Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1925
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1925, 462 aa
1>>>pF1KE1925 462 - 462 aa - 462 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4640+/-0.000949; mu= 10.6453+/- 0.058
mean_var=237.5905+/-62.163, 0's: 0 Z-trim(113.4): 226 B-trim: 1556 in 2/50
Lambda= 0.083207
statistics sampled from 13761 (14084) to 13761 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 3099 385.0 8.9e-107
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 1308 170.0 4.7e-42
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 948 126.8 4.7e-29
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 706 97.7 2.6e-20
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 624 87.9 2.4e-17
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 567 81.0 2.7e-15
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 553 79.4 9.7e-15
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 535 77.1 3.5e-14
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 524 75.7 8.3e-14
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 524 75.8 9.6e-14
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 524 75.9 1e-13
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 524 75.9 1e-13
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 524 75.9 1e-13
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 522 75.6 1.2e-13
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 514 74.8 2.6e-13
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 491 71.9 1.5e-12
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 490 71.7 1.5e-12
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 477 70.1 4.3e-12
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 468 69.0 9.2e-12
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 469 69.3 1e-11
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 462 68.4 1.6e-11
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 456 67.6 2.5e-11
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 455 67.5 2.7e-11
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 455 67.5 2.9e-11
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 448 66.7 5.4e-11
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 448 66.7 5.5e-11
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 448 66.8 5.7e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 443 66.1 7.9e-11
>>CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 (462 aa)
initn: 3099 init1: 3099 opt: 3099 Z-score: 2030.4 bits: 385.0 E(32554): 8.9e-107
Smith-Waterman score: 3099; 100.0% identity (100.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRTLSEKRAPVGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPPPADVEPDESSAAAERRRRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TRTLSEKRAPVGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPPPADVEPDESSAAAERRRRRGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASSRSVEFFLSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASSRSVEFFLSRR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVPGPLFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVPGPLFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE1 FFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
430 440 450 460
>>CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 1463 init1: 768 opt: 1308 Z-score: 868.5 bits: 170.0 E(32554): 4.7e-42
Smith-Waterman score: 1515; 53.6% identity (73.0% similar) in 474 aa overlap (1-458:8-462)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAG
.: ..: .. :: ::: : .. :: : :. : :: ..
CCDS75 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAG-NASWNGTEAPGGGARAT------P---YSLQVTLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LAAVVGFLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANEL
:. ..:.:...:: :::::.:::.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::.
CCDS75 LVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 MAYWYFGQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIV
:.:::::..:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::.:: :.
CCDS75 MGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 AVWLISAVISFPPLVSLYRQPDGA----AYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLV
.::.::::::::::.:. .. :. : :.: .::. ::..:::::::::::::: ::
CCDS75 TVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 YARIYRVAKLRTRTLSEKRAP---VGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPP-PADVE-
:.:::..:: :::. .:.: ..: :.. :::: .:: .: : : :....
CCDS75 YVRIYQIAKRRTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE1 -PDESSAAAERRRRRGALRRGG-----RRRAGAEGGAGGADGQG-AGPGAAESGALTASR
: : . :. : :.... .: : . : :.: : . .. : :
CCDS75 APGEPAPAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 SPGPGGRLSRASSRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFP
.:: : . :.. . : : :..: : . : ::::::::::::.::::.::::
CCDS75 GPGATGIGTPAAGPGEE----RVGAAKAS--RWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFP
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 FFFSYSLYGICREACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRR
:::.:.: .. .:.:: :::::::.:::::::::::::.::.::::.::.:: : :
CCDS75 FFFTYTLTAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDR
410 420 430 440 450 460
460
pF1KE1 RGFRQ
.
