Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1832
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1832, 351 aa
1>>>pF1KE1832 351 - 351 aa - 351 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1665+/-0.00088; mu= 17.7364+/- 0.053
mean_var=77.5321+/-15.062, 0's: 0 Z-trim(107.2): 28 B-trim: 26 in 1/50
Lambda= 0.145658
statistics sampled from 9397 (9424) to 9397 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 2440 522.2 2.6e-148
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 1215 264.8 8.2e-71
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 1215 264.8 8.5e-71
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 1212 264.1 1.2e-70
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 1210 263.7 1.7e-70
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 1205 262.7 3.7e-70
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 1201 261.8 6.1e-70
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 1191 259.7 2.7e-69
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 1175 256.4 2.8e-68
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 1173 255.9 3.6e-68
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 1170 255.3 5.7e-68
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 1109 242.5 4.2e-64
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 1104 241.4 7.4e-64
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 1093 239.1 4.2e-63
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 930 204.9 8.8e-53
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 929 204.7 9.9e-53
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 840 186.0 4.3e-47
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 819 181.6 9.2e-46
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 766 170.4 2e-42
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 755 168.1 1e-41
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 746 166.2 3.7e-41
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 746 166.2 3.9e-41
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 685 153.4 2.9e-37
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 646 145.2 7.5e-35
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 410 95.7 7.6e-20
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 2440 init1: 2440 opt: 2440 Z-score: 2776.2 bits: 522.2 E(32554): 2.6e-148
Smith-Waterman score: 2440; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
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CCDS22 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 KAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
310 320 330 340 350
>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (365 aa)
initn: 1153 init1: 441 opt: 1215 Z-score: 1384.8 bits: 264.8 E(32554): 8.2e-71
Smith-Waterman score: 1220; 47.9% identity (72.7% similar) in 363 aa overlap (1-351:6-365)
10 20 30 40
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLV-FAVFSAAASNWLYLA-----KLSSVGSISEEETCEKLKGL
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CCDS58 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 IQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREA
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CCDS58 SQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSRET
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVS-PQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQS
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CCDS58 AFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FVDVRER----SKGA-SSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRA
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CCDS58 FVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQD
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CCDS58 LADFRKVGDALKEKYDSAAAM---RLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRN
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 MRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQR
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CCDS58 ESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTE
300 310 320 330 340 350
350
pF1KE1 LVELHTCR
.:. .:.
CCDS58 IVDQFVCK
360
>>CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (380 aa)
initn: 1153 init1: 441 opt: 1215 Z-score: 1384.5 bits: 264.8 E(32554): 8.5e-71
Smith-Waterman score: 1220; 47.9% identity (72.7% similar) in 363 aa overlap (1-351:21-380)
10 20 30
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLV-FAVFSAAASNWLYLA-----KLSSV
:: . : .: .. :: :..: :. ..: :
CCDS46 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDS
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CCDS46 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 LPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVS-PQGFQWS
:::.:. :.::.::.::.:.:::. :..::: ::: :::.:... . :. . :.
CCDS46 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE1 GCSDNIAYGVAFSQSFVDVRER----SKGA-SSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKC
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CCDS46 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 HGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDE
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CCDS46 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAM---RLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQ
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 DLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSC
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CCDS46 DLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHC
300 310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KE1 KFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
::::::.:::..: ..:. .:.
CCDS46 KFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
360 370 380
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 1082 init1: 397 opt: 1212 Z-score: 1381.6 bits: 264.1 E(32554): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 1212; 49.4% identity (73.3% similar) in 352 aa overlap (8-351:3-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
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CCDS33 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
... . .:::..:.::::::: :::::.: :::. . :.:::::.:::..:::
CCDS33 PDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 AFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQ--GFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKG
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CCDS33 AHAVTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 ASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKF
: : ::::::::::::.. .:..::::::::::: .:::: ..: ::.::: ::::.
CCDS33 A---RRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DGATEVEPRRVGSSRALVP---RNAQFKPHT---DEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTR
..:..:: : .:: : : :.. . . ::::.: ::..::.: .: .::.
