FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1833, 351 aa
1>>>pF1KE1833 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0733+/-0.000909; mu= 18.1576+/- 0.055
mean_var=76.7930+/-15.123, 0's: 0 Z-trim(107.1): 30 B-trim: 38 in 1/49
Lambda= 0.146357
statistics sampled from 9360 (9389) to 9360 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 2477 532.4 2.1e-151
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 2324 500.2 1.2e-141
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 1626 352.8 2.6e-97
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 876 194.4 1.3e-49
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 868 192.7 4e-49
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 854 189.8 3.1e-48
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 854 189.8 3.2e-48
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 840 186.8 2.4e-47
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 840 186.8 2.4e-47
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 837 186.2 3.7e-47
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 821 182.8 3.8e-46
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 751 168.0 1.1e-41
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 746 166.9 2.2e-41
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 732 163.9 1.5e-40
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 732 164.0 1.8e-40
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 732 164.0 1.9e-40
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 674 151.8 8.7e-37
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 615 139.3 4.8e-33
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 615 139.3 4.9e-33
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 607 137.6 1.5e-32
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 596 135.3 7.7e-32
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 568 129.4 5.2e-30
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 562 128.1 1.1e-29
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 492 113.3 3.2e-25
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 437 101.7 1.1e-21
>>CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 (351 aa)
initn: 2477 init1: 2477 opt: 2477 Z-score: 2831.6 bits: 532.4 E(32554): 2.1e-151
Smith-Waterman score: 2477; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNLFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGNLFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ERWNCPENALQLSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ERWNCPENALQLSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KTGGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KTGGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 VEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
310 320 330 340 350
>>CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 (369 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 2656.8 bits: 500.2 E(32554): 1.2e-141
Smith-Waterman score: 2324; 98.2% identity (98.8% similar) in 337 aa overlap (15-351:33-369)
10 20 30 40
pF1KE1 MGNLFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVA
: .:: . :::::::::::::::::::::
CCDS75 CCIQCLCLVSPFPTLTPCQGGPHCLIPIHLCLTFSLFGRSVNNFLITGPKAYLTYTTSVA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LGAQSGIEECKFQFAWERWNCPENALQLSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LGAQSGIEECKFQFAWERWNCPENALQLSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 SMGDFENCGCDGSNNGKTGGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SMGDFENCGCDGSNNGKTGGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 NRAGRLAVRATMKRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NRAGRLAVRATMKRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 LRAGNSAEGHWVPAEAFLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRAGNSAEGHWVPAEAFLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 WERRSCGRLCTECGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WERRSCGRLCTECGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQ
310 320 330 340 350 360
350
pF1KE1 SLGKGSA
:::::::
CCDS75 SLGKGSA
>>CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 (351 aa)
initn: 1617 init1: 1111 opt: 1626 Z-score: 1860.5 bits: 352.8 E(32554): 2.6e-97
Smith-Waterman score: 1626; 63.4% identity (83.0% similar) in 352 aa overlap (4-348:1-349)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGNLFMLWAALGIC---CAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQ
.:. .. :: :. . .:::::::.::::::: :..::: ::::::::::.:
CCDS74 MFLSKPSVYICLFTCVLQLSHSWSVNNFLMTGPKAYLIYSSSVAAGAQSGIEECKYQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 FAWERWNCPENALQLSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGS
:::.:::::: :::::.:. ::::.:::.:.:::::::::: .:.:::.:::.::::: :
CCDS74 FAWDRWNCPERALQLSSHGGLRSANRETAFVHAISSAGVMYTLTRNCSLGDFDNCGCDDS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NNGKTGGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMK
::. ::.::.:::::::: ::: ::: :::.:: :.:::: ::::::.::: ::..:::
CCDS74 RNGQLGGQGWLWGGCSDNVGFGEAISKQFVDALETGQDARAAMNLHNNEAGRKAVKGTMK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVP
:::::::.::::. ::::::: ::::.: .:: :: :::... . ::::: :. .
