FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1865, 386 aa
1>>>pF1KE1865 386 - 386 aa - 386 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6303+/-0.000959; mu= 15.1265+/- 0.057
mean_var=68.5108+/-13.919, 0's: 0 Z-trim(104.5): 22 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.154951
statistics sampled from 7932 (7942) to 7932 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10902.1 CHST4 gene_id:10164|Hs108|chr16 ( 386) 2637 598.7 2.9e-171
CCDS10918.1 CHST6 gene_id:4166|Hs108|chr16 ( 395) 1337 308.1 9.1e-84
CCDS10919.1 CHST5 gene_id:23563|Hs108|chr16 ( 411) 1334 307.4 1.5e-83
CCDS7913.1 CHST1 gene_id:8534|Hs108|chr11 ( 411) 745 175.7 6.5e-44
CCDS7312.1 CHST3 gene_id:9469|Hs108|chr10 ( 479) 684 162.1 9.5e-40
CCDS3129.1 CHST2 gene_id:9435|Hs108|chr3 ( 530) 318 80.3 4.4e-15
CCDS14268.1 CHST7 gene_id:56548|Hs108|chrX ( 486) 317 80.1 4.8e-15
>>CCDS10902.1 CHST4 gene_id:10164|Hs108|chr16 (386 aa)
initn: 2637 init1: 2637 opt: 2637 Z-score: 3188.1 bits: 598.7 E(32554): 2.9e-171
Smith-Waterman score: 2637; 100.0% identity (100.0% similar) in 386 aa overlap (1-386:1-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLLPKKMKLLLFLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMKAQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQ
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CCDS10 MLLPKKMKLLLFLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMKAQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LFGQHPDVFYLMEPAWHVWMTFKQSTAWMLHMAVRDLIRAVFLCDMSVFDAYMEPGPRRQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SSLFQWENSRALCSAPACDIIPQDEIIPRAHCRLLCSQQPFEVVEKACRSYSHVVLKEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSLFQWENSRALCSAPACDIIPQDEIIPRAHCRLLCSQQPFEVVEKACRSYSHVVLKEVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERTKGDLMIDSRIVMGQHEQKLKKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERTKGDLMIDSRIVMGQHEQKLKKED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QPYYVMQVICQSQLEIYKTIQSLPKALQERYLLVRYEDLARAPVAQTSRMYEFVGLEFLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QPYYVMQVICQSQLEIYKTIQSLPKALQERYLLVRYEDLARAPVAQTSRMYEFVGLEFLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HLQTWVHNITRGKGMGDHAFHTNARDALNVSQAWRWSLPYEKVSRLQKACGDAMNLLGYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HLQTWVHNITRGKGMGDHAFHTNARDALNVSQAWRWSLPYEKVSRLQKACGDAMNLLGYR
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE1 HVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
370 380
>>CCDS10918.1 CHST6 gene_id:4166|Hs108|chr16 (395 aa)
initn: 1336 init1: 645 opt: 1337 Z-score: 1617.3 bits: 308.1 E(32554): 9.1e-84
Smith-Waterman score: 1337; 56.8% identity (77.5% similar) in 373 aa overlap (14-376:6-375)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLLPKKMKLLLFLVSQMAILAL-----FFHMYSHNISSLSMKAQPE-RMHVLVLSSWRSG
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CCDS10 MWLPRVSSTAVTALLLAQTFLLLFLVSRPGPSSPAGGEARVHVLVLSSWRSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SSFVGQLFGQHPDVFYLMEPAWHVWMTFKQSTAWMLHMAVRDLIRAVFLCDMSVFDAYME
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CCDS10 SSFVGQLFNQHPDVFYLMEPAWHVWTTLSQGSAATLHMAVRDLVRSVFLCDMDVFDAYL-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 PGPRRQSSLFQWENSRALCSAPACDIIPQDEIIPRAHCRLLCSQQPFEVVEKACRSYSHV
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CCDS10 PWRRNLSDLFQWAVSRALCSPPACSAFPRGAISSEAVCKPLCARQSFTLAREACRSYSHV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VLKEVRFFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERTKGDLMIDSRIVMGQHEQ
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CCDS10 VLKEVRFFNLQVLYPLLSDPALNLRIVHLVRDPRAVLRSREQTAKALARDNGIVLGTNGT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 KLKKEDQPYYVMQVICQSQLEIYK--TIQSLPKALQERYLLVRYEDLARAPVAQTSRMYE
