Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1886
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1886, 412 aa
1>>>pF1KE1886 412 - 412 aa - 412 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2246+/-0.000826; mu= 17.7545+/- 0.050
mean_var=68.3167+/-13.612, 0's: 0 Z-trim(107.3): 41 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155171
statistics sampled from 9431 (9470) to 9431 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 2.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 ( 412) 2828 642.1 2.9e-184
CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 414) 1559 358.0 9.6e-99
CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 442) 1232 284.8 1.1e-76
CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 ( 390) 700 165.7 7.1e-41
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 374 92.7 7.1e-19
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 317 79.9 4.9e-15
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 303 76.8 3.7e-14
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 298 75.7 9e-14
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 297 75.4 9.9e-14
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 289 73.7 4.4e-13
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 276 70.8 3e-12
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 275 70.6 3.8e-12
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 266 68.5 1.3e-11
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 264 68.1 1.8e-11
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 260 67.1 2.9e-11
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 259 67.0 4.2e-11
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 258 66.8 4.9e-11
>>CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 (412 aa)
initn: 2828 init1: 2828 opt: 2828 Z-score: 3421.6 bits: 642.1 E(32554): 2.9e-184
Smith-Waterman score: 2828; 100.0% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (1-412:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 VMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 AVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 AKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 NIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPCPYLRSADTTHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPCPYLRSADTTHST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE1 VLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKSCKCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 VLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKSCKCS
370 380 390 400 410
>>CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 (414 aa)
initn: 1532 init1: 725 opt: 1559 Z-score: 1886.2 bits: 358.0 E(32554): 9.6e-99
Smith-Waterman score: 1559; 55.7% identity (79.2% similar) in 418 aa overlap (3-412:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPT
:: .: .. .:...::.::::::.:::. .. .::.:::::::::::.::::::
CCDS15 MHYC-VLSAFLILHLVTVALSLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLTSPPEDY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 VMTH-VPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNE
. :: .:...:::::.::.: ..: .: .: .. ::::::..:.:: . .:
CCDS15 PEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMPPFFPSEN-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LAVCPKGITS--KVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRP-
:. : .. ::.::..::: .:: .:::::.:. ::... ::::::.:::.
CCDS15 -AIPPTFYRPYFRIVRFDVSAMEKNASNLVKAEFRVFRLQNPKARVPEQRIELYQILKSK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQP-N
: :::: .: . ::. .:::::::::.:.::: ... :::..::.:::: :: : :
CCDS15 DLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLK---KQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPG
. :. : : .: .: :.:. . . :: .: :... ..:::.::..: .::..
CCDS15 NYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTSGDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLMLLPSYRLESQ-
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 QGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPCPYLR
: ..:::::::. :::::...:::.:::::::..::::::.:::::: ::::.: ::::
CCDS15 QTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRPLYIDFKRDLGWKWIHEPKGYNANFCAGACPYLW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 SADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKSCKCS
:.:: :: ::.::::.::::::::::: :::::::::::.:.:::.::::::.:::::::
CCDS15 SSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCVSQDLEPLTILYYIGKTPKIEQLSNMIVKSCKCS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 (442 aa)
initn: 1535 init1: 725 opt: 1232 Z-score: 1490.2 bits: 284.8 E(32554): 1.1e-76
Smith-Waterman score: 1516; 52.7% identity (75.2% similar) in 444 aa overlap (3-412:1-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPT
:: .: .. .:...::.::::::.:::. .. .::.:::::::::::.::::::
CCDS44 MHYC-VLSAFLILHLVTVALSLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLTSPPEDY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 VMTH-VPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDM---------
. :: .:...:::::.::.: ..: .: .: .. ::::::..:.::
CCDS44 PEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMPPFFPSETV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KE1 ----------IQGLAEHNELAVC------PKGITSKVFR---FNVSSVEKNRTNLFRAEF
. .: .. ..: : . :: :.::..::: .:: .:::
CCDS44 CPVVTTPSGSVGSLCSRQSQVLCGYLDAIPPTFYRPYFRIVRFDVSAMEKNASNLVKAEF
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 RVLRVPNPSSKRNEQRIELFQILRP-DEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVRE
::.:. ::... ::::::.:::. : :::: .: . ::. .:::::::::.:.:
CCDS44 RVFRLQNPKARVPEQRIELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVHE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE1 WLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQP-NGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLK-
:: ... :::..::.:::: :: : :. :. : : .: .: :.:. . . :: .:
CCDS44 WLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTSGDQKTIKS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 --KQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQ
:... ..:::.::..: .::.. : ..:::::::. :::::...:::.:::::::..
