Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1566
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1566, 475 aa
1>>>pF1KE1566 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1653+/-0.00108; mu= -10.5549+/- 0.065
mean_var=457.4633+/-95.293, 0's: 0 Z-trim(116.0): 34 B-trim: 473 in 1/53
Lambda= 0.059965
statistics sampled from 16574 (16605) to 16574 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.51), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 475) 3210 291.7 1.1e-78
CCDS31171.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 481) 2354 217.7 2.2e-56
CCDS53500.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 480) 2346 217.0 3.6e-56
CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 476) 2270 210.4 3.4e-54
CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 507) 1870 175.8 9.3e-44
CCDS53501.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 496) 1851 174.2 2.9e-43
CCDS63093.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 513) 1844 173.6 4.5e-43
CCDS74634.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 390) 1682 159.4 6e-39
CCDS31170.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 452) 1624 154.5 2.2e-37
CCDS53499.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 451) 1616 153.8 3.5e-37
CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 446) 1484 142.4 9.6e-34
CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 508) 1450 139.5 8.1e-33
CCDS73078.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 422) 1411 136.0 7.3e-32
CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 393) 1400 135.1 1.3e-31
CCDS53497.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 329) 716 75.8 7.7e-14
CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 ( 366) 638 69.1 8.9e-12
>>CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (475 aa)
initn: 3210 init1: 3210 opt: 3210 Z-score: 1525.9 bits: 291.7 E(32554): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 3210; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
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CCDS23 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGS
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CCDS23 SGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGHPVQFYSMNRPASRHTPPTIGG
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CCDS23 SGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGHPVQFYSMNRPASRHTPPTIGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFVARVQENI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFVARVQENI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE1 IYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 IYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
430 440 450 460 470
>>CCDS31171.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (481 aa)
initn: 2342 init1: 891 opt: 2354 Z-score: 1125.7 bits: 217.7 E(32554): 2.2e-56
Smith-Waterman score: 2354; 73.1% identity (86.8% similar) in 491 aa overlap (1-475:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
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CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------STQNMKMGGLPRTTPPTQK
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CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
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CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGHP-----VQFYSMNRP
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CCDS31 H--SGSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ASRHTPPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLP
:::. : . .: ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .:.::::: . :.:::.:
CCDS31 ISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LMGFVARVQENISD--TPPPPPPVEE-PVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAE
: ::::::::::.: ::::::: .. :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::.
CCDS31 LTGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYAD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 EDPPWAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPG
:: :::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : :::::::
CCDS31 GDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPG
420 430 440 450 460 470
470
pF1KE1 NYVESIMHYSE
:::::::::..
CCDS31 NYVESIMHYTD
480
>>CCDS53500.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (480 aa)
initn: 1646 init1: 924 opt: 2346 Z-score: 1121.9 bits: 217.0 E(32554): 3.6e-56
Smith-Waterman score: 2346; 73.3% identity (86.9% similar) in 490 aa overlap (1-475:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
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CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------STQNMKMGGLPRTTPPTQK
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CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
::::::::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.: ::.:: ::::.::: ::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGH---P-VQFYSMNRPA
. ::::::: .:::::::.:.:.::::::::::.. :. : :. .:.:
CCDS53 H--SGSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 SRHTPPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPL
:::. : . .: ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .:.::::: . :.:::.::
CCDS53 SRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 MGFVARVQENISD--TPPPPPPVEE-PVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEE
::::::::::.: ::::::: .. :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::.
CCDS53 TGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 DPPWAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGN
:: :::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : ::::::::
CCDS53 DPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGN
420 430 440 450 460 470
470
pF1KE1 YVESIMHYSE
::::::::..
CCDS53 YVESIMHYTD
480
>>CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (476 aa)
initn: 2116 init1: 1022 opt: 2270 Z-score: 1086.4 bits: 210.4 E(32554): 3.4e-54
Smith-Waterman score: 2363; 73.9% identity (87.7% similar) in 486 aa overlap (1-475:1-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
:::::::::::::.:.:::..:: :: ::::::::::::..::..:::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV-STQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPP
:::::::::.::::::::::::::.:::.::::: ..: . : : ::.::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 MSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSG
:::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.: ::.:: ::::.::: ::. ::
CCDS31 MSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRTH--SG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 SSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGHP-----VQFYSMNRPASRHT
::::: .:::::::.:.:.::::::::::.. :. : :. .:.: :::.
CCDS31 SSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFV
: . .: ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .:.::::: . :.:::.:: :::
CCDS31 STTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE1 ARVQENISD--TPPPPPPVEE-PVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPW
:::::::.: ::::::: .. :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::. :: :
CCDS31 ARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAW
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 APRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVES
::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : ::::::::::::
CCDS31 APKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVES
420 430 440 450 460 470
470
pF1KE1 IMHYSE
::::..
CCDS31 IMHYTD
>>CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (507 aa)
initn: 2647 init1: 1818 opt: 1870 Z-score: 899.1 bits: 175.8 E(32554): 9.3e-44
Smith-Waterman score: 2816; 83.2% identity (83.2% similar) in 536 aa overlap (1-475:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE1 SGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFP-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPAPAGSAGTPPLPATSASAPAPLV
250 260 270 280 290 300
280 290
pF1KE1 --------------------------------------GHPVQFYSMNRPASRHTPPTIG
::::::::::::::::::::::
CCDS63 PATVPSSTAPDAAAGGAQTLADGFTSPTPPVVSSTPPTGHPVQFYSMNRPASRHTPPTIG
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFVARVQEN
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVS---------------------------
370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 --DTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVV
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 AIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
460 470 480 490 500
>>CCDS53501.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (496 aa)
initn: 1626 init1: 760 opt: 1851 Z-score: 890.3 bits: 174.2 E(32554): 2.9e-43
Smith-Waterman score: 2056; 63.5% identity (75.2% similar) in 532 aa overlap (1-475:1-496)
10 20 30 40
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQ-----------------SADK
:::::::::::::.:.:::..:: :: :::::::::::: ..::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQRHGFAVLLCLLSNSWPQATDK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QRALEETKAYTTQSLASVAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEK
..:::::::::::::::::: ::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RKALEETKAYTTQSLASVAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE1 VARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------ST
::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::: ..
