Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1958
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1958, 514 aa
1>>>pF1KE1958 514 - 514 aa - 514 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4767+/-0.000771; mu= 17.5071+/- 0.046
mean_var=70.9713+/-14.389, 0's: 0 Z-trim(108.8): 19 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.152241
statistics sampled from 10423 (10430) to 10423 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 3.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4623.1 PRSS16 gene_id:10279|Hs108|chr6 ( 514) 3439 764.5 0
CCDS7030.1 DPP7 gene_id:29952|Hs108|chr9 ( 492) 624 146.2 8.2e-35
CCDS8262.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 ( 496) 410 99.2 1.2e-20
CCDS41695.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 ( 517) 391 95.0 2.2e-19
>>CCDS4623.1 PRSS16 gene_id:10279|Hs108|chr6 (514 aa)
initn: 3439 init1: 3439 opt: 3439 Z-score: 4079.7 bits: 764.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3439; 100.0% identity (100.0% similar) in 514 aa overlap (1-514:1-514)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAVWLAQWLGPLLLVSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGLSLGPGAAALPKVG
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CCDS46 MAVWLAQWLGPLLLVSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGLSLGPGAAALPKVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 WLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AWGALVISLEHRFYGLSIPAGGLEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AWGALVISLEHRFYGLSIPAGGLEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLEC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELLGALQALVGGVVQYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELLGALQALVGGVVQYDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QTGAPLSVRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLGQKCLSFSRAETVAQLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QTGAPLSVRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLGQKCLSFSRAETVAQLRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSALSVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSALSVAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPER
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE1 PSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV
490 500 510
>>CCDS7030.1 DPP7 gene_id:29952|Hs108|chr9 (492 aa)
initn: 499 init1: 184 opt: 624 Z-score: 738.5 bits: 146.2 E(32554): 8.2e-35
Smith-Waterman score: 624; 30.5% identity (57.3% similar) in 485 aa overlap (45-509:14-480)
20 30 40 50 60
pF1KE1 VSLWGLLAPASLLRRLGEHIQQFQESSAQGLGL-SLGPGAAALPKVGWLE----QLLDPF
::: .: :: : :. : : :: :
CCDS70 MGSAPWAPVLLLALGLRGLQAGARRAPDPGFQERFFQQRLDHF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NVS--DRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAPAWGALVI
: ..: ::. :.:. :: .::::.. :.::.. . . : :: :::..
CCDS70 NFERFGNKTFPQRFLVSDRFWVRGEGPIFFYTGNEGDVWAFANNSAFVAELAAERGALLV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SLEHRFYGLSIPAGG--LEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWICFGGS
:::.:: :.: :. . .. ..:. . :::: . :: : .. ....: : ::::
CCDS70 FAEHRYYGKSLPFGAQSTQRGHTELLTVEQALADFAELLRALRRDLG-AQDAPAIAFGGS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 YAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSLECRAAVS
:.: :.:. :.:.:::. ...:.:::: :: ... :. :.. . : : .: .:
CCDS70 YGGMLSAYLRMKYPHLVAGALAASAPVLAVAGLGDSNQFF-RDVTADFEGQSPKCTQGVR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELL----GALQALVGGVVQYDGQ
:: ... . .: : ..: :...: ::. .. ..:. .:. .:. : .
CCDS70 EAFRQIKDLFLQG--AYDTVRWEFGTCQPLSDEKDLTQLFMFARNAFTVLAMMDYPYPTD
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE1 TGAPLS---VRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLG-QKCLSFSRAETVAQ
.:: :. : :: :.. ::: . .: .. : ..: .. :
CCDS70 FLGPLPANPVKVGCDRLL------SEAQRITGLRALAGLVYNASGSEHCYDIYR----LY
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LRSTEPQLSGVGD--RQWLYQTCTEFGFYVTCENPRCPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSA
..: :.: : : ::.:::... . .: : .:: : .: . :..
CCDS70 HSCADPTGCGTGPDARAWDYQACTEINLTFASNNVTDMFPDLPFT----DELRQRYCLDT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LSV-AQAVAQTNSYYGGQTPGANKVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCL
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CCDS70 WGVWPRPDWLLTSFWGGDLRAASNIIFSNGNLDPWAGGGIRRNLSASVIAVTIQGGAHHL
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KE1 DMAPERPSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV
:. .: : :. .:. . :.: :.. :
CCDS70 DLRASHPEDPASVVEARKLEATIIGEWVKAARREQQPALRGGPRLSL
450 460 470 480 490
>>CCDS8262.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 (496 aa)
initn: 416 init1: 191 opt: 410 Z-score: 484.4 bits: 99.2 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 521; 27.5% identity (53.9% similar) in 512 aa overlap (12-503:8-486)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAVWLAQWLGPLLLVSL---WGLLAPASLLRRLGE-HIQQFQESSAQGLGLSLGPGAAAL
:::.:. :. .: :: :: :. .. .: :..:
CCDS82 MGRRALLLLLLSFLAPWATIALRPALRALGSLHLP----TNPTSL-----PAVAKN
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PKVGWLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGPIFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPA
.: ...: .: :. . ..: ::: : :..: . : :... :.::.. :
CCDS82 YSVLYFQQKVDHFGFNTVKTFNQRYLVADKYWKKNGGSILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMW
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ALAPAWGALVISLEHRFYGLSIPAGG---LEMAQLRFLSSRLALADVVSARLALSRLFNI
.: :... :::.:: :.: : . .: ::.:. :::: . :.: .
