Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1898
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1898, 824 aa
1>>>pF1KE1898 824 - 824 aa - 824 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1954+/-0.00113; mu= 18.6093+/- 0.068
mean_var=148.4364+/-27.697, 0's: 0 Z-trim(108.8): 91 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.105270
statistics sampled from 10355 (10444) to 10355 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1665.1 ADAM17 gene_id:6868|Hs108|chr2 ( 824) 5684 875.9 0
CCDS10167.1 ADAM10 gene_id:102|Hs108|chr15 ( 748) 727 123.1 1.8e-27
CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 812) 402 73.7 1.4e-12
CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 813) 402 73.7 1.4e-12
CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 ( 918) 402 73.8 1.5e-12
CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 633) 391 72.0 3.7e-12
CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 772) 391 72.1 4.2e-12
CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 796) 391 72.1 4.3e-12
CCDS1084.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 814) 391 72.1 4.4e-12
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 824) 391 72.1 4.4e-12
CCDS1086.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 838) 391 72.1 4.5e-12
CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 839) 391 72.1 4.5e-12
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 862) 391 72.1 4.5e-12
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 863) 391 72.1 4.6e-12
CCDS2369.1 ADAM23 gene_id:8745|Hs108|chr2 ( 832) 379 70.3 1.6e-11
CCDS3823.1 ADAM29 gene_id:11086|Hs108|chr4 ( 820) 367 68.4 5.5e-11
CCDS7654.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 738) 362 67.6 8.7e-11
CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 909) 362 67.7 1e-10
>>CCDS1665.1 ADAM17 gene_id:6868|Hs108|chr2 (824 aa)
initn: 5684 init1: 5684 opt: 5684 Z-score: 4674.8 bits: 875.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5684; 100.0% identity (100.0% similar) in 824 aa overlap (1-824:1-824)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRQSLLFLTSVVPFVLAPRPPDDPGFGPHQRLEKLDSLLSDYDILSLSNIQQHSVRKRDL
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CCDS16 MRQSLLFLTSVVPFVLAPRPPDDPGFGPHQRLEKLDSLLSDYDILSLSNIQQHSVRKRDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QTSTHVETLLTFSALKRHFKLYLTSSTERFSQNFKVVVVDGKNESEYTVKWQDFFTGHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QTSTHVETLLTFSALKRHFKLYLTSSTERFSQNFKVVVVDGKNESEYTVKWQDFFTGHVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GEPDSRVLAHIRDDDVIIRINTDGAEYNIEPLWRFVNDTKDKRMLVYKSEDIKNVSRLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GEPDSRVLAHIRDDDVIIRINTDGAEYNIEPLWRFVNDTKDKRMLVYKSEDIKNVSRLQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PKVCGYLKVDNEELLPKGLVDREPPEELVHRVKRRADPDPMKNTCKLLVVADHRFYRYMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PKVCGYLKVDNEELLPKGLVDREPPEELVHRVKRRADPDPMKNTCKLLVVADHRFYRYMG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPQEVKPGEKHYNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPQEVKPGEKHYNM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AKSYPNEEKDAWDVKMLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYVGSPRANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 AKSYPNEEKDAWDVKMLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYVGSPRANS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 HGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELGHNFGAEHDPDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 HGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELGHNFGAEHDPDGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AECAPNEDQGGKYVMYPIAVSGDHENNKMFSNCSKQSIYKTIESKAQECFQERSNKVCGN
