Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1964
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1964, 528 aa
1>>>pF1KE1964 528 - 528 aa - 528 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2471+/-0.000876; mu= 1.2292+/- 0.053
mean_var=222.1466+/-46.805, 0's: 0 Z-trim(114.9): 149 B-trim: 371 in 1/53
Lambda= 0.086051
statistics sampled from 15247 (15409) to 15247 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.473), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6429.1 PPP1R16A gene_id:84988|Hs108|chr8 ( 528) 3572 456.1 4.6e-128
CCDS13309.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 ( 567) 1503 199.3 1e-50
CCDS54462.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 ( 525) 944 129.8 7.4e-30
CCDS53458.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 ( 515) 710 100.8 4e-21
CCDS53459.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 ( 386) 703 99.8 5.9e-21
CCDS1426.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 ( 982) 710 101.0 6.8e-21
CCDS81416.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (1043) 710 101.0 7.1e-21
CCDS12916.1 PPP1R12C gene_id:54776|Hs108|chr19 ( 782) 702 99.9 1.1e-20
CCDS58259.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 974) 653 93.9 9.1e-19
CCDS58260.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 995) 653 93.9 9.2e-19
CCDS44947.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 (1030) 653 93.9 9.5e-19
CCDS44948.1 PPP1R12A gene_id:4659|Hs108|chr12 ( 943) 509 76.0 2.1e-13
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 511 76.5 3.1e-13
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 509 76.2 3.6e-13
>>CCDS6429.1 PPP1R16A gene_id:84988|Hs108|chr8 (528 aa)
initn: 3572 init1: 3572 opt: 3572 Z-score: 2412.7 bits: 456.1 E(32554): 4.6e-128
Smith-Waterman score: 3572; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMWAQAEKEAQGKKGPGERPRKEAAS
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CCDS64 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMWAQAEKEAQGKKGPGERPRKEAAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFREMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFREMV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCDDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGADLHAPLDHGATLLHVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGADLHAPLDHGATLLHVAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSLMDET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSLMDET
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRSLLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLTQRTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRSLLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLTQRTDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDDRQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRVGGSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDDRQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRVGGSPV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RHLYSKRLDRSVSYQLSPLDSTTPHTLVHDKAHHTLADLKRQRAAAKLQRPPPEGPESPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RHLYSKRLDRSVSYQLSPLDSTTPHTLVHDKAHHTLADLKRQRAAAKLQRPPPEGPESPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE1 TAEPGLPGDTVTPQPDCGFRAGGDPPLLKLTAPAVEAPVERRPCCLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TAEPGLPGDTVTPQPDCGFRAGGDPPLLKLTAPAVEAPVERRPCCLLM
490 500 510 520
>>CCDS13309.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 (567 aa)
initn: 1799 init1: 1295 opt: 1503 Z-score: 1024.1 bits: 199.3 E(32554): 1e-50
Smith-Waterman score: 1586; 48.4% identity (68.9% similar) in 560 aa overlap (1-516:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMWAQAEKEAQGKKGPGERPRKEAAS
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CCDS13 MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKR---ST
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFREMV
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CCDS13 GGRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCDDE
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CCDS13 KLLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGADLHAPLDHGATLLHVAA
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CCDS13 PTLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATLLHIAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSLMDET
:::. .:: :::.: . ...:: ::::::::::.:::. ..::::.:::.:.:.. :::
CCDS13 ANGYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWGQMQMAELLVSHGASLSARTSMDEM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRSLLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLTQRTDL
:.:.: .:: .. :::::::::.....: :..: : :::::::::::::::.::..::.:
CCDS13 PIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE1 YRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDD---RQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRVGG
:::.. :::.::. . . : : .: : . : :. ..: .. ..
CCDS13 YRKEYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE1 S----PVRH-------LYSKRL------------DRSVSYQLSP--LDSTTPHTLVHDKA
. ::.. :. : : :..: .: :.: : . ....
