator of G- (567 aa)
initn: 3742 init1: 3742 opt: 3742 Z-score: 3439.5 bits: 646.3 E(85289): 7.7e-185
Smith-Waterman score: 3742; 100.0% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE1 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
:::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
550 560
>>NP_006471 (OMIM: 602513) regulator of G-protein signal (566 aa)
initn: 2342 init1: 2342 opt: 3724 Z-score: 3423.0 bits: 643.2 E(85289): 6.4e-184
Smith-Waterman score: 3724; 99.8% identity (99.8% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-566)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_006 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQ-ALVLDQDC
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
480 490 500 510 520 530
550 560
pF1KE1 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
:::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
540 550 560
>>XP_005265852 (OMIM: 602513) PREDICTED: regulator of G- (467 aa)
initn: 3043 init1: 3043 opt: 3043 Z-score: 2799.0 bits: 527.5 E(85289): 3.6e-149
Smith-Waterman score: 3043; 100.0% identity (100.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQAWWSC
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
>>NP_937870 (OMIM: 602512) regulator of G-protein signal (799 aa)
initn: 1277 init1: 635 opt: 711 Z-score: 655.2 bits: 131.6 E(85289): 9.4e-30
Smith-Waterman score: 1254; 41.7% identity (65.0% similar) in 611 aa overlap (10-563:13-599)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIH-SLPSGPSSPFPT
: : .. .:::::: :: . . ..::: . :::: :
NP_937 MNLGKELSNETHVSNDQQSATVSDGEL---TGADLKDCVSNNSLSSNASLPSVQSCRR-L
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EEQPVASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQ
.:. :::::.:::::::::.:. ::..::.:::: ::. ::.::: :...:: : ..:.
NP_937 RERRVASWAVSFERLLQDPVGVRYFSDFLRKEFSEENILFWQACEYFNHVPAHDKKELSY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 EARNIYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVK
.::.:...:: :.: .::::: :: :...:: :.::::. ::::::::::::::.::.:
NP_937 RAREIFSKFLCSKATTPVNIDSQAQLADDVLRAPHPDMFKEQQLQIFNLMKFDSYTRFLK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 SPLYRECLLAEAEGRPLRE-------PGSSR-LGSPDATRKKPKLKPGKSLP---LGVEE
::::.::.:::.::: : . :.:.. ::: .. . :: ::: :. ::
NP_937 SPLYQECILAEVEGRALPDSQQVPSSPASKHSLGSDHSSVSTPKKLSGKSKSGRSLN-EE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KE1 LGQLPPVEGPGGRPL---------RKSFRRELGGTANAAL-------RRESQGSLNSSAS
::. . : . :.. .:: : :. :: :::::::..:..:
NP_937 LGDEDSEKKRKGAFFSWSRTRSTGRSQKKREHGDHADDALHANGGLCRRESQGSVSSAGS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 LDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLA
::: ::. : : . ... :.::..:::::. .. .. :..:.:.:.
NP_937 LDL---------SEACR-----TLAPEKDKATKHCCIHLPDGTSCVVAVKAGFSIKDILS
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
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:.::..:.. ..:::.. : ::: :: ..: ....:::.: :.:.:. ..: : .
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390 400 410 420 430 440
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.::::: . :.:.:.. ..::. .... :::.::::: .::. .::.::
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: :: . :..:..: :. : . :. . : : :
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490 500 510 520 530 540
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: . ::.. : : . ::....::. : :::::::::::::::::.:: : :
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.: : : ..:. : : :.:
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pF1KE1 GLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDCTVLADQEVRLENRITFELEL
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NP_937 GFSIKDILSGLCERHGINGAAADLFLVGGD-KPLVLHQDSSILESRDLRLEKRTLFRLDL
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pF1KE1 TALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRPGEKQPLDLGKLVSSVAAQRL
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NP_937 VPINRSVGLKAKPTKPVTEVLRPVVARYGLDLSGLLVRLSGEKEPLDLGAPISSLDGQRV
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pF1KE1 VL------------DTLPGVKI-------SKARDKSPC---RSQGCPPRTQDKATHPPPA
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NP_937 VLEEKDPSRGKASADKQKGVPVKQNTAVNSSSRNHSATGEERTLGKSNSIKIKGENGKNA
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pF1KE1 SPSSLVKVPSSAT--GKRQTCDI-----EGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEF
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NP_937 RDPRLSKREESIAKIGKKKYQKINLDEAEEFFELISKAQSNRADDQRGLLRKEDLVLPEF
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pF1KE1 LQLPAQGPSSEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
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XP_016 AHDKKELSYRAREIFSKFLCSKATTPVNIDSQAQLADDVLRAPHPDMFKEQQLQIFNLMK
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XP_016 QGSVSSAGSLDL---------SEACR-----TLAPEKDKATKHCCIHLPDGTSCVVAVKA
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pF1KE1 GLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDCTVLADQEVRLENRITFELEL
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XP_016 GFSIKDILSGLCERHGINGAAADLFLVGGD-KPLVLHQDSSILESRDLRLEKRTLFRLDL
990 1000 1010 1020 1030
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pF1KE1 TALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRPGEKQPLDLGKLVSSVAAQRL
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XP_016 VPINRSVGLKAKPTKPVTEVLRPVVARYGLDLSGLLVRLSGEKEPLDLGAPISSLDGQRV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KE1 VL------------DTLPGVKI-------SKARDKSPC---RSQGCPPRTQDKATHPPPA
:: : :: . :..:..: :. : . :. . :
XP_016 VLEEKDPSRGKASADKQKGVPVKQNTAVNSSSRNHSATGEERTLGKSNSIKIKGENGKNA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KE1 SPSSLVKVPSSAT--GKRQTCDI-----EGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEF
: : : . ::.. : : . ::....::. : ::::::::::::::::
XP_016 RDPRLSKREESIAKIGKKKYQKINLDEAEEFFELISKAQSNRADDQRGLLRKEDLVLPEF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
540 550 560
pF1KE1 LQLPAQGPSSEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
:.:: :.: : : ..:. : : :.:
XP_016 LRLPPG--STELTLPTPAAVAK--GFSKRSATGNGRESASQPGEQWEPVQESSDSPSTSP
1220 1230 1240 1250 1260 1270
XP_016 GSASSPPGPPGTTPPGQKSPSGPFCTPQSPVSLAQEGTAQIWKRQSQEVEAGGIQTVEDE
1280 1290 1300 1310 1320 1330
>>XP_016864023 (OMIM: 602512) PREDICTED: regulator of G- (509 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]