Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1878
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1878, 398 aa
1>>>pF1KE1878 398 - 398 aa - 398 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3954+/-0.00101; mu= 10.9479+/- 0.060
mean_var=91.0277+/-18.412, 0's: 0 Z-trim(105.0): 80 B-trim: 2 in 1/48
Lambda= 0.134427
statistics sampled from 8138 (8218) to 8138 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2054.1 IL1R2 gene_id:7850|Hs108|chr2 ( 398) 2710 536.1 2.1e-152
CCDS58719.1 IL1R2 gene_id:7850|Hs108|chr2 ( 296) 2003 398.9 3.1e-111
CCDS74547.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 538) 444 96.7 5.4e-20
CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 569) 444 96.7 5.6e-20
CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX ( 686) 443 96.6 7.6e-20
CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX ( 696) 392 86.7 7.3e-17
CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 ( 575) 383 84.9 2.1e-16
CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 556) 359 80.2 5.1e-15
CCDS2058.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 328) 354 79.2 6.3e-15
CCDS46982.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 356) 313 71.2 1.7e-12
CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 570) 313 71.3 2.5e-12
CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 687) 313 71.4 2.9e-12
>>CCDS2054.1 IL1R2 gene_id:7850|Hs108|chr2 (398 aa)
initn: 2710 init1: 2710 opt: 2710 Z-score: 2849.5 bits: 536.1 E(32554): 2.1e-152
Smith-Waterman score: 2710; 100.0% identity (100.0% similar) in 398 aa overlap (1-398:1-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLRLYVLVMGVSAFTLQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWLWAS
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CCDS20 MLRLYVLVMGVSAFTLQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWLWAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VSPRINLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLLPALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VSPRINLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLLPALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IELRVFENTDAFLPFISYPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKTDVKIQWYKDSLLLDKDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 IELRVFENTDAFLPFISYPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKTDVKIQWYKDSLLLDKDN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRSIELRIKKKKEETIPVII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 EKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRSIELRIKKKKEETIPVII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SPLKTISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLWWTANDTHIESAYPGGRVTEGPRQEYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SPLKTISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLWWTANDTHIESAYPGGRVTEGPRQEYSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NNENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNTLSFQTLRTTVKEASSTFSWGIVLAPLSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 NNENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNTLSFQTLRTTVKEASSTFSWGIVLAPLSLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE1 FLVLGGIWMHRRCKHRTGKADGLTVLWPHHQDFQSYPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 FLVLGGIWMHRRCKHRTGKADGLTVLWPHHQDFQSYPK
370 380 390
>>CCDS58719.1 IL1R2 gene_id:7850|Hs108|chr2 (296 aa)
initn: 2003 init1: 2003 opt: 2003 Z-score: 2110.5 bits: 398.9 E(32554): 3.1e-111
Smith-Waterman score: 2003; 100.0% identity (100.0% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLRLYVLVMGVSAFTLQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWLWAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLRLYVLVMGVSAFTLQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWLWAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VSPRINLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLLPALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VSPRINLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLLPALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IELRVFENTDAFLPFISYPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKTDVKIQWYKDSLLLDKDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IELRVFENTDAFLPFISYPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKTDVKIQWYKDSLLLDKDN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRSIELRIKKKKEETIPVII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRSIELRIKKKKEETIPVII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SPLKTISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLWWTANDTHIESAYPGGRVTEGPRQEYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPLKTISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLWWTANDTHIESAYPGGRVTEGPRQ
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NNENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNTLSFQTLRTTVKEASSTFSWGIVLAPLSLA
>>CCDS74547.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 (538 aa)
initn: 368 init1: 188 opt: 444 Z-score: 472.5 bits: 96.7 E(32554): 5.4e-20
Smith-Waterman score: 444; 29.4% identity (59.4% similar) in 310 aa overlap (67-371:55-357)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 REFRLEGEPVALRCPQVPYWLWASVSPRINLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLL
.::.:.:: : :. .:. . ::..
CCDS74 EREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWYKDDSKTPVSTEQASRIHQHKEKLWFV
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMSIELRVFENTDAFLPFIS--YPQILTLSTSGVLVCPD
:: :::: : :..::.::: ...: . :: . . . : : .. .: ::::
CCDS74 PAKVEDSGHYYCVVRNSSYCLRIKISAKFVENEPNLCYNAQAIFKQKLPVAGDGGLVCPY
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 LSEFTRDKTDV-KIQWYKDSLLLDKDNEKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAH
. : ..... :.::::: : :: .: .:. .:.: .:: . : : : ....
CCDS74 MEFFKNENNELPKLQWYKDCKPLLLDNIHFSGVK--DRLIVMNVAEKHRGNYTCHASYTY
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 EGQQYNITRSIELRIKKKKEETIPVIISPL-KTISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTML
:.:: ::: ::. .... : :::.:: .:. ..:::.. . :.: :: :. .