CCDS44 TRKKNSGKTPHLLLMLLPSYRLESQ-QTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRPLYIDFKR
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 DLGWKWVHEPKGYYANFCSGPCPYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPL
::::::.:::::: ::::.: :::: :.:: :: ::.::::.::::::::::: ::::::
CCDS44 DLGWKWIHEPKGYNANFCAGACPYLWSSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCVSQDLEPL
360 370 380 390 400 410
390 400 410
pF1KE1 TILYYVGRTPKVEQLSNMVVKSCKCS
:::::.:.:::.::::::.:::::::
CCDS44 TILYYIGKTPKIEQLSNMIVKSCKCS
420 430 440
>>CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 (390 aa)
initn: 1022 init1: 669 opt: 700 Z-score: 847.3 bits: 165.7 E(32554): 7.1e-41
Smith-Waterman score: 1093; 46.3% identity (67.3% similar) in 410 aa overlap (9-412:15-390)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLT
:. : .:. . . .:::: :.:. .:.::.:::::::::::::.
CCDS33 MPPSGLRLLPLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SPPEPTVMTH--VPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQ
::: . .: :::::::::. .. :: : . . :..:::::. . :..
CCDS33 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRD---RVAGESAE--PEPEPEADYYAKEVTRVLMVE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE1 GLAEHNELAVCPKGITSKVFRF-NVSSVEKNRTN---LFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRI
:::. : : ... : :.: ... . : :::.:.::. . . ::..
CCDS33 ---THNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRL----KLKVEQHV
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 ELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCP
::.: . . ::.... : . :::::::: .::.:: : :...: ::
CCDS33 ELYQKYSNN----SWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 CHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRL
: : .: .... ..: . ::::. .. . : :.:: : .:
CCDS33 C-------DSRDN---TLQVDINGFTTGR---RGDLATIH---GMNRPFLLLMATPLERA
230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 DNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPC
.. ..:..::::::::: . :.::::: ::::::.::::::.::::::.:::: :::
CCDS33 QH--LQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPC
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 PYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKS
::. : :: .: ::.::: :: :::.:::::: :::: :.::::: :::::::::.:.:
CCDS33 PYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRS
330 340 350 360 370 380
410
pF1KE1 CKCS
::::
CCDS33 CKCS
390
>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa)
initn: 308 init1: 115 opt: 374 Z-score: 452.3 bits: 92.7 E(32554): 7.1e-19
Smith-Waterman score: 408; 26.6% identity (56.1% similar) in 433 aa overlap (12-411:21-430)
10 20 30 40
pF1KE1 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGH--IKKKRVEAIRGQILS
: :: : ...::.. . .: : ..... . .. .:::
CCDS13 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 KLRLTSPPEPTVM-TH--VPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQE-----NTESEYY
: : :.: .. : .:. .: :::. .:: : .: . .:..
CCDS13 ILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYNAMA--VEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE1 A--KEIHKF---DMIQG---LAEHNELAVCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRV
: .. : . ::... :.::.. :. . :::..:.. .... . ::::.
CCDS13 ASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPR-YHHREFRFDLSKIPEGEA-VTAAEFRI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 LRVPNPSSKRNEQ-RIELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAE--WLSFDVTDTVRE
. :: :: ..:.:. ::.... . . : ..: :: ::.: : .
CCDS13 YKDYIRERFDNETFRISVYQVLQ--EHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNH
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE1 WLLRRESNLGLEISIHC-PCHTFQPNGDIL------ENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGD
:.. . ::::..:.. ....:. : .: . : ::... . :.
CCDS13 WVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRST
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 LGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYID
.. ..:. ..:. . :. : ..... .: . : . ::..
CCDS13 GSKQRSQNRSKTPKNQEAL----RMANVAENSSSDQR------------QACKKHELYVS
300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KE1 FRQDLGWK-WVHEPKGYYANFCSGPCPY-LRS--ADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCV
:: ::::. :. :.:: : .: : : . : : :.:. : : . .:::. .:::.
CCDS13 FR-DLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCA
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410
pF1KE1 PQDLEPLTILYYVGRTPKV-EQLSNMVVKSCKCS
: .:. ...::. . . .. ::::..: :
CCDS13 PTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
400 410 420 430
>>CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 (426 aa)
initn: 285 init1: 129 opt: 317 Z-score: 383.4 bits: 79.9 E(32554): 4.9e-15
Smith-Waterman score: 412; 26.7% identity (56.6% similar) in 408 aa overlap (31-412:46-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPT
: . . . :::.. .::. :.: . .:
CCDS54 IIVRSSPTPGSEGHSAAPDCPSCALAALPKDVPNSQPEMVEAVKKHILNMLHLKK--RPD
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VMTHVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNEL
: :: :: :. :.: : : . :: : .. .: . . . .:.
