Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1832
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1832, 351 aa
1>>>pF1KE1832 351 - 351 aa - 351 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5857+/-0.000387; mu= 15.1039+/- 0.024
mean_var=74.4466+/-14.298, 0's: 0 Z-trim(113.5): 60 B-trim: 146 in 2/51
Lambda= 0.148646
statistics sampled from 22796 (22857) to 22796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 7.060
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_110388 (OMIM: 158330,603490,611812) protein Wnt ( 351) 2440 532.6 4.8e-151
XP_011539899 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTE ( 373) 2271 496.4 4.1e-140
XP_011539900 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTE ( 296) 2094 458.4 9e-129
XP_006713387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
XP_011532387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
XP_016862617 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
XP_011532390 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
XP_011532391 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
NP_001243034 (OMIM: 164975,180700) protein Wnt-5a ( 365) 1215 270.0 6e-72
XP_011532389 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
XP_011532388 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1215 270.0 6e-72
NP_003383 (OMIM: 164975,180700) protein Wnt-5a iso ( 380) 1215 270.0 6.2e-72
XP_016862616 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 394) 1215 270.0 6.4e-72
XP_011528668 (OMIM: 601967) PREDICTED: protein Wnt ( 353) 1213 269.5 7.8e-72
NP_478679 (OMIM: 601967) protein Wnt-7b precursor ( 349) 1212 269.3 9e-72
NP_110380 (OMIM: 165330,273395) proto-oncogene Wnt ( 355) 1210 268.9 1.2e-71
NP_078613 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WN ( 391) 1205 267.8 2.8e-71
NP_149122 (OMIM: 606359) protein Wnt-3a precursor ( 352) 1201 266.9 4.6e-71
XP_011542621 (OMIM: 606359) PREDICTED: protein Wnt ( 446) 1201 267.0 5.6e-71
NP_004176 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WN ( 372) 1191 264.8 2.1e-70
NP_003382 (OMIM: 147870) protein Wnt-2 precursor [ ( 360) 1175 261.4 2.3e-69
NP_004616 (OMIM: 228930,276820,601570) protein Wnt ( 349) 1173 260.9 3e-69
NP_116031 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor ( 359) 1170 260.3 4.7e-69
NP_110402 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor ( 359) 1170 260.3 4.7e-69
NP_005421 (OMIM: 164820,615220,615221) proto-oncog ( 370) 1109 247.2 4.2e-65
NP_001278809 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform ( 299) 1104 246.1 7.4e-65
NP_004617 (OMIM: 603699) protein Wnt-11 precursor ( 354) 1093 243.8 4.4e-64
XP_005274288 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 354) 1093 243.8 4.4e-64
XP_011532393 (OMIM: 228930,276820,601570) PREDICTE ( 282) 1089 242.9 6.6e-64
NP_476509 (OMIM: 606267) protein Wnt-16 isoform 1 ( 365) 930 208.8 1.5e-53
NP_057171 (OMIM: 606267) protein Wnt-16 isoform 2 ( 355) 929 208.6 1.7e-53
XP_016873730 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 251) 877 197.4 2.9e-50
XP_011543543 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 251) 877 197.4 2.9e-50
XP_011543541 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364) 877 197.5 3.9e-50
XP_011543540 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364) 877 197.5 3.9e-50
XP_011543542 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364) 877 197.5 3.9e-50
NP_003387 (OMIM: 602864) protein Wnt-9b isoform 1 ( 357) 840 189.5 9.5e-48
XP_011523480 (OMIM: 602864) PREDICTED: protein Wnt ( 363) 840 189.5 9.6e-48
NP_003386 (OMIM: 602863) protein Wnt-9a precursor ( 365) 819 185.0 2.2e-46
XP_011542573 (OMIM: 602863) PREDICTED: protein Wnt ( 295) 791 179.0 1.2e-44
NP_003384 (OMIM: 601396) protein Wnt-8b precursor ( 351) 766 173.7 5.6e-43
NP_006513 (OMIM: 604663) protein Wnt-6 precursor [ ( 365) 755 171.3 3e-42
NP_490645 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform 3 ( 351) 746 169.4 1.1e-41
NP_001287868 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform ( 369) 746 169.4 1.1e-41
NP_001287867 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform ( 386) 746 169.4 1.2e-41
XP_016865314 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 391) 746 169.4 1.2e-41
XP_016865313 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 408) 746 169.4 1.2e-41
XP_011541927 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 337) 728 165.5 1.5e-40
XP_011537024 (OMIM: 225300,601906,617073) PREDICTE ( 267) 685 156.2 7.5e-38
XP_016875408 (OMIM: 225300,601906,617073) PREDICTE ( 267) 685 156.2 7.5e-38
>>NP_110388 (OMIM: 158330,603490,611812) protein Wnt-4 p (351 aa)
initn: 2440 init1: 2440 opt: 2440 Z-score: 2832.7 bits: 532.6 E(85289): 4.8e-151
Smith-Waterman score: 2440; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 AFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 SSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 ATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 KAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 KAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
310 320 330 340 350
>>XP_011539899 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTED: p (373 aa)
initn: 2271 init1: 2271 opt: 2271 Z-score: 2636.5 bits: 496.4 E(85289): 4.1e-140
