FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1573, 960 aa
1>>>pF1KE1573 960 - 960 aa - 960 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5766+/-0.0013; mu= 0.3189+/- 0.077
mean_var=231.9300+/-47.601, 0's: 0 Z-trim(107.5): 91 B-trim: 72 in 1/53
Lambda= 0.084216
statistics sampled from 9507 (9587) to 9507 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32278.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 ( 960) 6387 790.4 0
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CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1820) 766 107.6 2.3e-22
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 454 69.7 5.7e-11
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 454 69.7 5.7e-11
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 454 69.7 5.7e-11
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 454 69.7 5.8e-11
>>CCDS32278.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 (960 aa)
initn: 6387 init1: 6387 opt: 6387 Z-score: 4210.0 bits: 790.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6387; 100.0% identity (100.0% similar) in 960 aa overlap (1-960:1-960)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQECCIEVINNTTVQLHTPEGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQECCIEVINNTTVQLHTPEGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RLNRNGDYKETQYSFKQVFGTHTTQKELFDVVANPLVNDLIHGKNGLLFTYGVTGSGKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLNRNGDYKETQYSFKQVFGTHTTQKELFDVVANPLVNDLIHGKNGLLFTYGVTGSGKTH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGSFQAKRYVFKSNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGSFQAKRYVFKSNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NPKTSSSKRQVDPEFADMITVQEFCKAEEVDEDSVYGVFVSYIEIYNNYIYDLLEEVPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPKTSSSKRQVDPEFADMITVQEFCKAEEVDEDSVYGVFVSYIEIYNNYIYDLLEEVPFD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PIKPKPPQSKLLREDKNHNMYVAGCTEVEVKSTEEAFEVFWRGQKKRRIANTHLNRESSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PIKPKPPQSKLLREDKNHNMYVAGCTEVEVKSTEEAFEVFWRGQKKRRIANTHLNRESSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SHSVFNIKLVQAPLDADGDNVLQEKEQITISQLSLVDLAGSERTNRTRAEGNRLREAGNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHSVFNIKLVQAPLDADGDNVLQEKEQITISQLSLVDLAGSERTNRTRAEGNRLREAGNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NQSLMTLRTCMDVLRENQMYGTNKMVPYRDSKLTHLFKNYFDGEGKVRMIVCVNPKAEDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQSLMTLRTCMDVLRENQMYGTNKMVPYRDSKLTHLFKNYFDGEGKVRMIVCVNPKAEDY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 EENLQVMRFAEVTQEVEVARPVDKAICGLTPGRRYRNQPRGPVGNEPLVTDVVLQSFPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EENLQVMRFAEVTQEVEVARPVDKAICGLTPGRRYRNQPRGPVGNEPLVTDVVLQSFPPL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PSCEILDINDEQTLPRLIEALEKRHNLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSCEILDINDEQTLPRLIEALEKRHNLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 QGKLNEKEKMISGQKLEIERLEKKNKTLEYKIEILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QGKLNEKEKMISGQKLEIERLEKKNKTLEYKIEILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 QRQFSDKRRLEARLQGMVTETTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QRQFSDKRRLEARLQGMVTETTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 PKTEKPERPSRERDREKVTQRSVSPSPVPLSSNYIAQISNGQQLMSQPQLHRRSNSCSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKTEKPERPSRERDREKVTQRSVSPSPVPLSSNYIAQISNGQQLMSQPQLHRRSNSCSSI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 SVASCISEWEQKIPTYNTPLKVTSIARRRQQEPGQSKTCIVSDRRRGMYWTEGREVVPTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SVASCISEWEQKIPTYNTPLKVTSIARRRQQEPGQSKTCIVSDRRRGMYWTEGREVVPTF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RNEIEIEEDHCGRLLFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDRWVDHKPASNMQTETVMQPHVPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNEIEIEEDHCGRLLFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDRWVDHKPASNMQTETVMQPHVPH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 AITVSVANEKALAKCEKYMLTHQELASDGEIETKLIKGDIYKTRGGGQSVQFTDIETLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AITVSVANEKALAKCEKYMLTHQELASDGEIETKLIKGDIYKTRGGGQSVQFTDIETLKQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 ESPNGSRKRRSSTVAPAQPDGAESEWTDVETRCSVAVEMRAGSQLGPGYQHHAQPKRKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESPNGSRKRRSSTVAPAQPDGAESEWTDVETRCSVAVEMRAGSQLGPGYQHHAQPKRKKP
910 920 930 940 950 960
>>CCDS32279.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 (856 aa)
initn: 4558 init1: 4558 opt: 4558 Z-score: 3009.8 bits: 568.1 E(32554): 2.5e-161
