Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1926, 464 aa
1>>>pF1KE1926 464 - 464 aa - 464 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5849+/-0.00116; mu= 16.0935+/- 0.069
mean_var=68.2741+/-13.456, 0's: 0 Z-trim(102.2): 52 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.155219
statistics sampled from 6808 (6859) to 6808 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 3037 689.6 1.8e-198
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 881 206.8 3.3e-53
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 827 194.7 1.4e-49
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 827 194.7 1.4e-49
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 827 194.7 1.5e-49
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 811 191.1 1.7e-48
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 781 184.4 1.8e-46
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 774 182.8 5.5e-46
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 764 180.6 2.6e-45
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 736 174.3 2e-43
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 731 173.2 4.6e-43
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 720 170.7 2.4e-42
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 707 167.8 1.9e-41
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 707 167.8 1.9e-41
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 703 166.9 3.4e-41
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 703 166.9 3.4e-41
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 670 159.5 5.8e-39
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 670 159.5 6.1e-39
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 647 154.4 2.1e-37
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 646 154.2 2.5e-37
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 640 152.8 6.1e-37
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 632 151.0 2.2e-36
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 627 149.9 4.5e-36
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 624 149.2 6.7e-36
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 615 147.2 2.9e-35
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 615 147.2 3e-35
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 611 146.3 5.9e-35
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 610 146.1 6.5e-35
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 610 146.1 7.7e-35
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 585 140.5 3.4e-33
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 576 138.5 1.3e-32
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 569 136.9 3.5e-32
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 548 132.2 1e-30
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 518 125.4 6.6e-29
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 520 125.9 7.7e-29
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 502 121.8 9.1e-28
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 498 121.0 2.3e-27
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 479 116.7 3.7e-26
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 474 115.6 7.4e-26
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 462 112.9 6.2e-25
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 452 110.7 3e-24
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 427 105.0 7.3e-23
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 419 103.3 5e-22
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 410 101.3 2e-21
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 345 86.8 5.7e-17
>>CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 (464 aa)
initn: 3037 init1: 3037 opt: 3037 Z-score: 3676.7 bits: 689.6 E(32554): 1.8e-198
Smith-Waterman score: 3037; 100.0% identity (100.0% similar) in 464 aa overlap (1-464:1-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MYSNVIGTVTSGKRKVYLLSLLLIGFWDCVTCHGSPVDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MYSNVIGTVTSGKRKVYLLSLLLIGFWDCVTCHGSPVDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 MTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAIN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE1 VIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
430 440 450 460
>>CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 (379 aa)
initn: 821 init1: 319 opt: 881 Z-score: 1068.8 bits: 206.8 E(32554): 3.3e-53
Smith-Waterman score: 881; 39.3% identity (70.3% similar) in 387 aa overlap (82-461:3-379)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 MCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLS
.::.::.::: .. :... : :::.:
CCDS44 MEQLSSANTRFALDLFLALSEN-NPAGNIFIS
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 PLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSK
:.:::.:.::. ::. ..: :: ..:.:.:. : .: : .:: . ... :
CCDS44 PFSISSAMAMVFLGTRGNTAAQLSKTFHFNTVEE-----VHSRFQSLNADINKRGA-SYI
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRIT
: ::::.:.:. .: . .. .::: : .::.. .:..: .::.::...:::.:
CCDS44 LKLANRLYGEKTYNFLPEFLVSTQKTYGADLASVDFQHASEDARKTINQWVKGQTEGKIP
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFR
... : ....: :::::.::::: ::.:: : : . : . ...::::. ::
CCDS44 ELLASGMVDNMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTNAPFRLNKKDRKTVKMMYQKKKFA
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340
pF1KE1 YRRVAE-GTQVLELPFKGDDITMVLILP---KPEKS-LAKVEKELTPEVLQEWL--DELE
: . . .:::::..:....::..:: . :.. : :.:..:: : :.:: ..:.
