Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1787
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1787, 294 aa
1>>>pF1KE1787 294 - 294 aa - 294 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5403+/-0.000838; mu= 14.1830+/- 0.050
mean_var=66.3371+/-13.551, 0's: 0 Z-trim(106.8): 20 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.157469
statistics sampled from 9191 (9210) to 9191 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3531.1 SULT1E1 gene_id:6783|Hs108|chr4 ( 294) 2030 469.9 1e-132
CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 ( 296) 1161 272.4 2.8e-73
CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 295) 1080 254.0 9.5e-68
CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 ( 295) 1053 247.9 6.7e-66
CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 ( 295) 1051 247.4 9.2e-66
CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 ( 295) 1051 247.4 9.2e-66
CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 ( 304) 1043 245.6 3.3e-65
CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 302) 1024 241.3 6.6e-64
CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 296) 1019 240.2 1.4e-63
CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 217) 714 170.8 7.8e-43
CCDS12724.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 350) 688 165.0 7.1e-41
CCDS12723.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 365) 688 165.0 7.4e-41
CCDS2076.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 307) 685 164.3 1e-40
CCDS12707.1 SULT2A1 gene_id:6822|Hs108|chr19 ( 285) 643 154.7 7.1e-38
CCDS82492.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 227) 512 124.9 5.3e-29
CCDS14051.1 SULT4A1 gene_id:25830|Hs108|chr22 ( 284) 473 116.1 3e-26
CCDS33182.1 SULT6B1 gene_id:391365|Hs108|chr2 ( 265) 470 115.4 4.5e-26
>>CCDS3531.1 SULT1E1 gene_id:6783|Hs108|chr4 (294 aa)
initn: 2030 init1: 2030 opt: 2030 Z-score: 2496.2 bits: 469.9 E(32554): 1e-132
Smith-Waterman score: 2030; 100.0% identity (100.0% similar) in 294 aa overlap (1-294:1-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYMI
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CCDS35 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFWEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSWWE
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CCDS35 DCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSWWE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTNYT
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CCDS35 KGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTNYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE1 TLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS35 TLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
250 260 270 280 290
>>CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 (296 aa)
initn: 1159 init1: 881 opt: 1161 Z-score: 1429.2 bits: 272.4 E(32554): 2.8e-73
Smith-Waterman score: 1161; 55.7% identity (80.7% similar) in 296 aa overlap (1-294:1-296)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEK-FEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYM
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CCDS35 MLSPKDILRKDLKLVHGYPMTCAFASNWEKIEQFHSRPDDIVIATYPKSGTTWVSEIIDM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENL-MNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFW
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CCDS35 ILNDGDIEKCKRGFITEKVPMLEMTLPGLRTSGIEQLEKNPSPRIVKTHLPTDLLPKSFW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 EKDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSW
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CCDS35 ENNCKMIYLARNAKDVSVSYYHFDLMNNLQPFPGTWEEYLEKFLTGKVAYGSWFTHVKNW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 WEKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTN
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CCDS35 WKKKEEHPILFLYYEDMKENPKEEIKKIIRFLEKNLNDEILDRIIHHTSFEVMKDNPLVN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YTTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS35 YTHLPTTVMDHSKSPFMRKGTAGDWKNYFTVAQNEKFDAIYETEMSKTALQFRTEI
250 260 270 280 290
>>CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1096 init1: 1051 opt: 1080 Z-score: 1329.8 bits: 254.0 E(32554): 9.5e-68
Smith-Waterman score: 1080; 51.8% identity (80.6% similar) in 284 aa overlap (11-294:12-295)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYM
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CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFWE
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CCDS32 IYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKAPGIPSGMETLKDTPAPRLLKTHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSWW
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CCDS32 QKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVHPEPGTWDSFLEKFMVGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 EKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTNY
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CCDS32 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDFVVQHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 TTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS32 TTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1069 init1: 1024 opt: 1053 Z-score: 1296.6 bits: 247.9 E(32554): 6.7e-66
Smith-Waterman score: 1053; 51.1% identity (79.9% similar) in 284 aa overlap (11-294:12-295)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYM
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CCDS10 MELIQDISRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFWE
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CCDS10 IYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKVPGIPSGMETLKNTPAPRLLKTHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSWW
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CCDS10 QKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVYPHPGTWESFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 EKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTNY
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CCDS10 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDLMVEHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 TTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS10 TTVRREFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAKKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1046 init1: 1022 opt: 1051 Z-score: 1294.1 bits: 247.4 E(32554): 9.2e-66
Smith-Waterman score: 1051; 50.4% identity (78.5% similar) in 284 aa overlap (11-294:12-295)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYM
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CCDS10 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFWE
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CCDS10 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSWW
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CCDS10 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 EKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTNY
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CCDS10 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 TTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS10 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1046 init1: 1022 opt: 1051 Z-score: 1294.1 bits: 247.4 E(32554): 9.2e-66
Smith-Waterman score: 1051; 50.4% identity (78.5% similar) in 284 aa overlap (11-294:12-295)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTWVSEIVYM
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CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPELLPASFWE
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CCDS32 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWYKHVKSWW
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CCDS32 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 EKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMKNNPSTNY
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CCDS32 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 TTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS32 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 (304 aa)
initn: 1055 init1: 820 opt: 1043 Z-score: 1284.1 bits: 245.6 E(32554): 3.3e-65
Smith-Waterman score: 1043; 52.3% identity (77.7% similar) in 283 aa overlap (13-294:22-304)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTT
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CCDS33 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 WVSEIVYMIYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECR-KENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPP
:. ::. :: ..:::::::. ..: ::: . .. .. . ::.::...:::::
CCDS33 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ELLPASFWEKDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGS
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CCDS33 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 WYKHVKSWWEKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQE
:. :::.:: :.:.:::::.:.: ..:. :...:::. :::....::.::::.