CCDS13 GELDMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYG-NPGVADATPPWSSYKEQS
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE1 HHTLADLKRQRAAAKLQRPP-----------PEGPESPETAEPGLPGDTVTPQPDCGFRA
.:: .:::::::::: : : : : : : : ..: . : .
CCDS13 PQTLLELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAP-LIGGRTSPYSSNGTSV
480 490 500 510 520 530
510 520
pF1KE1 -----GGDPPLLKLTAPAVEAPVERRPCCLLM
.:::::::. :: :
CCDS13 YYTVTSGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
540 550 560
>>CCDS54462.1 PPP1R16B gene_id:26051|Hs108|chr20 (525 aa)
initn: 1330 init1: 718 opt: 944 Z-score: 649.5 bits: 129.8 E(32554): 7.4e-30
Smith-Waterman score: 1314; 43.4% identity (62.2% similar) in 569 aa overlap (1-525:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMWAQAEKEAQGKKGPGERPRKEAAS
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CCDS54 MASHVDLLTELQLLEKVPTLERLRAAQKRRAQQLKKWAQYEQDLQHRKRKHERKR---ST
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFREMV
: :.: : ::.::::. ::: :::: :: . ::::: ::::::::::::::.:.:.:
CCDS54 GGRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNEDGLTALHQCCIDNFEEIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCDDE
. :: :::.:: :.: ::::::::::::..::..:. ::.:::::.:::::::::.::
CCDS54 KLLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADLLAVNSDGNMPYDLCEDE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGADLHAPLDHGATLLHVAA
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CCDS54 PTLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIHCMIAAGQDLDWIDAQGATLMQMA-
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSLMDET
::::.:::.:.:.. :::
CCDS54 -----------------------------------------ELLVSHGASLSARTSMDEM
240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRSLLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLTQRTDL
:.:.: .:: .. :::::::::.....: :..: : :::::::::::::::.::..::.:
CCDS54 PIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLSRRTSSAGSRGKVVRRASLSDRTNL
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KE1 YRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDD---RQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRVGG
:::.. :::.::. . . : : .: : . : :. ..: .. ..
CCDS54 YRKEYEGEAILWQRSAAEDQRTSTYNGDIRETRTDQENKDPNPRLEKPVLLSEFPTKIPR
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450
pF1KE1 S----PVRH-------LYSKRL------------DRSVSYQLSP--LDSTTPHTLVHDKA
. ::.. :. : : :..: .: :.: : . ....
CCDS54 GELDMPVENGLRAPVSAYQYALANGDVWKVHEVPDYSMAYG-NPGVADATPPWSSYKEQS
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KE1 HHTLADLKRQRAAAKLQRPP-----------PEGPESPETAEPGLPGDTVTPQPDCGFRA
.:: .:::::::::: : : : : : : : ..: . : .
CCDS54 PQTLLELKRQRAAAKLLSHPFLSTHLGSSMARTGESSSEGKAP-LIGGRTSPYSSNGTSV
440 450 460 470 480 490
510 520
pF1KE1 -----GGDPPLLKLTAPAVEAPVERRPCCLLM
.:::::::. :: : . . ::
CCDS54 YYTVTSGDPPLLKFKAPIEEMEEKVHGCCRIS
500 510 520
>>CCDS53458.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (515 aa)
initn: 590 init1: 320 opt: 710 Z-score: 492.6 bits: 100.8 E(32554): 4e-21
Smith-Waterman score: 710; 33.0% identity (62.7% similar) in 418 aa overlap (8-420:1-399)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMW--AQAEKEAQGKKGPGERPRKEA
.::. .: .: . :. :::.:.. : . .:.: ..: :..: .
CCDS53 MAELEHLG----GKRAESARMRRAEQLRRWRGSLTEQEPAERRGAGRQPLTRR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 ASQGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFRE
.: .: : ..:.: : . .: .:::..:. :.. . .: :::::::: :::. .
CCDS53 GS----PRVRFEDGAVFLAACSSGDTDEVRKLLARGADINTVNVDGLTALHQACIDENLD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 MVQQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCD
::. :.: ::.: :.: ::::::::.::.:...: .: ::.. ::..:..: :: .