CCDS54 VTQPVPKA--ALLNAIRKL----H----VGKVGENGYVEIEDDIGRRAEMNELMEQTSEI
80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 AVCPK-GITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRV-LRVPNPSSKRNEQRIELFQILR-PD
. . : . :...:..:. .. . . ::: . :.::. . :.. :.::: . :.
CCDS54 ITFAESGTARKTLHFEISKEGSDLSVVERAEVWLFLKVPKANRTRTKVTIRLFQQQKHPQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE1 EHI-----AKQRYIGG---------KNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEI
. :.. . : : . .: .. : : :...... : . .:.: ..:
CCDS54 GSLDTGEEAEEVGLKGERSELLLSEKVVDARKST-WHVFPVSSSIQRLLDQGKSSLDVRI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SIHCPCHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMI
. :. : .: : . . . . .: .. :.: : ..... : : .::.
CCDS54 A----CEQCQESGASLVLLGKKKKKEEEGEGKKKGGGEGGAGADEEKEQSHRP--FLMLQ
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 PPHRLDNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWK-WVHEPKGYYAN
. :.: .:..:.:. . :. :: . ....:. :.::. :. :.::.::
CCDS54 ARQSEDHPH---RRRRRGLECDGKV-NI---CCKKQFFVSFK-DIGWNDWIIAPSGYHAN
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE1 FCSGPCP-YLR----SADTTHSTVLGLYNTL--NPEASASPCCVPQDLEPLTILYYV-GR
.: : :: .. :. . ::::.. : .: :. . :::: :.:...::: :.
CCDS54 YCEGECPSHIAGTSGSSLSFHSTVINHYRMRGHSPFANLKSCCVPTKLRPMSMLYYDDGQ
350 360 370 380 390 400
400 410
pF1KE1 TPKVEQLSNMVVKSCKCS
. ....::.:. : ::
CCDS54 NIIKKDIQNMIVEECGCS
410 420
>>CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 (350 aa)
initn: 307 init1: 143 opt: 303 Z-score: 367.7 bits: 76.8 E(32554): 3.7e-14
Smith-Waterman score: 317; 36.5% identity (60.4% similar) in 159 aa overlap (262-412:203-350)
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 FQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNP
:. :: :..: : : . : ..:
CCDS89 LPSSGLRGEKSGVLKLQLDCRPLEGNSTVTGQPRRLLDTAGHQQPFLELKI----RANEP
180 190 200 210 220
300 310 320 330 340
pF1KE1 GQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWK-WVHEPKGYYANFCSGPCP-
: : :.. : : . :: : :.:: :.:::. :. .:.:: :.::: ::
CCDS89 GAGRARRR----TPTC-EPATPLCCRRDHYVDF-QELGWRDWILQPEGYQLNYCSGQCPP
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 YLRS----ADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILY--YVGRTPKVEQLSN
.: . : . ::.:..: .. :: ... :::: .::..:: . : . :.. . .
CCDS89 HLAGSPGIAASFHSAVFSLLKANNPWPASTSCCVPTARRPLSLLYLDHNGNVVKTD-VPD
290 300 310 320 330 340
410
pF1KE1 MVVKSCKCS
:::..: ::
CCDS89 MVVEACGCS
350
>>CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 (407 aa)
initn: 325 init1: 119 opt: 298 Z-score: 360.7 bits: 75.7 E(32554): 9e-14
Smith-Waterman score: 377; 26.8% identity (51.0% similar) in 396 aa overlap (34-412:70-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 HLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPTVMT
: .. :.:.:..:::::::: : ..
CCDS88 AAGVGGERSSRPAPSVAPEPDGCPVCVWRQHSRELRLESIKSQILSKLRLKEAP--NISR
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 HVPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQEN--TESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNELA
.: :.: ...:. .: . .. :. :.::.: . . ..:.... :
CCDS88 EVVKQLLPKAPPLQQILD-LHDFQGDALQPEDFLEEDEYHATT----ETVISMAQETDPA
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170
pF1KE1 VCPKGITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRV-LR-VPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEH
: : . .:. : . :....:.. : :: :: :.. .::::
CCDS88 VQTDG-SPLCCHFHFSP-KVMFTKVLKAQLWVYLRPVPRPATVY-------LQILRLKPL
160 170 180 190 200
180 190 200 210 220
pF1KE1 IAKQRYIGG----KNLPTRG--------TAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHC
.. :: ... :. ...: :.: .... :. . .:: :.::.
CCDS88 TGEGTAGGGGGGRRHIRIRSLKIELHSRSGHWQSIDFKQVLHSWFRQPQSNWGIEIN---
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 PCHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHR
.:.:.: : . : : : : . : .
