Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1990, 567 aa
1>>>pF1KE1990 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9173+/-0.000699; mu= 12.8364+/- 0.043
mean_var=117.2068+/-23.215, 0's: 0 Z-trim(113.6): 51 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.118467
statistics sampled from 14186 (14237) to 14186 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.437), width: 16
Scan time: 4.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43405.1 RGS14 gene_id:10636|Hs108|chr5 ( 566) 3724 647.1 1.7e-185
CCDS3368.1 RGS12 gene_id:6002|Hs108|chr4 ( 799) 711 132.2 2.3e-30
CCDS3367.1 RGS12 gene_id:6002|Hs108|chr4 (1376) 704 131.2 8.2e-30
CCDS3366.1 RGS12 gene_id:6002|Hs108|chr4 (1447) 704 131.2 8.6e-30
CCDS41572.1 RGS10 gene_id:6001|Hs108|chr10 ( 167) 446 86.5 2.7e-17
CCDS31294.1 RGS10 gene_id:6001|Hs108|chr10 ( 181) 446 86.6 2.9e-17
CCDS10403.1 RGS11 gene_id:8786|Hs108|chr16 ( 446) 341 68.8 1.5e-11
CCDS66884.1 RGS11 gene_id:8786|Hs108|chr16 ( 456) 341 68.9 1.6e-11
CCDS42088.1 RGS11 gene_id:8786|Hs108|chr16 ( 467) 341 68.9 1.6e-11
CCDS6156.1 RGS20 gene_id:8601|Hs108|chr8 ( 241) 329 66.6 3.9e-11
CCDS69482.1 RGS20 gene_id:8601|Hs108|chr8 ( 273) 329 66.7 4.3e-11
CCDS13555.1 RGS19 gene_id:10287|Hs108|chr20 ( 217) 326 66.1 5.1e-11
CCDS6155.1 RGS20 gene_id:8601|Hs108|chr8 ( 388) 329 66.8 5.7e-11
>>CCDS43405.1 RGS14 gene_id:10636|Hs108|chr5 (566 aa)
initn: 2342 init1: 2342 opt: 3724 Z-score: 3443.9 bits: 647.1 E(32554): 1.7e-185
Smith-Waterman score: 3724; 99.8% identity (99.8% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-566)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RECLLAEAEGRPLREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RKSFRRELGGTANAALRRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS43 GKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQ-ALVLDQDC
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVLDTLPGVKISKARDKSPCRSQGCPPRTQDKATHPPPASP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSLVKVPSSATGKRQTCDIEGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
480 490 500 510 520 530
550 560
pF1KE1 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
540 550 560
>>CCDS3368.1 RGS12 gene_id:6002|Hs108|chr4 (799 aa)
initn: 1277 init1: 635 opt: 711 Z-score: 658.6 bits: 132.2 E(32554): 2.3e-30
Smith-Waterman score: 1254; 41.7% identity (65.0% similar) in 611 aa overlap (10-563:13-599)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIH-SLPSGPSSPFPT
: : .. .:::::: :: . . ..::: . :::: :
CCDS33 MNLGKELSNETHVSNDQQSATVSDGEL---TGADLKDCVSNNSLSSNASLPSVQSCRR-L
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EEQPVASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQ
.:. :::::.:::::::::.:. ::..::.:::: ::. ::.::: :...:: : ..:.
CCDS33 RERRVASWAVSFERLLQDPVGVRYFSDFLRKEFSEENILFWQACEYFNHVPAHDKKELSY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 EARNIYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVK
.::.:...:: :.: .::::: :: :...:: :.::::. ::::::::::::::.::.:
CCDS33 RAREIFSKFLCSKATTPVNIDSQAQLADDVLRAPHPDMFKEQQLQIFNLMKFDSYTRFLK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 SPLYRECLLAEAEGRPLRE-------PGSSR-LGSPDATRKKPKLKPGKSLP---LGVEE
::::.::.:::.::: : . :.:.. ::: .. . :: ::: :. ::
CCDS33 SPLYQECILAEVEGRALPDSQQVPSSPASKHSLGSDHSSVSTPKKLSGKSKSGRSLN-EE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KE1 LGQLPPVEGPGGRPL---------RKSFRRELGGTANAAL-------RRESQGSLNSSAS
::. . : . :.. .:: : :. :: :::::::..:..:
CCDS33 LGDEDSEKKRKGAFFSWSRTRSTGRSQKKREHGDHADDALHANGGLCRRESQGSVSSAGS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 LDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLALARPGLTIRDMLA
::: ::. : : . ... :.::..:::::. .. .. :..:.:.:.
