Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1796
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1796, 313 aa
1>>>pF1KE1796 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7733+/-0.000872; mu= 8.4939+/- 0.053
mean_var=226.3845+/-45.739, 0's: 0 Z-trim(115.0): 144 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.085241
statistics sampled from 15404 (15553) to 15404 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 2226 285.7 3.2e-77
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 1422 186.8 1.9e-47
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 1021 137.5 1.3e-32
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 956 129.5 3.1e-30
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 802 110.8 2.1e-24
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 758 105.1 6.2e-23
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 758 105.1 6.5e-23
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 726 101.9 2.9e-21
CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 681 96.1 8.3e-20
CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 681 96.4 1.3e-19
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 670 94.6 1.7e-19
CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 659 93.0 3.5e-19
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 667 94.9 6e-19
CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 652 92.3 8e-19
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 620 88.2 8.8e-18
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 620 88.4 1.2e-17
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 620 88.4 1.2e-17
CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 604 86.4 4.6e-17
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 569 82.1 8.8e-16
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 569 82.1 9.5e-16
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 569 82.1 9.5e-16
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 566 81.8 1.2e-15
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 538 78.3 1.2e-14
CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 406) 533 77.6 1.8e-14
CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 368) 464 69.1 6e-12
CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 ( 312) 445 66.7 2.7e-11
CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 448 67.2 2.7e-11
>>CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 2226 init1: 2226 opt: 2226 Z-score: 1499.9 bits: 285.7 E(32554): 3.2e-77
Smith-Waterman score: 2226; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MELDRAVGVLGAATLLLSFLGMAWALQAADTCPEVKMVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAPG
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CCDS69 MELDRAVGVLGAATLLLSFLGMAWALQAADTCPEVKMVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGWHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGWHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFGSRLGEFWLGNDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFGSRLGEFWLGNDNI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFHNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFHNN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKGYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKGYN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE1 YSYKVSEMKVRPA
:::::::::::::
CCDS69 YSYKVSEMKVRPA
310
>>CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 (326 aa)
initn: 1420 init1: 1420 opt: 1422 Z-score: 965.3 bits: 186.8 E(32554): 1.9e-47
Smith-Waterman score: 1719; 77.0% identity (86.8% similar) in 326 aa overlap (1-313:1-326)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MELDRAVGVLGAATLLLSFLGMA-WALQAADTCPEVKMVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAP
:::. :. . : :.::. :: . ::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS69 MELSGATMARGLAVLLVLFLHIKNLPAQAADTCPEVKVVGLEGSDKLTILRGCPGLPGAP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 GPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEP------------QPCLTGPRTCKD
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CCDS69 GPKGEAGVIGERGERGLPGAPGKAGPVGPKGDRGEKGMRGEKGDAGQSQSCATGPRNCKD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 LLDRGHFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFG
:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::
CCDS69 LLDRGYFLSGWHTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRMDGSVDFYRDWAAYKQGFG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 SRLGEFWLGNDNIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFV
:.::::::::::::::::::.::::::::::: :.:::::.:::::::::::.:::::::
CCDS69 SQLGEFWLGNDNIHALTAQGSSELRVDLVDFEGNHQFAKYKSFKVADEAEKYKLVLGAFV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 EGSAGDSLTFHNNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSF
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CCDS69 GGSAGNSLTGHNNNFFSTKDQDNDVSSSNCAEKFQGAWWYADCHASNLNGLYLMGPHESY
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE1 ANGINWKSGKGYNYSYKVSEMKVRPA
::::::...:::.:::::::::::::
CCDS69 ANGINWSAAKGYKYSYKVSEMKVRPA
310 320
>>CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 (299 aa)
initn: 1213 init1: 990 opt: 1021 Z-score: 699.2 bits: 137.5 E(32554): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 1034; 49.0% identity (73.0% similar) in 300 aa overlap (14-311:9-299)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MELDRAVGVLGAATLLLSFLGMAWALQAAD--TCPEVKMVGLEGSDKLTILRGCPGLPGA
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CCDS30 MDLLWILPSLWLLLLGGPACLKTQEHPSCPGPRE--LEAS-KVVLLPSCPGAPGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGW
:: :: : .:::::::: :: : : : . : :::.:..::..: ::::
CCDS30 PGEKGAPGP------QGPPGPPGKMGPKGEPGDPVNLLRCQEGPRNCRELLSQGATLSGW
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 HTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFGSRLGEFWLGND
. . ::. : : :.:::::.:::: ::::: ::::::.:.:..:. :::.. .::::::.
