Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1983
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1983, 559 aa
1>>>pF1KE1983 559 - 559 aa - 559 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0173+/-0.00101; mu= -6.2771+/- 0.061
mean_var=278.9846+/-57.666, 0's: 0 Z-trim(114.3): 17 B-trim: 347 in 1/50
Lambda= 0.076786
statistics sampled from 14853 (14866) to 14853 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 4.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13480.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 559) 3633 415.7 7.6e-116
CCDS56202.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 556) 3399 389.7 4.8e-108
CCDS42895.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 518) 3370 386.5 4.2e-107
CCDS13481.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 ( 448) 1996 234.3 2.5e-61
CCDS75401.1 PHACTR1 gene_id:221692|Hs108|chr6 ( 580) 943 117.7 4e-26
CCDS47492.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 634) 807 102.6 1.5e-21
CCDS47493.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 645) 807 102.6 1.5e-21
CCDS43512.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 554) 793 101.0 3.9e-21
CCDS47494.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 ( 565) 793 101.0 3.9e-21
CCDS41293.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1 ( 702) 732 94.3 5.1e-19
CCDS41294.1 PHACTR4 gene_id:65979|Hs108|chr1 ( 712) 732 94.3 5.2e-19
>>CCDS13480.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (559 aa)
initn: 3633 init1: 3633 opt: 3633 Z-score: 2193.2 bits: 415.7 E(32554): 7.6e-116
Smith-Waterman score: 3633; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAASEDGSGCLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAASEDGSGCLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 IFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYK
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE1 SNEMEVHASSKHLTRFHRP
:::::::::::::::::::
CCDS13 SNEMEVHASSKHLTRFHRP
550
>>CCDS56202.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (556 aa)
initn: 3384 init1: 3384 opt: 3399 Z-score: 2053.2 bits: 389.7 E(32554): 4.8e-108
Smith-Waterman score: 3399; 97.4% identity (98.7% similar) in 540 aa overlap (22-559:17-556)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAASEDGSGCLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENP--DEMDQTPPARPEYLVSGIR
:.: .: ..: :...: :::::::::::::::::::
CCDS56 MRGRGGGRARCPAPLRSLLGAFGARDAAAAARDPAQDEMDQTPPARPEYLVSGIR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TPPVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TPPVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMME
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 QDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DAAKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DAAKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 SEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELED
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 RNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 LTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNE
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE1 YKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
:::::::::::::::::::::
CCDS56 YKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
540 550
>>CCDS42895.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (518 aa)
initn: 3370 init1: 3370 opt: 3370 Z-score: 2036.3 bits: 386.5 E(32554): 4.2e-107
Smith-Waterman score: 3370; 100.0% identity (100.0% similar) in 518 aa overlap (42-559:1-518)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 VSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 GRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGG
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 PRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 ADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTG
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 QATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESEENKENLIINSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESEENKENLIINSE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 LKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQ
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 EIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSK
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 HLTRFHRP
::::::::
CCDS42 HLTRFHRP
>>CCDS13481.1 PHACTR3 gene_id:116154|Hs108|chr20 (448 aa)
initn: 1992 init1: 1992 opt: 1996 Z-score: 1214.6 bits: 234.3 E(32554): 2.5e-61
Smith-Waterman score: 2767; 86.5% identity (86.5% similar) in 518 aa overlap (42-559:1-448)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 VSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 GRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GRIFKPWKWRKKKNEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGG
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 PRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDA-----------
100 110 120 130
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 ADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTG
:
CCDS13 -----------------------------------------------------------G
140
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 QATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPHLTTVHRPLPPSRVIEELHRALATKHRQDSFQ
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESEENKENLIINSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAKESEENKENLIINSE
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 LKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQ
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 EIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDE
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSK
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 HLTRFHRP
::::::::
CCDS13 HLTRFHRP
>>CCDS75401.1 PHACTR1 gene_id:221692|Hs108|chr6 (580 aa)
initn: 1172 init1: 866 opt: 943 Z-score: 582.5 bits: 117.7 E(32554): 4e-26
Smith-Waterman score: 1277; 45.0% identity (67.1% similar) in 578 aa overlap (1-559:47-580)
10 20
pF1KE1 MAAS--EDGSGCLVSRGRSQSDPSVLTDSS
:::: .: . . : ::.:: :...