CCDS75 KRIV
>>CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 (450 aa)
initn: 1391 init1: 727 opt: 948 Z-score: 635.1 bits: 126.8 E(32554): 4.7e-29
Smith-Waterman score: 1377; 54.5% identity (71.8% similar) in 444 aa overlap (46-454:7-443)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 AGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGFLIVFTVVGNVLVVIA
::. :.:..::.. :::.::. ::.::..:
CCDS56 MDHQDPYSVQATAAIAAAITFLILFTIFGNALVILA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 VLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFGQVWCGVYLALDVLFC
:::::.:::::::::::::.::::::::..::::::::..:::: ..:: ::::::::::
CCDS56 VLTSRSLRAPQNLFLVSLAAADILVATLIIPFSLANELLGYWYFRRTWCEVYLALDVLFC
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 TSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISAVISFPPLVSLYRQ-P
::::::::::::::::.:..:.::: ::::::.: :..::::.::::.:::. : :
CCDS56 TSSIVHLCAISLDRYWAVSRALEYNSKRTPRRIKCIILTVWLIAAVISLPPLIYKGDQGP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 DGAAYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLRTRTLSEKRAPVGP-
. . ::: ::.:.::::.: ::::::::::: ::: ::: .:: .: :: ::
CCDS56 QPRGRPQCKLNQEAWYILASSIGSFFAPCLIMILVYLRIYLIAKRSNRR--GPRAKGGPG
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290
pF1KE1 DGAS--PTTENG----------LGAAAGAGE-NGHCAPPPADVEPDESSAAAERRR---R
.: : : ..: :...:.: : ::: . .. : :. . :
CCDS56 QGESKQPRPDHGGALASAKLPALASVASAREVNGH-SKSTGEKEEGETPEDTGTRALPPS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE1 RGALRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAG--------------PGAAESGALTASRSP--GP
.:: .:. : . :. ::. . . : :. . .: : :
CCDS56 WAALPNSGQ---GQKEGVCGASPEDEAEEEEEEEEEEEECEPQAVPVSPASACSPPLQQP
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GGRLSRASSRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQ-AREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFF
: :. :. . .:.: : .. :. :: .::::::::::::.::::::::::::
CCDS56 QGSRVLATLRG-QVLLGRGVGAIGGQWWRRRAQLTREKRFTFVLAVVIGVFVLCWFPFFF
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 SYSLYGICREACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGF
:::: .:: . :.:: ::.::::::::::::::::::.:::::::.:..:: :
CCDS56 SYSLGAICPKHCKVPHGLFQFFFWIGYCNSSLNPVIYTIFNQDFRRAFRRILCRPWTQTA
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 RQ
CCDS56 W
450
>>CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (443 aa)
initn: 746 init1: 342 opt: 706 Z-score: 478.1 bits: 97.7 E(32554): 2.6e-20
Smith-Waterman score: 718; 32.9% identity (63.4% similar) in 423 aa overlap (55-452:38-441)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 ERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGFLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRA
:... .::. : ::::: .:: .::..
CCDS83 WYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVSREKALQT
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 PQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFGQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCA
: ..:::: ::.::::::::. . :... : :... : ....:::..::.::..:::
CCDS83 TTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTASILNLCA
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 ISLDRYWSVTQAVEYNLKRTP-RRVKATIVAVWLISAVISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCG
::.::: .:.. . :: . . ::: . : ::..: .:: : : .: ..: .:
CCDS83 ISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGL----NNADQNECI
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLRTRTLSEKRAPVGPDGASPTTENG
. . .. . :: . ::..: .. ::: .:: : . : . .. :: . .
CCDS83 IANPAFVVYSSIV-SFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRVNTKR-----------SSRA
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310
pF1KE1 LGAAAGAGENGHCAPPP-----ADVEPDESSAAAERRRRRGALRRGGRRRAGAEGGAGGA
. : : .:.:. : . . ...: ..::: ..: ::. . . ....
CCDS83 FRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAA-RRAQELEMEMLSSTSPP
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350
pF1KE1 D-----------GQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASS--RSVEFFL------SR
. : . : .. : .. ::. . ..:.. . ...: ..
CCDS83 ERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFEIQTMPNGK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 RRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVPGPLF
: . ... :::..: .::. : .::.:.:::..::.:::... : : :..: :.
CCDS83 TRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCD--CNIPPVLY
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE1 KFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
. : :.:: ::..::.:::.:: .::..: .::
CCDS83 SAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
410 420 430 440
>>CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 (445 aa)
initn: 528 init1: 305 opt: 624 Z-score: 424.9 bits: 87.9 E(32554): 2.4e-17
Smith-Waterman score: 640; 31.5% identity (59.4% similar) in 451 aa overlap (13-452:4-427)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MASPALAAALAVAAAAGP-NASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVG
: :: ::::: .: .: :.:: :: .::. .: :::...
CCDS13 MERAPPDGPLNASGAL---AGEAAAAGGA-----RG-FSAAWTAVLAALMA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 FLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYF
.::: ::.::.::..: ... .::. .:.::..:: .:.::... .:. . : . : :
CCDS13 LLIVATVLGNALVMLAFVADSSLRTQNNFFLLNLAISDFLVGAFCIPLYVPYVLTGRWTF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKR-TPRRVKATIVAVWLI
:. : ..:..: :.:::: .. :: ::. :::.:: : .. ::. .. ::..