CCDS33 LDL---------SEACR-----TLAPEKDKATKHCCIHLPDGTSCVVAVKAGFSIKDILS
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 GICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDCTVLADQEVRLENRITFELELTALERVVRI
:.::..:.. ..:::.. : ::: :: ..: ....:::.: :.:.:. ..: : .
CCDS33 GLCERHGINGAAADLFLVGGD-KPLVLHQDSSILESRDLRLEKRTLFRLDLVPINRSVGL
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 SAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRPGEKQPLDLGKLVSSVAAQRLVL-------
.::::: . :.:.:.. ..::. .... :::.::::: .::. .::.::
CCDS33 KAKPTKPVTEVLRPVVARYGLDLSGLLVRLSGEKEPLDLGAPISSLDGQRVVLEEKDPSR
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480
pF1KE1 -----DTLPGVKI-------SKARDKSPC---RSQGCPPRTQDKATHPPPASPSSLVKVP
: :: . :..:..: :. : . :. . : : :
CCDS33 GKASADKQKGVPVKQNTAVNSSSRNHSATGEERTLGKSNSIKIKGENGKNARDPRLSKRE
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 SSAT--GKRQTCDI-----EGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEFLQLPAQGPS
: . ::.. : : . ::....::. : :::::::::::::::::.:: : :
CCDS33 ESIAKIGKKKYQKINLDEAEEFFELISKAQSNRADDQRGLLRKEDLVLPEFLRLPP-G-S
530 540 550 560 570
550 560
pF1KE1 SEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
.: : : ..:. : : :.:
CCDS33 TELTLPTPAAVAK--GFSKRSATGNGRESASQPGEQWEPVQESSDSPSTSPGSASSPPGP
580 590 600 610 620 630
>>CCDS3367.1 RGS12 gene_id:6002|Hs108|chr4 (1376 aa)
initn: 1277 init1: 635 opt: 704 Z-score: 648.7 bits: 131.2 E(32554): 8.2e-30
Smith-Waterman score: 1247; 41.9% identity (64.8% similar) in 602 aa overlap (19-563:670-1247)
10 20 30 40
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIH-SLP
:::::: :: . . ..::: . :::
CCDS33 PSQRTSARRSFGRSKRFSITRSLDDLESATVSDGEL---TGADLKDCVSNNSLSSNASLP
640 650 660 670 680 690
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 SGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIP
: : .:. :::::.:::::::::.:. ::..::.:::: ::. ::.::: :...:
CCDS33 SVQSCRR-LRERRVASWAVSFERLLQDPVGVRYFSDFLRKEFSEENILFWQACEYFNHVP
700 710 720 730 740 750
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMK
: : ..:. .::.:...:: :.: .::::: :: :...:: :.::::. ::::::::::
CCDS33 AHDKKELSYRAREIFSKFLCSKATTPVNIDSQAQLADDVLRAPHPDMFKEQQLQIFNLMK
760 770 780 790 800 810
170 180 190 200 210
pF1KE1 FDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRPLRE-------PGSSR-LGSPDATRKKPKLKPGKSL
::::.::.:::::.::.:::.::: : . :.:.. ::: .. . :: :::
CCDS33 FDSYTRFLKSPLYQECILAEVEGRALPDSQQVPSSPASKHSLGSDHSSVSTPKKLSGKS-
820 830 840 850 860 870
220 230 240 250 260
pF1KE1 PLGV---EELGQLPPVEGPGGRPL---------RKSFRRELGGTANAAL-------RRES
: ::::. . : . :.. .:: : :. :: ::::
CCDS33 KSGRSLNEELGDEDSEKKRKGAFFSWSRTRSTGRSQKKREHGDHADDALHANGGLCRRES
880 890 900 910 920 930
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 QGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLALARP
:::..:..:::: ::. : : . ... :.::..:::::. .. ..
CCDS33 QGSVSSAGSLDL---------SEACR-----TLAPEKDKATKHCCIHLPDGTSCVVAVKA
940 950 960 970 980
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 GLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDCTVLADQEVRLENRITFELEL
:..:.:.:.:.::..:.. ..:::.. : ::: :: ..: ....:::.: :.:.:
CCDS33 GFSIKDILSGLCERHGINGAAADLFLVGGD-KPLVLHQDSSILESRDLRLEKRTLFRLDL
990 1000 1010 1020 1030
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 TALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRPGEKQPLDLGKLVSSVAAQRL
. ..: : ..::::: . :.:.:.. ..::. .... :::.::::: .::. .::.