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CCDS16 AECAPNEDQGGKYVMYPIAVSGDHENNKMFSNCSKQSIYKTIESKAQECFQERSNKVCGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 SRVDEGEECDPGIMYLNNDTCCNSDCTLKEGVQCSDRNSPCCKNCQFETAQKKCQEAINA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SRVDEGEECDPGIMYLNNDTCCNSDCTLKEGVQCSDRNSPCCKNCQFETAQKKCQEAINA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TCKGVSYCTGNSSECPPPGNAEDDTVCLDLGKCKDGKCIPFCEREQQLESCACNETDNSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TCKGVSYCTGNSSECPPPGNAEDDTVCLDLGKCKDGKCIPFCEREQQLESCACNETDNSC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 KVCCRDLSGRCVPYVDAEQKNLFLRKGKPCTVGFCDMNGKCEKRVQDVIERFWDFIDQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KVCCRDLSGRCVPYVDAEQKNLFLRKGKPCTVGFCDMNGKCEKRVQDVIERFWDFIDQLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 INTFGKFLADNIVGSVLVFSLIFWIPFSILVHCVDKKLDKQYESLSLFHPSNVEMLSSMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 INTFGKFLADNIVGSVLVFSLIFWIPFSILVHCVDKKLDKQYESLSLFHPSNVEMLSSMD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 SASVRIIKPFPAPQTPGRLQPAPVIPSAPAAPKLDHQRMDTIQEDPSTDSHMDEDGFEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SASVRIIKPFPAPQTPGRLQPAPVIPSAPAAPKLDHQRMDTIQEDPSTDSHMDEDGFEKD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KE1 PFPNSSTAAKSFEDLTDHPVTRSEKAASFKLQRQNRVDSKETEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PFPNSSTAAKSFEDLTDHPVTRSEKAASFKLQRQNRVDSKETEC
790 800 810 820
>>CCDS10167.1 ADAM10 gene_id:102|Hs108|chr15 (748 aa)
initn: 627 init1: 240 opt: 727 Z-score: 606.7 bits: 123.1 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 979; 28.1% identity (56.3% similar) in 778 aa overlap (25-757:16-742)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRQSLLFLTSVVPFVLAPRPPDDPGFGPHQRLEKLDSLLSDYDILSLSNIQQHSVRKRDL
:.: : . :.. . :. :: . . :. ..:
CCDS10 MVLLRVLILLLSWAAGMGG-QYGNPLNKYIRHYEGLSYNVDSLHQKHQRAK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 QTSTHVETLLT--FSALKRHFKLYLTSSTERFSQNFKVVVVDGKNES-EYTVKWQDFFTG
.. .: . .: : : :::.: . .: ::..::: . .:. .: .. ..::
CCDS10 RAVSHEDQFLRLDFHAHGRHFNLRMKRDTSLFSDEFKV---ETSNKVLDYDTS--HIYTG
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 HVVGEPDSRVLAHIRDDDVIIRINTDGAEYNIEPLWRFVND-TKDKRMLVYKSEDIKNVS
:. :: : . . : :.: :. . .:: :...: : . ..:. .::.
CCDS10 HIYGEEGSFSHGSVIDGRFEGFIQTRGGTFYVEPAERYIKDRTLPFHSVIYHEDDINYPH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE1 RLQSPKVCG----YLKVDNEELLPKGLVDREPPEELVHR----VKRRADPDPMKNTCKLL
. :. . .. . .. : . : :: . .... . ::::.:
CCDS10 KYGPQGGCADHSVFERMRKYQMTGVEEVTQIPQEEHAANGPELLRKKRTTSAEKNTCQLY
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VVADHRFYRYMGRGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSP
. .:: :..:.: : .. . . .: ::..: : .:... ......::: .
CCDS10 IQTDHLFFKYYGTRE--AVIAQISSHVKAIDTIYQTT--DFSGIRNISFMVKRIRINTTA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 QEVKPGEKHYNMAKSYPNEEKDAWDVKMLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTL
.: : . .:: :. .:: .. .. . :::..:: .::: :.:
CCDS10 DEKDPTNPFR-----FPN-----IGVEKFLE---LNSEQNHDDYCLAYVFTDRDFDDGVL
290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GLAYVGSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELG
:::.::.: ..: ::.: :. :::. ::.:. ...:::. . : . .. .::.:
CCDS10 GLAWVGAP-SGSSGGICEKSKLYSDGKKK-SLNTGIITVQNYGSHVPPKVSHITFAHEVG
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 HNFGAEHDPDGLAECAPNEDQG------GKYVMYPIAVSGDHENNKMFSNCSKQSIYKTI
::::. :: .: .::.:.:... :.:.:: :.:::. ::. :: :: ..: ...
