Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1943
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1943, 498 aa
1>>>pF1KE1943 498 - 498 aa - 498 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0538+/-0.00093; mu= 13.7601+/- 0.055
mean_var=72.7378+/-14.059, 0's: 0 Z-trim(105.5): 93 B-trim: 86 in 1/50
Lambda= 0.150381
statistics sampled from 8383 (8478) to 8383 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6722.1 CDC14B gene_id:8555|Hs108|chr9 ( 498) 3357 737.9 6.1e-213
CCDS6721.1 CDC14B gene_id:8555|Hs108|chr9 ( 459) 3067 674.9 4.9e-194
CCDS43853.1 CDC14B gene_id:8555|Hs108|chr9 ( 461) 2993 658.9 3.4e-189
CCDS769.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 ( 594) 1812 402.7 5.8e-112
CCDS770.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 ( 623) 1812 402.7 6e-112
CCDS771.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 ( 383) 1716 381.8 7.2e-106
CCDS81353.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 ( 565) 1594 355.4 9.5e-98
>>CCDS6722.1 CDC14B gene_id:8555|Hs108|chr9 (498 aa)
initn: 3357 init1: 3357 opt: 3357 Z-score: 3936.4 bits: 737.9 E(32554): 6.1e-213
Smith-Waterman score: 3357; 100.0% identity (100.0% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKRKSERRSSWAAAPPCSRRCSSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MKRKSERRSSWAAAPPCSRRCSSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LYSRPKSASNVHYFSIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LYSRPKSASNVHYFSIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRILIFGETSYIPFRDAAYGSCNFYITLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRILIFGETSYIPFRDAAYGSCNFYITLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DCFHAVKKAMQYGFLNFNSFNLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DCFHAVKKAMQYGFLNFNSFNLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQHSPETYIQYFKNHNVTTIIRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HQHSPETYIQYFKNHNVTTIIRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DICENAEGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DICENAEGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VMKQTNLWLEGDYFRQKLKGQENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEPEPYSDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VMKQTNLWLEGDYFRQKLKGQENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEPEPYSDDD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 EINGVTQGDRLRALKSRRQSKTNAIPLTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRTTRSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EINGVTQGDRLRALKSRRQSKTNAIPLTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRTTRSAS
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE1 RKSSVKSLSISRTKTVLR
::::::::::::::::::
CCDS67 RKSSVKSLSISRTKTVLR
490
>>CCDS6721.1 CDC14B gene_id:8555|Hs108|chr9 (459 aa)
initn: 3119 init1: 3067 opt: 3067 Z-score: 3597.0 bits: 674.9 E(32554): 4.9e-194
Smith-Waterman score: 3067; 99.8% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (1-449:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKRKSERRSSWAAAPPCSRRCSSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MKRKSERRSSWAAAPPCSRRCSSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LYSRPKSASNVHYFSIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LYSRPKSASNVHYFSIDNELEYENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRILIFGETSYIPFRDAAYGSCNFYITLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FTGSDQRKQANAAFLVGCYMVIYLGRTPEEAYRILIFGETSYIPFRDAAYGSCNFYITLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DCFHAVKKAMQYGFLNFNSFNLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DCFHAVKKAMQYGFLNFNSFNLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQHSPETYIQYFKNHNVTTIIRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HQHSPETYIQYFKNHNVTTIIRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DICENAEGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DICENAEGAIAVHCKAGLGRTGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VMKQTNLWLEGDYFRQKLKGQENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEPEPYSDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VMKQTNLWLEGDYFRQKLKGQENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEPEPYSDDD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 EINGVTQGDRLRALKSRRQSKTNAIPLTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRTTRSAS
::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS67 EINGVTQGDRLRALKSRRQSKTNAIPLTLSISRTKTVLR
430 440 450
>>CCDS43853.1 CDC14B gene_id:8555|Hs108|chr9 (461 aa)
initn: 2993 init1: 2993 opt: 2993 Z-score: 3510.2 bits: 658.9 E(32554): 3.4e-189
Smith-Waterman score: 2993; 99.8% identity (99.8% similar) in 447 aa overlap (52-498:15-461)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 SSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAILYSRPKSASNVHYFSIDNELE
: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSREGAGAALVAEVIKDRLCFAILYSRPKSASNVHYFSIDNELE
