FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1915, 452 aa
1>>>pF1KE1915 452 - 452 aa - 452 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3019+/-0.000874; mu= 12.2210+/- 0.052
mean_var=77.4190+/-15.361, 0's: 0 Z-trim(107.5): 43 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.145764
statistics sampled from 9589 (9632) to 9589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 204) 284 69.2 4.5e-12
CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19 ( 242) 278 67.9 1.3e-11
>>CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 (452 aa)
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Smith-Waterman score: 3090; 100.0% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (1-452:1-452)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAPSAGSWSTFQHKELMAADRGRRILGVCGMHPHHQETLKKNRVVLAKQLLLSELLEHL
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pF1KE1 LEKDIITLEMRELIQAKVGSFSQNVELLNLLPKRGPQAFDAFCEALRETKQGHLEDMLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEKDIITLEMRELIQAKVGSFSQNVELLNLLPKRGPQAFDAFCEALRETKQGHLEDMLLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLSGLQHVLPPLSCDYDLSLPFPVCESCPLYKKLRLSTDTVEHSLDNKDGPVCLQVKPCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PEFYQTHFQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGEKELEFRSGGDVDHSTLVTLFKLLGYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PEFYQTHFQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGEKELEFRSGGDVDHSTLVTLFKLLGYDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVALLSHGVEGAIYGVDGKLLQLQEVFQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVALLSHGVEGAIYGVDGKLLQLQEVFQLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQDGKNHAGSPGCEESDAGKEKLPKMRLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQDGKNHAGSPGCEESDAGKEKLPKMRLPT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RSDMICGYACLKGTAAMRNTKRGSWYIEALAQVFSERACDMHVADMLVKVNALIKDREGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSDMICGYACLKGTAAMRNTKRGSWYIEALAQVFSERACDMHVADMLVKVNALIKDREGY
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430 440 450
pF1KE1 APGTEFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 APGTEFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPPT
430 440 450
>>CCDS47733.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 (108 aa)
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Smith-Waterman score: 694; 100.0% identity (100.0% similar) in 106 aa overlap (1-106:1-106)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAPSAGSWSTFQHKELMAADRGRRILGVCGMHPHHQETLKKNRVVLAKQLLLSELLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEKDIITLEMRELIQAKVGSFSQNVELLNLLPKRGPQAFDAFCEALHS
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
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>>CCDS158.1 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 (416 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 AAPSAGSWSTFQHKELMAADRGRRILGVCGMHPHHQETLKKNRVVLAKQLLLSELLEHLL
: .. :.. :. :...: ...: . ::
CCDS15 MDEADRRLLRRCRLRLVEELQVDQLWDALL
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE1 EKDIITLEMRELIQAKVGSFS---QNVELLNLLPKRGPQAFDAFCEALRETKQGHLEDML
.... .: : :: ..:: : : .:. : :: ::. : :..: : : ..:
CCDS15 SRELFRPHMIEDIQ-RAGSGSRRDQARQLIIDLETRGSQALPLFISCLEDTGQDMLASFL
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pF1KE1 LTTLSGLQHVLPPLSCDYDLSLPFPVCESCPLYKKLRLSTDTVEHSLDNKDGPVCLQVKP
:. .. . : : .:. :: : .: .. . . .: .: .:
CCDS15 RTNRQAAKLSKPTLE---NLT---PVVLR-PEIRKPEVLRPETPRPVDIGSGGFG-DVGA
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: . . .::: :. .: : :...::.: :. :. :.:...: : :. : .
CCDS15 L--ESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHF
150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVALLSHGVE-------GAIYGVDGKLL
:.: : ::..: : ..:: : . : :.:..:::: . ::.::.:: .
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pF1KE1 QLQEVFQLFDNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQDGKNHAGSPGCE-ESDA--
..... ..:....:::: .:::.:::::: :.. :.: . . . . ::: . : ::
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350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ---GKEKLPKM----RLPTRSDMICGYACLKGTAAMRNTKRGSWYIEALAQVFSERACDM
: . . .. ::: ::.. .:. . : .. :. : ::::.:.: ..: . : .
CCDS15 FQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSE
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450
pF1KE1 HVADMLVKV-NAL-IKDREGYAPGT-EFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPPT
. ..:..: ::. .: :: .: : :
CCDS15 DLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTS
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>>CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (464 aa)
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pF1KE1 LLTTLSGLQHVLPPLSCDYDLSLPFPVCESCPLYKK--LRLSTDTVEHSLDNKD-GPVCL
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CCDS23 DDDMNLLDIFIEMEKRVILGEGKLDILKRVCAQINKSLLKIINDYEEFSKGEELCGVMTI
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180 190 200 210 220
pF1KE1 QVKPCTPEFYQTHFQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGEKE-------LEFRSGGDVDHS
. .: . . .. .:...:.::: :...: .:. .: .. :.: .: .
CCDS23 SDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLHSIRDRNGTHLDAG
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 TLVTLFKLLGYDVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVALLSHGVEGAIYGVD
.:.: :. : .... : :.... : :. . :: : : : .:::: .: :::.:
CCDS23 ALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIY-QLMDHSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTD
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GKLLQLQEVFQLFDNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQDGKNHAGSPGCEESD
:. . :. . : . .:::: .:::.::::::.::. ..:. . ... .: : .
