Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1988
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1988, 564 aa
1>>>pF1KE1988 564 - 564 aa - 564 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5295+/-0.00116; mu= -11.0142+/- 0.071
mean_var=572.4475+/-115.555, 0's: 0 Z-trim(116.3): 26 B-trim: 69 in 1/53
Lambda= 0.053605
statistics sampled from 16890 (16913) to 16890 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.52), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1892.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 ( 564) 3905 316.8 4.6e-86
CCDS46313.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 ( 368) 2424 202.0 1e-51
CCDS46314.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 ( 333) 2105 177.3 2.6e-44
CCDS47085.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 ( 488) 1851 157.8 2.7e-38
CCDS47086.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 ( 489) 1792 153.3 6.4e-37
CCDS68733.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 ( 411) 1625 140.3 4.4e-33
CCDS60524.1 ANTXRL gene_id:195977|Hs108|chr10 ( 631) 961 89.1 1.7e-17
>>CCDS1892.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 (564 aa)
initn: 3905 init1: 3905 opt: 3905 Z-score: 1658.7 bits: 316.8 E(32554): 4.6e-86
Smith-Waterman score: 3905; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVKM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 PEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDRVSVMRPQPGDTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDRVSVMRPQPGDTGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 CINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPSAPTPPIPSPPSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 CINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPSAPTPPIPSPPSTL
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE1 PPPPQAPPPNRAPPPSRPPPRPSV
::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PPPPQAPPPNRAPPPSRPPPRPSV
550 560
>>CCDS46313.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 (368 aa)
initn: 2504 init1: 2424 opt: 2424 Z-score: 1041.9 bits: 202.0 E(32554): 1e-51
Smith-Waterman score: 2424; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVKM
::::
CCDS46 ESEENKIK
>>CCDS46314.1 ANTXR1 gene_id:84168|Hs108|chr2 (333 aa)
initn: 2105 init1: 2105 opt: 2105 Z-score: 909.1 bits: 177.3 E(32554): 2.6e-44
Smith-Waterman score: 2105; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGRREDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPAE
::::::::::::::::::
CCDS46 DGLSFISSSVIITTTHCSLHKIASGPTTAACME
310 320 330
>>CCDS47085.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 (488 aa)
initn: 1823 init1: 1443 opt: 1851 Z-score: 800.9 bits: 157.8 E(32554): 2.7e-38
Smith-Waterman score: 1851; 56.3% identity (78.6% similar) in 485 aa overlap (4-487:3-485)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGR-REDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHW
::: .:: . .:. .: :: : . :.: .:::::.::::::: ..:
CCDS47 MVAERSPARSPGSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRRAFDLYFVLDKSGSVANNW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NEIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTY
::: ::.:::..:.::..:.::::::...: .. :: :: .: .:::.:..: : :.::
CCDS47 IEIYNFVQQLAERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLEDLKRVSPVGETY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 MHEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVG
.:::.. :.::: .. : .:.:.:::::::.: . :.:.::. ::.::: :::::
CCDS47 IHEGLKLANEQI--QKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKISRSLGASVYCVG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VKDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQV
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CCDS47 VLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSCTEILELQPSSVCVGEEFQI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VVRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSM
:. : :: . :::.. .:.. : . :: ::. . .:::::::...: ..::.
CCDS47 VLSGRGFMLGSRNGSVLCTYTVNETYTTSVKPVSVQLNSMLCPAPILNKAGETLDVSVSF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NDGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPA
: : : ::.:.:.:.:.::.: :..:.:.:::...:.:::::::: :.::. :::::
CCDS47 NGGKSVISGSLIVTATECSNGIAAIIVILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPPPPA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 EESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVK
.::... :: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::: ::
CCDS47 PAPKEEEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 MPEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDRVSVMRPQPGDTG
.::. : .:: . . :::.::::.:::::.:::. :::::.:::: :: :
CCDS47 IPEETEEPIRPRPPRPKPTHQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDEG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 RCINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPSAPTPPIPSPPST
:::::.::
CCDS47 RCINFSRVPSQ
480
>>CCDS47086.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 (489 aa)
initn: 1762 init1: 1382 opt: 1792 Z-score: 776.3 bits: 153.3 E(32554): 6.4e-37
Smith-Waterman score: 1792; 55.6% identity (77.9% similar) in 480 aa overlap (4-482:3-479)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MATAERRALGIGFQWLSLATLVLICAGQGGR-REDGGPACYGGFDLYFILDKSGSVLHHW
::: .:: . .:. .: :: : . :.: .:::::.::::::: ..:
CCDS47 MVAERSPARSPGSWLFPGLWLLVLSGPGGLLRAQEQPSCRRAFDLYFVLDKSGSVANNW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NEIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLEELQKVLPGGDTY
::: ::.:::..:.::..:.::::::...: .. :: :: .: .:::.:..: : :.::
CCDS47 IEIYNFVQQLAERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLEDLKRVSPVGETY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 MHEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANRSRDLGAIVYCVG
.:::.. :.::: .. : .:.:.:::::::.: . :.:.::. ::.::: :::::
CCDS47 IHEGLKLANEQI--QKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKISRSLGASVYCVG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VKDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAEPSTICAGESFQV
: ::...:: ::::::..::::. :::::.:::.::: .:: ::: .::..:.:: ::.