CCDS53 MVKFLVENRANVNQQDNEGWTPLHAAASCGYLNIAEYFINHGASVGIVNSEGEVPSDLAE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DEQTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGA--DLHAPLDHGATLL
. : : . .:. ..: .: : .::.: :. :..: :.. ::: :
CCDS53 EPAMKDLLLEQVKKQGV---DLEQSRKEEEQQMLQDARQWLNSGKIEDVRQA-RSGATAL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 HVAAANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSL
:::::.:.::. ::.. :...: ::: ::::::.:: .:. :.. ..
CCDS53 HVAAAKGYSEVLRLLIQAGYELNVQDYDGWTPLHAAAHWGVKEACSILAEALCDMDIRNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 MDETPLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRS-LLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLT
. .::.:: .:: . .. ::: .:.. .::.... :. :.. .: . : . ..
CCDS53 LGQTPFDV-ADEGL-VEHLELLQKKQNVLRSEKETRNKLIESDLNSKIQSGFFKNKEKML
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 QRTDLYRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDDRQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRV
. . ..:. .: .. .: : : .:. ..: . . .::. :..
CCDS53 YEEETPKSQEMEEEN--KESSSSSSEEEEGEDE---ASESETEKEADKKPEAFVNHSNSE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 GGSPVRHLYSKRLDRSVSYQLSPLDSTTPHTLVHDKAHHTLADLKRQRAAAKLQRPPPEG
. : .
CCDS53 SKSSITEQIPAPAQNTFSASSARRFSSGLFNKPEEPKDESPSSWRLGLRKTGSHNMLSEV
400 410 420 430 440 450
>>CCDS53459.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (386 aa)
initn: 590 init1: 320 opt: 703 Z-score: 489.7 bits: 99.8 E(32554): 5.9e-21
Smith-Waterman score: 703; 34.5% identity (64.2% similar) in 386 aa overlap (8-388:1-370)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMW--AQAEKEAQGKKGPGERPRKEA
.::. .: .: . :. :::.:.. : . .:.: ..: :..: .
CCDS53 MAELEHLG----GKRAESARMRRAEQLRRWRGSLTEQEPAERRGAGRQPLTRR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 ASQGLLKQVLFPPSVVLLEAAARNDLEEVRQFLGSGVSPDLANEDGLTALHQCCIDDFRE
.: .: : ..:.: : . .: .:::..:. :.. . .: :::::::: :::. .
CCDS53 GSP----RVRFEDGAVFLAACSSGDTDEVRKLLARGADINTVNVDGLTALHQACIDENLD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 MVQQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCD
::. :.: ::.: :.: ::::::::.::.:...: .: ::.. ::..:..: :: .
CCDS53 MVKFLVENRANVNQQDNEGWTPLHAAASCGYLNIAEYFINHGASVGIVNSEGEVPSDLAE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DEQTLDCLETAMADRGITQDSIEAARAVPELRMLDDIRSRLQAGA--DLHAPLDHGATLL
. : : . .:. ..: .: : .::.: :. :..: :.. . ::: :
CCDS53 EPAMKDLLLEQVKKQGV---DLEQSRKEEEQQMLQDARQWLNSGKIEDVRQARS-GATAL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 HVAAANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSL
:::::.:.::. ::.. :...: ::: ::::::.:: .:. :.. ..
CCDS53 HVAAAKGYSEVLRLLIQAGYELNVQDYDGWTPLHAAAHWGVKEACSILAEALCDMDIRNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 MDETPLDVCGDEEVRAKLLELKHKHDALLRAQSRQRS-LLRRRTSSAGSRGKVVRRVSLT
. .::.:: .:: . .. ::: .:.. .::.... :. :.. .: . : . ..
CCDS53 LGQTPFDV-ADEGL-VEHLELLQKKQNVLRSEKETRNKLIESDLNSKIQSGFFKNKEKML
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 QRTDLYRKQHAQEAIVWQQPPPTSPEPPEDNDDRQTGAELRPPPPEEDNPEVVRPHNGRV
. . ..:. .: .. .: : : .:.