CCDS10 HNFGSPHD-SG-TECTPGESKNLGQKENGNYIMYARATSGDKLNNNKFSLCSIRNISQVL
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KE1 ESKAQECFQERSNKVCGNSRVDEGEECDPGIMYLNNDTCC-------NSDCTLKEGVQCS
:.: ..:: : .. .:::. :..::::: : .: :: . : :: : :::
CCDS10 EKKRNNCFVESGQPICGNGMVEQGEECDCGYSDQCKDECCFDANQPEGRKCKLKPGKQCS
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 DRNSPCCK-NCQFETAQKKCQEAINATCKGVSYCTGNSSECPPPGNAEDDTVCLDLGK-C
..::: .: :.. ..::.. .. : . :.: .. :: . : : . :
CCDS10 PSQGPCCTAQCAFKSKSEKCRD--DSDCAREGICNGFTALCPASDPKPNFTDCNRHTQVC
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KE1 KDGKCI-PFCEREQQLESCACNETDNS-----CKVCC-RDLS-GRCVPYVDAEQKNLF--
.:.: .::. :: :.: .:.. :.::: . .. . :. ... . :
CCDS10 INGQCAGSICEK-YGLEECTCASSDGKDDKELCHVCCMKKMDPSTCASTGSVQWSRHFSG
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670
pF1KE1 ----LRKGKPCT--VGFCDMNGKCEKRVQDVIERFWDFIDQLSINTFGKFLADNIVGSVL
:. :.::. :.::. .: :. :. . .:. :. : .::. ..
CCDS10 RTITLQPGSPCNDFRGYCDVFMRC--RLVDAD----GPLARLKKAIFSPELYENIAEWIV
630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KE1 VFSLIFWIPFSILVHCVDKKLDKQYESLSLFHPSNVEMLS-SMDSASVRIIKPFPAPQTP
. : ...:. . .: .. . ... : :.. .. : : : :
CCDS10 A----HW--WAVLLMGI---------ALIMLMAGFIKICSVHTPSSNPKLPPPKPLPGTL
680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KE1 GRLQPA-PVIPSAPAAPKLDHQRMDTIQEDPSTDSHMDEDGFEKDPFPNSSTAAKSFEDL
: .: :. :. ..:
CCDS10 KRRRPPQPIQQPQRQRPRESYQMGHMRR
730 740
>>CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 (812 aa)
initn: 176 init1: 97 opt: 402 Z-score: 339.5 bits: 73.7 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 460; 26.7% identity (48.6% similar) in 543 aa overlap (115-629:116-583)
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 SSTERFSQNFKVVVVDGKNESEYTVKWQDFFTGHVVGEPDSRV-LAHIRDDDVIIRINTD
. :.: : ::: : : . .: .. .
CCDS63 RLLAPGYIETHYGPDGQPVVLAPNHTDHCHYQGRVRGFPDSWVVLCTCSGMSGLITLSRN
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190
pF1KE1 GAEYNIEPLWRFVNDTKDKRMLVYKSEDIKNVSRLQSPK-VCGYLKVDNEE---LLPKGL
: : ..: : .:: .....: . .: . : .::. :. :: :
CCDS63 -ASYYLRP-WP-PRGSKD-----FSTHEIFRMEQLLTWKGTCGHRDPGNKAGMTSLPGG-
150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 VDREPPEELVHRVKRRADPDPMKNTCKLLVVADHRFYRYMGRGEESTTTNYLIELIDRVD
:. .: ::. .. .: .:::: .. :. . : . :.:. . ::
CCDS63 -----PQSRGRREARRT-----RKYLELYIVADHTLFLTRHRNLNHTK-QRLLEVANYVD
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 DIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPQEVKPGEKHYNMAKSYPNEEKDAWDVKMLLE
.. :. . . : . : . :. : . :... .. . .. :
CCDS63 QLLRTLDIQVA-LTGLEVWTERDRS-RVTQDAN------ATLWAFLQWRRGLW------A
250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 QFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYV-GSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNI
: : :. :.: . :. .:.::: : : ::.: ::: :.:
CCDS63 QRPHDSAQ---------LLTGRAFQGATVGLAPVEGMCRAESSGGVSTDHSELPIG----
300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 YLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELGHNFGAEHDPDGLAECAPNEDQGGKYVMYPI
: . .::.::..: ::::: :. ..: ::
CCDS63 --------------------AAATMAHEIGHSLGLSHDPDGC--CVEAAAESGGCVM--A
340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 AVSGDHENNKMFSNCSKQSIYKTIESKAQECFQERSNK-------VCGNSRVDEGEECDP
:..: : ..:: ::.... ... . :... . .:::. :. :::::
CCDS63 AATG-HPFPRVFSACSRRQLRAFFRKGGGACLSNAPDPGLPVPPALCGNGFVEAGEECDC
380 390 400 410 420 430
500 510 520 530 540 550
pF1KE1 GIMYLNNDTCC-NSDCTLKEGVQCSDRNSPCCKNCQFETAQKKCQEAINATCKGVSYCTG
: : :: .:.:. :.::. .. :: : .. : :..:.. : .:::
CCDS63 GPGQECRDLCCFAHNCSLRPGAQCA--HGDCCVRCLLKPAGALCRQAMG-DCDLPEFCTG
440 450 460 470 480 490
560 570 580 590
pF1KE1 NSSECPPPGNAEDDTVCL-DLGKCKDGKCIPFCEREQQL---------ESC--ACNETDN
.::.::: : . : : : :: : . .. ::: :.: . : . .