CCDS23 GQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPVETDSEE--QPYLEMDL
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
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.. :. : .: ..:.. :.: ... ...:: .:.:::..: : . :: : .
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pF1KE1 DMLVKVNALIKDREGYAPGTEFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPPT
.:..:: ..... . . :.: . :: ..: .::
CCDS23 TILTEVNYEVSNKD-----DKKNMGKQMPQPTFTLRKKL-VFPSD
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>>CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (479 aa)
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:...:.::: :...: .:. .:
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220 230 240 250 260 270
pF1KE1 -LEFRSGGDVDHSTLVTLFKLLGYDVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVAL
.. :.: .: ..:.: :. : .... : :.... : :. . :: : : : .
CCDS23 SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIY-QLMDHSNMDCFICCI
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pF1KE1 LSHGVEGAIYGVDGKLLQLQEVFQLFDNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQDG
:::: .: :::.::. . :. . : . .:::: .:::.::::::.::. ..:. .
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pF1KE1 KNHAGSPGCEESDAGKEKLPKMR-LPTRSDMICGYACLKGTAAMRNTKRGSWYIEALAQV
... .: : . .. :. : .: ..:.. :.: ... ...:: .:.:::..: :
CCDS23 SEE--QPYLEMDLSS----PQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQS
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pF1KE1 FSERACDM--HVADMLVKVNALIKDREGYAPGTEFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPP
. :: : . .:..:: ..... . . :.: . :: ..: .::
CCDS23 LRER-CPRGDDILTILTEVNYEVSNKD-----DKKNMGKQMPQPTFTLRKKL-VFPSD
430 440 450 460 470
pF1KE1 T
>>CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (496 aa)
initn: 321 init1: 227 opt: 421 Z-score: 479.6 bits: 98.1 E(32554): 2.1e-20
Smith-Waterman score: 424; 28.8% identity (61.0% similar) in 313 aa overlap (148-447:196-494)
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pF1KE1 LLTTLSGLQHVLPPLSCDYDLSLPFPVCESCPLYKK--LRLSTDTVEHSLDNKD-GPVCL
: .: :.. .: : : .. : . .
CCDS42 DDDMNLLDIFIEMEKRVILGEGKLDILKRVCAQINKSLLKIINDYEEFSKGEELCGVMTI
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220
pF1KE1 QVKPCTPEFYQTHFQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGEKE-------LEFRSGGDVDHS
. .: . . .. .:...:.::: :...: .:. .: .. :.: .: .
CCDS42 SDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLHSIRDRNGTHLDAG
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230 240 250 260 270 280
pF1KE1 TLVTLFKLLGYDVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVALLSHGVEGAIYGVD
.:.: :. : .... : :.... : :. . :: : : : .:::: .: :::.:
CCDS42 ALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIY-QLMDHSNMDCFICCILSHGDKGIIYGTD
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GKLLQLQEVFQLFDNANCPSLQNKPKMFFIQACRGDETDRGVDQQDGKNHAGSPGCEESD
:. . :. . : . .:::: .:::.::::::.::. ..:. . ... .: : .
CCDS42 GQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPVETDSEE--QPYLEMDL
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 AGKEKLPKMR-LPTRSDMICGYACLKGTAAMRNTKRGSWYIEALAQVFSERACDM--HVA
.. :. : .: ..:.. :.: ... ...:: .:.:::..: : . :: : .
CCDS42 SS----PQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRER-CPRGDDIL
410 420 430 440 450
410 420 430 440 450
pF1KE1 DMLVKVNALIKDREGYAPGTEFHRCKEMSEYCSTLCRHLYLFPGHPPT
.:..:: ..... . . :.: . :: ..: .::
CCDS42 TILTEVNYEVSNKD-----DKKNMGKQMPQPTFTLRKKL-VFPSD
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>>CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (538 aa)
initn: 321 init1: 227 opt: 421 Z-score: 479.0 bits: 98.1 E(32554): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 423; 30.8% identity (63.2% similar) in 266 aa overlap (192-447:285-536)
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pF1KE1 EHSLDNKDGPVCLQVKPCTPEFYQTHFQLAYRLQSRPRGLALVLSNVHFTGEKE------
:...:.::: :...: .:. .:
CCDS42 FSNGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH
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pF1KE1 -LEFRSGGDVDHSTLVTLFKLLGYDVHVLCDQTAQEMQEKLQNFAQLPAHRVTDSCIVAL
.. :.: .: ..:.: :. : .... : :.... : :. . :: : : : .
CCDS42 SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIY-QLMDHSNMDCFICCI
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:::: .: :::.::. . :. . : . .:::: .:::.::::::.::. ..:. .
CCDS42 LSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPVETD
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pF1KE1 KNHAGSPGCEESDAGKEKLPKMR-LPTRSDMICGYACLKGTAAMRNTKRGSWYIEALAQV
... .: : . .. :. : .: ..:.. :.: ... ...:: .:.:::..: :
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CCDS15 LRPETPRPVDIGSGGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTR
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CCDS15 TGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQD-HGALDCCVVVILSHGC
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CCDS15 QASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVA
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pF1KE1 CRHLYLFPGHPPT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]