Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1711, 216 aa
1>>>pF1KE1711 216 - 216 aa - 216 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2178+/-0.000752; mu= 14.3547+/- 0.045
mean_var=65.3712+/-12.742, 0's: 0 Z-trim(108.2): 35 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.158628
statistics sampled from 10006 (10040) to 10006 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6019.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 ( 216) 1458 342.0 1.7e-94
CCDS78310.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 ( 205) 1216 286.6 7.6e-78
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 215) 854 203.8 6.9e-53
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 244) 808 193.3 1.1e-49
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 233) 780 186.9 9.2e-48
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 204) 778 186.4 1.1e-47
CCDS4378.1 FGF18 gene_id:8817|Hs108|chr5 ( 207) 740 177.7 4.8e-45
CCDS73185.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 140) 597 144.9 2.4e-35
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 251 65.8 2.2e-11
>>CCDS6019.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 (216 aa)
initn: 1458 init1: 1458 opt: 1458 Z-score: 1810.0 bits: 342.0 E(32554): 1.7e-94
Smith-Waterman score: 1458; 100.0% identity (100.0% similar) in 216 aa overlap (1-216:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYSR
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CCDS60 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLYQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210
pF1KE1 GQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
190 200 210
>>CCDS78310.1 FGF17 gene_id:8822|Hs108|chr8 (205 aa)
initn: 1216 init1: 1216 opt: 1216 Z-score: 1511.0 bits: 286.6 E(32554): 7.6e-78
Smith-Waterman score: 1341; 94.9% identity (94.9% similar) in 216 aa overlap (1-216:1-205)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYSR
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQ-----------YVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYSR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGKP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLYQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210
pF1KE1 GQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
170 180 190 200
>>CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (215 aa)
initn: 633 init1: 582 opt: 854 Z-score: 1063.0 bits: 203.8 E(32554): 6.9e-53
Smith-Waterman score: 854; 61.2% identity (82.6% similar) in 219 aa overlap (1-214:1-214)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYSR
::. : . : :.::.:: :.: . ::::.:.::.:. .::::::: :: ::::::
CCDS75 MGSPRSALS-CLLLHLLVLCLQAQVTVQSSPNFTQHVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 TSGKHVQV-TGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
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CCDS75 TSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
.::.::::::::::::::::.:::..:::.:::::.::::..:..::.:::.::.:::
CCDS75 SNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KE1 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRT----KRTRRPQPLT
.:. . .:.. .:::.. : :. .:: :.:
CCDS75 RGH----HTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
180 190 200 210
>>CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (244 aa)
initn: 647 init1: 582 opt: 808 Z-score: 1005.3 bits: 193.3 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 808; 64.7% identity (86.3% similar) in 190 aa overlap (30-214:58-243)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYS
::::.:.::.:. .::::::: :: :::::
CCDS75 RGPALGRELASLFRAGREPQGVSQQVTVQSSPNFTQHVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYS
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 RTSGKHVQV-TGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIG
::::::::: ...::.: ::::. ::::::::::::::::..:::. ::::::.::::.
CCDS75 RTSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIA
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KPSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRL
: .::.::::::::::::::::.:::..:::.:::::.::::..:..::.:::.::.:::
CCDS75 KSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRL
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210
pF1KE1 YQGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRT----KRTRRPQPLT
.:. . .:.. .:::.. : :. .:: :.:
CCDS75 PRGH----HTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
210 220 230 240
>>CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (233 aa)
initn: 663 init1: 582 opt: 780 Z-score: 971.0 bits: 186.9 E(32554): 9.2e-48
Smith-Waterman score: 786; 55.7% identity (76.8% similar) in 237 aa overlap (1-214:1-232)
10 20 30 40
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQ---GEN---------------HPSPNFNQYVRDQGA
::. : . : :.::.:: :.: :.. .:. .:.::.:.
CCDS75 MGSPRSALS-CLLLHLLVLCLQAQEGPGRGPALGRELASLFRAGREPQGVSQQHVREQSL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 MTDQLSRRQIREYQLYSRTSGKHVQV-TGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKG
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CCDS75 VTDQLSRRLIRTYQLYSRTSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AESEKYICMNKRGKLIGKPSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQ
::. ::::::.::::.: .::.::::::::::::::::.:::..:::.:::::.::::.