CCDS53 VARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 QNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAP
: . : : ::.:::::::::::::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.:
CCDS53 QPARTGTLSRTNPPTQKPPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LG
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFP
::.:: ::::.::: ::. ::::::: .:::::::.:.:.::::::::::.. :
CCDS53 SQHSPGRTASLNQRPRTH--SGSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGP
240 250 260 270 280 290
280 290 300
pF1KE1 ---------GHP-----------------------VQFYSMNRPASRHTPPTIG-GSLPY
: : :. .:.: :::. : . .: :
CCDS53 ENISVPPPSGAPPAPPLAPLLPVSTVIAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGY
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFVARVQENISDTP
:: ::.:.: : : ..::::.:::: .. .: ::
CCDS53 RRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPP--------------------------
360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 PPPPPVEEPVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVVAIYD
::::: . :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::. :: :::..:.::::::::
CCDS53 PPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYD
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470
pF1KE1 YTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
:::::.:::::.::::::::::::::::::: : ::::::::::::::::..
CCDS53 YTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
450 460 470 480 490
>>CCDS63093.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (513 aa)
initn: 1798 init1: 969 opt: 1844 Z-score: 886.8 bits: 173.6 E(32554): 4.5e-43
Smith-Waterman score: 2753; 82.1% identity (82.1% similar) in 536 aa overlap (1-469:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVK------VSTQNMKMGGLPRTTPPTQK
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS63 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKWLLRFKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE1 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFP-----------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPAPAGSAGTPPLPATSAS
250 260 270 280 290 300
280 290
pF1KE1 --------------------------------------------GHPVQFYSMNRPASRH
::::::::::::::::
CCDS63 APAPLVPATVPSSTAPDAAAGGAQTLADGFTSPTPPVVSSTPPTGHPVQFYSMNRPASRH
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TPPTIGGSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TPPTIGGSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVS---------------------
370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ARVQENISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 --------DTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRS
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 YLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHY
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 SE
CCDS63 SE
>>CCDS74634.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (390 aa)
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Smith-Waterman score: 2367; 85.3% identity (90.1% similar) in 415 aa overlap (62-475:5-390)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 YCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLASVAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSIN
.::.. .. .:.... . .. .. .
CCDS74 MFFKSYLLKISILRQIRGVDLESTFVTKFGNNCS
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 -HISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIG
....:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRLNETVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSRTHKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIG
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 HGVKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HGVKVSTQNMKMGGLPRTTPPTQKPPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPS
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRTYSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTP
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 SPPSVFPGHPVQFYSMNRPASRHTPPTIGGSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SPPSVFPGHPVQFYSMNRPASRHTPPTIGGSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNP
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 VSLAPPPPSILQVTPQLPLMGFVARVQENISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEE
:: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VS-----------------------------DTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPEDYEE
280 290 300
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 EEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EEAAVVEYSDPYAEEDPPWAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGW
310 320 330 340 350 360
460 470
pF1KE1 YEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YEGVMNGVTGLFPGNYVESIMHYSE
370 380 390
>>CCDS31170.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (452 aa)
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Smith-Waterman score: 2156; 69.1% identity (82.0% similar) in 488 aa overlap (1-475:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
:::::::::::::.:.:::..:: :: ::::::::::::..::..:::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------STQNMKMGGLPRTTPPTQK
:::::::::.::::::::::::::.:::.::::: ..: . : : ::.:::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
::::::::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.: ::.:: ::::.::: ::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGHP-----VQFYSMNRP
. ::::::: .:::::::.:.:.::::::::::.. :. : :. .:.:
CCDS31 H--SGSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ASRHTPPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLP
:::. : . .: ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .. .: ::
CCDS31 ISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPP----------
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LMGFVARVQENISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEEDP
::::: . :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::. ::
CCDS31 ----------------PPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDP
350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PWAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYV
:::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : ::::::::::
CCDS31 AWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYV
390 400 410 420 430 440
470
pF1KE1 ESIMHYSE
::::::..
CCDS31 ESIMHYTD
450
>>CCDS53499.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (451 aa)
initn: 2309 init1: 915 opt: 1616 Z-score: 781.0 bits: 153.8 E(32554): 3.5e-37
Smith-Waterman score: 2148; 69.2% identity (82.1% similar) in 487 aa overlap (1-475:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
:::::::::::::.:.:::..:: :: ::::::::::::..::..:::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------STQNMKMGGLPRTTPPTQK
:::::::::.::::::::::::::.:::.::::: ..: . : : ::.:::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
::::::::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.: ::.:: ::::.::: ::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPGH---P-VQFYSMNRPA
. ::::::: .:::::::.:.:.::::::::::.. :. : :. .:.:
CCDS53 H--SGSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 SRHTPPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPL
:::. : . .: ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .. .: ::
CCDS53 SRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPP-----------
300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 MGFVARVQENISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPP
::::: . :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::. ::
CCDS53 ---------------PPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPA
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 WAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVE
:::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : :::::::::::
CCDS53 WAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVE
390 400 410 420 430 440
470
pF1KE1 SIMHYSE
:::::..
CCDS53 SIMHYTD
450
475 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:29:42 2016 done: Sun Nov 6 23:29:43 2016
Total Scan time: 3.990 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]