CCDS30 YHLCLPEGRALPVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYRAGFGNQESEFWLGNE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 NIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFH
:.: :: ::. ::::.: ::. : ::.: .:.. :...:.:.:: : ::.:::::..:
CCDS30 NLHQLTLQGNWELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLALGKFSEGTAGDSLSLH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKG
... :.: : :.: ...::::. .::::: .:. ::::::: . .. ::.: ::.:
CCDS30 SGRPFTTYDADHDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSEAAAHKYGIDWASGRG
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE1 YNYSYKVSEMKVRPA
.. :. .: .:
CCDS30 VGHPYRRVRMMLR
290
>>CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 (288 aa)
initn: 971 init1: 831 opt: 956 Z-score: 656.2 bits: 129.5 E(32554): 3.1e-30
Smith-Waterman score: 998; 48.7% identity (72.3% similar) in 300 aa overlap (14-311:9-288)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MELDRAVGVLGAATLLLSFLGMAWALQAAD--TCPEVKMVGLEGSDKLTILRGCPGLPGA
.: : .:: :.. . .:: . ::.: :...: .::: ::.
CCDS30 MDLLWILPSLWLLLLGGPACLKTQEHPSCPGPRE--LEAS-KVVLLPSCPGAPGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGW
:: :: : .:::::::: :: : :: :::.:..::..: ::::
CCDS30 PGEKGAPGP------QGPPGPPGKMGPKG------EP-----GPRNCRELLSQGATLSGW
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 HTIYLPDCRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYKQGFGSRLGEFWLGND
. . ::. : : :.:::::.:::: ::::: ::::::.:.:..:. :::.. .::::::.
CCDS30 YHLCLPEGRALPVFCDMDTEGGGWLVFQRRQDGSVDFFRSWSSYRAGFGNQESEFWLGNE
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 NIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFH
:.: :: ::. ::::.: ::. : ::.: .:.. :...:.:.:: : ::.:::::..:
CCDS30 NLHQLTLQGNWELRVELEDFNGNRTFAHYATFRLLGEVDHYQLALGKFSEGTAGDSLSLH
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKG
... :.: : :.: ...::::. .::::: .:. ::::::: . .. ::.: ::.:
CCDS30 SGRPFTTYDADHDSSNSNCAVIVHGAWWYASCYRSNLNGRYAVSEAAAHKYGIDWASGRG
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE1 YNYSYKVSEMKVRPA
.. :. .: .:
CCDS30 VGHPYRRVRMMLR
280
>>CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 (461 aa)
initn: 787 init1: 391 opt: 802 Z-score: 551.5 bits: 110.8 E(32554): 2.1e-24
Smith-Waterman score: 802; 48.6% identity (71.9% similar) in 249 aa overlap (73-312:210-456)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 SDKLTILRGCPGLPGAPGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTG-
.:: : .:: . .:. : ::
CCDS69 GRLIQLLSESQGHMAHLVNSVSDILDALQRDRGLGRPRNKADLQRAPARGTRPRGCATGS
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150
pF1KE1 -PRTCKDLLDRGHFLSGWHTIYLPDCRP--LTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRD
:: : :.: :. .: .... : : . : ::: :::::::::::: ::::.:.:
CCDS69 RPRDCLDVLLSGQQDDGVYSVF-PTHYPAGFQVYCDMRTDGGGWTVFQRREDGSVNFFRG
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 WATYKQGFGSRLGEFWLGNDNIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVA-----
: .:..::: :: ::: :::::.:.. ::.::: :::.. .:.: :: :.
