FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1923, 460 aa
1>>>pF1KE1923 460 - 460 aa - 460 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2058+/-0.00124; mu= 4.7315+/- 0.074
mean_var=194.1828+/-38.445, 0's: 0 Z-trim(107.5): 46 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.092038
statistics sampled from 9577 (9615) to 9577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 3080 421.9 6.6e-118
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CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 618 95.1 1.8e-19
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 589 91.2 2.6e-18
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 583 90.4 4.1e-18
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 581 90.1 5.4e-18
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 580 90.0 6e-18
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 577 89.6 7.8e-18
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 555 86.7 6e-17
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 533 83.8 4.5e-16
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 520 81.9 1e-15
CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 368) 516 81.4 1.7e-15
CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 514 81.1 2e-15
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 488 77.8 2.6e-14
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 486 77.5 3.2e-14
CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 465 74.7 2.3e-13
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 448 72.3 7.9e-13
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 443 71.6 1.1e-12
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 443 71.6 1.2e-12
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 442 71.5 1.4e-12
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 406 66.7 3.7e-11
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 398 65.7 7.4e-11
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 410 67.8 7.9e-11
>>CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 (460 aa)
initn: 3080 init1: 3080 opt: 3080 Z-score: 2230.3 bits: 421.9 E(32554): 6.6e-118
Smith-Waterman score: 3080; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (1-460:1-460)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MFTIKLLLFIVPLVISSRIDQDNSSFDSLSPEPKSRFAMLDDVKILANGLLQLGHGLKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MFTIKLLLFIVPLVISSRIDQDNSSFDSLSPEPKSRFAMLDDVKILANGLLQLGHGLKDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLSLQTSEIKEEEKELRRTTYKLQVKNEEVKNMSLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLSLQTSEIKEEEKELRRTTYKLQVKNEEVKNMSLEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NSKLESLLEEKILLQQKVKYLEEQLTNLIQNQPETPEHPEVTSLKTFVEKQDNSIKDLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NSKLESLLEEKILLQQKVKYLEEQLTNLIQNQPETPEHPEVTSLKTFVEKQDNSIKDLLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TVEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TVEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 GIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIRPSNSQVFHVYCDVISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIRPSNSQVFHVYCDVISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYSFYLGNHETNYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYSFYLGNHETNYTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 HLVAITGNVPNAIPENKDLVFSTWDHKAKGHFNCPEGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 HLVAITGNVPNAIPENKDLVFSTWDHKAKGHFNCPEGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE1 RAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE
430 440 450 460
>>CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 (406 aa)
initn: 738 init1: 371 opt: 699 Z-score: 522.4 bits: 105.7 E(32554): 8.9e-23
Smith-Waterman score: 699; 35.4% identity (67.5% similar) in 314 aa overlap (153-458:93-404)
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KLESLLEEKILLQQKVKYLEEQLTNLIQNQPETPEHPEVT-SLKTFVEKQDNSIKDLLQT
::. ::: ::.: .. :.. :..:..
CCDS12 RSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLFHK
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230
pF1KE1 VEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQ-LNEIRNVKH-
: .: ..:..:: .:.....:. . .. . ... : : . : .. .::..
CCDS12 VAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLD-HKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSRL
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DGIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIRPSNSQVFHVYCDVISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETW
.: .: ... ::. ::.. :.:..: : : : . : . ::.::.: ::: .::. :
CCDS12 HRLPRDCQELFQVGERQSGLFEIQPQGSPPFLVNCKMTSDGGWTVIQRRHDGSVDFNRPW
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 ENYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYSFYLGNHETNYT
: :: ::: :::::::::..::. . : : ..:.:: : . ...: .::...: :.
CCDS12 EAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAYS
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LHLVA-ITGNVPNAI--PENKDLVFSTWD--HKAKGHFNCPEGYSGGWWWHDECGENNLN
:.:.: ..:.. . : . .. ::::: : . :: .. :::::. :...:::
CCDS12 LQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWF-GTCSHSNLN
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
pF1KE1 GKYNKPRAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE
:.: . ... . ..:. ::. :: : ...: :::.: .:.