CCDS47 VLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSCTEILELQPSSVCVGEEFQI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VVRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILKEVGMKAALQVSM
:. : :: . :::.. .:.. : . :: ::. . .:::::::...: ..::.
CCDS47 VLSGRGFMLGSRNGSVLCTYTVNETYTTSVKPVSVQLNSMLCPAPILNKAGETLDVSVSF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NDGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCCTVIIKEVPPPPA
: : : ::.:.:.:.:.::.: :..:.:.:::...:.:::::::: :.::. :::::
CCDS47 NGGKSVISGSLIVTATECSNGIAAIIVILVLLLLLGIGLMWWFWPLCCKVVIKDPPPPPA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 EESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEGAKLEKAKNARVK
.::... :: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::: ::
CCDS47 PAPKEEEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEGARLEKAKNAVVK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 MPEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDRVSVMRPQPGDTG
.::. : .:: . . :::.::::.:::::.:::. :::::.:::: ::
CCDS47 IPEETEEPIRPRPPRPKPTHQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDRVSLMRPQEGDE-
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 RCINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPSAPTPPIPSPPST
::
CCDS47 VCIWECIEKELTA
480
>>CCDS68733.1 ANTXR2 gene_id:118429|Hs108|chr4 (411 aa)
initn: 1627 init1: 1443 opt: 1625 Z-score: 707.4 bits: 140.3 E(32554): 4.4e-33
Smith-Waterman score: 1625; 57.8% identity (80.2% similar) in 410 aa overlap (78-487:1-408)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ILDKSGSVLHHWNEIYYFVEQLAHKFISPQLRMSFIVFSTRGTTLMKLTEDREQIRQGLE
.:.::::::...: .. :: :: .: .:::
CCDS68 MRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLE
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ELQKVLPGGDTYMHEGFERASEQIYYENRQGYRTASVIIALTDGELHEDLFFYSEREANR
.:..: : :.::.:::.. :.::: .. : .:.:.:::::::.: . :.:.::.
CCDS68 DLKRVSPVGETYIHEGLKLANEQI--QKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKI
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 SRDLGAIVYCVGVKDFNETQLARIADSKDHVFPVNDGFQALQGIIHSILKKSCIEILAAE
::.::: :::::: ::...:: ::::::..::::. :::::.:::.::: .:: ::: .
CCDS68 SRSLGASVYCVGVLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSCTEILELQ
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 PSTICAGESFQVVVRGNGFRHARNVDRVLCSFKINDSVTLNEKPFSVEDTYLLCPAPILK
::..:.:: ::.:. : :: . :::.. .:.. : . :: ::. . .:::::::.
CCDS68 PSSVCVGEEFQIVLSGRGFMLGSRNGSVLCTYTVNETYTTSVKPVSVQLNSMLCPAPILN
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EVGMKAALQVSMNDGLSFISSSVIITTTHCSDGSILAIALLILFLLLALALLWWFWPLCC
..: ..::.: : : ::.:.:.:.:.::.: :..:.:.:::...:.::::::::
CCDS68 KAGETLDVSVSFNGGKSVISGSLIVTATECSNGIAAIIVILVLLLLLGIGLMWWFWPLCC
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 TVIIKEVPPPPAEESEEEDDDGLPKKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGEKGSTEEG
:.::. ::::: .::... :: :::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS68 KVVIKDPPPPPAPAPKEEEEEPLPTKKWPTVDASYYGGRGVGGIKRMEVRWGDKGSTEEG
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 AKLEKAKNARVKMPEQEYEFPEPRNLNNNMRRPSSPRKWYSPIKGKLDALWVLLRKGYDR
:.::::::: ::.::. : .:: . . :::.::::.:::::.:::. :::
CCDS68 ARLEKAKNAVVKIPEETEEPIRPRPPRPKPTHQPPQTKWYTPIKGRLDALWALLRRQYDR
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 VSVMRPQPGDTGRCINFTRVKNNQPAKYPLNNAYHTSSPPPAPIYTPPPPAPHCPPPPPS
::.:::: :: ::::::.::
CCDS68 VSLMRPQEGDEGRCINFSRVPSQ
390 400 410
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CCDS60 PSEPNF
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