CCDS33 VPINRSVGLKAKPTKPVTEVLRPVVARYGLDLSGLLVRLSGEKEPLDLGAPISSLDGQRV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
450 460 470
pF1KE1 VL------------DTLPGVKI-------SKARDKSPC---RSQGCPPRTQDKATHPPPA
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CCDS33 VLEEKDPSRGKASADKQKGVPVKQNTAVNSSSRNHSATGEERTLGKSNSIKIKGENGKNA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 SPSSLVKVPSSAT--GKRQTCDI-----EGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEF
: : : . ::.. : : . ::....::. : ::::::::::::::::
CCDS33 RDPRLSKREESIAKIGKKKYQKINLDEAEEFFELISKAQSNRADDQRGLLRKEDLVLPEF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
540 550 560
pF1KE1 LQLPAQGPSSEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
:.:: :.: : : ..:. : : :.:
CCDS33 LRLPPG--STELTLPTPAAVAK--GFSKRSATGNGRESASQPGEQWEPVQESSDSPSTSP
1220 1230 1240 1250 1260 1270
CCDS33 GSASSPPGPPGTTPPGQKSPSGPFCTPQSPVSLAQEGTAQIWKRQSQEVEAGGIQTVEDE
1280 1290 1300 1310 1320 1330
>>CCDS3366.1 RGS12 gene_id:6002|Hs108|chr4 (1447 aa)
initn: 1117 init1: 635 opt: 704 Z-score: 648.4 bits: 131.2 E(32554): 8.6e-30
Smith-Waterman score: 1247; 41.9% identity (64.8% similar) in 602 aa overlap (19-563:670-1247)
10 20 30 40
pF1KE1 MPGKPKHLGVPNGRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIH-SLP
:::::: :: . . ..::: . :::
CCDS33 PSQRTSARRSFGRSKRFSITRSLDDLESATVSDGEL---TGADLKDCVSNNSLSSNASLP
640 650 660 670 680 690
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 SGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIP
: : .:. :::::.:::::::::.:. ::..::.:::: ::. ::.::: :...:
CCDS33 SVQSCRR-LRERRVASWAVSFERLLQDPVGVRYFSDFLRKEFSEENILFWQACEYFNHVP
700 710 720 730 740 750
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALSPVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMK
: : ..:. .::.:...:: :.: .::::: :: :...:: :.::::. ::::::::::
CCDS33 AHDKKELSYRAREIFSKFLCSKATTPVNIDSQAQLADDVLRAPHPDMFKEQQLQIFNLMK
760 770 780 790 800 810
170 180 190 200 210
pF1KE1 FDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRPLRE-------PGSSR-LGSPDATRKKPKLKPGKSL
::::.::.:::::.::.:::.::: : . :.:.. ::: .. . :: :::
CCDS33 FDSYTRFLKSPLYQECILAEVEGRALPDSQQVPSSPASKHSLGSDHSSVSTPKKLSGKS-
820 830 840 850 860 870
220 230 240 250 260
pF1KE1 PLGV---EELGQLPPVEGPGGRPL---------RKSFRRELGGTANAAL-------RRES
: ::::. . : . :.. .:: : :. :: ::::
CCDS33 KSGRSLNEELGDEDSEKKRKGAFFSWSRTRSTGRSQKKREHGDHADDALHANGGLCRRES
880 890 900 910 920 930
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 QGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLALARP
:::..:..:::: ::. : : . ... :.::..:::::. .. ..
CCDS33 QGSVSSAGSLDL---------SEACR-----TLAPEKDKATKHCCIHLPDGTSCVVAVKA
940 950 960 970 980
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 GLTIRDMLAGICEKRGLSLPDIKVYLVGNEQKALVLDQDCTVLADQEVRLENRITFELEL
:..:.:.:.:.::..:.. ..:::.. : ::: :: ..: ....:::.: :.:.:
CCDS33 GFSIKDILSGLCERHGINGAAADLFLVGGD-KPLVLHQDSSILESRDLRLEKRTLFRLDL
990 1000 1010 1020 1030
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 TALERVVRISAKPTKRLQEALQPILEKHGLSPLEVVLHRPGEKQPLDLGKLVSSVAAQRL
. ..: : ..::::: . :.:.:.. ..::. .... :::.::::: .::. .::.