CCDS12 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
370 380 390 400
>>CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 (491 aa)
initn: 392 init1: 315 opt: 618 Z-score: 463.1 bits: 95.1 E(32554): 1.8e-19
Smith-Waterman score: 623; 30.8% identity (60.6% similar) in 419 aa overlap (57-455:88-491)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 DSLSPEPKSRFAMLDDVKILANGLLQLGHGLKDFVHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLS
::: . . : .: :..: . : .. .
CCDS13 QRITGPICVNTKGQDASTIKDMITRMDLENLKDVLSRQKREI-DVLQLVVDVDGNIVN--
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KE1 LQTSEIKEEEKEL--RRTTYKLQVKNEEVK--NMSLELN---SKLESLLEEKILLQQKVK
... ...: ... : : .:. .: .. . ::::. .:. .. : . . . .
CCDS13 -EVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNSLELSQLENKILNVTTEMLKMATRYR
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 YLEEQ---LTNLIQNQPETPEHPEVTSLKTFVEKQDNSIKDLLQTVEDQYKQLNQQHSQI
:: . ::.:..:: : :. : .::. .. : : :. .::..
CCDS13 ELEVKYASLTDLVNNQSVMITLLEEQCLRIF-SRQDTHVSPPLVQVVPQHIPNSQQYTPG
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 KEIENQLRRT-----SIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHDGIPAECTTIYN
:...: ... : ... : : .:: .. . . ..: .: .
CCDS13 LLGGNEIQRDPGYPRDLMPPPDLATS-----PTKSPF-KIPPVTFI-NEGPFKDCQQAKE
240 250 260 270 280
260 270 280 290 300
pF1KE1 RGEHTSGMYAIRPSNSQ-VFHVYCD-VISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWENYKYGFGRL
:. .::.: :.: ::. ....:. .. . ::.::.: ::: :: ..::::: ::: .
CCDS13 AGHSVSGIYMIKPENSNGPMQLWCENSLDPGGWTVIQKRTDGSVNFFRNWENYKKGFGNI
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYS-FYLGNHETNYTLHLVAITGN
:::.:::::.:: . .:.:: : ::::::.:.: : ::: : : . : :.: . ::
CCDS13 DGEYWLGLENIYMLSNQDNYKLLIELEDWSDKKVYAEYSSFRLEPESEFYRLRLGTYQGN
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VPNAIPENKDLVFSTWDHKAKGHF--NCPEGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKPRAKSKP
. ... .. :.: : . : . :: . ..::::. . :...:::: . . .. .
CCDS13 AGDSMMWHNGKQFTTLD-RDKDMYAGNCAHFHKGGWWY-NACAHSNLNGVWYRG-GHYRS
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460
pF1KE1 ERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE
... :. : : ::.....:.:.: :
CCDS13 KHQDGIFWAEYRGGSYSLRAVQMMIKPID
470 480 490
>>CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 (496 aa)
initn: 439 init1: 252 opt: 589 Z-score: 442.2 bits: 91.2 E(32554): 2.6e-18
Smith-Waterman score: 605; 30.2% identity (62.0% similar) in 450 aa overlap (36-455:79-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 LLLFIVPLVISSRIDQDNSSFDSLSPEPKSRFAMLDDVKILANG---LLQLGHGLKDFVH
:. .:.. :. :. :..: . ..: ..
CCDS59 EMDNCRSSSSPYVSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLEN--IMENNTQWLMKLENYIQDNMK
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLSLQTSEIKEEEKELRRTT-YKLQVKNEEVK-NMSLEL
: .: :. . .:. . . :. ... .. :. : . :: :. .. ...:
CCDS59 KEMVEI----QQNAVQNQTAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLE
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160
pF1KE1 NSKLESLLEEKIL--------LQQKVKYLEEQLT-----NLIQNQPETPEHPEVTSLKTF
.: . ::..:: ::.: ..::... ..:: : :. . :...
CCDS59 HSLSTNKLEKQILDQTSEINKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQ---LQVL
170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 VEKQDNSIKDLLQ-----TVEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISLSSKPRA
: ::.. :..: . ::... : .:::. .. ..: : : .: :.. .
CCDS59 VSKQNSIIEELEKKIVTATVNNSVLQ-KQQHDLMETVNNLL--------TMMSTSNSAKD
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 PRTTPFLQLNEIRNVKHDGIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIR-PSNSQVFHVYCDV-ISGS
: .. :.. .:. :. ... :. :.:.:.. :.... ...:::. .:.