CCDS13 GRGLCKLWLVVDYLLCTSSAFNIVLISYDRFLSVTRAVSYRAQQGDTRRAVRKMLLVWVL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SAVISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCGLNDE---TWYIL-SSCIGSFFAPCLIMGL----VY
. .. : ..: :.. :. : .::.: .. ::.: : . . .:
CCDS13 AFLLYGPAILSWEYLSGGSSIPEGHCYAEFFYNWYFLITASTLEFFTPFLSVTFFNLSIY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE1 ARIYRVAKLRTRTLSEKRAPVGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHC-APPPADVEPDESS
: : ..:: : .: : :.:. : : ..:: : : :..
CCDS13 LNIQRRTRLRLDGAREAAGPEPPPEAQPSPPPPPGCW-GCWQKGHGEAMPLHRYGVGEAA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 AAAERRRRRGALRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRAS
..:: .:. : ::.:: :. :.: .. ... ... : : :. :
CCDS13 VGAE----------AGEATLG--GGGGG--GSVASPTSSSGSSSRGTERPRSLKRGSKPS
290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 SRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICR
. :. : .: . :. .. .:... . :::....: ::: :. . . . . :.
CCDS13 ASSAS--LEKRMKMVSQSFTQRFRLSRDRKVAKSLAVIVSIFGLCWAPYTLLMIIRAACH
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 EACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
: :: .. ::. . ::..:::.: . ...:::.: ..:
CCDS13 GHC-VPDYWYETSFWLLWANSAVNPVLYPLCHHSFRRAFTKLLCPQKLKIQPHSSLEHCW
390 400 410 420 430 440
CCDS13 K
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 850 init1: 546 opt: 567 Z-score: 388.2 bits: 81.0 E(32554): 2.7e-15
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30 40 50 60 70 80
pF1KE1 GSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGFLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQ
..: :: .:.::. :: :. :.:.
CCDS34 TTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALERSLQNVA
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 NLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFGQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAIS
: .. ::: .:..:..::.:.. ... : .::: : ...::::: :::::.:::::.
CCDS34 NYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIA
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 LDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISAVISFPPLVSLYRQPDGAAYPQ-CGLN
:::::..:. ..: ::::::. : : .:::. .::.::... .: :. . :. : ..
CCDS34 LDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLG-WRTPEDRSDPDACTIS
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 DETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLRTRTLSEKRAPVGPD---GASPTTEN
. : . : .:.:. : :.: ..:.::.:.:..: : .: .: : ::::
CCDS34 KDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGASP----
200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 GLGAAAGAGENGHCAPPPADVEPDESSAAAERRRRRGALRRGGRRRAGAEGGAGGADGQG
:: : ..:. .: : : : . .::. :.:: ::
CCDS34 --------------APQP------KKSVNGESGSR--NWRLGVESKAGGALCANGAVRQG
250 260 270 280
330 340 350 360 370
pF1KE1 AGPGAAESGALTASRSPGPGGRL---SRASSRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKR
.: : .. . : . .: :.:. .:. :.. .::.: :::..
CCDS34 DDGAALE--VIEVHRVGNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERK
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 FTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTV
. .:...::.:.:::.:::. . .:. .:..: : .. :.:: :: ::::::.
CCDS34 TVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAY
350 360 370 380 390 400
440 450 460
pF1KE1 FNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
::.::. .::.:.
CCDS34 FNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
410 420
>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa)
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Smith-Waterman score: 651; 31.7% identity (55.2% similar) in 458 aa overlap (17-462:8-380)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGP-----PRGQYSAGAVAGLA
: :.:. .. : :: .: . :. . . . .::
CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGL-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 AVVGFLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMA
:.: .:.:..:::.::...: .: ::.: : :.:.:: ::.:.. :.::: : :...
CCDS43 -VLGAFILFAIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLG
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YWYFGQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAV
:: .:...: .. :.::: ::.::. :::::.::: .: ...: : :.. ....:
CCDS43 YWVLGRIFCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 WLISAVISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYR
:..:.:::. ::.. ...: .::...: .: : : .:::. : .. ..: :.:
CCDS43 WVLSTVISIGPLLG-WKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VAKLRTRTLSEKRAPVGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPPPADVEPDESSAAAERR
::: :..: .: : . : . : : . .: : : ::. :
CCDS43 VAKRTTKNL---EAGVMKE-MSNSKELTLRIHS---KNFH--------EDTLSSTKA---
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RRRGALRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASSRSVEF
.: .:
CCDS43 -------------------------KGHNP------------------------------
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 FLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVP
:::. . .:::. . .:..:.:.:.:::.:::.. : : . . :
CCDS43 --------RSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVVGMFILCWLPFFIALPL-GSLFSTLKPP
280 290 300 310 320
420 430 440 450 460
pF1KE1 GPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILF-------RRRRRGFRQ
.:: ::.:: :: :::.:: ...:.:.: .:: ::::: :.