CCDS74 LGKQYPITRVIEFITLEENKPTRPVIVSPANETMEVDLGSQIQLICNV---TGQ-LSDIA
210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 WWTANDTHIESAYPG-GRVTEGPRQEYSENNENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNT
.: : . :. : :. . .. .. . : : : . .: : : : ..::
CCDS74 YWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANKRRSTLITVLNISEIESRFYKH-PFTCFAKNT
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 LSFQTLRTTVKEASSTFSWGIVLAPLSLAFLVLGGIWMHRRCKHRTGKADGLTVLWPHHQ
.... . ..:. .. ..:. ... ......
CCDS74 HGIDAAYIQLIYPVTNFQKHMIGICVTLTVIIVCSVFIYKIFKIDIVLWYRDSCYDFLPI
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 DFQSYPK
CCDS74 KVLPEVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSS
380 390 400 410 420 430
>>CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 (569 aa)
initn: 368 init1: 188 opt: 444 Z-score: 472.1 bits: 96.7 E(32554): 5.6e-20
Smith-Waterman score: 444; 29.4% identity (59.4% similar) in 310 aa overlap (67-371:55-357)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 REFRLEGEPVALRCPQVPYWLWASVSPRINLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLL
.::.:.:: : :. .:. . ::..
CCDS20 EREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWYKDDSKTPVSTEQASRIHQHKEKLWFV
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMSIELRVFENTDAFLPFIS--YPQILTLSTSGVLVCPD
:: :::: : :..::.::: ...: . :: . . . : : .. .: ::::
CCDS20 PAKVEDSGHYYCVVRNSSYCLRIKISAKFVENEPNLCYNAQAIFKQKLPVAGDGGLVCPY
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 LSEFTRDKTDV-KIQWYKDSLLLDKDNEKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAH
. : ..... :.::::: : :: .: .:. .:.: .:: . : : : ....
CCDS20 MEFFKNENNELPKLQWYKDCKPLLLDNIHFSGVK--DRLIVMNVAEKHRGNYTCHASYTY
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 EGQQYNITRSIELRIKKKKEETIPVIISPL-KTISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTML
:.:: ::: ::. .... : :::.:: .:. ..:::.. . :.: :: :. .
CCDS20 LGKQYPITRVIEFITLEENKPTRPVIVSPANETMEVDLGSQIQLICNV---TGQ-LSDIA
210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 WWTANDTHIESAYPG-GRVTEGPRQEYSENNENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNT
.: : . :. : :. . .. .. . : : : . .: : : : ..::
CCDS20 YWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANKRRSTLITVLNISEIESRFYKH-PFTCFAKNT
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 LSFQTLRTTVKEASSTFSWGIVLAPLSLAFLVLGGIWMHRRCKHRTGKADGLTVLWPHHQ
.... . ..:. .. ..:. ... ......
CCDS20 HGIDAAYIQLIYPVTNFQKHMIGICVTLTVIIVCSVFIYKIFKIDIVLWYRDSCYDFLPI
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 DFQSYPK
CCDS20 KASDGKTYDAYILYPKTVGEGSTSDCDIFVFKVLPEVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIV
380 390 400 410 420 430
>>CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX (686 aa)
initn: 358 init1: 141 opt: 443 Z-score: 469.8 bits: 96.6 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 443; 28.0% identity (57.8% similar) in 339 aa overlap (4-330:7-335)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLRLYVLVMGVSAFTLQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWL
: ..: .: . .:. ... ... .: . : . : :::: ..: ..
CCDS14 MKPPFLLALVVCSVVSTNLKMVSKRNSVDGCIDWSVDLKTYMALAGEPVRVKCALFYSYI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 WASVSPR----INLTWHKNDSARTVPG-EEETRMWAQDGALWLLPALQEDSGTYVCTTRN
.. : . : :.:: . : :.:: .. ..:. : .::: :.:. ::
CCDS14 RTNYSTAQSTGLRLMWYKNKGDLEEPIIFSEVRMSKEEDSIWFHSAEAQDSGFYTCVLRN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ASYCDKMSIELRVFENTDA--FLPFISYPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKTDVKIQWY
..:: :.:. : : :: .. . : : . .. . :::...: .. . . ::
CCDS14 STYCMKVSMSLTVAENESGLCYNSRIRYLEKSEVTKRKEISCPDMDDFKKSDQEPDVVWY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KDSLLLDKDNEKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRSIELRIKK
:. : .... .:.. ::...: ::.: : : : . ::. . :. ::..
CCDS14 KECK--PKMWRSIIIQKGNA-LLIQEVQEEDGGNYTCELKY--EGKL--VRRTTELKVTA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 KKEETIPVIISPLKT----ISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLWWTANDTHIESAYP
. : . :... :...::. :.::::.:.: . :..: .. ::
CCDS14 LLTDKPPKPLFPMENQPSVIDVQLGKPLNIPCKAFFGFSGESGPMIYWMKGEKFIEEL--
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GGRVTEGPRQEYSEN-NENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNTLSFQTLRTTVKEAS
.:.. :: . .:. .:. .:. :::: :.. :: .. : :.:
CCDS14 AGHIREGEIRLLKEHLGEKEVELALIFDSVVEADL-ANYTCHVENRNGRKHASVLLRKKD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE1 STFSWGIVLAPLSLAFLVLGGIWMHRRCKHRTGKADGLTVLWPHHQDFQSYPK
CCDS14 LIYKIELAGGLGAIFLLLVLLVVIYKCYNIELMLFYRQHFGADETNDDNKEYDAYLSYTK
360 370 380 390 400 410
>>CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX (696 aa)
initn: 213 init1: 153 opt: 392 Z-score: 416.2 bits: 86.7 E(32554): 7.3e-17
Smith-Waterman score: 394; 27.5% identity (55.4% similar) in 345 aa overlap (7-330:8-338)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLRLYVLVMGVSAFT--LQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWL
:.. ..:: :. ... :.: .: . :. : :::: ..: ..