CCDS88 ---AFDPSGTDLA-------VTSLGPGAEGLH----------------PFMELRV-----
270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 LDNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGP
:.: .:..: : . .. : :: :: .:: . .:: :. :: : ::.:::
CCDS88 LENT----KRSRRNLGLDCDEHSSESRCCRYPLTVDF-EAFGWDWIIAPKRYKANYCSGQ
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 CPYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVE-QLSNMVV
: :. :. : . ::..::.:::.: . :...::. . . .. .:::
CCDS88 CEYMFMQKYPHTH---LVQQANPRGSAGPCCTPTKMSPINMLYFNDKQQIIYGKIPGMVV
350 360 370 380 390 400
410
pF1KE1 KSCKCS
: ::
CCDS88 DRCGCS
>>CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 (375 aa)
initn: 429 init1: 113 opt: 297 Z-score: 360.0 bits: 75.4 E(32554): 9.9e-14
Smith-Waterman score: 448; 27.9% identity (52.5% similar) in 383 aa overlap (36-412:49-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 QRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLTSPPEPTVMTHV
:..:.:::. :::::::: . :. . :
CCDS23 GPVDLNENSEQKENVEKEGLCNACTWRQNTKSSRIEAIKIQILSKLRLETAPN--ISKDV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQGLAEHNELAVCPK
:.: :::.... .:... ...:.: .: .: . :
CCDS23 IRQLLPKAPPLRELIDQYDVQRDDSSDGSLEDDDYHATT---ETIITMPTESDFLMQVDG
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GITSKVFRFNVSSVEKNRTNLFRAEFRV-LR-VPNPSSKRNEQRIELFQILRPDEHIAKQ
:.:. :... :. . .:.. . :: : .:.. ........: .
CCDS23 KPKCCFFKFS-SKIQYNK--VVKAQLWIYLRPVETPTTVF----VQILRLIKPMKD--GT
140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RYIGGKNLPTR---GTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCPCHTFQPNGDILE
:: : ..: ::. : :.:: ....:: . :::::.::. . :
CCDS23 RYTGIRSLKLDMNPGTGIWQSIDVKTVLQNWLKQPESNLGIEIKA------------LDE
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKR
: :. . . : : .: :: : . . :.: .:..:
CCDS23 NGHD-LAVTFPG----------------PGEDGLNPFLEVKVT-----DTP----KRSRR
240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPCPYLRSADTTHST
. . .. : :: :: .:: . .:: :. :: : ::.::: : .. :.
CCDS23 DFGLDCDEHSTESRCCRYPLTVDF-EAFGWDWIIAPKRYKANYCSGECEFVFLQKYPHTH
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KE1 VLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVE-QLSNMVVKSCKCS
: . ::..::.:::.: . :...::. :. . .. ::: : ::
CCDS23 ---LVHQANPRGSAGPCCTPTKMSPINMLYFNGKEQIIYGKIPAMVVDRCGCS
330 340 350 360 370
>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 294 init1: 109 opt: 289 Z-score: 348.4 bits: 73.7 E(32554): 4.4e-13
Smith-Waterman score: 377; 27.0% identity (53.9% similar) in 319 aa overlap (109-411:213-512)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQG---LAEHNELAVCPKGITSKVFRFN
::... :.:... :. : :.::
CCDS45 NRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDK-EFSPRQRHHKEFKFN
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 VSSVEKNRTNLFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQR-IELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTR
.:.. .... . ::::. . .: .:. : ..:.:. .: .. .. .
CCDS45 LSQIPEGEV-VTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWA
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240
pF1KE1 GTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISI------HC-PCHTFQPNGDILENIHEVME
. :: ::.: : :.. . :.::..:. : : . . : . . :
CCDS45 SEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMV
310 320 330 340 350 360
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 IKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRLDNPGQGGQRKKRALDTNYC
:: . . :. .: ..:. ... . .: : . : : :
CCDS45 AFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQ--------------SQDVARVSSASDYNS-
370 380 390 400
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWK-WVHEPKGYYANFCSGPCPYLRSAD---TTHSTVLG
.:. : . ::..: :::::. :. :::: ::.:.: : . .: :.:. :
CCDS45 -SELKTACRKHELYVSF-QDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQT
410 420 430 440 450 460
370 380 390 400 410
pF1KE1 LYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKV-EQLSNMVVKSCKCS
: . .::: .:::.: :. ...::. . . .. ::::..: :
CCDS45 LVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
470 480 490 500 510
412 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:24:29 2016 done: Sun Nov 6 14:24:29 2016
Total Scan time: 2.680 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]