CCDS74 RTCKCHGVSGSCTTQTCWLQLPEFREVGAHLKEKYHAALKVDLLQG---AGNSAAGRGAI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 AEAFLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTEC
:..: . ::. ::.::::: :..::. ::::::::. .. .::::::: ::: .:
CCDS74 ADTFRSISTRELVHLEDSPDYCLENKTLGLLGTEGRECLRRGRALGRWERRSCRRLCGDC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARS--P--GSAQSLGKGSA
:: ::::..:..:::::::.:::.:.:.:::. :.::.:.:. : :.:.. :.
CCDS74 GLAVEERRAETVSSCNCKFHWCCAVRCEQCRRRVTKYFCSRAERPRGGAAHKPGRKP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 (370 aa)
initn: 672 init1: 428 opt: 876 Z-score: 1004.4 bits: 194.4 E(32554): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 876; 42.4% identity (65.3% similar) in 297 aa overlap (42-336:81-369)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNCPENALQ
::. : ::...:::.:: .:::::
CCDS87 KSLQLVLEPSLQLLSRKQRRLIRQNPGILHSVSGGLQSAVRECKWQFRNRRWNCPTAPGP
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 LSTHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGGHGWIWGG
. . . :::.:: ::.:::: . ....:: :..:.: :: : :: : :::
CCDS87 HLFGKIVNRGCRETAFIFAITSAGVTHSVARSCSEGSIESCTCDYRRRGP-GGPDWHWGG
120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 CSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKCHGISGSCSI
::::..::. ... :::: :::.: : :::::::.::: .: . :.. :::::.::::..
CCDS87 CSDNIDFGRLFGREFVDSGEKGRDLRFLMNLHNNEAGRTTVFSEMRQECKCHGMSGSCTV
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240
pF1KE1 QTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAE--AFLPSAEAEL
.:::..: .: .:: :. ..: : .. . .: .. :: . : : : . .:
CCDS87 RTCWMRLPTLRAVGDVLRDRFDGASRVLYGNRGSNRASRAELLRLEPEDPAHKPPSPHDL
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 IFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQVEERKTEVI
...:.::..:: .. :: :: :: : :.: .: :: :: . : .:
CCDS87 VYFEKSPNFCTYSGRLGTAGTAGRAC-----NSSSPALDGCELLC--CGRGHRTRTQRVT
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350
pF1KE1 SSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
::: :.::: :.: .: :. . :
CCDS87 ERCNCTFHWCCHVSCRNCTHTRVLHECL
350 360 370
>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 (359 aa)
initn: 545 init1: 395 opt: 868 Z-score: 995.4 bits: 192.7 E(32554): 4e-49
Smith-Waterman score: 868; 41.6% identity (67.1% similar) in 310 aa overlap (36-336:65-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNC
: . . .. ::..::.::. :: .::::
CCDS85 QRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNC
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGG
.: . :. .: .. ..:::.: ::.:.:::. :.. : :.. .:::. . :
CCDS85 S-TADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLP
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170
pF1KE1 HGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKD--------ARALMNLHNNRAGRLAVRATM
. :.::::.::::.: :..: :::. :. :. .:.::::.::.::: ::
CCDS85 RDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMA
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWV
.:::::.:::::..::::::::::..:: :: :::.: . : : : . . :
CCDS85 DVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYDSAAAM----RVTRKG---RLELV
220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PAEAFLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTE
.. :. : .:.... ::::: : : : ::.:: : ..:.. . .: .:
CCDS85 NSRFTQPTPE-DLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMD-----GCELMC--
270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 CGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
:: .. :. . :.:::.::: :.: .: ..:..: :
CCDS85 CGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
320 330 340 350
>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (365 aa)
initn: 548 init1: 378 opt: 854 Z-score: 979.4 bits: 189.8 E(32554): 3.1e-48
Smith-Waterman score: 854; 39.9% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (36-336:71-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNC
: . .. ::..::.::..:: .::::
CCDS58 QMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNC
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGG
.. . :. .: .. ..:::.: .:.:.:::. ... : :.. .:::. . :
CCDS58 S-TVDNTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLP
110 120 130 140 150
130 140 150 160 170
pF1KE1 HGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLE------KG--KDARALMNLHNNRAGRLAVRATM
. :.::::.::...: :..: :::. : :: ..:: :::::::.::: .:
CCDS58 RDWLWGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLA
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWV
.:::::.:::::..:::::::.::..:: :: :::.: .....: :. :
CCDS58 DVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSR---------GKLV
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PAEA-FLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCT
... : . .:.... :::::. : : : ::.:: : ..:.. . .: .:
CCDS58 QVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMD-----GCELMC-
280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 ECGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
:: .. :: :.:::.::: ::: .: ..:... :
CCDS58 -CGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
330 340 350 360
>>CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (380 aa)
initn: 548 init1: 378 opt: 854 Z-score: 979.1 bits: 189.8 E(32554): 3.2e-48
Smith-Waterman score: 854; 39.9% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (36-336:86-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNC
: . .. ::..::.::..:: .::::
CCDS46 QMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNC
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTGG
.. . :. .: .. ..:::.: .:.:.:::. ... : :.. .:::. . :
CCDS46 S-TVDNTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLP
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170
pF1KE1 HGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLE------KG--KDARALMNLHNNRAGRLAVRATM
. :.::::.::...: :..: :::. : :: ..:: :::::::.::: .:
CCDS46 RDWLWGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLA
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KRTCKCHGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWV
.:::::.:::::..:::::::.::..:: :: :::.: .....: :. :
CCDS46 DVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSR---------GKLV
240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PAEA-FLPSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCT
... : . .:.... :::::. : : : ::.:: : ..:.. . .: .:
CCDS46 QVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMD-----GCELMC-
290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 ECGLQVEERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
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CCDS46 -CGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
340 350 360 370 380
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20 30 40 50 60 70
pF1KE1 ICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERWNCPENALQL
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CCDS33 LGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKT
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80 90 100 110 120 130
pF1KE1 STHNRLRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKTG-GHGWIWGG
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CCDS33 VFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGG
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 CSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKCHGISGSCSI
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CCDS33 CSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTT
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 QTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAEAFLPSAEAELIF
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CCDS33 KTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQVEV-VRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVY
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 LEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQVEERKTEVISS
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CCDS33 IEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPGAD-----GCDTMC--CGRGYNTHQYTKVWQ
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pF1KE1 CNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
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CCDS33 CNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
330 340
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pF1KE1 LFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERW
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CCDS11 ALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRW
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70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NCPENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKT
:: .:. . : .::::..:.:::.:::: . .:..:. : ::::. ..:
CCDS11 NCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPP
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130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GGHGWIWGGCSDNVEFGERISKLFVDSLEKGKDARALMNLHNNRAGRLAVRATMKRTCKC
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CCDS11 G-EGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKC
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190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HGISGSCSIQTCWLQLAEFREMGDYLKAKYDQALKIEMDKRQLRAGNSAEGHWVPAEAFL
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CCDS11 HGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGW-VETLRAKYSLFK
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PSAEAELIFLEESPDYCTCNSSLGIYGTEGRECLQNSHNTSRWERRSCGRLCTECGLQVE
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CCDS11 PPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVTSHGID-----GCDLLC--CGRGHN
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350
pF1KE1 ERKTEVISSCNCKFQWCCTVKCDQCRHVVSKYYCARSPGSAQSLGKGSA
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CCDS11 TRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
330 340 350
>>CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 (352 aa)
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pF1KE1 LFMLWAALGICCAAFSASAWSVNNFLITGPKAYLTYTTSVALGAQSGIEECKFQFAWERW
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CCDS15 AVGPQYSSLGSQPILCASIPGLVPKQLRFCRNYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRW
30 40 50 60 70 80
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pF1KE1 NCPENALQLSTHNR-LRSATRETSFIHAISSAGVMYIITKNCSMGDFENCGCDGSNNGKT
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CCDS15 NCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQG-S
90 100 110 120 130 140
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CCDS15 PGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENRPDARSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKC
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CCDS15 HGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRG------WVETLRPR
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CCDS15 YTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVSSHGID-----GCDLLC--C
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]