Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1840
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1840, 357 aa
1>>>pF1KE1840 357 - 357 aa - 357 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2010+/-0.000752; mu= 18.0870+/- 0.046
mean_var=85.1020+/-16.662, 0's: 0 Z-trim(110.7): 44 B-trim: 38 in 1/50
Lambda= 0.139029
statistics sampled from 11797 (11840) to 11797 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.364), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 2492 509.3 2e-144
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 2063 423.2 1.5e-118
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 1540 318.4 6.1e-87
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 837 177.4 1.7e-44
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 833 176.6 3e-44
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 828 175.6 5.7e-44
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 824 174.8 1e-43
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 745 158.9 6e-39
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 726 155.1 8.4e-38
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 715 152.9 3.8e-37
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 714 152.7 4.4e-37
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 699 149.7 3.6e-36
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 699 149.7 3.7e-36
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 660 141.8 7.2e-34
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 660 141.9 8.4e-34
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 660 141.9 8.7e-34
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 642 138.3 1e-32
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 596 129.0 5.9e-30
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 596 129.0 6.1e-30
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 520 113.8 2.5e-25
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 510 111.8 9.4e-25
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 482 106.2 4.6e-23
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 480 105.8 6.1e-23
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 480 105.8 6.3e-23
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 427 95.2 1.1e-19
>>CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 (357 aa)
initn: 2492 init1: 2492 opt: 2492 Z-score: 2706.5 bits: 509.3 E(32554): 2e-144
Smith-Waterman score: 2492; 99.7% identity (99.7% similar) in 357 aa overlap (1-357:1-357)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLKL
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CCDS11 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRTGLLKRGFKETAFLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS11 SRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRMGLLKRGFKETAFLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFRETGQVLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFRETGQVLKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPARQGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPSFCRPSKYSPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPARQGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPSFCRPSKYSPGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 AGRVCSREASCSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQEELVYTCKH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGRVCSREASCSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQEELVYTCKH
310 320 330 340 350
>>CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 (329 aa)
initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 2241.9 bits: 423.2 E(32554): 1.5e-118
Smith-Waterman score: 2063; 99.7% identity (99.7% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRTGLLKRGFKETAFLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS82 SRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRMGLLKRGFKETAFLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFRETGQVLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFRETGQVLKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPARQGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPSFCRPSKYSPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPARQGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPSFCRPSKYSPGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 AGRVCSREASCSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQEELVYTCKH
::
CCDS82 AGWSAVARSQLITTSTSRIQAILPSQLPE
310 320
>>CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 (365 aa)
initn: 1223 init1: 453 opt: 1540 Z-score: 1674.4 bits: 318.4 E(32554): 6.1e-87
Smith-Waterman score: 1540; 61.2% identity (82.9% similar) in 356 aa overlap (6-356:12-364)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQ
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CCDS31 MLDGSPLARWLAAAFGLTLLLAALRPSAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQ--AHYKA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CDLLKLSRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGR--TGLLKRG
:: ::: :.:...:::.::.:::: .:. .. :::::::: :::::.:::: ..:::::
CCDS31 CDRLKLERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVSMSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRASLLKRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FKETAFLYAVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKF
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CCDS31 FKETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKYSSKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LSNFLGSKRGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFR
...::: .:..::::::.: ::. ::.:..:.:..::::::::::::.:::::.::.::.
CCDS31 VKEFLG-RRSSKDLRARVDFHNNLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 ETGQVLKLRYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPAR---QGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPS
:.:. :: .:..:.::.:.:::: :. .: : .:. . ::. .::...::::
CCDS31 EVGKHLKHKYETALKVGSTTNEAAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPELVHLDDSPS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 FCRPSKYSPGTAGRVCSREASCSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQE
:: ...::::::: : :: .: :.:::::..::::.:. :.:::.:::::::.::.:.
CCDS31 FCLAGRFSPGTAGRRCHREKNCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQR
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE1 ELVYTCKH
: :::::
CCDS31 EEVYTCKG
360
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 569 init1: 255 opt: 837 Z-score: 912.5 bits: 177.4 E(32554): 1.7e-44
Smith-Waterman score: 846; 38.9% identity (68.2% similar) in 324 aa overlap (55-356:43-351)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 FGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLK-LSRRQKQLCRREPGLAETLRDAAH
:. :: : .:: :.:.:. . ...: .:.
CCDS22 LVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQ
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130
pF1KE1 LGLLECQFQFRHERWNCS----LEGRTGLLKRGFKETAFLYAVSSAALTHTLARACSAGR
:.. :::.:::..::::: : .. .: .:.::.::.:::... ...::::.:.
CCDS22 LAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGE
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 MERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSK---RGNKDLRARADAHNTH
.:.: :: . : :..::. :.::. :.. : ..:. . .: .. :: . ::..
CCDS22 LEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHNNE
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 VGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFRETGQVLKLRYDSAVKVSSATNEAL
.: ::. . .:. :::::::::: :.:::. . :::..:..:: ..:.:..:
CCDS22 AGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVE-------
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300
pF1KE1 GRLELWAPARQGSLTKGLAPRSG--------DLVYMEDSPSFCRPSKYSP--GTAGRVCS
: : :: ...:.::.. ::::.: ::.::. . : :: ::.:.