CCDS75 RLLDVESAQRFFYSQGAQARRATLLLPPTLMAASSEDDIDRRPIRRVRSKSDTPYLAEAR
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 ATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKKNEKL
. . :.: :... : . :: : .:::.:: ::.:.::::::::::::::.::.
CCDS75 ISFNLGAAE---EVERLAAMRSDSLVPGTHTPPIRRRSKFANLGRIFKPWKWRKKKSEKF
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 KQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETL
:.:..:::.:.. ::.::::::.:.: :....:.: . : : ....:
CCDS75 KHTSAALERKISMRQSREELIKRGVLKEIYDKDGELSISNE---------EDSLENGQSL
140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 TSEDAQPGSPLATGTDQVSLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQA
.: .: . : . . : . . : :. . : .: . : :: :
CCDS75 SS--SQLSLPALSEMEPVPMPRDPCSYEVLQPSDIM----DGPDPGAPVKLPC---LPVK
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LAGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPS
: ::: : .. . .: . : . : :... .:: . :. ... ::
CCDS75 L-------SPPLPPKKVMICMP----VGGPDLSLVSYTAQK-SGQQGV--AQHHHTVLPS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 -LRGQLSTPTGSPHL--TTVHRPLPPS--RVIEELHRALATKHRQDSFQGRESKGSPKKR
.. ::. . . :: :: :. :: :.:.::...:: ..: ::. ..:
CCDS75 QIQHQLQYGSHGQHLPSTTGSLPMHPSGCRMIDELNKTLAM-----TMQRLESS---EQR
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KE1 LDVRLSRTSS-VERGKEREEAWSFDGALENKR--TAAKESEENKENLIINSELKDDLLLY
. : :: .. : .: . : : .. :.. : ..::::. .:. .:. ::
CCDS75 VPCSTSYHSSGLHSGDGVTKAGPM-GLPEIRQVPTVVIECDDNKENVPHESDYEDSSCLY
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 -----QDEEALND--SIISGTLPRK-CKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQ
..:: .: :. ...: : :.:. ::.:: :::::.:::..::.::.:::::
CCDS75 TREEEEEEEDEDDDSSLYTSSLAMKVCRKDSLAIKLSNRPSKRELEEKNILPRQTDEERL
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 EIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDE
:.:::: ::..::::::..::::.::::: ::.: ::::.::::.::::::.:::::.:
CCDS75 ELRQQIGTKLTRRLSQRPTAEELEQRNILKPRNEQEEQEEKREIKRRLTRKLSQRPTVEE
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 LRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSK
::.:::::::::::::: :::::::::::::::.:::::::::::::.::.::::: :.
CCDS75 LRERKILIRFSDYVEVADAQDYDRRADKPWTRLTAADKAAIRKELNEFKSTEMEVHELSR
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 HLTRFHRP
::::::::
CCDS75 HLTRFHRP
580
>>CCDS47492.1 PHACTR2 gene_id:9749|Hs108|chr6 (634 aa)
initn: 683 init1: 422 opt: 807 Z-score: 500.5 bits: 102.6 E(32554): 1.5e-21
Smith-Waterman score: 807; 38.9% identity (61.8% similar) in 435 aa overlap (139-559:208-634)
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 IKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLD
:: : :.. : : : . : ...: .
CCDS47 GATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASAS
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSL--------LPTTNELSQALAGADSLDSPPRP
::.. :.: . :.. . .:. : :..::. . . . : .:
CCDS47 PSTSSTSSRPKASK--ETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEP
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 LERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPH
: : .. .: . ..: . : . : . : :. : : . .:
CCDS47 AETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLP-LEDQCITASDTPV
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330
pF1KE1 -LTTVHRPLPPSRV-IEELHRALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKE
:..: :: : . .: : .: ..: : .: ... :.. : ::
CCDS47 VLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGT---GLSVNRENAK-CFTTKEELGKT
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 REEAWSFDGALENKRT-AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISG--TLP
. . :.... .:.:.: ..: .:. .: .::. .: :: .:
CCDS47 VPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALA
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 RKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEEL
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CCDS47 SKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEEL
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 ERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYD
:.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: ::..::::. . :::
CCDS47 EQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-RFNEYVEVTDSPDYD
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520 530 540 550
pF1KE1 RRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
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CCDS47 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
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pF1KE1 IKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPTPKSETLTSEDAQPGSPLATGTDQVSLD
:: : :.. : : : . : ...: .