CCDS33 NAAVQVEVVR--ASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
:: ::.:: . :::. .:::::..: : . .:.::::::::::: :.. .:. ::.
CCDS33 GRLCNRTSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
300 310 320 330 340
>>CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 (355 aa)
initn: 1209 init1: 425 opt: 1210 Z-score: 1379.3 bits: 263.7 E(32554): 1.7e-70
Smith-Waterman score: 1210; 50.7% identity (74.6% similar) in 335 aa overlap (25-351:26-355)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLA---KLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQM
: :: . .:.:: . : .. ::. .:...
CCDS11 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGS--QPLLCGSIPGLVPKQLRF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLD-SLPVFGKVVTQGTREAAFVYAI
:. .:.: :: .:..:.:.:::.:::.:::::.:.: :: .:: :. ..:::.:::.::
CCDS11 CRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRER
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CCDS11 ASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADAREN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALK
: :. :: ::::::: .:: ::...:::::.:::::::::: : : :: .: ::
CCDS11 RPDA---RSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EKFDGATE--VEPRRV--GSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGT
.:.:.:.: :: .: : ..: . . ::: :..:::: : ::.::: . ..: .::
CCDS11 DKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
: :::: ::..::::.::::::: .: . :.: : :::::.:.:..: :. ..:::.
CCDS11 RDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (391 aa)
initn: 990 init1: 427 opt: 1205 Z-score: 1373.0 bits: 262.7 E(32554): 3.7e-70
Smith-Waterman score: 1205; 47.9% identity (74.9% similar) in 351 aa overlap (5-351:42-380)
10 20 30
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSV
.:: : ::.... . . ..: : .
CCDS84 QLPLRRASAPVPVPSPAAPDGSRASARLGLACL--LLLLLLTLPARVDTSWWY------I
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLD-
:... . :... ::..:: :.:.: ..: :: .::. :.:::.:::..::::.:::
CCDS84 GALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDR
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 SLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCD---RTVHGVSPQGF
. :::.:. ...::::::::::::::. :.:::::.::: :.:: : : . :
CCDS84 DHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 QWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHG
.:.:::::: ::: :...:::..: : ...:::::::::. :: :. ...::::::
CCDS84 DWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKE--KRLKDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDL
::::: ..:::::. ::..: :....:::..: . :.. .. .. : ::
CCDS84 VSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGAN--FTAARQGYRRATRTDL
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKF
::.. :::.: : .: ::: ::.:.::::. ::::..:::::. :..: . .: :::
CCDS84 VYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKF
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KE1 HWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
:::: :.:..:. :..:::.
CCDS84 HWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
360 370 380 390
>>CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 (352 aa)
initn: 900 init1: 418 opt: 1201 Z-score: 1369.1 bits: 261.8 E(32554): 6.1e-70
Smith-Waterman score: 1201; 50.6% identity (75.3% similar) in 336 aa overlap (25-351:23-352)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLA---KLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMC
: :: . ::.:: . : .. ::. .:...:
CCDS15 MAPLGYFLLLCSLKQALGSYPIWWSLAVGPQYSSLGS--QPILCASIPGLVPKQLRFC
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pF1KE1 KRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTL-DSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAIS
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CCDS15 RNYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIA
60 70 80 90 100 110
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CCDS15 SAGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQGSPGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENR
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CCDS15 PDA---RSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKD
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CCDS15 KYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRPRYTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTR
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pF1KE1 GRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELA-ERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
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CCDS15 DRTCNVSSHGIDGCDLLCCGRG-HNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCK
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CCDS84 GLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSS
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CCDS84 RFAKAFVDAKE--KRLKDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRA
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pF1KE1 VPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQD
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CCDS84 LSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGAN--FTAARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLD
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350
pF1KE1 LVELHTCR
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CCDS84 TVDVHTCKAPKKAEWLDQT
360 370
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CCDS57 WRKYNGAIQVVMNQDGTGFTVA--NERFKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSLGTAGR
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CCDS57 NADWTTAT
360
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CCDS26 SRPDAIIVIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAA
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CCDS26 GVAHAITAACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIK
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CCDS26 QNA---RTLMNLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]