CCDS44 YGYIEDLKCRVLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLKKIEEQLTLEKLHEWTKPENLD
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 EMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAF
. . : .:::..:....:. .: .:. :::. :. : :. : :...: ::.:
CCDS44 FIEVNVSLPRFKLEESYTLNSDLARLGVQDLFNSSKADLSGM--SGARDIFISKIVHKSF
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 LEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
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CCDS44 VEVNEEGTEAAAATAGIATFCMLMPEE-NFTADHPFLFFIRHNSSGSILFLGRFSSP
330 340 350 360 370
>>CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (376 aa)
initn: 677 init1: 343 opt: 827 Z-score: 1003.5 bits: 194.7 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 827; 37.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (83-461:4-376)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSP
:..::. :: .. . :. :... :.:.::
CCDS44 MDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKL
.:.: :.::. .:: ..: :. ....:. : .: :: : .: .. :.. . :
CCDS44 MSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQSLLTEV-NKTGTQYLL
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITD
::::::.:: : ...: . : :... ::: .:.:: :: ::..::::.:..
CCDS44 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
.. ... :: :::::..::.: : .:. :::...:: . .: ..::.... :.
CCDS44 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340
pF1KE1 RRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEW--LDELEEMMLV
..: ::.: ::. : ...:...:: .: :::::: : . :: :: ..: .
CCDS44 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNE
: .:::..:...... :...:..: : :. . :. .. :: .: . ::.:.::::
CCDS44 VSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGM---SQTDLSLSKVVHKSFVEVNE
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 EGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
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CCDS44 EGTEAAAATAAIMMMRCARFVPR---FCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
330 340 350 360 370
>>CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (380 aa)
initn: 677 init1: 343 opt: 827 Z-score: 1003.4 bits: 194.7 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 827; 37.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (83-461:8-380)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSP
:..::. :: .. . :. :... :.:.::
CCDS75 MSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKL
.:.: :.::. .:: ..: :. ....:. : .: :: : .: .. :.. . :
CCDS75 MSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQSLLTEV-NKTGTQYLL
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITD
::::::.:: : ...: . : :... ::: .:.:: :: ::..::::.:..
CCDS75 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
.. ... :: :::::..::.: : .:. :::...:: . .: ..::.... :.
CCDS75 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KE1 RRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEW--LDELEEMMLV
..: ::.: ::. : ...:...:: .: :::::: : . :: :: ..: .
CCDS75 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNE
: .:::..:...... :...:..: : :. . :. .. :: .: . ::.:.::::
CCDS75 VSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGM---SQTDLSLSKVVHKSFVEVNE
280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 EGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
::.::::.::... : . : : :..::: ::.. : :.: :: ..:
CCDS75 EGTEAAAATAAIMMMRCARFVPR---FCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
330 340 350 360 370 380
>>CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (395 aa)
initn: 677 init1: 343 opt: 827 Z-score: 1003.1 bits: 194.7 E(32554): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 827; 37.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (83-461:23-395)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSP
:..::. :: .. . :. :... :.:.::
CCDS75 MSSRQRGNFNYKLAFKSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKL
.:.: :.::. .:: ..: :. ....:. : .: :: : .: .. :.. . :
CCDS75 MSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQSLLTEV-NKTGTQYLL
60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITD
::::::.:: : ...: . : :... ::: .:.:: :: ::..::::.:..
CCDS75 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
.. ... :: :::::..::.: : .:. :::...:: . .: ..::.... :.
CCDS75 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
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CCDS75 EGTEAAAATAAIMMMRCARFVPR---FCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
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CCDS11 PMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL----YKDGD-IHRGFQSLLSEVNRTGTQYL-
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CCDS11 LRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKIS
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CCDS11 EVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYTRGMLF-KTNEEKKTVQMMFKEAKFK
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CCDS11 EEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPR---FCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
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CCDS44 VSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSLN-----TEEDIHRAFQSLLTEV-NKAGTQYLL
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CCDS44 RTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELSFIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEE
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CCDS44 AHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELSTVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVE
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CCDS44 VLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADLSAMSAE--RDLCLSKFVHKSFVEVNE
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CCDS44 EGTEAAAASSCFVVAECCMESGPRFCADHPFLFFIRHNRANSILFCGRFSSP
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..:
CCDS11 SSP
390
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..:
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CCDS11 GKIKNVIGEGGISSSAVMVLVNAVYFKGKWQSAFTKSETINCHFKSPKCSGKAVAMMHQE
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