Smith-Waterman score: 5463; 89.2% identity (89.2% similar) in 960 aa overlap (1-960:1-856)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQECCIEVINNTTVQLHTPEGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQECCIEVINNTTVQLHTPEGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RLNRNGDYKETQYSFKQVFGTHTTQKELFDVVANPLVNDLIHGKNGLLFTYGVTGSGKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLNRNGDYKETQYSFKQVFGTHTTQKELFDVVANPLVNDLIHGKNGLLFTYGVTGSGKTH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGSFQAKRYVFKSNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGSFQAKRYVFKSNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NPKTSSSKRQVDPEFADMITVQEFCKAEEVDEDSVYGVFVSYIEIYNNYIYDLLEEVPFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPKTSSSKRQVDPEFADMITVQEFCKAEEVDEDSVYGVFVSYIEIYNNYIYDLLEEVPFD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PIKPKPPQSKLLREDKNHNMYVAGCTEVEVKSTEEAFEVFWRGQKKRRIANTHLNRESSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PIKPKPPQSKLLREDKNHNMYVAGCTEVEVKSTEEAFEVFWRGQKKRRIANTHLNRESSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SHSVFNIKLVQAPLDADGDNVLQEKEQITISQLSLVDLAGSERTNRTRAEGNRLREAGNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHSVFNIKLVQAPLDADGDNVLQEKEQITISQLSLVDLAGSERTNRTRAEGNRLREAGNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NQSLMTLRTCMDVLRENQMYGTNKMVPYRDSKLTHLFKNYFDGEGKVRMIVCVNPKAEDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQSLMTLRTCMDVLRENQMYGTNKMVPYRDSKLTHLFKNYFDGEGKVRMIVCVNPKAEDY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 EENLQVMRFAEVTQEVEVARPVDKAICGLTPGRRYRNQPRGPVGNEPLVTDVVLQSFPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EENLQVMRFAEVTQEVEVARPVDKAICGLTPGRRYRNQPRGPVGNEPLVTDVVLQSFPPL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PSCEILDINDEQTLPRLIEALEKRHNLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSCEILDINDEQTLPRLIEALEKRHNLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 QGKLNEKEKMISGQKLEIERLEKKNKTLEYKIEILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QGKLNEKEKMISGQKLEIERLEKKNKTLEYKIEILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 QRQFSDKRRLEARLQGMVTETTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QRQFSDKRRLEARLQGMVTETTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 PKTEKPERPSRERDREKVTQRSVSPSPVPLSSNYIAQISNGQQLMSQPQLHRRSNSCSSI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKTEKPERPSRERDREKVTQRSVSPSPVPL------------------------------
670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 SVASCISEWEQKIPTYNTPLKVTSIARRRQQEPGQSKTCIVSDRRRGMYWTEGREVVPTF
CCDS32 ------------------------------------------------------------
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RNEIEIEEDHCGRLLFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDRWVDHKPASNMQTETVMQPHVPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 --------------LFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDRWVDHKPASNMQTETVMQPHVPH
700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 AITVSVANEKALAKCEKYMLTHQELASDGEIETKLIKGDIYKTRGGGQSVQFTDIETLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AITVSVANEKALAKCEKYMLTHQELASDGEIETKLIKGDIYKTRGGGQSVQFTDIETLKQ
740 750 760 770 780 790
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 ESPNGSRKRRSSTVAPAQPDGAESEWTDVETRCSVAVEMRAGSQLGPGYQHHAQPKRKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESPNGSRKRRSSTVAPAQPDGAESEWTDVETRCSVAVEMRAGSQLGPGYQHHAQPKRKKP
800 810 820 830 840 850
>>CCDS7407.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1780 aa)
initn: 878 init1: 368 opt: 771 Z-score: 518.5 bits: 108.2 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 917; 29.0% identity (62.5% similar) in 784 aa overlap (23-766:56-793)
10 20 30 40
pF1KE1 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQEC----CIEVIN
:: . : :.::. ..: :.....
CCDS74 SEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQVCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILD
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 NTTVQLHTPEGY--RLNRNGDYKETQ-YSFKQVFGTHTTQKELFD-VVANPLVNDLIHGK
. :: :. :. ::..... . .: .::..::: :::::.:. . .: :.::..:.
CCDS74 SQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFGPATTQKEFFQGCIMQP-VKDLLKGQ
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150
pF1KE1 NGLLFTYGVTGSGKTHTMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGS----------FQAKRYVFK
. :.::::.:.::::.:. :. . :.::: :...:.:. ....:.
CCDS74 SRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLFDSLQERLYTKMNLKPHRSREYLRL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KE1 SNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMPNPKTSSSKRQVD-----PEFADMITVQEFCKAEE
:..... .: . .:::.. :. .. : . .. .. :: . ..... .:.
CCDS74 SSEQEKEEIASK-SALLRQIKEVTVHNDSDDTLYGSLTNSLNISEFEE--SIKDYEQANL
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 VDEDSV-YGVFVSYIEIYNNYIYDLLEEVPFDPIKPKPPQSKLLR--EDKNHNMYVAGCT
.:. ..:.::..::::.::::: : :.. : . :.:: .: . ..