CCDS33 VPINRSVGLKAKPTKPVTEVLRPVVARYGLDLSGLLVRLSGEKEPLDLGAPISSLDGQRV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
450 460 470
pF1KE1 VL------------DTLPGVKI-------SKARDKSPC---RSQGCPPRTQDKATHPPPA
:: : :: . :..:..: :. : . :. . :
CCDS33 VLEEKDPSRGKASADKQKGVPVKQNTAVNSSSRNHSATGEERTLGKSNSIKIKGENGKNA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 SPSSLVKVPSSAT--GKRQTCDI-----EGLVELLNRVQSSGAHDQRGLLRKEDLVLPEF
: : : . ::.. : : . ::....::. : ::::::::::::::::
CCDS33 RDPRLSKREESIAKIGKKKYQKINLDEAEEFFELISKAQSNRADDQRGLLRKEDLVLPEF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
540 550 560
pF1KE1 LQLPAQGPSSEETPPQTKSAAQPIGGSLNSTTDSAL
:.:: :.: : : ..:. : : :.:
CCDS33 LRLPPG--STELTLPTPAAVAK--GFSKRSATGNGRESASQPGEQWEPVQESSDSPSTSP
1220 1230 1240 1250 1260 1270
CCDS33 GSASSPPGPPGTTPPGQKSPSGPFCTPQSPVSLAQEGTAQIWKRQSQEVEAGGIQTVEDE
1280 1290 1300 1310 1320 1330
>>CCDS41572.1 RGS10 gene_id:6001|Hs108|chr10 (167 aa)
initn: 411 init1: 227 opt: 446 Z-score: 423.9 bits: 86.5 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 446; 49.0% identity (71.5% similar) in 151 aa overlap (43-193:4-151)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLL
::. .: :: . .:.:: :.: ::
CCDS41 MEHIHD-SDGSSSSSHQSLKSTAKWAASLENLL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 QDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALS
.:: :. : :::::::: ::: :: ::: :... .: :. ..:..::. ::::.: :
CCDS41 EDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKM--QDKTQMQEKAKEIYMTFLSSKASS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 PVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRP
::.. :. :.:..: ::.: ::. : :::::::.:::.::.:: :. . .: : .
CCDS41 QVNVEGQSRLNEKILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKRTEEEEED
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPLRKSFRRELGGTA
:
CCDS41 LPDAQTAAKRASRIYNT
160
>>CCDS31294.1 RGS10 gene_id:6001|Hs108|chr10 (181 aa)
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Smith-Waterman score: 446; 49.0% identity (71.5% similar) in 151 aa overlap (43-193:18-165)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GRMVLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLL
::. .: :: . .:.:: :.: ::
CCDS31 MFNRAVSRLSRKRPPSDIHD-SDGSSSSSHQSLKSTAKWAASLENLL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 QDPLGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALS
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CCDS31 EDPEGVKRFREFLKKEFSEENVLFWLACEDFKKM--QDKTQMQEKAKEIYMTFLSSKASS
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 PVNIDRQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRP
::.. :. :.:..: ::.: ::. : :::::::.:::.::.:: :. . .: : .
CCDS31 QVNVEGQSRLNEKILEEPHPLMFQKLQDQIFNLMKYDSYSRFLKSDLFLKHKRTEEEEED
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPLRKSFRRELGGTA
:
CCDS31 LPDAQTAAKRASRIYNT
170 180
>>CCDS10403.1 RGS11 gene_id:8786|Hs108|chr16 (446 aa)
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Smith-Waterman score: 341; 38.2% identity (61.8% similar) in 191 aa overlap (48-237:264-441)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDPLG
..:. ::. . : :..::..::.::.:
CCDS10 CGQRGPHDPLVSGCLPSNPWISDNDAYWVMNAPTVAAPTKLR-VERWGFSFRELLEDPVG
240 250 260 270 280 290
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALSPVNID
:.: .:: ::::.::..::.:::... ... :.. .:..::. : ::::
CCDS10 RAHFMDFLGKEFSGENLSFWEACEELRYGAQAQVPTLVDA---VYEQFLAPGAAHWVNID
300 310 320 330 340
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 -RQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRPLREP
: : : .:. .. ::.:. ::: ::: ::.:: .:. ::::: : ::.