CCDS69 WDAYRDGFGRLTGEHWLGLKRIHALTTQAAYELHVDLEDFENGTAYARYGSFGVGLFSVD
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 DEAEKYNLVLGAFVEGSAGDSLTFHNNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVS
: . : :... . :.::::: :... :.:::.:.: . .:::....:::::.:::.:
CCDS69 PEEDGYPLTVADY-SGTAGDSLLKHSGMRFTTKDRDSDHSENNCAAFYRGAWWYRNCHTS
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310
pF1KE1 NLNGRYLRGTHGSFANGINWKSGKGYNYSYKVSEMKVRPA
::::.::::.:.:.:.:..:.: :..:: : ::::.::
CCDS69 NLNGQYLRGAHASYADGVEWSSWTGWQYSLKFSEMKIRPVREDR
420 430 440 450 460
>>CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 (255 aa)
initn: 743 init1: 345 opt: 758 Z-score: 525.3 bits: 105.1 E(32554): 6.2e-23
Smith-Waterman score: 758; 46.9% identity (69.8% similar) in 245 aa overlap (76-313:16-255)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LTILRGCPGLPGAPGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTC
:: : .: : . . :: : :
CCDS11 MKALLALPLLLLLSTPPCAPQVSGIRGD----ALERFCLQQPLDC
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 KDLLDRGHFLSGWHTIYLPD--CRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYK
:. .:. .: . :: :. :. :.::: :.:: :::::.: .:::.:.: : ::
CCDS11 DDIYAQGYQSDGVYLIY-PSGPSVPVPVFCDMTTEGGKWTVFQKRFNGSVSFFRGWNDYK
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210
pF1KE1 QGFGSRLGEFWLGNDNIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEA-----EK
::: ::.::: .:.: :: . :::::: :::.: .::: .:... .: .
CCDS11 LGFGRADGEYWLGLQNMHLLTLKQKYELRVDLEDFENNTAYAKYADFSISPNAVSAEEDG
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 YNLVLGAFVEGSAGDSLTFHNNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGR
:.: ...: .:.:::::..:..:.::: :.:.:: . :::.. .::.:...:: .::::
CCDS11 YTLFVAGFEDGGAGDSLSYHSGQKFSTFDRDQDLFVQNCAALSSGAFWFRSCHFANLNGF
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310
pF1KE1 YLRGTHGSFANGINWKSGKGYNYSYKVSEMKVRPA
:: :.: :.:::::: . ::. :: : .:::.: :
CCDS11 YLGGSHLSYANGINWAQWKGFYYSLKRTEMKIRRA
230 240 250
>>CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 (279 aa)
initn: 743 init1: 345 opt: 758 Z-score: 524.8 bits: 105.1 E(32554): 6.5e-23
Smith-Waterman score: 758; 46.9% identity (69.8% similar) in 245 aa overlap (76-313:40-279)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LTILRGCPGLPGAPGPKGEAGTNGKRGERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTC
:: : .: : . . :: : :
CCDS56 PLATEGTMKAQGVLLKLALLALPLLLLLSTPPCAPQVSGIRGD----ALERFCLQQPLDC
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 KDLLDRGHFLSGWHTIYLPD--CRPLTVLCDMDTDGGGWTVFQRRVDGSVDFYRDWATYK
:. .:. .: . :: :. :. :.::: :.:: :::::.: .:::.:.: : ::
CCDS56 DDIYAQGYQSDGVYLIY-PSGPSVPVPVFCDMTTEGGKWTVFQKRFNGSVSFFRGWNDYK
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210
pF1KE1 QGFGSRLGEFWLGNDNIHALTAQGTSELRVDLVDFEDNYQFAKYRSFKVADEA-----EK
::: ::.::: .:.: :: . :::::: :::.: .::: .:... .: .
CCDS56 LGFGRADGEYWLGLQNMHLLTLKQKYELRVDLEDFENNTAYAKYADFSISPNAVSAEEDG
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 YNLVLGAFVEGSAGDSLTFHNNQSFSTKDQDNDLNTGNCAVMFQGAWWYKNCHVSNLNGR
:.: ...: .:.:::::..:..:.::: :.:.:: . :::.. .::.:...:: .::::
CCDS56 YTLFVAGFEDGGAGDSLSYHSGQKFSTFDRDQDLFVQNCAALSSGAFWFRSCHFANLNGF
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310
pF1KE1 YLRGTHGSFANGINWKSGKGYNYSYKVSEMKVRPA
:: :.: :.:::::: . ::. :: : .:::.: :
CCDS56 YLGGSHLSYANGINWAQWKGFYYSLKRTEMKIRRA
250 260 270
>>CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358 aa)
initn: 586 init1: 315 opt: 726 Z-score: 495.4 bits: 101.9 E(32554): 2.9e-21
Smith-Waterman score: 726; 49.8% identity (71.8% similar) in 213 aa overlap (102-312:1135-1342)
80 90 100 110 120
pF1KE1 GERGPPGPPGKAGPPGPNGAPGEPQPCLTGPRTCKDLLDRGHFLSGWHTIYLPD--CRPL
:. : . : : ::: . :.: . :
CCDS13 YTVLLQAAQDTTWSSITSTAFTTGGRVFPHPQDCAQHLMNGDTLSGVYPIFLNGELSQKL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]