CCDS14 MKAPIPHLILLYATFTQSLKVVTKRGSADGCTDWSIDIKKYQVLVGEPVRIKCALFYGYI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 WASVS----PRINLTWHKNDSARTVPGEEE-------TRMWAQDGALWLLPALQEDSGTY
.. : ..: :.:... ::. : .:: .. ..:. :.: .::: :
CCDS14 RTNYSLAQSAGLSLMWYKSSG----PGDFEEPIAFDGSRMSKEEDSIWFRPTLLQDSGLY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 VCTTRNASYCDKMSIELRVFENTDAFLPFIS---YPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKT
.:. ::..:: :.:: : : :: :. : . : : . :: : . : :. .:
CCDS14 ACVIRNSTYCMKVSISLTVGEN-DTGLCYNSKMKYFEKAELSKSKEISCRDIEDFLLPTR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 DVKIQWYKDSLLLDKDNEKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRS
. .: :::. : . . . : ::...: .: : : : : .. . . :.
CCDS14 EPEILWYKECRT--KTWRPSIVFKRDT-LLIREVREDDIGNYTCELKYGG----FVVRRT
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE1 IELRIKKKKEETIPVIISPLK---TISAS-LGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLWWTANDT
:: . . : .. :.. ::. . ::. .. :..:.: . .. ...: ..
CCDS14 TELTVTAPLTDKPPKLLYPMESKLTIQETQLGDSANLTCRAFFGYSGDVSPLIYWMKGEK
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 HIESAYPGGRVTEGPRQEYSEN-NENYIEVPLIFDPVTREDLHMDFKCVVHNTLSFQTLR
::. .:: :. . .:. .:. . . :: : : . :: ...: :.:
CCDS14 FIED-LDENRVWESDIRILKEHLGEQEVSISLIVDSVEEGDLG-NYSCYVENGNGRRHAS
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 TTVKEASSTFSWGIVLAPLSLAFLVLGGIWMHRRCKHRTGKADGLTVLWPHHQDFQSYPK
CCDS14 VLLHKRELMYTVELAGGLGAILLLLVCLVTIYKCYKIEIMLFYRNHFGAEELDGDNKDYD
350 360 370 380 390 400
>>CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 (575 aa)
initn: 247 init1: 131 opt: 383 Z-score: 408.1 bits: 84.9 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 391; 27.4% identity (54.0% similar) in 387 aa overlap (36-396:28-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 VLVMGVSAFTLQPAAHTGAARSCRFRGRHYKREFRLEGEPVALRCPQVPYWLWASVSPRI
: :. ..: :. : : .: ..
CCDS20 MWSLLLCGLSIALPLSVTADGCKDIFMKNEILSASQPFAFNCTFPPI-----TSGEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NLTWHKNDSARTVPGEEETRMWAQDGALWLLPALQEDSGTYVCTTRNASYCDKMSIELRV
..::.::.: : ..:. .. . .:: :::.: :. .. . : .. ..: :
CCDS20 SVTWYKNSSKIPVSKIIQSRIHQDETWILFLPMEWGDSGVYQCVIKGRDSCHRIHVNLTV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 FEN--TDAF---LPFIS--YPQILTLSTSGVLVCPDLSEFTRDKTDVKIQWYKDSLLLDK
::. :. :: .: : ::: :. . :.: .: .. . :.:::: .
CCDS20 FEKHWCDTSIGGLPNLSDEYKQILHLGKDDSLTCH--LHFPKSCVLGPIKWYKDC--NEI
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DNEKFLSVRGTTHLLVHDVALEDAGYYRCVLTFAHEGQQYNITRSIELRIKKKKEE--TI
.:.: .. :.::: .:. :: : : : ..: :.::.. .: . : .. ..
CCDS20 KGERFTVLE--TRLLVSNVSAEDRGNYACQAILTHSGKQYEVLNGITVSITERAGYGGSV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PVIISPLK-TISASLGSRLTIPCKVFLGTGTPLTTMLW-WTANDTHIESAYP-GGRVTEG
: :: : . .: ..::. : . :.: : : .: : : .:.: ... : . :. ::
CCDS20 PKIIYPKNHSIEVQLGTTLIVDCNV---TDTKDNTNLRCWRVNNTLVDDYYDESKRIREG
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CCDS20 APAQNEIKEVEIGKNANLTCSACFGKGTQFLAAVLWQLNGTKITDFGEPRIQQEEGQNQS
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CCDS46 GNRCGQ
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]