CCDS47 GATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKTTGSKASAS
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSL--------LPTTNELSQALAGADSLDSPPRP
::.. :.: . :.. . .:. : :..::. . . . : .:
CCDS47 PSTSSTSSRPKASK--ETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLKGEP
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230 240 250 260 270 280
pF1KE1 LERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTGSPH
: : .. .: . ..: . : . : . : :. : : . .:
CCDS47 AETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLP-LEDQCITASDTPV
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330
pF1KE1 -LTTVHRPLPPSRV-IEELHRALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVERGKE
:..: :: : . .: : .: ..: : .: ... :.. : ::
CCDS47 VLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGT---GLSVNRENAK-CFTTKEELGKT
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340 350 360 370 380 390
pF1KE1 REEAWSFDGALENKRT-AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISG--TLP
. . :.... .:.:.: ..: .:. .: .::. .: :: .:
CCDS47 VPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESALA
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400 410 420 430 440 450
pF1KE1 RKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEEL
: .. . ::.:: :::::.::::.::. : ..:::::::::: :: .::::::..:::
CCDS47 SKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEEL
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460 470 480 490 500 510
pF1KE1 ERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQDYD
:.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: ::..::::. . :::
CCDS47 EQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-RFNEYVEVTDSPDYD
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550
pF1KE1 RRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
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CCDS47 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 CLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTPPVRRNSKLA
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CCDS43 MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLS
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70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMMEQDAESKTC-
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CCDS43 TIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNF
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130 140 150 160
pF1KE1 -NPDG-----GPRS------VQSEP-------PTPKSETLTSEDAQPGSPLATGT--DQV
: .: : .: :.:: :: : .:: . :: . : ...
CCDS43 ENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEE-QAEDKKAGSSHSKKTTGSKA
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KE1 SLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSL--------LPTTNELSQALAGADSLDSP
: . ::.. :.: . :.. . .:. : :..::. . . . :
CCDS43 SASPSTSSTSSRPKASK--ETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTSDLK
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSLRGQLSTPTG
.: : : .. .: . ..: . : . : . : :. : : .
CCDS43 GEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLP-LEDQCITASD
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 SPH-LTTVHRPLPPSRV-IEELHRALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVRLSRTSSVER
.: :..: :: : . .: : .: ..: : .: ... :.. :
CCDS43 TPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSG---TGLSVNRENAK-CFTTKEEL
280 290 300 310 320
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pF1KE1 GKEREEAWSFDGALENKRT-AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEALNDSIISG--
:: . . :.... .:.:.: ..: .:. .: .::. .: ::
CCDS43 GKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGES
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 TLPRKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLSKRLSQRPAV
.: : .. . ::.:: :::::.::::.::. : ..:::::::::: :: .::::::..
CCDS43 ALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTT
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 EELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFSDYVEVAKAQ
::::.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: ::..::::. .
CCDS43 EELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-RFNEYVEVTDSP
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550
pF1KE1 DYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
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CCDS43 DYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
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pF1KE1 MAASEDGSGCLVSRGRSQSDPSVLTDSSATSSADAGENPDEMDQTPPARPEYLVSGIRTP
: .: : . : . : .:.. : . ..: .::
CCDS47 MGQTSVSTLSPQPG-SVDGLDKASIANSDGPTAGSQTP
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE1 PVRRNSKLATLGRIFKPWKWRKKK-NEKLKQTTSALEKKMAGRQGREELIKKGLL-EMME
: .:..::.:.:.::::::::::: ..:...:...::.:.. ::.:::::..:.: :. .
CCDS47 PFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKKKTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPD
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pF1KE1 QDAESKTC--NPDG-----GPRS------VQSEP-------PTPKSETLTSEDAQPGSPL
::.. . : .: : .: :.:: :: : .:: . ::
CCDS47 QDGDVTVNFENSNGHMIPIGEESTREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEE-QAEDKKAGSSH
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 ATGT--DQVSLDKPLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSL--------LPTTNELSQAL
. : ...: . ::.. :.: . :.. . .:. : :..::.