CCDS75 AETGLYICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE1 ASRSRQNQREAHFIKRLYQGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRT----KRTRRPQPLT
.:..::.:::.::.::: .:. . .:.. .:::.. : :. .:: :.:
CCDS75 GSKTRQHQREVHFMKRLPRGH----HTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
180 190 200 210 220 230
>>CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (204 aa)
initn: 649 init1: 582 opt: 778 Z-score: 969.3 bits: 186.4 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 793; 58.9% identity (79.5% similar) in 219 aa overlap (1-214:1-203)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYSR
::. : . : :.::.:: :.: .::.:. .::::::: :: ::::::
CCDS75 MGSPRSALSCLL-LHLLVLCLQAQ-----------HVREQSLVTDQLSRRLIRTYQLYSR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE1 TSGKHVQV-TGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
:::::::: ...::.: ::::. ::::::::::::::::..:::. ::::::.::::.:
CCDS75 TSGKHVQVLANKRINAMAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGLYICMNKKGKLIAK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
.::.::::::::::::::::.:::..:::.:::::.::::..:..::.:::.::.:::
CCDS75 SNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTRQHQREVHFMKRLP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210
pF1KE1 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRT----KRTRRPQPLT
.:. . .:.. .:::.. : :. .:: :.:
CCDS75 RGH----HTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
170 180 190 200
>>CCDS4378.1 FGF18 gene_id:8817|Hs108|chr5 (207 aa)
initn: 730 init1: 654 opt: 740 Z-score: 922.3 bits: 177.7 E(32554): 4.8e-45
Smith-Waterman score: 740; 53.4% identity (80.9% similar) in 204 aa overlap (12-214:11-206)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLILCCQTQGE-NHPSPNFNQYVRDQGAMTDQLSRRQIREYQLYS
:::..:.:: :.: . . .: .:..: :..::.:.: :::::
CCDS43 MYSAPSACTCLCLHFLLLCFQVQVLVAEENVDFRIHVENQTRARDDVSRKQLRLYQLYS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 RTSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKYICMNKRGKLIGK
::::::.:: :::::: .:::.:.:.:.::::::::.::::: :.: :.:::..:::.::
CCDS43 RTSGKHIQVLGRRISARGEDGDKYAQLLVETDTFGSQVRIKGKETEFYLCMNRKGKLVGK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 PSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSRQNQREAHFIKRLY
:.: ::.::: : ::::::::...:.. ::...::..::::.. ..:.::...::.::
CCDS43 PDGTSKECVFIEKVLENNYTALMSAKYSGWYVGFTKKGRPRKGPKTRENQQDVHFMKRYP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KE1 QGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
.:: : : :: :.. .. :.:..: : .:
CCDS43 KGQ-P-----ELQKPFKY--TTVTKRSRRIRPTHPA
180 190 200
>>CCDS73185.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 (140 aa)
initn: 587 init1: 561 opt: 597 Z-score: 747.9 bits: 144.9 E(32554): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 597; 62.7% identity (85.2% similar) in 142 aa overlap (77-214:2-139)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LSRRQIREYQLYSRTSGKHVQVTGRRISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEK
::::. ::::::::::::::::..:::.
CCDS73 MAEDGDPFAKLIVETDTFGSRVRVRGAETGL
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 YICMNKRGKLIGKPSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNARHEGWFMAFTRQGRPRQASRSR
::::::.::::.: .::.::::::::::::::::.:::..:::.:::::.::::..:..:
CCDS73 YICMNKKGKLIAKSNGKGKDCVFTEIVLENNYTALQNAKYEGWYMAFTRKGRPRKGSKTR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE1 QNQREAHFIKRLYQGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRT----KRTRRPQPLT
:.:::.::.::: .:. . .:.. .:::.. : :. .:: :.:
CCDS73 QHQREVHFMKRLPRGH----HTTEQSLRFEFLNYPPFTRSLRGSQRTWAPEPR
100 110 120 130 140
>>CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 (194 aa)
initn: 199 init1: 85 opt: 251 Z-score: 317.9 bits: 65.8 E(32554): 2.2e-11
Smith-Waterman score: 251; 31.0% identity (65.5% similar) in 171 aa overlap (12-175:22-189)
10 20 30 40
pF1KE1 MGAARLLPNLTLCLQLLI-LCCQTQGENHPSPNFNQYVRDQGAMT-DQLS
.:: : : :. . .. . : : .. . . : .
CCDS10 MHKWILTWILPTLLYRSCFHIICLVGTISLACNDMTPEQMATNVNCSSPERHTRSYDYME
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 RRQIREYQLYSRTSGKHVQVTGR-RISATAEDGNKFAKLIVETDTFGSRVRIKGAESEKY
.:: .:. ::. .... : ....: : :.. . ..: . : : :::.::: :
CCDS10 GGDIRVRRLFCRTQW-YLRIDKRGKVKGTQEMKNNYNIMEIRTVAVGI-VAIKGVESEFY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ICMNKRGKLIGKPSGKSKDCVFTEIVLENNYTAFQNAR--HEG--WFMAFTRQGRPRQAS
. :::.::: .: ..:: : :..:::.:... .:. :.: :.:....: : ...
CCDS10 LAMNKEGKLYAKKEC-NEDCNFKELILENHYNTYASAKWTHNGGEMFVALNQKGIPVRGK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE1 RSRQNQREAHFIKRLYQGQLPFPNHAEKQKQFEFVGSAPTRRTKRTRRPQPLT
.....:. :::.
CCDS10 KTKKEQKTAHFLPMAIT
180 190
216 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 22:57:22 2016 done: Mon Nov 7 22:57:23 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]