CCDS53 YEEETPKSQEMEEEN--KESSSSSSEEEEGEDEASESETEKEAVLFWPF
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 GGSPVRHLYSKRLDRSVSYQLSPLDSTTPHTLVHDKAHHTLADLKRQRAAAKLQRPPPEG
>>CCDS1426.1 PPP1R12B gene_id:4660|Hs108|chr1 (982 aa)
initn: 590 init1: 320 opt: 710 Z-score: 488.6 bits: 101.0 E(32554): 6.8e-21
Smith-Waterman score: 710; 33.0% identity (62.7% similar) in 418 aa overlap (8-420:1-399)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAEHLELLAEMPMVGRMSTQERLKHAQKRRAQQVKMW--AQAEKEAQGKKGPGERPRKEA
.::. .: .: . :. :::.:.. : . .:.: ..: :..: .
CCDS14 MAELEHLG----GKRAESARMRRAEQLRRWRGSLTEQEPAERRGAGRQPLTRR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
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.: .: : ..:.: : . .: .:::..:. :.. . .: :::::::: :::. .
CCDS14 GS----PRVRFEDGAVFLAACSSGDTDEVRKLLARGADINTVNVDGLTALHQACIDENLD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
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::. :.: ::.: :.: ::::::::.::.:...: .: ::.. ::..:..: :: .
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110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
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. : : . .:. ..: .: : .::.: :. :..: :.. ::: :
CCDS14 EPAMKDLLLEQVKKQGV---DLEQSRKEEEQQMLQDARQWLNSGKIEDVRQA-RSGATAL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 HVAAANGFSEAAALLLEHRASLSAKDQDGWEPLHAAAYWGQVPLVELLVAHGADLNAKSL
:::::.:.::. ::.. :...: ::: ::::::.:: .:. :.. ..
CCDS14 HVAAAKGYSEVLRLLIQAGYELNVQDYDGWTPLHAAAHWGVKEACSILAEALCDMDIRNK
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. .::.:: .:: . .. ::: .:.. .::.... :. :.. .: . : . ..
CCDS14 LGQTPFDV-ADEGL-VEHLELLQKKQNVLRSEKETRNKLIESDLNSKIQSGFFKNKEKML
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. . ..:. .: .. .: : : .:. ..: . . .::. :..
CCDS14 YEEETPKSQEMEEEN--KESSSSSSEEEEGEDE---ASESETEKEADKKPEAFVNHSNSE
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. : .
CCDS14 SKSSITEQIPAPAQNTFSASSARRFSSGLFNKPEEPKDESPSSWRLGLRKTGSHNMLSEV
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Smith-Waterman score: 710; 33.0% identity (62.7% similar) in 418 aa overlap (8-420:1-399)
10 20 30 40 50
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.::. .: .: . :. :::.:.. : . .:.: ..: :..: .
CCDS81 MAELEHLG----GKRAESARMRRAEQLRRWRGSLTEQEPAERRGAGRQPLTRR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
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.: .: : ..:.: : . .: .:::..:. :.. . .: :::::::: :::. .
CCDS81 GS----PRVRFEDGAVFLAACSSGDTDEVRKLLARGADINTVNVDGLTALHQACIDENLD
50 60 70 80 90 100
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pF1KE1 MVQQLLEAGANINACDSECWTPLHAAATCGHLHLVELLIASGANLLAVNTDGNMPYDLCD
::. :.: ::.: :.: ::::::::.::.:...: .: ::.. ::..:..: :: .
CCDS81 MVKFLVENRANVNQQDNEGWTPLHAAASCGYLNIAEYFINHGASVGIVNSEGEVPSDLAE
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. : : . .:. ..: .: : .::.: :. :..: :.. ::: :
CCDS81 EPAMKDLLLEQVKKQGV---DLEQSRKEEEQQMLQDARQWLNSGKIEDVRQA-RSGATAL
170 180 190 200 210 220
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:::::.:.::. ::.. :...: ::: ::::::.:: .:. :.. ..