.. : :.. .:.:...: . :.. : :. :: :::.::::: :.:. .:
CCDS10 WVEA-DPGLRVVREVCRSHVRIAEAATLKP-PPFLRGRYRLVRFEDLAREPLAEIRALYA
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FVGLEFLPHLQTWVHNITRGKGMGDH--AFHTNARDALNVSQAWRWSLPYEKVSRLQKAC
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CCDS10 FTGLSLTPQLEAWIHNITHGSGPGARREAFKTSSRNALNVSQAWRHALPFAKIRRVQELC
290 300 310 320 330 340
360 370 380
pF1KE1 GDAMNLLGYRHVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
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CCDS10 AGALQLLGYRPVYSEDEQRNLALDLVLPRGLNGFTWASSTASHPRN
350 360 370 380 390
>>CCDS10919.1 CHST5 gene_id:23563|Hs108|chr16 (411 aa)
initn: 1284 init1: 622 opt: 1334 Z-score: 1613.5 bits: 307.4 E(32554): 1.5e-83
Smith-Waterman score: 1334; 54.1% identity (77.2% similar) in 381 aa overlap (1-376:22-397)
10 20 30
pF1KE1 MLLPK--KMKLLLFLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMK
: ::. . . ..:..: . : :: . :. : :
CCDS10 MGMRARVPKVAHSTRRPPAARMWLPRFSSKTVTVLLLAQTTCLLLF--IISRPGPS-SPA
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQLFGQHPDVFYLMEPAWHVWMTFKQSTAWMLHMAVRDL
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CCDS10 GGEDRVHVLVLSSWRSGSSFLGQLFSQHPDVFYLMEPAWHVWTTLSQGSAATLHMAVRDL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 IRAVFLCDMSVFDAYMEPGPRRQSSLFQWENSRALCSAPACDIIPQDEIIPRAHCRLLCS
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CCDS10 MRSIFLCDMDVFDAYM-PQSRNLSAFFNWATSRALCSPPACSAFPRGTISKQDVCKTLCT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 QQPFEVVEKACRSYSHVVLKEVRFFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERT
.::: ....::::::::::::::::::: :::::.::.:::.:::::::::::.:::: .
CCDS10 RQPFSLAREACRSYSHVVLKEVRFFNLQVLYPLLSDPALNLRIVHLVRDPRAVLRSREAA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 KGDLMIDSRIVMGQHEQKLKKEDQPYYVMQVICQSQLEIYKTIQSLPKA-LQERYLLVRY
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CCDS10 GPILARDNGIVLGTN-GKWVEADPHLRLIREVCRSHVRIAEAATLKPPPFLRGRYRLVRF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 EDLARAPVAQTSRMYEFVGLEFLPHLQTWVHNITRGKGMGD--HAFHTNARDALNVSQAW
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CCDS10 EDLAREPLAEIRALYAFTGLTLTPQLEAWIHNITHGSGIGKPIEAFHTSSRNARNVSQAW
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE1 RWSLPYEKVSRLQKACGDAMNLLGYRHVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
: .::. :. :.:..:. :..::::: : : ..::.: :::.
CCDS10 RHALPFTKILRVQEVCAGALQLLGYRPVYSADQQRDLTLDLVLPRGPDHFSWASPD
360 370 380 390 400 410
>>CCDS7913.1 CHST1 gene_id:8534|Hs108|chr11 (411 aa)
initn: 708 init1: 241 opt: 745 Z-score: 901.9 bits: 175.7 E(32554): 6.5e-44
Smith-Waterman score: 745; 36.7% identity (64.8% similar) in 341 aa overlap (42-370:60-396)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 FLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMKAQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQLFGQHPDVFYL
. :.:.:.. :::::::::::.:: :::::
CCDS79 SFHTCPGLAEAGLAERLCEESPTFAYNLSRKTHILILATTRSGSSFVGQLFNQHLDVFYL
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120
pF1KE1 MEPAWHVWMT----FKQSTA----WMLHMAVRDLIRAVFLCDMSVFDAYMEPGPRRQSS-
.:: .:: : : :. . .. : :::.:... ::. .. :..: : ...
CCDS79 FEPLYHVQNTLIPRFTQGKSPADRRVMLGASRDLLRSLYDCDLYFLENYIKPPPVNHTTD
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 -LFQWENSRALCSAPACDII-PQDEIIPRAHCRLLCSQQPFEVVEKACRSYSHVVLKEVR
.:. ::.::: :.:: : : .. .. : :. . :. .::: :::..: ::
CCDS79 RIFRRGASRVLCSRPVCDPPGPADLVLEEGDCVRKCGLLNLTVAAEACRERSHVAIKTVR
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERTKGDLMIDSRIVMGQHEQKLKKED
....: :..:: :::....::::::... :: .: : . :. .: . : .
