Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1574
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1574, 683 aa
1>>>pF1KE1574 683 - 683 aa - 683 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8150+/-0.000431; mu= 16.5381+/- 0.027
mean_var=69.6963+/-13.469, 0's: 0 Z-trim(110.8): 35 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.153628
statistics sampled from 19175 (19208) to 19175 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 10.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000349 (OMIM: 121820,121900,122200,601692,60208 ( 683) 4404 985.8 0
NP_001129407 (OMIM: 608777) periostin isoform 3 pr ( 781) 2000 453.0 1.9e-126
NP_001273594 (OMIM: 608777) periostin isoform 5 pr ( 809) 2000 453.0 2e-126
NP_001129408 (OMIM: 608777) periostin isoform 4 pr ( 751) 1996 452.1 3.4e-126
NP_001129406 (OMIM: 608777) periostin isoform 2 pr ( 779) 1996 452.1 3.5e-126
NP_001273596 (OMIM: 608777) periostin isoform 7 pr ( 721) 1992 451.2 6.1e-126
NP_001273595 (OMIM: 608777) periostin isoform 6 pr ( 749) 1992 451.3 6.3e-126
XP_005266289 (OMIM: 608777) PREDICTED: periostin i ( 806) 1992 451.3 6.7e-126
NP_001317446 (OMIM: 608777) periostin isoform 8 pr ( 808) 1992 451.3 6.7e-126
XP_016875845 (OMIM: 608777) PREDICTED: periostin i ( 812) 1992 451.3 6.8e-126
XP_016875844 (OMIM: 608777) PREDICTED: periostin i ( 817) 1992 451.3 6.8e-126
NP_006466 (OMIM: 608777) periostin isoform 1 precu ( 836) 1992 451.3 6.9e-126
XP_016861492 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2555) 176 48.9 0.00027
XP_016861491 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2565) 176 48.9 0.00027
XP_005265031 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2569) 176 48.9 0.00028
NP_055951 (OMIM: 608560) stabilin-1 precursor [Hom (2570) 176 48.9 0.00028
XP_016861490 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2583) 176 49.0 0.00028
XP_016861489 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2589) 176 49.0 0.00028
XP_016861488 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2590) 176 49.0 0.00028
XP_005265030 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2595) 176 49.0 0.00028
XP_016861487 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (2615) 176 49.0 0.00028
XP_016861493 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (1819) 171 47.8 0.00044
XP_006713128 (OMIM: 608560) PREDICTED: stabilin-1 (1619) 169 47.3 0.00053
XP_011536844 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1238) 159 45.1 0.002
XP_011536843 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1684) 159 45.1 0.0026
XP_011536841 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1994) 159 45.1 0.003
XP_011536840 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2242) 159 45.2 0.0033
XP_016875074 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2246) 159 45.2 0.0033
XP_011536839 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2283) 159 45.2 0.0034
NP_060034 (OMIM: 608561) stabilin-2 precursor [Hom (2551) 159 45.2 0.0037
>>NP_000349 (OMIM: 121820,121900,122200,601692,602082,60 (683 aa)
initn: 4404 init1: 4404 opt: 4404 Z-score: 5271.6 bits: 985.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4404; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNLLRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KDGTPPIDAHTRNLLRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 APTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 LKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAF
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE1 SRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
:::::::::::::::::::::::
NP_000 SRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
670 680
>>NP_001129407 (OMIM: 608777) periostin isoform 3 precur (781 aa)
initn: 1425 init1: 1312 opt: 2000 Z-score: 2391.1 bits: 453.0 E(85289): 1.9e-126
Smith-Waterman score: 2000; 45.5% identity (76.2% similar) in 686 aa overlap (1-682:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
: :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..:
NP_001 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
::..::.::...:::..:.. ::::::: .. : :::::.::....: :::.::.::::
NP_001 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
:.: . ::: :.:: :::: :::::::: .: ... .: ::::.::::::. ::...:.
NP_001 YSDAS-KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
:: .::.:: . :::.: .. :.:::::.:::::::...... :::::::.::.:.. :
NP_001 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
..::..:: :: . ..:::. .: . : .:..::.:::::::::.: .:.::.::
NP_001 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
: . :.. :::.. .:.:.:..: :::::.:.:.::.:: .:.:: ....:::...
NP_001 VASEALMKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
::::: ::..::::::: ..:::.... .: :: : ::.. : . . :::::.:..:
NP_001 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI
.: : .: . .: :.:::.: ... . ::.:: :::.:::.:::::::...::::::.
NP_001 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AAHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTV
.:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:.
NP_001 EKGSKQGRNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL
:.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:.
NP_001 FVPTNDAFKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 EVSLKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQA
.. :... ::. : :::.::::.::. ..: : :. : .:.: . ...:
NP_001 FLKEVNDTLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYP-ADTPVG-NDQLLEILNKLIKYI
600 610 620 630 640 650
660 670 680
pF1KE1 SA-FSRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
. : :.: . . ::. : ..:
NP_001 QIKFVRGSTFKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIID
660 670 680 690 700 710
>>NP_001273594 (OMIM: 608777) periostin isoform 5 precur (809 aa)
initn: 1425 init1: 1312 opt: 2000 Z-score: 2390.8 bits: 453.0 E(85289): 2e-126
Smith-Waterman score: 2000; 45.5% identity (76.2% similar) in 686 aa overlap (1-682:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
: :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..:
NP_001 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
::..::.::...:::..:.. ::::::: .. : :::::.::....: :::.::.::::
NP_001 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
:.: . ::: :.:: :::: :::::::: .: ... .: ::::.::::::. ::...:.
NP_001 YSDAS-KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
:: .::.:: . :::.: .. :.:::::.:::::::...... :::::::.::.:.. :
NP_001 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
..::..:: :: . ..:::. .: . : .:..::.:::::::::.: .:.::.::
NP_001 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
: . :.. :::.. .:.:.:..: :::::.:.:.::.:: .:.:: ....:::...
NP_001 VASEALMKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
::::: ::..::::::: ..:::.... .: :: : ::.. : . . :::::.:..:
NP_001 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI
.: : .: . .: :.:::.: ... . ::.:: :::.:::.:::::::...::::::.
NP_001 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AAHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTV
.:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:.
NP_001 EKGSKQGRNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL
:.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:.
NP_001 FVPTNDAFKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 EVSLKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQA
.. :... ::. : :::.::::.::. ..: : :. : .:.: . ...:
NP_001 FLKEVNDTLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYP-ADTPVG-NDQLLEILNKLIKYI
600 610 620 630 640 650
660 670 680
pF1KE1 SA-FSRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
. : :.: . . ::. : ..:
NP_001 QIKFVRGSTFKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIID
660 670 680 690 700 710
>>NP_001129408 (OMIM: 608777) periostin isoform 4 precur (751 aa)
initn: 1425 init1: 1312 opt: 1996 Z-score: 2386.6 bits: 452.1 E(85289): 3.4e-126
Smith-Waterman score: 1996; 45.3% identity (76.5% similar) in 684 aa overlap (1-680:1-675)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
: :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..:
NP_001 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
::..::.::...:::..:.. ::::::: .. : :::::.::....: :::.::.::::
NP_001 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
:.: . ::: :.:: :::: :::::::: .: ... .: ::::.::::::. ::...:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]