CCDS59 PTVAKEEQIS-FRD---------CAEVFKSGHTTNGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGG
280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 PWTLIQHRIDGSQNFNETWENYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKD
::.::.: ::: .:..::..:: ::: .::.::: : . ....:. :::.:.:.::.
CCDS59 GWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEG
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390
pF1KE1 NKHYIEYS-FYLGNHETNYTLHLVAITGN---VPNAIPENKDLVFSTWD-HKAKGHFNCP
:. : : :::...: :: .:: ..::. . . ..: ::: : . : .:
CCDS59 NEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPGND--FSTKDGDNDKCICKCS
390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 EGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKPRAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTD
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CCDS59 QMLTGGWWF-DACGPSNLNGMYYPQRQNT--NKFNGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPAD
440 450 460 470 480 490
460
pF1KE1 SESFE
CCDS59 F
>>CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 (444 aa)
initn: 439 init1: 252 opt: 583 Z-score: 438.6 bits: 90.4 E(32554): 4.1e-18
Smith-Waterman score: 613; 29.7% identity (65.1% similar) in 401 aa overlap (67-455:72-443)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 FAMLDDVKILANGLLQLGHGLKDFVHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLSLQTSEIKEEE
. .: :.:..... . . . .. ..
CCDS47 SYTFLLPEMDNCRSSSSPYVSNAVQRDAPLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKVLNQT
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 KELRRTTYKLQVKNEEVKNMSLELNSKLESLLEEKILLQQKVKYLEEQLTNLIQNQPETP
.:. . .......... :. .:....: ... .:..:: .:.. ..:: :
CCDS47 TRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSEINKLQDKNSFLEKKVLAMEDK--HIIQLQSIKE
110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 EHPEVTSLKTFVEKQDNSIKDLLQ-----TVEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEP
:. . :...: ::.. :..: . ::... : .:::. .. ..: :
CCDS47 EKDQ---LQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVNNSVLQ-KQQHDLMETVNNLL--------
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 TEISLSSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHDGIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIR-PSNSQVF
: .: :.. . : .. :.. .:. :. ... :. :.:.:.. :.... .
CCDS47 TMMSTSNSAKDPTVAKEEQIS-FRD---------CAEVFKSGHTTNGIYTLTFPNSTEEI
210 220 230 240 250
280 290 300 310 320
pF1KE1 HVYCDV-ISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWENYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNY
..:::. .:. ::.::.: ::: .:..::..:: ::: .::.::: : . ....:. :
CCDS47 KAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLGNEFVSQLTNQQRY
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 VLRIELEDWKDNKHYIEYS-FYLGNHETNYTLHLVAITGN---VPNAIPENKDLVFSTWD
::.:.:.::. :. : : :::...: :: .:: ..::. . . ..: ::: :
CCDS47 VLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPGND--FSTKD
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 -HKAKGHFNCPEGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKPRAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSI
. : .: . .::::. : :: .:::: : : ... . :..: .: ::.
CCDS47 GDNDKCICKCSQMLTGGWWF-DACGPSNLNGMYYPQRQNTN--KFNGIKWYYWKGSGYSL
380 390 400 410 420 430
450 460
pF1KE1 KSTKMLIHPTDSESFE
:.: :.:.:.:
CCDS47 KATTMMIRPADF
440
>>CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 (497 aa)
initn: 453 init1: 280 opt: 581 Z-score: 436.5 bits: 90.1 E(32554): 5.4e-18
Smith-Waterman score: 581; 29.6% identity (59.4% similar) in 456 aa overlap (17-455:57-496)
10 20 30 40
pF1KE1 MFTIKLLLFIVPLVISSRIDQDNSSF---DSLSPEPKSRFAMLDDV
: :: :.. :. :: :. .
CCDS56 ENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCRESTTDQYNTNALQRDAPHVEPDFSSQKLQHL
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 KILANGLLQLGHGLKDF-VHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLSLQTSEIKEEEKELRRT
. . .. : . :... :.. :... .: :. . ... : . :: ... .. :.
CCDS56 EHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQI-QQNAVQNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKL
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 T-YKLQVKNEEVKNMSLELNSKLESLLEEKILLQQKVKYLEEQLTN-LIQNQPETPEHPE
: . :: :. . :...: . :: :::: . :. . : :.... : .