CCDS79 VPEVNDLRALVEDPRLNLKVIQLVRDPRGILASRSETFRDTYRLWRLWYGTGR---KPYN
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QPYYVMQVICQSQLEIYKTIQSLPKALQERYLLVRYEDLARAPVAQTSRMYEFVGLEFLP
. ..:.. . .: : :. .:.::::::::: :. .: ..: :.:. .
CCDS79 LDVTQLTTVCEDFSNSVSTGLMRPPWLKGKYMLVRYEDLARNPMKKTEEIYGFLGIPLDS
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KE1 HLQTWVHNITRGKG-MGDHAFHTNARDALNVSQAWRWSLPYEKVSRLQKACGDAMNLLGY
:. :..: ::: .: : . : .:.. ... ::. : :. :. :.:: ... :::
CCDS79 HVARWIQNNTRGDPTLGKHKYGT-VRNSAATAEKWRFRLSYDIVAFAQNACQQVLAQLGY
330 340 350 360 370 380
360 370 380
pF1KE1 RHVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
. . ::.: .:
CCDS79 KIAASEEELKNPSVSLVEERDFRPFS
390 400 410
>>CCDS7312.1 CHST3 gene_id:9469|Hs108|chr10 (479 aa)
initn: 667 init1: 203 opt: 684 Z-score: 827.1 bits: 162.1 E(32554): 9.5e-40
Smith-Waterman score: 684; 33.1% identity (65.7% similar) in 347 aa overlap (38-376:129-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 KLLLFLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMKAQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQLFGQHPD
: :.: :::.... :.::::::..:.:. .
CCDS73 LQLGVEPAMEAAGEEEEEQRKEEEPPRPAVAGPRR-HVLLMATTRTGSSFVGEFFNQQGN
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VFYLMEPAWHVWMT--FKQSTAWMLHMAV--RDLIRAVFLCDMSVFDAYMEPGPRRQSSL
.:::.:: ::. : :. . : :. ::... .::::. :.. .. : :. . .
CCDS73 IFYLFEPLWHIERTVSFEPGGANAAGSALVYRDVLKQLFLCDLYVLEHFITPLPEDHLTQ
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FQWE--NSRALCSAPACDIIPQDEIIPRAHCR-LLCSQQPFEVVEKACRSYSHVVLKEVR
:... .::.:: :.: . . ... . ::. :. .. .::: :..:: ::
CCDS73 FMFRRGSSRSLCEDPVCTPFVK-KVFEKYHCKNRRCGPLNVTLAAEACRRKEHMALKAVR
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230
pF1KE1 FFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERT-KGDLMIDSRIVMGQHEQKLKKE
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CCDS73 IRQLEFLQPLAEDPRLDLRVIQLVRDPRAVLASRMVAFAGKYKTWKKWLDDEGQDGLREE
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DQPYYVMQVICQSQLEIYKTIQSLPKALQERYLLVRYEDLARAPVAQTSRMYEFVGLEFL
. .. :.: . : :. ::.::::::.::.:. .. .::.:.:. .
CCDS73 E--VQRLRGNCESIRLSAELGLRQPAWLRGRYMLVRYEDVARGPLQKAREMYRFAGIPLT
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PHLQTWVHNITRGKGMGDHAFHTNARDALNVSQAWRWSLPYEKVSRLQKACGDAMNLLGY
:... :... :.. :. . :. ... . . ::.:.:.. .. .: ::: :: :.::
CCDS73 PQVEDWIQKNTQAAHDGSGIYSTQ-KNSSEQFEKWRFSMPFKLAQVVQAACGPAMRLFGY
400 410 420 430 440 450
360 370 380
pF1KE1 RHVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
. .:. : ..::
CCDS73 KLARDAAALTNRSVSLLEERGTFWVT
460 470
>>CCDS3129.1 CHST2 gene_id:9435|Hs108|chr3 (530 aa)
initn: 750 init1: 313 opt: 318 Z-score: 384.2 bits: 80.3 E(32554): 4.4e-15
Smith-Waterman score: 781; 37.1% identity (65.9% similar) in 364 aa overlap (41-376:163-525)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 LFLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMKAQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQLFGQHPDVFY
.:. : :...::::::: :.::.:.:.::.