CCDS22 -------PRRVGS-SRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCN
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE1 REAS----CSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQEELVYTCKH
. .. : ::::::. : . .: : :. .:::.:.:.:: . ..::.
CCDS22 KTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 (370 aa)
initn: 804 init1: 480 opt: 833 Z-score: 907.9 bits: 176.6 E(32554): 3e-44
Smith-Waterman score: 833; 37.1% identity (63.7% similar) in 372 aa overlap (12-355:17-369)
10 20 30 40
pF1KE1 MRPPPALALAGLCLLALPAAAAS-----YFGL----TGREVLTPFPGLGTAAAPA
: : ::::: :. ..:. .. ..:: .: . :.
CCDS87 MGLWALLPGWVSATLLLALAALPAALAANSSGRWWGIVNVASSTNLLTDSKSLQLVLEPS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QGGAHLKQCDLLKLSRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCS-----
: :::.:..: :..::. ... . . .. ::..:::..::::
CCDS87 ----------LQLLSRKQRRLIRQNPGILHSVSGGLQSAVRECKWQFRNRRWNCPTAPGP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 -LEGRTGLLKRGFKETAFLYAVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWG
: :. ...:: .::::..:..::..::..::.:: : .: :::: . :.::
CCDS87 HLFGK--IVNRGCRETAFIFAITSAGVTHSVARSCSEGSIESCTCDYRRRGPGGPDWHWG
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 VCGDNLKYSTKFLSNFLGSKRGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCA
:.::. .. : .:. : . ..::: . ::...: .: : .: :::::.::::.
CCDS87 GCSDNIDFGRLFGREFVDSGEKGRDLRFLMNLHNNEAGRTTVFSEMRQECKCHGMSGSCT
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE1 VRTCWKQLSPFRETGQVLKLRYDSAVKV---SSATNEA----LGRLELWAPARQGSLTKG
::::: .: .: .:.::. :.:.: .: . ..:.: : ::: ::..
CCDS87 VRTCWMRLPTLRAVGDVLRDRFDGASRVLYGNRGSNRASRAELLRLEPEDPAHK------
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE1 LAPRSGDLVYMEDSPSFCRPSKY--SPGTAGRVCSREA----SCSSLCCGRGYDTQSRLV
: ::::.: ::.:: : . :::::.:. . .: ::::::. :... :
CCDS87 -PPSPHDLVYFEKSPNFCTYSGRLGTAGTAGRACNSSSPALDGCELLCCGRGHRTRTQRV
290 300 310 320 330 340
330 340 350
pF1KE1 AFSCHCQVQWCCYVECQQCVQEELVYTCKH
. :.: .:::.: :..:.. .... :
CCDS87 TERCNCTFHWCCHVSCRNCTHTRVLHECL
350 360 370
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 799 init1: 281 opt: 828 Z-score: 902.8 bits: 175.6 E(32554): 5.7e-44
Smith-Waterman score: 828; 35.5% identity (67.6% similar) in 330 aa overlap (39-356:23-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 LAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLKLSRRQKQLC
::. .. . ::.. . :. ::. .:
CCDS33 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAIC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRTGL----LKRGFKETAFLYAVSS
. .: .. ..:..:. :::.::: ::::: :. . :. : .:.:: ::...
CCDS33 QSRPDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AALTHTLARACSAGRMERCTCD-DSPGLESR-QAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSKRG
:...:... ::: : . : :: .. : .. ..:.:: :. ...:. : :. ...
CCDS33 AGVAHAVTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFRETGQVLKLRY
.:. : . ::...: :.... .. ::::::::::...::: : :::.:..:: .:
CCDS33 KKNARRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 DSAVKVSSATNEALGRLELWAPARQGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPSFCRPSKY--SPGT
..::.: . .::. . : .: . : ::::.: ::..:. . : ::
CCDS33 NAAVQVEVVRA---SRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGT
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE1 AGRVCSREA----SCSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQEELVYTCK
::.:.: . .:...::::::.:.. ...:.:. .:::.:.:. : .. :.:::
CCDS33 QGRLCNRTSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 H
>>CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 (349 aa)
initn: 777 init1: 278 opt: 824 Z-score: 898.5 bits: 174.8 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 824; 37.0% identity (66.1% similar) in 330 aa overlap (40-356:25-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 AGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQCDLLK-LSRRQKQLC
: ... : :.. . :. . :. ::. .:
CCDS26 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASII--CNKIPGLAPRQRAIC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEG-RTGL---LKRGFKETAFLYAVSS
. .: .. .....:: :::::::. ::::: : :: . :: : .:.:: ::. .
CCDS26 QSRPDAIIVIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AALTHTLARACSAGRMERCTCD-DSPGLESR-QAWQWGVCGDNLKYSTKFLSNFLGSKRG
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CCDS26 AGVAHAITAACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREI
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CCDS11 ECIRIYDVHTCK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]