CCDS82 DVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGDNSFKDSRHLNFLTSEQALADFAELIKHLKRTIPG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SSSSPWICFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAPVRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTA
. ..: : .::::.: :::: :.:.::.. ...:.:::. :. . : ....:
CCDS82 AENQPVIAIGGSYGGMLAAWFRMKYPHMVVGALAASAPIWQFEDLVPCG--VFMKIVTTD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 IGGSL-ECRAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELSACGPLGRAENQAELLGALQALV
. : .: .. .. ..: : . :.. : : :.:: . : .. :
CCDS82 FRKSGPHCSESIHRSWDAINR-LSNTGSGLQWLTGALHLCSPLTSQDIQHLKDWISETWV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 G-GVVQYDGQTG--APLS---VRQLCGLLLGGGGNRSHSTPYCGLRRAVQIVLHSLGQ-K
. ..:.: .. :: .. .: : . : : : .. .:... . :: :
CCDS82 NLAMVDYPYASNFLQPLPAWPIKVVCQYL--KNPNVSDSLLLQNIFQALNVYYNYSGQVK
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 CLSFSRAETVAQLRSTEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGFYVTCENPR----CPFSQLPALP
::..:.. : :..: : ::.::: . : : : : :
CCDS82 CLNISETAT-----------SSLGTLGWSYQACTEV-VMPFCTNGVDDMFEPHSW--NLK
350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 SQLDLCEQVFGLSALSVAQAVAQTNSYYGGQTPGAN-KVLFVNGDTDPWHVLSVTQALGS
: : : .: : . ...:::.. ... ...: ::. ::: .::. . .
CCDS82 ELSDDCFQQWG-----VRPRPSWITTMYGGKNISSHTNIVFSNGELDPWSGGGVTKDITD
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KE1 SESTLLIRTGSHCLDMAPERPSDSPSLRLGRQNIFQQLQTWLKLAKESQIKGEV
. .. : :.: ::. . : :. :.:. .....:..
CCDS82 TLVAVTISEGAHHLDLRTKNALDPMSVLLARSLEVRHMKNWIRDFYDSAGKQH
450 460 470 480 490
>>CCDS41695.1 PRCP gene_id:5547|Hs108|chr11 (517 aa)
initn: 416 init1: 191 opt: 391 Z-score: 461.6 bits: 95.0 E(32554): 2.2e-19
Smith-Waterman score: 502; 27.7% identity (54.3% similar) in 455 aa overlap (65-503:77-507)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 QQFQESSAQGLGLSLGPGAAALPKVGWLEQLLDPFNVSDRRSFLQRYWVNDQHWVGQDGP
:.: :. . ..: ::: : :..: . :
CCDS41 NYSVLYFQQKALAAGQLHICIIQLNHYKTPLVDHFGFNTVKTFNQRYLVADKYWKKNGGS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 IFLHLGGEGSLGPGSVMRGHPAALAPAWGALVISLEHRFYGLSIPAGG---LEMAQLRFL
:... :.::.. : .: :... :::.:: :.: : . .: ::
CCDS41 ILFYTGNEGDIIWFCNNTGFMWDVAEELKAMLVFAEHRYYGESLPFGDNSFKDSRHLNFL
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 SSRLALADVVSARLALSRLFNISSSSPWICFGGSYAGSLAAWARLKFPHLIFASVASSAP
.:. :::: . :.: . . ..: : .::::.: :::: :.:.::.. ...:.:::
CCDS41 TSEQALADFAELIKHLKRTIPGAENQPVIAIGGSYGGMLAAWFRMKYPHMVVGALAASAP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VRAVLDFSEYNDVVSRSLMSTAIGGSL-ECRAAVSVAFAEVERRLRSGGAAQAALRTELS
. :. . : ....: . : .: .. .. ..: : . :.. : :
CCDS41 IWQFEDLVPCG--VFMKIVTTDFRKSGPHCSESIHRSWDAINR-LSNTGSGLQWLTGALH
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE1 ACGPLGRAENQAELLGALQALVG-GVVQYDGQTG--APLS---VRQLCGLLLGGGGNRSH
:.:: . : .. :. ..:.: .. :: .. .: : . : :
CCDS41 LCSPLTSQDIQHLKDWISETWVNLAMVDYPYASNFLQPLPAWPIKVVCQYL--KNPNVSD
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 STPYCGLRRAVQIVLHSLGQ-KCLSFSRAETVAQLRSTEPQLSGVGDRQWLYQTCTEFGF
: .. .:... . :: :::..:.. : :..: : ::.:::
CCDS41 SLLLQNIFQALNVYYNYSGQVKCLNISETAT-----------SSLGTLGWSYQACTEV-V
350 360 370 380
390 400 410 420 430
pF1KE1 YVTCENPR----CPFSQLPALPSQLDLCEQVFGLSALSVAQAVAQTNSYYGGQTPGAN-K
. : : : : : : : : .: : . ...:::.. ... .
CCDS41 MPFCTNGVDDMFEPHSW--NLKELSDDCFQQWG-----VRPRPSWITTMYGGKNISSHTN
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 VLFVNGDTDPWHVLSVTQALGSSESTLLIRTGSHCLDMAPERPSDSPSLRLGRQNIFQQL
..: ::. ::: .::. . .. .. : :.: ::. . : :. :.:. ...
CCDS41 IVFSNGELDPWSGGGVTKDITDTLVAVTISEGAHHLDLRTKNALDPMSVLLARSLEVRHM
450 460 470 480 490 500
500 510
pF1KE1 QTWLKLAKESQIKGEV
..:..
CCDS41 KNWIRDFYDSAGKQH
510
514 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:19:30 2016 done: Sun Nov 6 21:19:31 2016
Total Scan time: 3.600 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]