CCDS74 NMANSIKFSVWVSFFEIYNEYIYDL-----FVPVSSKFQKRKMLRLSQDVKGYSFIKDLQ
270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 EVEVKSTEEAFEVFWRGQKKRRIANTHLNRESSRSHSVFNIKLVQAPLDADGDNVLQEKE
..:....::.... : :.. .: :.:: ::::::.:..:..: :.. . :
CCDS74 WIQVSDSKEAYRLLKLGIKHQSVAFTKLNNASSRSHSIFTVKILQIE-DSEMSRV-----
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 QITISQLSLVDLAGSERTNRTRAEGNRLREAGNINQSLMTLRTCMDVLRENQMYGTNKMV
: .:.::: :::::::: .:. ::.::::.:::: ::.:: :..::.... .. :
CCDS74 -IRVSELSLCDLAGSERTMKTQNEGERLRETGNINTSLLTLGKCINVLKNSEKSKFQQHV
380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 PYRDSKLTHLFKNYFDGEGKVRMIVCVNPKAEDYEENLQVMRFAEVTQEVEVARPVDKAI
:.:.::::: :...:.:.::. ::: .. :.:.:.:..:. ..:.: : ....
CCDS74 PFRESKLTHYFQSFFNGKGKICMIVNISQCYLAYDETLNVLKFSAIAQKVCVPDTLNSS-
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 CGLTPGRRYRNQPRGPVGNEPLVTDVVLQSFPPLPSCEILDINDEQ-TLPRLIEALEKRH
... ::: . :: :.: . .::... . .: : . .
CCDS74 ---------QEKLFGPVKSS---QDVSLDSNS---NSKILNVKRATISWENSLEDLMEDE
490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 NLRQMMIDEFNKQSNAFKALLQEFDNAVLSKENHMQGKLNEKEKMISGQKLEIERL--EK
.: . . . . :. : : ...:... .::. . .::.:... . ..: ::
CCDS74 DLVEELENAEETQNVETKLLDEDLDKTL--EENKAFISHEEKRKLLDLIEDLKKKLINEK
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 KNK-TLEYKI--EILEKTTTIYEEDKRNLQQELETQNQKLQRQFSDKRRLEARLQGMVTE
:.: :::.:: :. .. : . . . .... : . . :.. . .::: : .. .: .
CCDS74 KEKLTLEFKIREEVTQEFTQYWAQREADFKETLLQEREILEE--NAERRL-AIFKDLVGK
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670
pF1KE1 TTMKWEKECERRVAAKQLEMQNKLWVKDEKLKQLKAIVTEPKTE----KPERPSRERDRE
. .: . . : ..: .. . :..:.:: ... : : : : .:: . .
CCDS74 CDTR--EEAAKDICATKVETEEATACLELKFNQIKAELAKTKGELIKTKEELKKRENESD
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KE1 KVTQR-SVSPSPVPLSSNYIAQISNGQQLMSQPQ--LHRRSNSCSSI-SVASCISEWEQK
.. :. .: . . ... : .. : ...: . ... .: : . .. .: ..:
CCDS74 SLIQELETSNKKIITQNQRIKELIN---IIDQKEDTINEFQNLKSHMENTFKC----NDK
710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KE1 IPTYNTPLKVTSIARRRQQEPGQSKTCIVSDRRRGMYWTEGREVVPTFRNEIEIEEDHCG
: . .. : . . : .::. : :.:.:
CCDS74 ADTSSLIINNKLICNETVEVPKDSKSKICSERKRVNENELQQDEPPAKKGSIHVSSAITE
760 770 780 790 800 810
800 810 820 830 840 850
pF1KE1 RLLFQPDQNAPPIRLRHRRSRSAGDRWVDHKPASNMQTETVMQPHVPHAITVSVANEKAL
CCDS74 DQKKSEEVRPNIAEIEDIRVLQENNEGLRAFLLTIENELKNEKEEKAELNKQIVHFQQEL
820 830 840 850 860 870
>>CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1820 aa)
initn: 888 init1: 368 opt: 766 Z-score: 515.1 bits: 107.6 E(32554): 2.3e-22
Smith-Waterman score: 868; 30.6% identity (64.1% similar) in 651 aa overlap (23-641:56-667)
10 20 30 40
pF1KE1 MKSARAKTPRKPTVKKGSQTNLKDPVGVYCRVRPLGFPDQEC----CIEVIN
:: . : :.::. ..: :.....
CCDS60 SEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQVCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILD
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 NTTVQLHTPEGY--RLNRNGDYKETQ-YSFKQVFGTHTTQKELFD-VVANPLVNDLIHGK
. :: :. :. ::..... . .: .::..::: :::::.:. . .: :.::..:.
CCDS60 SQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFGPATTQKEFFQGCIMQP-VKDLLKGQ
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150
pF1KE1 NGLLFTYGVTGSGKTHTMTGSPGEGGLLPRCLDMIFNSIGS----------FQAKRYVFK
. :.::::.:.::::.:. :. . :.::: :...:.:. ....:.
CCDS60 SRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLFDSLQERLYTKMNLKPHRSREYLRL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KE1 SNDRNSMDIQCEVDALLERQKREAMPNPKTSSSKRQVD-----PEFADMITVQEFCKAEE
:..... .: . .:::.. :. .. : . .. .. :: . ..... .:.
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