CCDS31 VGAAPAAAAGMAGVAAPPGNGTRGTGGVGDKRQLVYVFTTWRSGSSFFGELFNQNPEVFF
140 150 160 170 180 190
80 90 100 110 120
pF1KE1 LMEPAWHVWMTFKQSTAWMLHMAVRDLIRAVFLCDMSVFDAYMEPGP--RRQSSL--FQW
:.::.::::. . . : :. :.::.. :.. ::.:::. : : : ..: :
CCDS31 LYEPVWHVWQKLYPGDAVSLQGAARDMLSALYRCDLSVFQLYSPAGSGGRNLTTLGIFGA
200 210 220 230 240 250
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ENSRALCSAPACDIIPQDEIIPRAHCRLL--CSQQPFEVVEKACRSYSHVVLKEVRFFNL
.....::.: : . :.. . :. : : . :. ::.: .:.: :: :..
CCDS31 ATNKVVCSSPLCPAY-RKEVVGLVDDRVCKKCPPQRLARFEEECRKYRTLVIKGVRVFDV
260 270 280 290 300 310
190 200 210 220 230
pF1KE1 QSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERTKGDLMIDS-RIVMGQ------------
: :::.::.:.:...::::::::: :: :.. :. .: ..: ..
CCDS31 AVLAPLLRDPALDLKVIHLVRDPRAVASSRIRSRHGLIRESLQVVRSRDPRAHRMPFLEA
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280
pF1KE1 --HEQKLKKED--QP--YYV---MQVICQSQLEIYKTIQSLPKALQERYLLVRYEDLARA
:. ::: : :.. :.:::.:. . .: . : :: .::.::::::.
CCDS31 AGHKLGAKKEGVGGPADYHALGAMEVICNSMAKTLQTALQPPDWLQGHYLVVRYEDLVGD
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 PVAQTSRMYEFVGLEFLPHLQTWVHNITRGKGMGDHAFHTNARDALNVSQAWRWSLPYEK
:: :.:.:::: :... .. :.: :.: ... : ..::.: ....::: .: ...
CCDS31 PVKTLRRVYDFVGLLVSPEMEQFALNMTSGSGSSSKPFVVSARNATQAANAWRTALTFQQ
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380
pF1KE1 VSRLQKACGDAMNLLGYRHVRSEQEQRNLLLDLLSTWTVPEQIH
...... : . : .:::..: : .: ..: ::
CCDS31 IKQVEEFCYQPMAVLGYERVNSPEEVKDLSKTLLRKPRL
500 510 520 530
>>CCDS14268.1 CHST7 gene_id:56548|Hs108|chrX (486 aa)
initn: 772 init1: 310 opt: 317 Z-score: 383.6 bits: 80.1 E(32554): 4.8e-15
Smith-Waterman score: 796; 36.9% identity (64.4% similar) in 360 aa overlap (41-359:100-459)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 LFLVSQMAILALFFHMYSHNISSLSMKAQPERMHVLVLSSWRSGSSFVGQLFGQHPDVFY
:..:. : ..::.::::.:.::.:::::::
CCDS14 EARAAEEGGANQSPRFPSNLSGAVGEAVSREKQHIYVHATWRTGSSFLGELFNQHPDVFY
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120
pF1KE1 LMEPAWHVWMTFKQSTAWMLHMAVRDLIRAVFLCDMSVFDAYMEPG-PRRQS--------
:.:: ::.:... . : :. :.::..:..: ::.::. : :: : ..
CCDS14 LYEPMWHLWQALYPGDAESLQGALRDMLRSLFRCDFSVLRLYAPPGDPAARAPDTANLTT
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170
pF1KE1 -SLFQWENSRALCSAPACDIIPQDE----IIPRAHCRLLCSQQPFEVVEKACRSYSHVVL
.::.:......:: : : :. . .. . :. : ....: ::.: ::.
CCDS14 AALFRWRTNKVICSPPLCPGAPRARAEVGLVEDTACERSCPPVAIRALEAECRKYPVVVI
190 200 210 220 230 240
180 190 200 210 220
pF1KE1 KEVRFFNLQSLYPLLKDPSLNLHIVHLVRDPRAVFRSRERTKGDLMIDS-----------
:.::...: : :::.::.:::..:.: :::::: :: ... :. .:
CCDS14 KDVRLLDLGVLVPLLRDPGLNLKVVQLFRDPRAVHNSRLKSRQGLLRESIQVLRTRQRGD
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270
pF1KE1 ---RIVM--------GQHEQKLKKEDQPYY----VMQVICQSQLEIYKTIQSLPKALQER
:... : . . : . . ...:::.. :. .. : :..:
CCDS14 RFHRVLLAHGVGARPGGQSRALPAAPRADFFLTGALEVICEAWLRDLLFARGAPAWLRRR
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