CCDS63 TSSHCPPDVYLLDGSPCARGSGYCWDGACPTLEQQCQQLWGPGSHPAPEACFQVVNSAGD
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 SCKVCCRDLSGRCVPYV--DAEQKNLFLRKGKPCTVGFCDMNGKCEKRVQDVIERFWDFI
. : .: :. .: . :: .: . :::
CCDS63 AHGNCGQDSEGHFLPCAGRDALCGKLQCQGGKPSLLAPHMVPVDSTVHLDGQEVTCRGAL
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 DQLSINTFGKFLADNIVGSVLVFSLIFWIPFSILVHCVDKKLDKQYESLSLFHPSNVEML
CCDS63 ALPSAQLDLLGLGLVEPGTQCGPRMVCQSRRCRKNAFQELQRCLTACHSHGVCNSNHNCH
620 630 640 650 660 670
>>CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 (813 aa)
initn: 176 init1: 97 opt: 402 Z-score: 339.5 bits: 73.7 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 460; 26.7% identity (48.6% similar) in 543 aa overlap (115-629:116-583)
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 SSTERFSQNFKVVVVDGKNESEYTVKWQDFFTGHVVGEPDSRV-LAHIRDDDVIIRINTD
. :.: : ::: : : . .: .. .
CCDS13 RLLAPGYIETHYGPDGQPVVLAPNHTDHCHYQGRVRGFPDSWVVLCTCSGMSGLITLSRN
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190
pF1KE1 GAEYNIEPLWRFVNDTKDKRMLVYKSEDIKNVSRLQSPK-VCGYLKVDNEE---LLPKGL
: : ..: : .:: .....: . .: . : .::. :. :: :
CCDS13 -ASYYLRP-WP-PRGSKD-----FSTHEIFRMEQLLTWKGTCGHRDPGNKAGMTSLPGG-
150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 VDREPPEELVHRVKRRADPDPMKNTCKLLVVADHRFYRYMGRGEESTTTNYLIELIDRVD
:. .: ::. .. .: .:::: .. :. . : . :.:. . ::
CCDS13 -----PQSRGRREARRT-----RKYLELYIVADHTLFLTRHRNLNHTK-QRLLEVANYVD
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 DIYRNTSWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPQEVKPGEKHYNMAKSYPNEEKDAWDVKMLLE
.. :. . . : . : . :. : . :... .. . .. :
CCDS13 QLLRTLDIQVA-LTGLEVWTERDRS-RVTQDAN------ATLWAFLQWRRGLW------A
250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 QFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYV-GSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNI
: : :. :.: . :. .:.::: : : ::.: ::: :.:
CCDS13 QRPHDSAQ---------LLTGRAFQGATVGLAPVEGMCRAESSGGVSTDHSELPIG----
300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 YLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELGHNFGAEHDPDGLAECAPNEDQGGKYVMYPI
: . .::.::..: ::::: :. ..: ::
CCDS13 --------------------AAATMAHEIGHSLGLSHDPDGC--CVEAAAESGGCVM--A
340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 AVSGDHENNKMFSNCSKQSIYKTIESKAQECFQERSNK-------VCGNSRVDEGEECDP
:..: : ..:: ::.... ... . :... . .:::. :. :::::
CCDS13 AATG-HPFPRVFSACSRRQLRAFFRKGGGACLSNAPDPGLPVPPALCGNGFVEAGEECDC
380 390 400 410 420 430
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CCDS10 SYAQQCQSLWGPGAQPAAPLCLQTANTRGNAFGSCGRNPSGS---YVSCTPRDAI-----
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CCDS10 -CGQLQCQ-TGRTQPLLGSIRDLLWETIDVNGTELNCSWVHLDLGSDVAQPLLTLPGTAC
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