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMV
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 IYLGRTPEEAYRILIFGETSYIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IYLGRTPEEAYRILIFGETSYIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSFN
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGYHQHSPETYIQYFKNHNVTTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGYHQHSPETYIQYFKNHNVTTII
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 RLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGRT
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 GTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFLVMKQTNLWLEGDYFRQKLKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFLVMKQTNLWLEGDYFRQKLKGQ
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 ENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEPEPYSDDDEINGVTQGDRLRALKSRRQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEPEPYSDDDEINGVTQGDRLRALKSRRQSK
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490
pF1KE1 TNAIPLTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRTTRSASRKSSVKSLSISRTKTVLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TNAIPLTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRTTRSASRKSSVKSLSISRTKTVLR
410 420 430 440 450 460
>>CCDS769.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 (594 aa)
initn: 1849 init1: 1147 opt: 1812 Z-score: 2123.6 bits: 402.7 E(32554): 5.8e-112
Smith-Waterman score: 1835; 57.8% identity (81.9% similar) in 474 aa overlap (52-497:15-485)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 SSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAILYSRPKSASNVHYFSIDNELE
. ::: :: : .::::. :.::::::.::
CCDS76 MAAESGELIGACEFMKDRLYFATLRNRPKSTVNTHYFSIDEELV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMV
::::::::::::::::::::::.:::::: .. ::::::.: ::::.::::::.: : :
CCDS76 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKLNKKLKSYSLSRKKIVHYTCFDQRKRANAAFLIGAYAV
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 IYLGRTPEEAYRILIFGETS-YIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSF
::: .::::::: :. : . :.:::::..:.:.. .:.:::.....:..:.::..:..:
CCDS76 IYLKKTPEEAYRALLSGSNPPYLPFRDASFGNCTYNLTILDCLQGIRKGLQHGFFDFETF
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 NLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGYHQHSPETYIQYFKNHNVTTI
..:::::::..::::.:::.: .:.:: ::: ....:.:: :.::.:. :::.::::..
CCDS76 DVDEYEHYERVENGDFNWIVPGKFLAFSGPHPKSKIENGYPLHAPEAYFPYFKKHNVTAV
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 IRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGR
.::::..:.:::::::::.:.:::: :::::.: ::..::.::::.::::::::::::::
CCDS76 VRLNKKIYEAKRFTDAGFEHYDLFFIDGSTPSDNIVRRFLNICENTEGAIAVHCKAGLGR
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 TGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFLVMKQTNLWLEGDYFRQKLKG
::::::::.:::::.: :: :::.:::::::.:::::.:: ::..::..:: ::.:::.
CCDS76 TGTLIACYVMKHYRFTHAEIIAWIRICRPGSIIGPQQHFLEEKQASLWVQGDIFRSKLKN
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430
pF1KE1 QENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEP---EPYSDDDEI---NGVTQGDRLRAL
. ... ....:.:::.::.::.: .. :. : .::.. ::.::::.::::
CCDS76 RPSSE--GSINKILSGLDDMSIGGNLSKTQNMERFGEDNLEDDDVEMKNGITQGDKLRAL
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470
pF1KE1 KSRRQSKTN---------------AI--P--LTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRT
::.:: .:. :. : :. ::.:. . :::. .: :: .::
CCDS76 KSQRQPRTSPSCAFRSDDTKGHPRAVSQPFRLSSSLQGSAVTLKTSKMALSPSA-TAKRI
410 420 430 440 450 460
480 490
pF1KE1 TRSA-SRKSSVKSLSI-SRTKTVLR
.:.. : ..:.:.:: :: . :
CCDS76 NRTSLSSGATVRSFSINSRLASSLGNLNAATDDPENKKTSSSSKAGFTASPFTNLLNGSS
470 480 490 500 510 520
>>CCDS770.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 (623 aa)
initn: 1849 init1: 1147 opt: 1812 Z-score: 2123.3 bits: 402.7 E(32554): 6e-112
Smith-Waterman score: 1835; 57.8% identity (81.9% similar) in 474 aa overlap (52-497:15-485)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 SSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAILYSRPKSASNVHYFSIDNELE
. ::: :: : .::::. :.::::::.::
CCDS77 MAAESGELIGACEFMKDRLYFATLRNRPKSTVNTHYFSIDEELV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMV
::::::::::::::::::::::.:::::: .. ::::::.: ::::.::::::.: : :
CCDS77 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKLNKKLKSYSLSRKKIVHYTCFDQRKRANAAFLIGAYAV
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 IYLGRTPEEAYRILIFGETS-YIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSF
::: .::::::: :. : . :.:::::..:.:.. .:.:::.....:..:.::..:..:
CCDS77 IYLKKTPEEAYRALLSGSNPPYLPFRDASFGNCTYNLTILDCLQGIRKGLQHGFFDFETF
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 NLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGYHQHSPETYIQYFKNHNVTTI
..:::::::..::::.:::.: .:.:: ::: ....:.:: :.::.:. :::.::::..