CCDS81 HVAAAKGYSEVLRLLIQAGYELNVQDYDGWTPLHAAAHWGVKEACSILAEALCDMDIRNK
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. .::.:: .:: . .. ::: .:.. .::.... :. :.. .: . : . ..
CCDS81 LGQTPFDV-ADEGL-VEHLELLQKKQNVLRSEKETRNKLIESDLNSKIQSGFFKNKEKML
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. . ..:. .: .. .: : : .:. ..: . . .::. :..
CCDS81 YEEETPKSQEMEEEN--KESSSSSSEEEEGEDE---ASESETEKEADKKPEAFVNHSNSE
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. : .
CCDS81 SKSSITEQIPAPAQNTFSASSARRFSSGLFNKPEEPKDESPSSWRLGLRKTGSHNMLSEV
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10 20 30 40 50 60
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. : : .. .: : : .::.:.: .: :. ..: : .: :
CCDS12 ----RTVRFERAAEFLAACAGGDLDEARLMLRAADPGPGAELDPAAPPPARAVLDSTNAD
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.: . ::. ::::::.:. :. :::. . .: ::: ::::::.:: .
CCDS12 MPEARHPRTGASALHVAAAKGYIEVMRLLLQAGYDPELRDGDGWTPLHAAAHWGVEDACR
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::. ::. ... . . : :. .:::: . : :: .:.. : : : .. : : . .:
CCDS12 LLAEHGGGMDSLTHAGQRPCDL-ADEEVLSLLEELARKQEDL-RNQ-KEASQSRGQEPQA
280 290 300 310 320 330
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CCDS12 PSSSK--HRRSSVCRLSSREKISLQDLSKERRPGGAGGPPIQDEDEGEEGPT-EPPPAEP
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pF1KE1 EEDNPEVVRPHNGRVGGSPVRHL---YSKR---LDRSVSYQLSPLDSTT----PHTLVHD
. : :: . :::. .:.: : . : :.: . : : . ..
CCDS12 RTLNGVSSPPHPS--PKSPVQLEEAPFSRRFGLLKTGSSGALGPPERRTAEGAPGAGLQR
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.: . : . : .: : : : ::. ::.. .... : : : ...::
CCDS12 SASSSWLEGTSTQAKELRLARITPT-P-SPKLPEPSVLSEVTKP-PPC--LENSSPPS--
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pF1KE1 LTAPAVEAPVERRPCCLLM
: :.:..
CCDS12 -RIPEPESPAKPNVPTASTAPPADSRDRRRSYQMPVRDEESESQRKARSRLMRQSRRSTQ
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10 20 30 40 50 60
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. :.: ::::: :.: : ::::::.::.: ..:.::..::.. :::..:. : :. ..:
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. :.. . .:. .::::: : :: : :. :..: :. :: :.: ::
CCDS58 AMEELLQNEVNRQGV---DIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHA--KSGGTALH
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CCDS58 VAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEMVNKV
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.: .:: .::.. . : ::..:.. : . ..: : . :.:. .. ... ...
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. .. : : . : : .:. ::: :. .: : : .:.:.. : :
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::: : . ::
CCDS58 DESPATWRLGLRKTGSYGALAEITASKEGQKEKDTAGVTRSASSPRLSSSLDNKEKEKDS
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. :.: ::::: :.: : ::::::.::.: ..:.::..::.. :::..:. : :. ..:
CCDS58 KFLVENGANINQPDNEGWIPLHAAASCGYLDIAEFLIGQGAHVGAVNSEGDTPLDIAEEE
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. :.. . .:. .::::: : :: : :. :..: :. :: :.: ::
CCDS58 AMEELLQNEVNRQGV---DIEAARKEEERIMLRDARQWLNSGHINDVRHA--KSGGTALH
150 160 170 180 190 200
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CCDS58 VAAAKGYTEVLKLLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEMVNKV
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CCDS58 DESPATWRLGLRKTGSYGALAEITASKEGQKEKDTAGVTRSASSPRLSSSLDNKEKEKDS
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528 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]