Smith-Waterman score: 2271; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (27-351:49-373)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STQGKRNKRLPRTLPNQRGYEGEDTGHIPRYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQM
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAIS
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERS
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 KFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTC
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
320 330 340 350 360 370
>>XP_011539900 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTED: p (296 aa)
initn: 2094 init1: 2094 opt: 2094 Z-score: 2432.8 bits: 458.4 E(85289): 9e-129
Smith-Waterman score: 2094; 100.0% identity (100.0% similar) in 296 aa overlap (56-351:1-296)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 LYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNR
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNR
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 RWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGV
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 CKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPH
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 TDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAER
220 230 240 250 260 270
330 340 350
pF1KE1 CSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
280 290
>>XP_006713387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: protein (365 aa)
initn: 1153 init1: 441 opt: 1215 Z-score: 1412.7 bits: 270.0 E(85289): 6e-72
Smith-Waterman score: 1220; 47.9% identity (72.7% similar) in 363 aa overlap (1-351:6-365)
10 20 30 40
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLV-FAVFSAAASNWLYLA-----KLSSVGSISEEETCEKLKGL
:: . : .: .. :: :..: :. ..: : :. . : .: ::
XP_006 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 IQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREA
: : ..:. . :. . .::. .:.:::::::.:::::::.:. :::.:. :.::.
XP_006 SQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSRET
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVS-PQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQS
::.::.:.:::. :..::: ::: :::.:... . :. . :.::.::: :: :..
XP_006 AFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FVDVRER----SKGA-SSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRA
:::.::: .::. :.: :::::::::::... . : :::::::::: .::::
XP_006 FVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQD
. ::.:: :::::.:.:. . :..: :: :..:. : .::::..::::.: ..
XP_006 LADFRKVGDALKEKYDSAAAM---RLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRN
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 MRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQR
.: :::.:: :::::...:::::.:::::. .. .::: :::::::.:::..: .
XP_006 ESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTE
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE1 LVELHTCR
.:. .:.
XP_006 IVDQFVCK
360
>>XP_011532387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: protein (365 aa)
initn: 1153 init1: 441 opt: 1215 Z-score: 1412.7 bits: 270.0 E(85289): 6e-72
Smith-Waterman score: 1220; 47.9% identity (72.7% similar) in 363 aa overlap (1-351:6-365)
10 20 30 40
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLV-FAVFSAAASNWLYLA-----KLSSVGSISEEETCEKLKGL
:: . : .: .. :: :..: :. ..: : :. . : .: ::
XP_011 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 IQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREA
: : ..:. . :. . .::. .:.:::::::.:::::::.:. :::.:. :.::.
XP_011 SQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSRET
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVS-PQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQS
::.::.:.:::. :..::: ::: :::.:... . :. . :.::.::: :: :..
XP_011 AFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FVDVRER----SKGA-SSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRA
:::.::: .::. :.: :::::::::::... . : :::::::::: .::::
XP_011 FVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQD
. ::.:: :::::.:.:. . :..: :: :..:. : .::::..::::.: ..
XP_011 LADFRKVGDALKEKYDSAAAM---RLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRN
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 MRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQR
.: :::.:: :::::...:::::.:::::. .. .::: :::::::.:::..: .
XP_011 ESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTE
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE1 LVELHTCR
.:. .:.
XP_011 IVDQFVCK
360
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XP_011 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGL
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110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVS-PQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQS
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pF1KE1 VPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQD
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XP_011 LADFRKVGDALKEKYDSAAAM---RLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRN
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pF1KE1 MRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQR
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300 310 320 330 340 350
350
pF1KE1 LVELHTCR
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XP_011 IVDQFVCK
360
351 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]