CCDS43 DAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAY
330 340 350 360 370 380
CCDS43 TYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDDSGSCLSGSQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPE
390 400 410 420 430 440
>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 (377 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGAS--WGPPRGQYSAGAVAGLAAVV
.: : ...:. ::. .: : : : : .. ::.:.
CCDS23 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQ--ALKIS-LAVVL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GFLIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWY
. . . ::..:..:. ..: .: :..: : .. :::..:.::. ::::.:.: . :
CCDS23 SVITLATVLSNAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWN
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FGQVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLI
:::. : ..:. :. ::.::.:::.:.:::::..:.:.::. .:: .. . :. :: :
CCDS23 FGQILCDIWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SAVISFPPLVSLYRQPDGAA-YPQCGLNDE--TWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYR
: ::.::: ..:: . . .: .: .. : :.: :.:. : ... ..:.::::
CCDS23 SICISIPPL--FWRQAKAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTC-GAFYIPSVLLIILYGRIYR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VAKLRTRTLSEKRAPVGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPPPADVEPDESSAAAERR
.: :.: :. : . : :: . . ..::.. :.
CCDS23 AA--RNRILN----PPSLYGKRFTTAHLITGSAGSSL---CS------------------
230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RRRGALRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASSRSVEF
..:..: . :: :: . :
CCDS23 -LNSSLHEGHSHSAG---------------------------SP-------------LFF
260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 FLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVP
. . : :.. :.... :::.. : .:....:.:..::.::: . :::..: .
CCDS23 NHVKIKLADSALERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIH
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460
pF1KE1 GPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHIL-FRRRRRGFRQ
:: :: :.:: :: .::.::::::..::..:..:. ::.
CCDS23 PALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
340 350 360 370
>>CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (342 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGF
::.....:. . : . : . . :. ..:
CCDS83 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGV--ILGG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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::.: :.::.::...: : :.. . ..:.:: ::.:... :.::: :...:: ::
CCDS83 LILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
.:.:... :.::: ::.::. :: ::.::: .:. ..: : :: ... :: .:
CCDS83 RVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLR
:::. :: . .::: : .:.: :.: : .:::. : :. ..: :.: ::: .
CCDS83 VISIGPLFG-WRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
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.: :
CCDS83 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTL
220 230 240 250 260 270
>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa)
initn: 691 init1: 385 opt: 524 Z-score: 360.2 bits: 75.8 E(32554): 9.6e-14
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10 20 30 40 50 60
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::.....:. . : . : . . :. ..:
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGV--ILGG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFG
::.: :.::.::...: : :.. . ..:.:: ::.:... :.::: :...:: ::
CCDS60 LILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFG
40 50 60 70 80 90
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pF1KE1 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
.:.:... :.::: ::.::. :: ::.::: .:. ..: : :: ... :: .:
CCDS60 RVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VISFPPLVSLYRQPDGAAYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRVAKLR
:::. :: . .::: : .:.: :.: : .:::. : :. ..: :.: ::: .
CCDS60 VISIGPLFG-WRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRTLSEKRAPVGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPPPADVEPDESSAAAERRRRRGA
.: : ..:: . :.:..
CCDS60 SRGL----------------KSGL-------------------KTDKSDS----------
220
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LRRGGRRRAGAEGGAGGADGQGAGPGAAESGALTASRSPGPGGRLSRASSRSVEFFLSRR
:. .: :. .:.: . ::... :
CCDS60 ----------------------------EQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHF----
230 240 250
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pF1KE1 RRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSLYGICREACQVPGPLFK
:: : . .:::. . .:..:.: :::::.:::. . . : . .::
CCDS60 -----SV--RLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPI-GSFFPDFKPSETVFK
260 270 280 290 300
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. ::.:: :: .::.:: .:.:...:...:
CCDS60 IVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEG
310 320 330 340 350 360
CCDS60 QHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARGHTPMT
370 380 390 400 410 420
462 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:07:24 2016 done: Sun Nov 6 09:07:25 2016
Total Scan time: 3.670 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]