CCDS56 TDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEKQLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKH
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210
pF1KE1 VTSLKTFVEKQDNSIKDLL--QT--VEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISL
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CCDS56 KEELDTLKEEKEN-LQGLVTRQTYIIQELEKQLNRATTNNSVLQKQQLELMDTVHNLVNL
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220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHDGIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIRPSN-SQVFHVYCD
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CCDS56 CTKEVLLKGGKREEEKPFRD---------CADVYQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCN
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280 290 300 310 320 330
pF1KE1 V-ISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWENYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIE
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340 350 360 370 380 390
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400 410 420 430 440
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450 460
pF1KE1 LIHPTDSESFE
.:.: :
CCDS56 MIRPLDF
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220 230 240 250 260 270
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340 350 360 370 380
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CCDS63 ELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHTGTAGKQSSLILHGAD--FSTKDADND
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390 400 410 420 430 440
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CCDS63 NCMCKCALMLTGGWWF-DACGPSNLNGMFY--TAGQNHGKLNGIKWHYFKGPSYSLRSTT
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450 460
pF1KE1 MLIHPTDSESFE
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CCDS63 MMIRPLDF
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CCDS47 KEMVEI----QQNAVQNQTAVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLT--------DVEAQVLNQTT
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CCDS47 RLELQLLEHSLSTNK---LEKQILD------QTSEINKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQ
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CCDS47 LQSIKEEKDQLQVLVSKQNSIIEELEKKIVTATVNN-SVLQKQQHDLMETVNNLLTMMST
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240 250 260 270 280
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: : . : :. ... :. :.:.:.. :.... ...:::. .:. ::.:
CCDS47 SNSKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTII
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CCDS47 LYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSISQPGND--FSTKDGDNDKCICKCSQMLTG
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CCDS47 GWWF-DACGPSNLNGMYYPQRQNT--NKFNGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
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CCDS13 PTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQVQQQMAQ-NQTAPMLELGTSLLNQ
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CCDS13 TTAQIRKLTDMEAQLLNQTSR-MDAQMPETFLSTNKLENQLLLQRQKLQQLQGQNSALEK
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CCDS13 RLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERGLRGVRHNSSLLQDQQHSLRQ
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210 220 230 240 250 260
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CCDS13 NATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEHWLGNEVVHQL
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CCDS13 TRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSGSAGRQSSLVLQNTS-
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CCDS13 -FSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWF-DACGLSNLNGVYYHAPDNKYKMD---GIRWHYF
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pF1KE1 NGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE
.: ::.....:.:.: :
CCDS13 KGPSYSLRASRMMIRPLDI
490 500
>>CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 (493 aa)
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10 20 30 40
pF1KE1 MFTIKLLLFIVPLVISSRIDQDNSSFDSLSPEPKSRFAMLDDVK----IL
::. .. . :. . :. . : .:
CCDS68 AGQEDGFEGTEEGSPREFIYLNRYKRAGESQDKCTYTFIVPQQRVTGAICVNSKEPEVLL
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: . : . :.. . : : :: . .:.: : .. . ... ...: ... : :
CCDS68 ENRVHKQELELLNNELLKQKRQI-ETLQQLVEVDGGIVS---EVKLLRKESRNMNSRVTQ
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CCDS68 LYMQLLHEIIRKRDNALEL-SQLENRILNQTADMLQLASKYKDLEHKYQHLATLAHNQSE
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...:. .. : . . : .. : . ..: ::. . :: ..
CCDS68 I-----IAQLEEHCQRVP-SARPVPQPPPAAPPRVYQPPTY-NRIINQISTNEIQSDQNL
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CCDS68 CDQ-RHDPGGWTVIQRRLDGSVNFFRNWETYKQGFGNIDGEYWLGLENIYWLTNQGNYKL
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CCDS68 LVTMEDWSGRKVFAEYASFRLEPESEYYKLRLGRYHGNAGDSFTWHNGKQFTTLDRDHDV
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CCDS68 YTGNCAHYQKGGWWY-NACAHSNLNGVWYRG-GHYRSRYQDGVYWAEFRGGSYSLKKVVM
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.:.:
CCDS68 MIRPNPNTFH
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460 residues in 1 query sequences
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start: Sun Nov 6 19:18:29 2016 done: Sun Nov 6 19:18:30 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]