CCDS33 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 MKNNPSTNYTTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKF
::.:: ::::::: ::....:::::::. :::::.:::: ::.::: :...: ::: :
CCDS33 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RTEI
::::
CCDS33 RTEI
>>CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 (302 aa)
initn: 1091 init1: 1019 opt: 1024 Z-score: 1260.8 bits: 241.3 E(32554): 6.6e-64
Smith-Waterman score: 1024; 51.3% identity (78.7% similar) in 277 aa overlap (14-290:22-298)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNSELDYYEKFEEVHGILMYKDFVKYWDNVEAFQARPDDLVIATYPKSGTTW
:.:::. : ::.. :::.::::.:.::::.::::
CCDS20 MALHDMEDFTFDGTKRLSVNYVKGILQPTDTCDIWDKIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VSEIVYMIYKEGDVEKCKEDVIFNRIPFLECRKENLMNGVKQLDEMNSPRIVKTHLPPEL
..::: .: .:::::: :. .:.:::: . .: .:..: : ::::.::::: .:
CCDS20 TQEIVELIQNEGDVEKSKRAPTHQRFPFLEMKIPSLGSGLEQAHAMPSPRILKTHLPFHL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LPASFWEKDCKIIYLCRNAKDVAVSFYYFFLMVAGHPNPGSFPEFVEKFMQGQVPYGSWY
:: :. ::.:::::. :: :: ::.:.: : . : ::.. :. : :. :.: .:::.
CCDS20 LPPSLLEKNCKIIYVARNPKDNMVSYYHFQRMNKALPAPGTWEEYFETFLAGKVCWGSWH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KHVKSWWEKGKSPRVLFLFYEDLKEDIRKEVIKLIHFLERKPSEELVDRIIHHTSFQEMK
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CCDS20 EHVKGWWEAKDKHRILYLFYEDMKKNPKHEIQKLAEFIGKKLDDKVLDKIVHYTSFDVMK
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CCDS20 QNPMANYSSIPAEIMDHSISPFMRKGAVGDWKKHFTVAQNERFDEDYKKKMTDTRLTFHF
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 EI
CCDS20 QF
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CCDS20 MALTSDLGKQIKLKEVEGTLLQPATVDNWSQIQSFEAKPDDLLICTYPKAGTTWIQEIVD
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CCDS20 MIEQNGDVEKCQRAIIQHRHPFIEWARPPQPSGVEKAKAMPSPRILKTHLSTQLLPPSFW
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CCDS20 ENNCKFLYVARNAKDCMVSYYHFQRMNHMLPDPGTWEEYFETFINGKVVWGSWFDHVKGW
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180 190 200 210 220 230
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CCDS20 WEMKDRHQILFLFYEDIKRDPKHEIRKVMQFMGKKVDETVLDKIVQETSFEKMKENPMTN
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pF1KE1 YTTLPDEIMNQKLSPFMRKGITGDWKNHFTVALNEKFDKHYEQQMKESTLKFRTEI
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CCDS20 RSTVSKSILDQSISSFMRKGTVGDWKNHFTVAQNERFDEIYRRKMEGTSINFCMEL
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>>CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (217 aa)
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CCDS10 HMAKVHPEPGTWDSFLEKFMVGEVSYGSWYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKRE
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CCDS10 IQKILEFVGRSLPEETVDFVVQHTSFKEMKKNPMTNYTTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGD
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CCDS10 WKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
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294 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]