CCDS47 SKKTTGSKASASPSTSSTSSRPKASK--ETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDT
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 AGADSLDSPPRPLERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATLFQASSMKSADPSL
. . . : .: : : .. .: . ..: . : . : . : :
CCDS47 TTSGTSDLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLP-L
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 RGQLSTPTGSPH-LTTVHRPLPPSRV-IEELHRALATKHRQDSFQGRESKGSPKKRLDVR
. : : . .: :..: :: : . .: : .: ..: : .: ...
CCDS47 EDQCITASDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGT---GLSVNRENAK
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 LSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRT-AAKESEENKENLIINSELKDDLLLYQDEEAL
:.. : :: . . :.... .:.:.: ..: .:. .: .::.
CCDS47 -CFTTKEELGKTVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDED
340 350 360 370 380
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pF1KE1 NDSIISG--TLPRKCKK-ELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQEIRQQIEMKLS
.: :: .: : .. . ::.:: :::::.::::.::. : ..:::::::::: ::
CCDS47 EDEDGSGESALASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLV
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 KRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDELRDRKILIRFS
.::::::..::::.::::::.:.. ::: . :.:.::.:::. :::: ::. :.:: ::.
CCDS47 RRLSQRPTTEELEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRIL-RFN
450 460 470 480 490 500
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pF1KE1 DYVEVAKAQDYDRRADKPWTRLSAADKAAIRKELNEYKSNEMEVHASSKHLTRFHRP
.::::. . ::::::::::.::. ::::::::::::.::.::::: :...::::::
CCDS47 EYVEVTDSPDYDRRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP
510 520 530 540 550 560
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pF1KE1 IKKGLLEMMEQDAESKTCNPDGGPRSVQSEPPTP---KSETLTSEDAQP---GSPLATGT
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CCDS41 RTLPAAPASTNTTATPSLTHMVPAKQPPIPPPKPAHRNSNPVIAELSQAINSGTLLSKPS
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170 180 190 200 210 220
pF1KE1 DQVSLDK--PLSSAAHLDDAAKMPSASSGEEADAGSLLPTTNELSQALAGADSLDSPPRP
. . : .:. :..:: . . . ..: . .: ... : : :: :
CCDS41 PPLPPKRGIPSTSVPTLESAAAITTKTPSDEREK-----STCSMGSELLPMISPRSPSPP
300 310 320 330 340
230 240 250 260 270
pF1KE1 LERSVGQLPSPPLLPTPPPKASSKTTKNVTGQATL------FQASSMKSADPSLRGQLST
: . : :: : : : . ... .. .: : ..:. : . :.
CCDS41 LPTHIP--PEPPRTP-PFPAKTFQVVPEIEFPPSLDLHQEIPQQEDQKKEVP--KRILDQ
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310
pF1KE1 PTGSPHLTT------VH--------RPLPPSRVIEELHRALATKHRQ-DSFQGRESKGSP
: ::. . .: ::: . ..: ::: . .. :::. ..:.
CCDS41 NFGEPHIPSRLPPLPLHIRIQQALTSPLPMTPILEGSHRAHSLLFENSDSFS-EDSSTLG
410 420 430 440 450 460
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pF1KE1 KKR---LDVRLSRTSSVERGKEREEAWSFDGALENKRTAAK-----ESEENKENLIINSE
. : . ... .. . :. .:. .:. . . : . ::.::. .:.
CCDS41 RTRSLPITIEMLKVPDDEEEEEQTCPSTFSEEMTPTSVIPKLPQCLREEEEKES---DSD
470 480 490 500 510
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pF1KE1 LKDDLLLYQDEEALNDSIISGTLPRKCKKELLAVKLRNRPSKQELEDRNIFPRRTDEERQ
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CCDS41 -SEGPIQYRDEEDEDESYQSALANKVKRKDTLAMKLNHRPSEPEL-NLNSWPCKSKEEWN
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 EIRQQIEMKLSKRLSQRPAVEELERRNILKQRNDQTEQEERREIKQRLTRKLNQRPTVDE
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CCDS41 EIRHQIGNTLIRRLSQRPTPEELEQRNILQPKNEADRQAEKREIKRRLTRKLSQRPTVAE
580 590 600 610 620 630
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CCDS41 LLARKIL-RFNEYVEVTDAQDYDRRADKPWTKLTPADKAAIRKELNEFKSSEMEVHEESK
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:.::.:::
CCDS41 HFTRYHRP
700
559 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 13:01:41 2016 done: Sun Nov 6 13:01:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]