FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1894, 423 aa
1>>>pF1KE1894 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9546+/-0.00113; mu= 13.0466+/- 0.068
mean_var=61.0605+/-12.214, 0's: 0 Z-trim(101.6): 52 B-trim: 40 in 1/47
Lambda= 0.164132
statistics sampled from 6528 (6580) to 6528 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 2706 649.7 1.5e-186
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 1149 281.0 1.5e-75
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 1111 272.0 7.1e-73
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 1108 271.3 1.2e-72
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 1107 271.1 1.4e-72
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 1106 270.9 1.7e-72
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 1090 267.1 2.3e-71
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 1052 258.1 1.2e-68
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 926 228.2 1.1e-59
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 800 198.4 7.5e-51
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 712 177.6 2.1e-44
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 697 174.0 2.3e-43
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 697 174.0 2.4e-43
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 692 172.8 4.3e-43
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 651 163.1 4.1e-40
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 651 163.1 4.1e-40
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 651 163.1 4.3e-40
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 646 161.9 1.1e-39
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 639 160.3 2.9e-39
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 630 158.2 1.7e-38
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 616 154.8 1.3e-37
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 611 153.6 3e-37
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 601 151.3 1.6e-36
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 594 149.6 4.6e-36
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 591 148.9 8e-36
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 569 143.7 3e-34
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 560 141.6 1.3e-33
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 550 139.2 6.7e-33
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 548 138.7 9.5e-33
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 530 134.5 1.7e-31
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 528 134.0 2.6e-31
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 527 133.8 2.8e-31
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 492 125.5 9.7e-29
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 486 124.1 2.5e-28
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 482 123.1 4.8e-28
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 482 123.1 4.9e-28
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 439 112.9 7e-25
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 398 103.2 5e-22
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 398 103.2 5.7e-22
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 381 99.2 4.7e-21
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 378 98.5 1.2e-20
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 347 91.1 2.1e-18
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 329 86.9 3e-17
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 281 75.5 5e-14
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 2706 init1: 2706 opt: 2706 Z-score: 3462.6 bits: 649.7 E(32554): 1.5e-186
Smith-Waterman score: 2706; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNP
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KQA
:::
CCDS32 KQA
>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (435 aa)
initn: 1078 init1: 788 opt: 1149 Z-score: 1469.9 bits: 281.0 E(32554): 1.5e-75
Smith-Waterman score: 1149; 45.3% identity (74.4% similar) in 422 aa overlap (3-423:18-435)
10 20 30 40
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHV
.: : :.:.:.: . : :: . . . .. .
CCDS41 MQGQGRRRGTCKDIFCSKMASYLYGVLFAVGLCAPIYC--VSPANAPSAYPRPSSTKSTP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 DLGLASANVDFAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKF
. : :.:::: ::..:::..:..:..:::.:.::.::.::::::..: :.::.:: :
CCDS41 ASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 NLTETSEAEIHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEA
:::.: :. :::.::::...:. : .: :.::.:.:::..:.: : ..:::: .:.
CCDS41 NLTHTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQD
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CCDS41 FSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 THQSR-FYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKM
:... : .... : :::: .. . . : ::.: :... : :.: :.:.::.. ::
CCDS41 TRKNFPFLVGEQVTVHVPMMH-QKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EEVEAMLLPETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLS
...: : .::..: ::. : : :...:.:::: .:::. :: ..::...: ..::.:
CCDS41 RQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWI-EVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIV
::. .: ::...::::::: ::::::.:::..:. . : . : ::: :::.:.
CCDS41 GIAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMIT
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE1 PTDTQNIFFMSKVTNPKQA
:..:.:..:: :: ..
CCDS41 NKATDGILFLGKVENPTKS
420 430
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 1063 init1: 636 opt: 1111 Z-score: 1421.8 bits: 272.0 E(32554): 7.1e-73
Smith-Waterman score: 1111; 47.4% identity (75.9% similar) in 403 aa overlap (21-420:10-406)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDR--GTHVDLGLA-SANVDFA
:: :.. ... .: . : :: .: :. ::.
CCDS99 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 FSLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQ
:.::. :. ::.....:::.::: .::.::::: ..: .::.:: .:: ..:: :.:.
CCDS99 FDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAK
.::.::. ::: : .:::.:::.:. ..: : :. : :: ...: :.:.:::.:
CCDS99 GFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKK
: ::::: . :.:::.::.:.:::......::::::::::: :. . :... ::....
CCDS99 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 WVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLK
: ::::: . :. :..::: :: . : :::.::::::.. ::..:: : .::.
CCDS99 VVRVPMMSRED-QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQV
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CCDS99 KWLKMFKKRQL-ELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEM
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 VHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKV
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CCDS99 VHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLV-FNRPFLMFIV---DNNILFLGKV
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE1 TNPKQA
. :
CCDS99 NRP
>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 (405 aa)
initn: 1104 init1: 686 opt: 1108 Z-score: 1418.0 bits: 271.3 E(32554): 1.2e-72
Smith-Waterman score: 1108; 48.5% identity (77.2% similar) in 373 aa overlap (48-420:38-404)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 CPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSP
:::::::::::::::.:: .: ::...::
CCDS99 CLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISP
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSM
.::: :::.::::. . : ...:.:: ::::: ::.::::.:::: . . .:. :...:
CCDS99 VSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTM
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 GNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLIK
:::.:. .: ::. :. : :. : ::..: .::: :.:.. ::.:::: :.:::.::..
CCDS99 GNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFS
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 DLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDE
::: ...:::::::::. : .::: .:.. ::... : :::: :. :: :..:
CCDS99 GLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMM-LQSSTISYLHDS
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 ELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFS
:: : .:...:.::....:::::. ::. : : : .:..:: .: .. .::.:: .
CCDS99 ELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQV-DLYIPKVT
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 ISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATA
:: :.:.:.: ..:: . ::..:..: :: .: :.:::::::.. :::......:.
CCDS99 ISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGSTG
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KE1 VKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNPKQA
: ..: : . :.:::.::...: : . .:...: ::
CCDS99 VTLNLTSKPI----ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
370 380 390 400
>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 (427 aa)
initn: 1110 init1: 775 opt: 1107 Z-score: 1416.3 bits: 271.1 E(32554): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 1107; 44.8% identity (73.6% similar) in 424 aa overlap (5-422:7-426)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAF
: :: .:::: . . : . .. . : . .: .: ::.::::
CCDS99 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQS
.: .. ..: ::..:::::::.: :.::::: . . ..::.:: ::::: ::...:..
CCDS99 RFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKK
:::::.::: . :. .:.:.:....:..: .: .:. .: .. : :.: :.... .
CCDS99 FQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKW
::::.::. :::::.::...: ....:::::::.::: :: :: . : . ::....
CCDS99 LINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTT
190 200 210 220 230 240
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420
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CCDS99 FLGKVVDPTKP
420
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CCDS99 LSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPE----VKFNKPFVFLMIEQNTKSPLF
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CCDS99 MGKVVNPTQK
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CCDS14 QVPMM--HQMEQYYHLVDMELNCTVLQMDYSKNALALFVLPKEGQMESVEAAMSSKTLKK
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CCDS14 NPTEA
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CCDS61 RKNFPFLVGEQVTVHVPMMH-QKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMR
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CCDS61 KATDGILFLGKVENPTKS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 12:22:15 2016 done: Sun Nov 6 12:22:15 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]