CCDS10 SRTMEQTLEGLRQPHRYVLDDAQLHIYMLMKKDSYPRFLKSDMYKA-LLAEA-GIPLEM-
350 360 370 380 390 400
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 GSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPLRKSFRRELGGTANAAL
.: : . : . . :: :: . . ::::
CCDS10 --KRRVFPFTWRPRHSSPSPALLPTPVEPTA----ACGPGGGDGVA
410 420 430 440
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 RRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLA
>>CCDS66884.1 RGS11 gene_id:8786|Hs108|chr16 (456 aa)
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Smith-Waterman score: 341; 38.2% identity (61.8% similar) in 191 aa overlap (48-237:274-451)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDPLG
..:. ::. . : :..::..::.::.:
CCDS66 CGQRGPHDPLVSGCLPSNPWISDNDAYWVMNAPTVAAPTKLR-VERWGFSFRELLEDPVG
250 260 270 280 290 300
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALSPVNID
:.: .:: ::::.::..::.:::... ... :.. .:..::. : ::::
CCDS66 RAHFMDFLGKEFSGENLSFWEACEELRYGAQAQVPTLVDA---VYEQFLAPGAAHWVNID
310 320 330 340 350
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 -RQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRPLREP
: : : .:. .. ::.:. ::: ::: ::.:: .:. ::::: : ::.
CCDS66 SRTMEQTLEGLRQPHRYVLDDAQLHIYMLMKKDSYPRFLKSDMYKA-LLAEA-GIPLEM-
360 370 380 390 400 410
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 GSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPLRKSFRRELGGTANAAL
.: : . : . . :: :: . . ::::
CCDS66 --KRRVFPFTWRPRHSSPSPALLPTPVEPTA----ACGPGGGDGVA
420 430 440 450
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 RRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLA
>>CCDS42088.1 RGS11 gene_id:8786|Hs108|chr16 (467 aa)
initn: 313 init1: 167 opt: 341 Z-score: 320.3 bits: 68.9 E(32554): 1.6e-11
Smith-Waterman score: 341; 38.2% identity (61.8% similar) in 191 aa overlap (48-237:285-462)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDPLG
..:. ::. . : :..::..::.::.:
CCDS42 CGQRGPHDPLVSGCLPSNPWISDNDAYWVMNAPTVAAPTKLR-VERWGFSFRELLEDPVG
260 270 280 290 300 310
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALSPVNID
:.: .:: ::::.::..::.:::... ... :.. .:..::. : ::::
CCDS42 RAHFMDFLGKEFSGENLSFWEACEELRYGAQAQVPTLVDA---VYEQFLAPGAAHWVNID
320 330 340 350 360 370
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 -RQAWLGEEVLAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRPLREP
: : : .:. .. ::.:. ::: ::: ::.:: .:. ::::: : ::.
CCDS42 SRTMEQTLEGLRQPHRYVLDDAQLHIYMLMKKDSYPRFLKSDMYKA-LLAEA-GIPLEM-
380 390 400 410 420
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 GSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPLRKSFRRELGGTANAAL
.: : . : . . :: :: . . ::::
CCDS42 --KRRVFPFTWRPRHSSPSPALLPTPVEPTA----ACGPGGGDGVA
430 440 450 460
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 RRESQGSLNSSASLDLGFLAFVSSKSESHRKSLGSTEGESESRPGKYCCVYLPDGTASLA
>>CCDS6156.1 RGS20 gene_id:8601|Hs108|chr8 (241 aa)
initn: 266 init1: 165 opt: 329 Z-score: 313.4 bits: 66.6 E(32554): 3.9e-11
Smith-Waterman score: 329; 38.1% identity (66.7% similar) in 147 aa overlap (46-189:95-236)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 VLAVSDGELSSTTGPQGQGEGRGSSLSIHSLPSGPSSPFPTEEQPVASWALSFERLLQDP
::. :: :: :. : .:: ::..:. :
CCDS61 WCCCCSCSCLTVRNQEDQRPTIASHELRADLPTWEESPAPTLEE-VNAWAQSFDKLMVTP
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LGLAYFTEFLKKEFSAENVTFWKACERFQQIPASDTQQLAQEARNIYQEFLSSQALSPVN
: : :::. ::: ::. :: :::.... .. . . ..:: ::....: ::: .
CCDS61 AGRNAFREFLRTEFSEENMLFWMACEELKK--EANKNIIEEKARIIYEDYIS--ILSPKE
130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 IDRQAWLGEEV---LAEPRPDMFRAQQLQIFNLMKFDSYARFVKSPLYRECLLAEAEGRP
.. .. . : . ..:: .: ::::..::. ::: ::..: .:.. : . .:
CCDS61 VSLDSRVREVINRNMVEPSQHIFDDAQLQIYTLMHRDSYPRFMNSAVYKDLLQSLSEKSI
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LREPGSSRLGSPDATRKKPKLKPGKSLPLGVEELGQLPPVEGPGGRPLRKSFRRELGGTA
CCDS61 EA
240
567 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:10:45 2016 done: Sun Nov 6 21:10:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]