CCDS77 DVDEYEHYERVENGDFNWIVPGKFLAFSGPHPKSKIENGYPLHAPEAYFPYFKKHNVTAV
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 IRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGR
.::::..:.:::::::::.:.:::: :::::.: ::..::.::::.::::::::::::::
CCDS77 VRLNKKIYEAKRFTDAGFEHYDLFFIDGSTPSDNIVRRFLNICENTEGAIAVHCKAGLGR
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 TGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFLVMKQTNLWLEGDYFRQKLKG
::::::::.:::::.: :: :::.:::::::.:::::.:: ::..::..:: ::.:::.
CCDS77 TGTLIACYVMKHYRFTHAEIIAWIRICRPGSIIGPQQHFLEEKQASLWVQGDIFRSKLKN
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430
pF1KE1 QENGQHRAAFSKLLSGVDDISINGVENQDQQEP---EPYSDDDEI---NGVTQGDRLRAL
. ... ....:.:::.::.::.: .. :. : .::.. ::.::::.::::
CCDS77 RPSSE--GSINKILSGLDDMSIGGNLSKTQNMERFGEDNLEDDDVEMKNGITQGDKLRAL
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470
pF1KE1 KSRRQSKTN---------------AI--P--LTVILQSSVQSCKTSEPNISGSAGITKRT
::.:: .:. :. : :. ::.:. . :::. .: :: .::
CCDS77 KSQRQPRTSPSCAFRSDDTKGHPRAVSQPFRLSSSLQGSAVTLKTSKMALSPSA-TAKRI
410 420 430 440 450 460
480 490
pF1KE1 TRSA-SRKSSVKSLSI-SRTKTVLR
.:.. : ..:.:.:: :: . :
CCDS77 NRTSLSSGATVRSFSINSRLASSLGNLNAATDDPENKKTSSSSKAGFTASPFTNLLNGSS
470 480 490 500 510 520
>>CCDS771.1 CDC14A gene_id:8556|Hs108|chr1 (383 aa)
initn: 1693 init1: 1137 opt: 1716 Z-score: 2014.2 bits: 381.8 E(32554): 7.2e-106
Smith-Waterman score: 1716; 64.7% identity (89.4% similar) in 360 aa overlap (52-410:15-372)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 SSTSPGVKKIRSSTQQDPRRRDPQDDVYLDITDRLCFAILYSRPKSASNVHYFSIDNELE
. ::: :: : .::::. :.::::::.::
CCDS77 MAAESGELIGACEFMKDRLYFATLRNRPKSTVNTHYFSIDEELV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKINKKLKSITMLRKKIVHFTGSDQRKQANAAFLVGCYMV
::::::::::::::::::::::.:::::: .. ::::::.: ::::.::::::.: : :
CCDS77 YENFYADFGPLNLAMVYRYCCKLNKKLKSYSLSRKKIVHYTCFDQRKRANAAFLIGAYAV
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 IYLGRTPEEAYRILIFGETS-YIPFRDAAYGSCNFYITLLDCFHAVKKAMQYGFLNFNSF
::: .::::::: :. : . :.:::::..:.:.. .:.:::.....:..:.::..:..:
CCDS77 IYLKKTPEEAYRALLSGSNPPYLPFRDASFGNCTYNLTILDCLQGIRKGLQHGFFDFETF
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 NLDEYEHYEKAENGDLNWIIPDRFIAFCGPHSRARLESGYHQHSPETYIQYFKNHNVTTI
..:::::::..::::.:::.: .:.:: ::: ....:.:: :.::.:. :::.::::..
CCDS77 DVDEYEHYERVENGDFNWIVPGKFLAFSGPHPKSKIENGYPLHAPEAYFPYFKKHNVTAV
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 IRLNKRMYDAKRFTDAGFDHHDLFFADGSTPTDAIVKEFLDICENAEGAIAVHCKAGLGR
.::::..:.:::::::::.:.:::: :::::.: ::..::.::::.::::::::::::::
CCDS77 VRLNKKIYEAKRFTDAGFEHYDLFFIDGSTPSDNIVRRFLNICENTEGAIAVHCKAGLGR
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 TGTLIACYIMKHYRMTAAETIAWVRICRPGSVIGPQQQFLVMKQTNLWLEGDYFRQKLKG
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